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'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ACT_YEAST P60010 ? 1 ;EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDME KIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVV PIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELP DGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPS SMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF ; 4 2 UNP A0A6A5PX31_YEASX A0A6A5PX31 ? 2 ;MSNAALQVYGGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLV IDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDI GHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQ ECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYV PLKRTKPSGVNKSDKKVTPTEEKEQEAVSKSTSPAANSADTPNETGKRPLEEEKPPKENNELIGLADLVYSSIMSSDVDL RATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGV ERLLNDRFR ; 1 3 UNP A0A8H8UNQ6_YEASX A0A8H8UNQ6 ? 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4 ;MSSSDIFDVLNIKQKSRSPTNGQVSVPSSSAANRPKPQVTGMQRELFNLLGENQPPVVIKSGNNFKEKMLSTSKPSPWSF VEFKANNSVTLRHWVKGSKELIGDTPKESPYSKFNQHLSIPSFTKEEYEAFMNENEGTQKSVESEKNHNENFTNEKKDES KNSWSFEEIEYLFNLCKKYDLRWFLIFDRYSYNNSRTLEDLKEKFYYTCRNYFKASDPSNPLLSSLNFSAEKEIERKKYL QRLLSRSAAEIAEEEALVVESKKFEMAAKRTLAERESLLRLLDSPHSDQTITQYLTSQGMSQLYNALLADKTRKRKHDLN IPENPWMKQQQQFAQHRQLQQLNVKKSEVKENLSPKKTKRQRQEMQTALKRKSESAYAEQLLKDFNSDERKALGVITHGE KLSPGVYLRSTKLSTFKPALQNKILAILQELSLPSRPVMPSFDVMERQEELLKKINTLIDLKKHVDKYEAGMSITK ; 1 5 UNP TRA1_YEAST P38811 ? 5 ;MSLTEQIEQFASRFRDDDATLQSRYSTLSELYDIMELLNSPEDYHFFLQAVIPLLLNQLKEVPISYDAHSPEQKLRNSML DIFNRCLMNQTFQPYAMEVLEFLLSVLPKENEENGILCMKVLTTLFKSFKSILQDKLDSFIRIIIQIYKNTPNLINQTFY EAGKAEQGDLDSPKEPQADELLDEFSKNDEEKDFPSKQSSTEPRFENSTSSNGLRSSMFSFKILSECPITMVTLYSSYKQ LTSTSLPEFTPLIMNLLNIQIKQQQEAREQAESRGEHFTSISTEIINRPAYCDFILAQIKATSFLAYVFIRGYAPEFLQD YVNFVPDLIIRLLQDCPSELSSARKELLHATRHILSTNYKKLFLPKLDYLFDERILIGNGFTMHETLRPLAYSTVADFIH NIRSELQLSEIEKTIKIYTGYLLDESLALTVQIMSAKLLLNLVERILKLGKENPQEAPRAKKLLMIIIDSYMNRFKTLNR QYDTIMKYYGRYETHKKEKAEKLKNSIQDNDKESEEFMRKVLEPSDDDHLMPQPKKEDINDSPDVEMTESDKVVKNDVEM FDIKNYAPILLLPTPTNDPIKDAFYLYRTLMSFLKTIIHDLKVFNPPPNEYTVANPKLWASVSRVFSYEEVIVFKDLFHE CIIGLKFFKDHNEKLSPETTKKHFDISMPSLPVSATKDARELMDYLAFMFMQMDNATFNEIIEQELPFVYERMLEDSGLL HVAQSFLTSEITSPNFAGILLRFLKGKLKDLGNVDFNTSNVLIRLFKLSFMSVNLFPNINEVVLLPHLNDLILNSLKYST TAEEPLVYFYLIRTLFRSIGGGRFENLYRSIKPILQVLLQSLNQMILTARLPHERELYVELCITVPVRLSVLAPYLPFLM KPLVFALQQYPDLVSQGLRTLELCIDNLTAEYFDPIIEPVIDDVSKALFNLLQPQPFNHAISHNVVRILGKLGGRNRQFL KPPTDLTEKTELDIDAIADFKINGMPEDVPLSVTPGIQSALNILQSYKSDIHYRKSAYKYLTCVLLLMTKSSAEFPTNYT ELLKTAVNSIKLERIGIEKNFDLEPTVNKRDYSNQENLFLRLLESVFYATSIKELKDDAMDLLNNLLDHFCLLQVNTTLL NKRNYNGTFNIDLKNPNFMLDSSLILDAIPFALSYYIPEVREVGVLAYKRIYEKSCLIYGEELALSHSFIPELAKQFIHL CYDETYYNKRGGVLGIKVLIDNVKSSSVFLKKYQYNLANGLLFVLKDTQSEAPSAITDSAEKLLIDLLSITFADVKEEDL GNKVLENTLTDIVCELSNANPKVRNACQKSLHTISNLTGIPIVKLMDHSKQFLLSPIFAKPLRALPFTMQIGNVDAITFC LSLPNTFLTFNEELFRLLQESIVLADAEDESLSTNIQKTTEYSTSEQLVQLRIACIKLLAIALKNEEFATAQQGNIRIRI LAVFFKTMLKTSPEIINTTYEALKGSLAENSKLPKELLQNGLKPLLMNLSDHQKLTVPGLDALSKLLELLIAYFKVEIGR KLLDHLTAWCRVEVLDTLFGQDLAEQMPTKIIVSIINIFHLLPPQADMFLNDLLLKVMLLERKLRLQLDSPFRTPLARYL NRFHNPVTEYFKKNMTLRQLVLFMCNIVQRPEAKELAEDFEKELDNFYDFYISNIPKNQVRVVSFFTNMVDLFNTMVITN GDEWLKKKGNMILKLKDMLNLTLKTIKENSFYIDHLQLNQSIAKFQALYLRFTELSERDQNPLLLDFIDFSFSNGIKASY SLKKFIFHNIIASSNKEKQNNFINDATLFVLSDKCLDARIFVLKNVINSTLIYEVATSGSLKSYLVEDKKPKWLELLHNK IWKNSNAILAYDVLDHHDLFRFELLQLSAIFIKADPEIIAEIKKDIIKFCWNFIKLEDTLIKQSAYLVTSYFISKFDFPI KVVTQVFVALLRSSHVEARYLVKQSLDVLTPVLHERMNAAGTPDTWINWVKRVMVENSSSQNNILYQFLISHPDLFFNSR DLFISNIIHHMNKITFMSNSNSDSHTLAIDLASLILYWENKTLEITNVNNTKTDSDGDVVMSDSKSDINPVEADTTAIIV DANNNSPISLHLREACTAFLIRYVCASNHRAIETELGLRAINILSELISDKHWTNVNVKLVYFEKFLIFQDLDSENILYY CMNALDVLYVFFKNKTKEWIMENLPTIQNLLEKCIKSDHHDVQEALQKVLQVIMKAIKAQGVSVIIEEESPGKTFIQMLT SVITQDLQETSSVTAGVTLAWVLFMNFPDNIVPLLTPLMKTFSKLCKDHLSISQPKDAMALEEARITTKLLEKVLYILSL KVSLLGDSRRPFLSTVALLIDHSMDQNFLRKIVNMSRSWIFNTEIFPTVKEKAAILTKMLAFEIRGEPSLSKLFYEIVLK LFDQEHFNNTEITVRMEQPFLVGTRVEDIGIRKRFMTILDNSLERDIKERLYYVIRDQNWEFIADYPWLNQALQLLYGSF NREKELSLKNIYCLSPPSILQEYLPENAEMVTEVNDLELSNFVKGHIASMQGLCRIISSDFIDSLIEIFYQDPKAIHRAW VTLFPQVYKSIPKNEKYGFVRSIITLLSKPYHTRQISSRTNVINMLLDSISKIESLELPPHLVKYLAISYNAWYQSINIL ESIQSNTSIDNTKIIEANEDALLELYVNLQEEDMFYGLWRRRAKYTETNIGLSYEQIGLWDKAQQLYEVAQVKARSGALP YSQSEYALWEDNWIQCAEKLQHWDVLTELAKHEGFTDLLLECGWRVADWNSDRDALEQSVKSVMDVPTPRRQMFKTFLAL QNFAESRKGDQEVRKLCDEGIQLSLIKWVSLPIRYTPAHKWLLHGFQQYMEFLEATQIYANLHTTTVQNLDSKAQEIKRI LQAWRDRLPNTWDDVNMWNDLVTWRQHAFQVINNAYLPLIPALQQSNSNSNINTHAYRGYHEIAWVINRFAHVARKHNMP DVCISQLARIYTLPNIEIQEAFLKLREQAKCHYQNMNELTTGLDVISNTNLVYFGTVQKAEFFTLKGMFLSKLRAYEEAN QAFATAVQIDLNLAKAWAQWGFFNDRRLSEEPNNISFASNAISCYLQAAGLYKNSKIRELLCRILWLISIDDASGMLTNA FDSFRGEIPVWYWITFIPQLLTSLSHKEANMVRHILIRIAKSYPQALHFQLRTTKEDFAVIQRQTMAVMGDKPDTNDRNG RRQPWEYLQELNNILKTAYPLLALSLESLVAQINDRFKSTTDEDLFRLINVLLIDGTLNYNRLPFPRKNPKLPENTEKNL VKFSTTLLAPYIRPKFNADFIDNKPDYETYIKRLRYWRRRLENKLDRASKKENLEVLCPHLSNFHHQKFEDIEIPGQYLL NKDNNVHFIKIARFLPTVDFVRGTHSSYRRLMIRGHDGSVHSFAVQYPAVRHSRREERMFQLYRLFNKSLSKNVETRRRS IQFNLPIAIPLSPQVRIMNDSVSFTTLHEIHNEFCKKKGFDPDDIQDFMADKLNAAHDDALPAPDMTILKVEIFNSIQTM FVPSNVLKDHFTSLFTQFEDFWLFRKQFASQYSSFVFMSYMMMINNRTPHKIHVDKTSGNVFTLEMLPSRFPYERVKPLL KNHDLSLPPDSPIFHNNEPVPFRLTPNIQSLIGDSALEGIFAVNLFTISRALIEPDNELNTYLALFIRDEIISWFSNLHR PIIENPQLREMVQTNVDLIIRKVAQLGHLNSTPTVTTQFILDCIGSAVSPRNLARTDVNFMPWF ; 1 6 UNP EPL1_YEAST P43572 ? 6 ;MPTPSNAIEINDGSHKSGRSTRRSGSRSAHDDGLDSFSKGDSGAGASAGSSNSRFRHRKISVKQHLKIYLPNDLKHLDKD ELQQREVVEIETGVEKNEEKEVHLHRILQMGSGHTKHKDYIPTPDASMTWNEYDKFYTGSFQETTSYIKFSATVEDCCGT NYNMDERDETFLNEQVNKGSSDILTEDEFEILCSSFEHAIHERQPFLSMDPESILSFEELKPTLIKSDMADFNLRNQLNH EINSHKTHFITQFDPVSQMNTRPLIQLIEKFGSKIYDYWRERKIEVNGYEIFPQLKFERPGEKEEIDPYVCFRRREVRHP RKTRRIDILNSQRLRALHQELKNAKDLALLVAKRENVSLNWINDELKIFDQRVKIKNLKRSLNISGEDDDLINHKRKRPT IVTVEQREAELRKAELKRAAAAAAAAKAKNNKRNNQLEDKSSRLTKQQQQQLLQQQQQQQQNALKTENGKQLANASSSST SQPITSHVYVKLPSSKIPDIVLEDVDALLNSKEKNARKFVQEKMEKRKIEDADVFFNLTDDPFNPVFDMSLPKNFSTSNV PFASIASSKFQIDRSFYSSHLPEYLKGISDDIRIYDSNGRSRNKDNYNLDTKRIKKTELYDPFQENLEIHSREYPIKFRK RVGRSNIKYVDRMPNFTTSSTKSACSLMDFVDFDSIEKEQYSREGSNDTDSINVYDSKYDEFVRLYDKWKYDSPQNEYGI KFSDEPARLNQISNDTQVIRFGTMLGTKSYEQLREATIKYRRDYITRLKQKHIQHLQQQQQQQQQQQQQAQQQKQKSQNN NSNSSNSLKKLNDSLINSEAKQNSSITQKNSS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7YFN A 1 ? 372 ? P60010 4 ? 375 ? 4 375 2 2 7YFN B 1 ? 489 ? A0A6A5PX31 1 ? 489 ? 1 489 3 3 7YFN D 1 ? 982 ? A0A8H8UNQ6 1 ? 982 ? 1 982 4 4 7YFN E 1 ? 476 ? A0A8H4F9Y4 1 ? 476 ? 1 476 5 5 7YFN T 1 ? 3744 ? P38811 1 ? 3744 ? 1 3744 6 6 7YFN F 1 ? 832 ? P43572 1 ? 832 ? 1 832 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7YFN _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7YFN _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 26992 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.656 ? 36569 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.920 ? 3553 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 4038 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 4692 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7YFN _struct.title 'Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7YFN _struct_keywords.text 'histone, acetyltransferase, H4, NuA4, TRANSFERASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 51 ? LYS A 58 ? VAL A 54 LYS A 61 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 75 ? ASN A 89 ? ASN A 78 ASN A 92 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 94 ? HIS A 98 ? ALA A 97 HIS A 101 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 109 ? ASN A 125 ? PRO A 112 ASN A 128 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 GLN A 134 ? GLY A 143 ? GLN A 137 GLY A 146 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA A 178 ? ARG A 193 ? 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