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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Zheng, L.' 1 ? primary 'Tsai, B.' 2 ? primary 'Gao, N.' 3 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7XFJ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 7XFJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 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;ATGCACAGGATGTATATATCTGACACGXGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCG CGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGG ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG) (DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA) (DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT) ; ;CCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCC CCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCCCGTGTCAGATATATACATCCTGTGCAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MVTPALQMKKPKQFCRRMGQKKQRPARAGQPHSSSDAAQAPAEQPHSSSDAAQAPCPRERCLGPPTTPGPYRSIYFSSPK GHLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAHSRGGRQTPRNRGMFMKPGTLYVYI IYGMYFCMNISSQGDGACVLLRALEPLEGLETMRQLRSTLRKGTASRVLKDRELCSGPSKLCQALAINKSFDQRDLAQDE AVWLERGPLEPSEPAVVAAARVGVGHAGEWARKPLRFYVRGSPWVSVVDRVAEQDTQA ; ;MVTPALQMKKPKQFCRRMGQKKQRPARAGQPHSSSDAAQAPAEQPHSSSDAAQAPCPRERCLGPPTTPGPYRSIYFSSPK GHLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAHSRGGRQTPRNRGMFMKPGTLYVYI IYGMYFCMNISSQGDGACVLLRALEPLEGLETMRQLRSTLRKGTASRVLKDRELCSGPSKLCQALAINKSFDQRDLAQDE AVWLERGPLEPSEPAVVAAARVGVGHAGEWARKPLRFYVRGSPWVSVVDRVAEQDTQA ; K ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ARG n 1 10 LYS n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 GLY n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PRO n 1 18 ARG n 1 19 LYS n 1 20 GLN n 1 21 LEU n 1 22 ALA n 1 23 THR n 1 24 LYS n 1 25 ALA n 1 26 ALA n 1 27 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 298 human ? 'MPG, AAG, ANPG, MID1' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H32_XENLA P84233 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1_XENLA P06897 ? 3 ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESAKSAKSK ; 1 4 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 5 PDB 7XFJ 7XFJ ? 5 ? 1 6 PDB 7XFJ 7XFJ ? 6 ? 1 7 UNP 3MG_HUMAN P29372 ? 7 ;MVTPALQMKKPKQFCRRMGQKKQRPARAGQPHSSSDAAQAPAEQPHSSSDAAQAPCPRERCLGPPTTPGPYRSIYFSSPK GHLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAHSRGGRQTPRNRGMFMKPGTLYVYI IYGMYFCMNISSQGDGACVLLRALEPLEGLETMRQLRSTLRKGTASRVLKDRELCSGPSKLCQALAINKSFDQRDLAQDE AVWLERGPLEPSEPAVVAAARVGVGHAGEWARKPLRFYVRGSPWVSVVDRVAEQDTQA ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7XFJ A 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 2 2 7XFJ B 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 3 3 7XFJ C 1 ? 130 ? P06897 1 ? 130 ? 0 129 4 4 7XFJ D 1 ? 126 ? P02281 1 ? 126 ? -3 122 5 1 7XFJ E 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 6 2 7XFJ F 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 7 3 7XFJ G 1 ? 130 ? P06897 1 ? 130 ? 0 129 8 4 7XFJ H 1 ? 126 ? P02281 1 ? 126 ? -3 122 9 5 7XFJ I 1 ? 152 ? 7XFJ -77 ? 74 ? -77 74 10 6 7XFJ J 1 ? 152 ? 7XFJ -74 ? 77 ? -74 77 11 7 7XFJ K 1 ? 298 ? P29372 1 ? 298 ? 1 298 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 7XFJ ARG C 100 ? UNP P06897 GLY 100 conflict 99 1 7 7XFJ ARG G 100 ? UNP P06897 GLY 100 conflict 99 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight AAB 'DNA linking' . "2'-DEOXY-RIBOFURANOSE-5'-MONOPHOSPHATE" 'ABASIC DEOXYRIBOSE' 'C5 H11 O7 P' 214.110 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7XFJ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7XFJ _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 13562 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.774 ? 19429 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 29.784 ? 3681 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 2205 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 1565 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7XFJ _struct.title 'Structure of nucleosome-AAG complex (T-50I, post-catalytic state)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7XFJ _struct_keywords.text 'Nucleosome, AAG, DNA repair, Base excision repair, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? SER A 58 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? GLN A 77 ? ARG A 63 GLN A 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 121 ? GLY A 133 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN B 26 ? ILE B 30 ? ASN B 25 ILE B 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 31 ? GLY B 42 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 50 ? ALA B 77 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 83 ? GLN B 94 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 17 ? ALA C 22 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 27 ? GLY C 38 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 46 ? ASN C 74 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 80 ? ASN C 90 ? ILE C 79 ASN C 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP C 91 ? LEU C 98 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR D 38 ? HIS D 50 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 56 ? ASN D 85 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 91 ? LEU D 103 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO D 104 ? ALA D 125 ? PRO D 100 ALA D 121 1 ? 22 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 45 ? SER E 58 ? GLY E 44 SER E 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG E 64 ? GLN E 77 ? ARG E 63 GLN E 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN E 86 ? ALA E 115 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P21 AC3 MET E 121 ? 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PRO K 94 ALA K 101 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY K 189 ? ARG K 197 ? GLY K 189 ARG K 197 1 ? 9 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY K 217 ? LEU K 225 ? GLY K 217 LEU K 225 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN K 228 ? ASP K 232 ? ASN K 228 ASP K 232 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? 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J 12 ? 1 I DA 66 1_555 J DT 87 1_555 I DC 67 1_555 J DG 86 1_555 -0.264 -0.210 3.195 -7.179 2.611 31.354 -0.835 -0.780 3.149 4.744 13.043 32.249 42 II_DA-12DC-11:DG11DT12_JJ I -12 ? J 12 ? I -11 ? J 11 ? 1 I DC 67 1_555 J DG 86 1_555 I DG 68 1_555 J DC 85 1_555 0.118 0.226 3.280 -2.835 5.526 34.539 -0.459 -0.624 3.257 9.215 4.728 35.076 43 II_DC-11DG-10:DC10DG11_JJ I -11 ? J 11 ? I -10 ? J 10 ? 1 I DG 68 1_555 J DC 85 1_555 I DC 69 1_555 J DG 84 1_555 -0.048 -0.341 3.285 -0.403 8.084 30.786 -2.090 0.015 3.098 14.906 0.743 31.807 44 II_DG-10DC-9:DG9DC10_JJ I -10 ? J 10 ? I -9 ? J 9 ? 1 I DC 69 1_555 J DG 84 1_555 I DG 70 1_555 J DC 83 1_555 -0.249 0.299 3.220 -0.587 5.508 33.235 -0.375 0.335 3.230 9.548 1.018 33.680 45 II_DC-9DG-8:DC8DG9_JJ I -9 ? J 9 ? I -8 ? J 8 ? 1 I DG 70 1_555 J DC 83 1_555 I DG 71 1_555 J DC 82 1_555 0.684 0.195 3.386 3.883 0.920 35.762 0.179 -0.528 3.442 1.492 -6.299 35.977 46 II_DG-8DG-7:DC7DC8_JJ I -8 ? J 8 ? I -7 ? J 7 ? 1 I DG 71 1_555 J DC 82 1_555 I DG 72 1_555 J DC 81 1_555 0.070 1.534 3.720 2.407 -3.070 41.794 2.499 0.182 3.602 -4.292 -3.365 41.967 47 II_DG-7DG-6:DC6DC7_JJ I -7 ? J 7 ? I -6 ? J 6 ? 1 I DG 72 1_555 J DC 81 1_555 I DG 73 1_555 J DC 80 1_555 -0.515 0.467 3.290 -1.438 3.955 31.322 0.111 0.675 3.342 7.285 2.648 31.596 48 II_DG-6DG-5:DC5DC6_JJ I -6 ? J 6 ? I -5 ? J 5 ? 1 I DG 73 1_555 J DC 80 1_555 I DG 74 1_555 J DC 79 1_555 -0.281 1.762 3.704 -2.540 -4.198 41.365 2.970 0.098 3.527 -5.918 3.581 41.642 49 II_DG-5DG-4:DC4DC5_JJ I -5 ? J 5 ? I -4 ? J 4 ? 1 I DG 74 1_555 J DC 79 1_555 I DA 75 1_555 J DT 78 1_555 -1.070 1.642 3.503 -3.482 -0.074 41.980 2.293 1.100 3.574 -0.102 4.851 42.118 50 II_DG-4DA-3:DT3DC4_JJ I -4 ? J 4 ? I -3 ? J 3 ? 1 I DA 75 1_555 J DT 78 1_555 I DC 76 1_555 J DG 77 1_555 0.121 -0.107 3.059 -9.244 3.865 28.445 -0.939 -1.987 2.842 7.575 18.117 30.124 51 II_DA-3DC-2:DG2DT3_JJ I -3 ? J 3 ? I -2 ? J 2 ? 1 I DC 76 1_555 J DG 77 1_555 I DA 77 1_555 J DT 76 1_555 -0.220 0.227 3.195 -3.332 6.918 35.400 -0.596 -0.108 3.189 11.215 5.402 36.197 52 II_DC-2DA-1:DT1DG2_JJ I -2 ? J 2 ? I -1 ? J 1 ? 1 I DA 77 1_555 J DT 76 1_555 I DG 78 1_555 J DC 75 1_555 -0.152 -0.607 3.335 -2.786 3.484 31.068 -1.786 -0.248 3.250 6.463 5.169 31.379 53 II_DA-1DG0:DC0DT1_JJ I -1 ? J 1 ? I 0 ? J 0 ? 1 I DG 78 1_555 J DC 75 1_555 I DC 79 1_555 J DG 74 1_555 0.162 -0.681 3.312 0.318 6.070 33.848 -2.097 -0.225 3.148 10.323 -0.541 34.374 54 II_DG0DC1:DG-1DC0_JJ I 0 ? J 0 ? I 1 ? J -1 ? 1 I DC 79 1_555 J DG 74 1_555 I DG 80 1_555 J DC 73 1_555 0.071 0.230 3.243 0.787 3.056 33.602 -0.098 0.004 3.252 5.272 -1.358 33.745 55 II_DC1DG2:DC-2DG-1_JJ I 1 ? J -1 ? I 2 ? J -2 ? 1 I DG 80 1_555 J DC 73 1_555 I DC 81 1_555 J DG 72 1_555 -0.426 -0.241 3.240 0.714 4.395 33.370 -1.122 0.851 3.173 7.611 -1.237 33.657 56 II_DG2DC3:DG-3DC-2_JJ I 2 ? J -2 ? I 3 ? J -3 ? 1 I DC 81 1_555 J DG 72 1_555 I DG 82 1_555 J DC 71 1_555 0.198 1.132 3.552 1.827 -0.738 39.323 1.774 -0.059 3.536 -1.096 -2.713 39.370 57 II_DC3DG4:DC-4DG-3_JJ I 3 ? J -3 ? I 4 ? J -4 ? 1 I DG 82 1_555 J DC 71 1_555 I DT 83 1_555 J DA 70 1_555 -0.556 0.252 3.444 0.141 -0.891 33.253 0.596 0.996 3.434 -1.557 -0.247 33.265 58 II_DG4DT5:DA-5DC-4_JJ I 4 ? J -4 ? I 5 ? J -5 ? 1 I DT 83 1_555 J DA 70 1_555 I DA 84 1_555 J DT 69 1_555 0.252 1.902 3.530 2.261 -3.409 44.580 2.826 -0.112 3.391 -4.482 -2.973 44.758 59 II_DT5DA6:DT-6DA-5_JJ I 5 ? J -5 ? I 6 ? J -6 ? 1 I DA 84 1_555 J DT 69 1_555 I DC 85 1_555 J DG 68 1_555 -0.343 1.518 3.117 -5.566 -4.825 38.614 2.795 -0.109 2.934 -7.217 8.324 39.284 60 II_DA6DC7:DG-7DT-6_JJ I 6 ? J -6 ? I 7 ? J -7 ? 1 I DC 85 1_555 J DG 68 1_555 I DG 86 1_555 J DC 67 1_555 -0.419 0.645 3.637 -4.680 4.725 36.071 0.293 -0.060 3.712 7.551 7.479 36.659 61 II_DC7DG8:DC-8DG-7_JJ I 7 ? J -7 ? I 8 ? J -8 ? 1 I DG 86 1_555 J DC 67 1_555 I DT 87 1_555 J DA 66 1_555 0.001 -0.201 3.359 -4.010 3.776 30.426 -1.126 -0.797 3.284 7.122 7.562 30.909 62 II_DG8DT9:DA-9DC-8_JJ I 8 ? J -8 ? I 9 ? J -9 ? 1 I DT 87 1_555 J DA 66 1_555 I DG 88 1_555 J DC 65 1_555 0.470 -0.207 3.018 -1.527 6.975 35.192 -1.248 -0.963 2.903 11.391 2.493 35.887 63 II_DT9DG10:DC-10DA-9_JJ I 9 ? J -9 ? I 10 ? J -10 ? 1 I DG 88 1_555 J DC 65 1_555 I DC 89 1_555 J DG 64 1_555 -0.244 -0.716 3.409 1.849 5.355 32.585 -2.185 0.749 3.235 9.455 -3.265 33.061 64 II_DG10DC11:DG-11DC-10_JJ I 10 ? J -10 ? I 11 ? J -11 ? 1 I DC 89 1_555 J DG 64 1_555 I DG 90 1_555 J DC 63 1_555 0.145 -0.078 3.111 1.896 2.535 33.738 -0.522 0.042 3.100 4.355 -3.257 33.882 65 II_DC11DG12:DC-12DG-11_JJ I 11 ? J -11 ? I 12 ? J -12 ? 1 I DG 90 1_555 J DC 63 1_555 I DT 91 1_555 J DA 62 1_555 0.170 -0.244 3.409 8.297 -0.300 39.945 -0.315 0.716 3.378 -0.434 -11.988 40.764 66 II_DG12DT13:DA-13DC-12_JJ I 12 ? J -12 ? I 13 ? J -13 ? 1 I DT 91 1_555 J DA 62 1_555 I DT 92 1_555 J DA 61 1_555 -0.081 -0.172 3.314 1.862 4.211 35.476 -0.893 0.403 3.264 6.875 -3.040 35.764 67 II_DT13DT14:DA-14DA-13_JJ I 13 ? J -13 ? I 14 ? J -14 ? 1 I DT 92 1_555 J DA 61 1_555 I DT 93 1_555 J DA 60 1_555 -0.142 0.099 3.218 1.620 1.687 34.359 -0.091 0.488 3.209 2.851 -2.738 34.436 68 II_DT14DT15:DA-15DA-14_JJ I 14 ? J -14 ? I 15 ? J -15 ? 1 I DT 93 1_555 J DA 60 1_555 I DA 94 1_555 J DT 59 1_555 0.201 2.109 3.810 2.172 -2.793 39.860 3.450 -0.009 3.665 -4.087 -3.179 40.010 69 II_DT15DA16:DT-16DA-15_JJ I 15 ? J -15 ? I 16 ? J -16 ? 1 I DA 94 1_555 J DT 59 1_555 I DA 95 1_555 J DT 58 1_555 -1.630 1.045 3.484 -10.068 0.627 33.301 1.640 0.972 3.820 1.064 17.086 34.754 70 II_DA16DA17:DT-17DT-16_JJ I 16 ? J -16 ? I 17 ? J -17 ? 1 I DA 95 1_555 J DT 58 1_555 I DG 96 1_555 J DC 57 1_555 0.221 0.758 3.182 -3.317 6.157 33.906 0.335 -0.878 3.231 10.420 5.614 34.599 71 II_DA17DG18:DC-18DT-17_JJ I 17 ? J -17 ? I 18 ? 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J -23 ? 1 I DG 101 1_555 J DC 52 1_555 I DC 102 1_555 J DG 51 1_555 -0.108 -0.227 3.298 1.938 3.325 35.430 -0.855 0.458 3.253 5.443 -3.173 35.632 77 II_DG23DC24:DG-24DC-23_JJ I 23 ? J -23 ? I 24 ? J -24 ? 1 I DC 102 1_555 J DG 51 1_555 I DT 103 1_555 J DA 50 1_555 0.674 0.389 3.446 2.608 -0.007 34.041 0.664 -0.710 3.486 -0.012 -4.446 34.138 78 II_DC24DT25:DA-25DG-24_JJ I 24 ? J -24 ? I 25 ? J -25 ? 1 I DT 103 1_555 J DA 50 1_555 I DA 104 1_555 J DT 49 1_555 -1.849 0.828 3.415 -4.609 -1.634 38.198 1.473 2.191 3.568 -2.484 7.008 38.498 79 II_DT25DA26:DT-26DA-25_JJ I 25 ? J -25 ? I 26 ? J -26 ? 1 I DA 104 1_555 J DT 49 1_555 I DG 105 1_555 J DC 48 1_555 1.322 0.624 3.637 2.658 -1.902 34.393 1.382 -1.765 3.687 -3.208 -4.482 34.543 80 II_DA26DG27:DC-27DT-26_JJ I 26 ? J -26 ? I 27 ? J -27 ? 1 I DG 105 1_555 J DC 48 1_555 I DA 106 1_555 J DT 47 1_555 -1.526 1.592 3.284 -6.270 1.551 42.162 2.026 1.439 3.519 2.142 8.655 42.631 81 II_DG27DA28:DT-28DC-27_JJ I 27 ? J -27 ? I 28 ? 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J -33 ? 1 I DT 111 1_555 J DA 42 1_555 I DC 112 1_555 J DG 41 1_555 0.917 0.619 3.414 3.156 4.415 34.670 0.321 -1.016 3.531 7.352 -5.256 35.079 87 II_DT33DC34:DG-34DA-33_JJ I 33 ? J -33 ? I 34 ? J -34 ? 1 I DC 112 1_555 J DG 41 1_555 I DT 113 1_555 J DA 40 1_555 -1.035 0.377 3.465 -0.409 -0.561 32.703 0.773 1.762 3.470 -0.997 0.726 32.710 88 II_DC34DT35:DA-35DG-34_JJ I 34 ? J -34 ? I 35 ? J -35 ? 1 I DT 113 1_555 J DA 40 1_555 I DA 114 1_555 J DT 39 1_555 0.692 1.874 3.480 -0.065 -11.015 44.896 3.332 -0.888 2.965 -14.172 0.083 46.160 89 II_DT35DA36:DT-36DA-35_JJ I 35 ? J -35 ? I 36 ? J -36 ? 1 I DA 114 1_555 J DT 39 1_555 I DC 115 1_555 J DG 38 1_555 -0.307 0.631 3.677 -2.718 -2.811 37.504 1.385 0.082 3.635 -4.357 4.213 37.700 90 II_DA36DC37:DG-37DT-36_JJ I 36 ? J -36 ? I 37 ? J -37 ? 1 I DC 115 1_555 J DG 38 1_555 I DG 116 1_555 J DC 37 1_555 -0.050 0.980 3.386 -0.358 2.917 34.525 1.176 0.027 3.455 4.905 0.602 34.646 91 II_DC37DG38:DC-38DG-37_JJ I 37 ? J -37 ? I 38 ? 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