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'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7VQX _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7VQX _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 9239 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.539 ? 12516 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.414 ? 1247 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 1404 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1594 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7VQX _struct.title 'Cryo-EM structure of human vasoactive intestinal polypeptide receptor 2 (VIP2R) in complex with PACAP27 and Gs' _struct.pdbx_structure_determination_methodology ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7VQX _struct_keywords.text 'vasoactive intestinal polypeptide receptor 2, G protein-coupled receptor, ligand recognition, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 9 ? ALA A 39 ? THR A 9 ALA A 39 1 ? 31 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 52 ? ILE A 62 ? GLY A 52 ILE A 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 TRP A 234 ? ASN A 239 ? TRP A 234 ASN A 239 5 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 264 ? ASN A 278 ? ASN A 264 ASN A 278 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS A 293 ? LEU A 302 ? LYS A 293 LEU A 302 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 AA6 PHE A 312 ? ALA A 316 ? 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ASN R 379 ARG R 393 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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AB2 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 207 ? 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F ARG 40 CZ 27 1 Y 1 R ARG 63 ? NH1 ? F ARG 40 NH1 28 1 Y 1 R ARG 63 ? NH2 ? F ARG 40 NH2 29 1 Y 1 R LYS 77 ? CD ? F LYS 54 CD 30 1 Y 1 R LYS 77 ? CE ? F LYS 54 CE 31 1 Y 1 R LYS 77 ? NZ ? F LYS 54 NZ 32 1 Y 1 R SER 187 ? OG ? F SER 164 OG 33 1 Y 1 R LEU 190 ? CG ? F LEU 167 CG 34 1 Y 1 R LEU 190 ? CD1 ? F LEU 167 CD1 35 1 Y 1 R LEU 190 ? CD2 ? F LEU 167 CD2 36 1 Y 1 R ILE 349 ? CG1 ? F ILE 326 CG1 37 1 Y 1 R ILE 349 ? CG2 ? F ILE 326 CG2 38 1 Y 1 R ILE 349 ? CD1 ? F ILE 326 CD1 39 1 Y 1 R ILE 351 ? CG1 ? F ILE 328 CG1 40 1 Y 1 R ILE 351 ? CG2 ? F ILE 328 CG2 41 1 Y 1 R ILE 351 ? CD1 ? F ILE 328 CD1 42 1 Y 1 R SER 352 ? OG ? 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A GLU 71 18 1 Y 1 A GLY 72 ? A GLY 72 19 1 Y 1 A GLY 73 ? A GLY 73 20 1 Y 1 A GLU 74 ? A GLU 74 21 1 Y 1 A GLU 75 ? A GLU 75 22 1 Y 1 A ASP 76 ? A ASP 76 23 1 Y 1 A PRO 77 ? A PRO 77 24 1 Y 1 A GLN 78 ? A GLN 78 25 1 Y 1 A ALA 79 ? A ALA 79 26 1 Y 1 A ALA 80 ? A ALA 80 27 1 Y 1 A ARG 81 ? A ARG 81 28 1 Y 1 A SER 82 ? A SER 82 29 1 Y 1 A ASN 83 ? A ASN 83 30 1 Y 1 A SER 84 ? A SER 84 31 1 Y 1 A ASP 85 ? A ASP 85 32 1 Y 1 A GLY 86 ? A GLY 86 33 1 Y 1 A GLU 87 ? A GLU 87 34 1 Y 1 A LYS 88 ? A LYS 88 35 1 Y 1 A ALA 89 ? A ALA 89 36 1 Y 1 A THR 90 ? A THR 90 37 1 Y 1 A LYS 91 ? A LYS 91 38 1 Y 1 A VAL 92 ? A VAL 92 39 1 Y 1 A GLN 93 ? A GLN 93 40 1 Y 1 A ASP 94 ? A ASP 94 41 1 Y 1 A ILE 95 ? A ILE 95 42 1 Y 1 A LYS 96 ? A LYS 96 43 1 Y 1 A ASN 97 ? A ASN 97 44 1 Y 1 A ASN 98 ? A ASN 98 45 1 Y 1 A LEU 99 ? A LEU 99 46 1 Y 1 A LYS 100 ? A LYS 100 47 1 Y 1 A GLU 101 ? A GLU 101 48 1 Y 1 A ALA 102 ? A ALA 102 49 1 Y 1 A ILE 103 ? A ILE 103 50 1 Y 1 A GLU 104 ? A GLU 104 51 1 Y 1 A THR 105 ? A THR 105 52 1 Y 1 A ILE 106 ? A ILE 106 53 1 Y 1 A VAL 107 ? A VAL 107 54 1 Y 1 A ALA 108 ? A ALA 108 55 1 Y 1 A ALA 109 ? A ALA 109 56 1 Y 1 A MET 110 ? A MET 110 57 1 Y 1 A SER 111 ? A SER 111 58 1 Y 1 A ASN 112 ? A ASN 112 59 1 Y 1 A LEU 113 ? A LEU 113 60 1 Y 1 A VAL 114 ? A VAL 114 61 1 Y 1 A PRO 115 ? A PRO 115 62 1 Y 1 A PRO 116 ? A PRO 116 63 1 Y 1 A VAL 117 ? A VAL 117 64 1 Y 1 A GLU 118 ? A GLU 118 65 1 Y 1 A LEU 119 ? A LEU 119 66 1 Y 1 A ALA 120 ? A ALA 120 67 1 Y 1 A ASN 121 ? A ASN 121 68 1 Y 1 A PRO 122 ? A PRO 122 69 1 Y 1 A GLU 123 ? A GLU 123 70 1 Y 1 A ASN 124 ? A ASN 124 71 1 Y 1 A GLN 125 ? A GLN 125 72 1 Y 1 A PHE 126 ? A PHE 126 73 1 Y 1 A ARG 127 ? A ARG 127 74 1 Y 1 A VAL 128 ? A VAL 128 75 1 Y 1 A ASP 129 ? A ASP 129 76 1 Y 1 A TYR 130 ? A TYR 130 77 1 Y 1 A ILE 131 ? A ILE 131 78 1 Y 1 A LEU 132 ? A LEU 132 79 1 Y 1 A SER 133 ? A SER 133 80 1 Y 1 A VAL 134 ? A VAL 134 81 1 Y 1 A MET 135 ? A MET 135 82 1 Y 1 A ASN 136 ? A ASN 136 83 1 Y 1 A VAL 137 ? 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A GLU 168 115 1 Y 1 A TYR 169 ? A TYR 169 116 1 Y 1 A GLN 170 ? A GLN 170 117 1 Y 1 A LEU 171 ? A LEU 171 118 1 Y 1 A ILE 172 ? A ILE 172 119 1 Y 1 A ASP 173 ? A ASP 173 120 1 Y 1 A CYS 174 ? A CYS 174 121 1 Y 1 A ALA 175 ? A ALA 175 122 1 Y 1 A GLN 176 ? A GLN 176 123 1 Y 1 A TYR 177 ? A TYR 177 124 1 Y 1 A PHE 178 ? A PHE 178 125 1 Y 1 A LEU 179 ? A LEU 179 126 1 Y 1 A ASP 180 ? A ASP 180 127 1 Y 1 A LYS 181 ? A LYS 181 128 1 Y 1 A ILE 182 ? A ILE 182 129 1 Y 1 A ASP 183 ? A ASP 183 130 1 Y 1 A VAL 184 ? A VAL 184 131 1 Y 1 A ILE 185 ? A ILE 185 132 1 Y 1 A LYS 186 ? A LYS 186 133 1 Y 1 A GLN 187 ? A GLN 187 134 1 Y 1 A ASP 188 ? A ASP 188 135 1 Y 1 A ASP 189 ? A ASP 189 136 1 Y 1 A TYR 190 ? A TYR 190 137 1 Y 1 A VAL 191 ? A VAL 191 138 1 Y 1 A PRO 192 ? A PRO 192 139 1 Y 1 A SER 193 ? A SER 193 140 1 Y 1 A ASP 194 ? A ASP 194 141 1 Y 1 A GLN 195 ? A GLN 195 142 1 Y 1 A ASP 196 ? A ASP 196 143 1 Y 1 A LEU 197 ? A LEU 197 144 1 Y 1 A LEU 198 ? A LEU 198 145 1 Y 1 A ARG 199 ? A ARG 199 146 1 Y 1 A CYS 200 ? A CYS 200 147 1 Y 1 A ARG 201 ? A ARG 201 148 1 Y 1 A VAL 202 ? A VAL 202 149 1 Y 1 A LEU 203 ? A LEU 203 150 1 Y 1 A TYR 253 ? A TYR 253 151 1 Y 1 A ASN 254 ? A ASN 254 152 1 Y 1 A MET 255 ? A MET 255 153 1 Y 1 A VAL 256 ? A VAL 256 154 1 Y 1 A ILE 257 ? A ILE 257 155 1 Y 1 A ARG 258 ? A ARG 258 156 1 Y 1 A GLU 259 ? A GLU 259 157 1 Y 1 A ASP 260 ? A ASP 260 158 1 Y 1 B MET -33 ? B MET 1 159 1 Y 1 B HIS -32 ? B HIS 2 160 1 Y 1 B HIS -31 ? B HIS 3 161 1 Y 1 B HIS -30 ? B HIS 4 162 1 Y 1 B HIS -29 ? B HIS 5 163 1 Y 1 B HIS -28 ? B HIS 6 164 1 Y 1 B HIS -27 ? B HIS 7 165 1 Y 1 B SER -26 ? B SER 8 166 1 Y 1 B SER -25 ? B SER 9 167 1 Y 1 B GLY -24 ? B GLY 10 168 1 Y 1 B LEU -23 ? B LEU 11 169 1 Y 1 B VAL -22 ? B VAL 12 170 1 Y 1 B PRO -21 ? B PRO 13 171 1 Y 1 B ARG -20 ? B ARG 14 172 1 Y 1 B GLY -19 ? B GLY 15 173 1 Y 1 B SER -18 ? B SER 16 174 1 Y 1 B HIS -17 ? B HIS 17 175 1 Y 1 B MET -16 ? B MET 18 176 1 Y 1 B ALA -15 ? B ALA 19 177 1 Y 1 B SER -14 ? B SER 20 178 1 Y 1 B HIS -13 ? B HIS 21 179 1 Y 1 B HIS -12 ? B HIS 22 180 1 Y 1 B HIS -11 ? B HIS 23 181 1 Y 1 B HIS -10 ? B HIS 24 182 1 Y 1 B HIS -9 ? B HIS 25 183 1 Y 1 B HIS -8 ? B HIS 26 184 1 Y 1 B HIS -7 ? B HIS 27 185 1 Y 1 B HIS -6 ? B HIS 28 186 1 Y 1 B HIS -5 ? B HIS 29 187 1 Y 1 B HIS -4 ? B HIS 30 188 1 Y 1 B GLY -3 ? B GLY 31 189 1 Y 1 B SER -2 ? B SER 32 190 1 Y 1 B LEU -1 ? B LEU 33 191 1 Y 1 B LEU 0 ? B LEU 34 192 1 Y 1 B GLN 1 ? B GLN 35 193 1 Y 1 B SER 2 ? B SER 36 194 1 Y 1 B SER 343 ? B SER 377 195 1 Y 1 B GLY 344 ? B GLY 378 196 1 Y 1 B GLY 345 ? B GLY 379 197 1 Y 1 B GLY 346 ? B GLY 380 198 1 Y 1 B GLY 347 ? B GLY 381 199 1 Y 1 B SER 348 ? B SER 382 200 1 Y 1 B GLY 349 ? B GLY 383 201 1 Y 1 B GLY 350 ? B GLY 384 202 1 Y 1 B GLY 351 ? B GLY 385 203 1 Y 1 B GLY 352 ? B GLY 386 204 1 Y 1 B SER 353 ? B SER 387 205 1 Y 1 B SER 354 ? B SER 388 206 1 Y 1 B GLY 355 ? B GLY 389 207 1 Y 1 B VAL 356 ? B VAL 390 208 1 Y 1 B SER 357 ? B SER 391 209 1 Y 1 B GLY 358 ? 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