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CCCGTATATTCTCCTACAGCACTAAATAATAGTGCTGTAGGAGAATATACGGGCTGCTCGTGTTGACAAGTACTGAT which forms a hairpin DNA molecule with 24 base-pairs of fully-complementary dsDNA capped with a tetraloop at one end, and with a 24 nucleotide 3' overhang ; 9 non-polymer syn 'PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER' 523.247 5 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'hRAD9,DNA repair exonuclease rad9 homolog A' 2 'hRAD1,DNA repair exonuclease rad1 homolog,Rad1-like DNA damage checkpoint protein,hRad17,RF-C/activator 1 homolog' 3 hHUS1 4 'Activator 1 37 kDa subunit,A1 37 kDa subunit,Activator 1 subunit 4,Replication factor C 37 kDa subunit,RF-C 37 kDa subunit,RFC37' 5 'Activator 1 38 kDa subunit,A1 38 kDa subunit,Activator 1 subunit 3,Replication factor C 38 kDa subunit,RF-C 38 kDa subunit,RFC38' 6 'Activator 1 40 kDa subunit,A1 40 kDa subunit,Activator 1 subunit 2,Replication factor C 40 kDa subunit,RF-C 40 kDa subunit,RFC40' 7 'Activator 1 36 kDa subunit,A1 36 kDa 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;MSLWVDKYRPCSLGRLDYHKEQAAQLRNLVQCGDFPHLLVYGPSGAGKKTRIMCILRELYGVGVEKLRIEHQTITTPSKK KIEISTIASNYHLEVNPSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETNSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCR LILCCNSTSKVIPPIRSRCLAVRVPAPSIEDICHVLSTVCKKEGLNLPSQLAHRLAEKSCRNLRKALLMCEACRVQQYPF TADQEIPETDWEVYLRETANAIVSQQTPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAYYEH RLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF ; ;MSLWVDKYRPCSLGRLDYHKEQAAQLRNLVQCGDFPHLLVYGPSGAGKKTRIMCILRELYGVGVEKLRIEHQTITTPSKK KIEISTIASNYHLEVNPSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETNSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCR LILCCNSTSKVIPPIRSRCLAVRVPAPSIEDICHVLSTVCKKEGLNLPSQLAHRLAEKSCRNLRKALLMCEACRVQQYPF TADQEIPETDWEVYLRETANAIVSQQTPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAYYEH RLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MEVEAVCGGAGEVEAQDSDPAPAFSKAPGSAGHYELPWVEKYRPVKLNEIVGNEDTVSRLEVFAREGNVPNIIIAGPPGT GKTTSILCLARALLGPALKDAMLELNASNDRGIDVVRNKIKMFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEI YSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILTRLMNVIEKERVPYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTF 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LEU G 243 GLN G 257 1 ? 15 HELX_P HELX_P77 AI5 ASP G 278 ? LYS G 293 ? ASP G 258 LYS G 273 1 ? 16 HELX_P HELX_P78 AI6 LEU G 297 ? VAL G 311 ? LEU G 277 VAL G 291 1 ? 15 HELX_P HELX_P79 AI7 SER G 315 ? ARG G 331 ? SER G 295 ARG G 311 1 ? 17 HELX_P HELX_P80 AI8 LEU G 332 ? VAL G 334 ? LEU G 312 VAL G 314 5 ? 3 HELX_P HELX_P81 AI9 ASN G 337 ? ILE G 356 ? ASN G 317 ILE G 336 1 ? 20 HELX_P HELX_P82 AJ1 PRO H 417 ? TYR H 422 ? PRO K 90 TYR K 95 1 ? 6 HELX_P HELX_P83 AJ2 THR H 426 ? LEU H 430 ? THR K 99 LEU K 103 5 ? 5 HELX_P HELX_P84 AJ3 HIS H 433 ? GLU H 450 ? HIS K 106 GLU K 123 1 ? 18 HELX_P HELX_P85 AJ4 GLY H 469 ? HIS H 481 ? GLY K 142 HIS K 154 1 ? 13 HELX_P HELX_P86 AJ5 SER H 518 ? TYR H 533 ? SER K 191 TYR K 206 1 ? 16 HELX_P HELX_P87 AJ6 PRO H 556 ? SER H 563 ? PRO K 229 SER K 236 1 ? 8 HELX_P HELX_P88 AJ7 HIS H 564 ? GLY H 577 ? HIS K 237 GLY K 250 1 ? 14 HELX_P HELX_P89 AJ8 ASP H 592 ? PHE H 599 ? ASP K 265 PHE K 272 1 ? 8 HELX_P HELX_P90 AJ9 GLU H 602 ? SER H 608 ? 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I DT 48 N3 ? ? ? 1_555 J DA 6 N1 ? ? X DT 49 Y DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? I DT 48 O4 ? ? ? 1_555 J DA 6 N6 ? ? X DT 49 Y DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? I DA 49 N1 ? ? ? 1_555 J DT 5 N3 ? ? X DA 50 Y DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? I DA 49 N6 ? ? ? 1_555 J DT 5 O4 ? ? X DA 50 Y DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? I DC 50 N3 ? ? ? 1_555 J DG 4 N2 ? ? X DC 51 Y DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? I DG 51 N2 ? ? ? 1_555 J DC 3 N3 ? ? X DG 52 Y DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? I DG 52 N1 ? ? ? 1_555 J DC 2 N3 ? ? X DG 53 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? I DG 52 N2 ? ? ? 1_555 J DC 2 O2 ? ? X DG 53 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? I DG 52 O6 ? ? ? 1_555 J DC 2 N4 ? ? X DG 53 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? I DG 53 N2 ? ? ? 1_555 J DC 1 N3 ? ? X DG 54 Y DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 138 B . ? GLU 138 B PRO 139 B ? PRO 139 B 1 -17.89 2 GLY 843 H . ? GLY 516 K GLY 844 H ? 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VAL A 176 SER A 180 AA4 3 VAL A 166 ? ILE A 170 ? VAL A 166 ILE A 170 AA4 4 ALA A 214 ? PHE A 217 ? ALA A 214 PHE A 217 AA5 1 GLU B 72 ? LYS B 74 ? GLU B 72 LYS B 74 AA5 2 LEU B 17 ? LEU B 21 ? LEU B 17 LEU B 21 AA5 3 ALA B 107 ? TYR B 112 ? ALA B 107 TYR B 112 AA5 4 LEU B 119 ? GLU B 125 ? LEU B 119 GLU B 125 AA5 5 VAL B 128 ? ILE B 134 ? VAL B 128 ILE B 134 AA5 6 VAL C 199 ? PHE C 205 ? VAL C 199 PHE C 205 AA5 7 LEU C 190 ? GLU C 195 ? LEU C 190 GLU C 195 AA5 8 LEU C 180 ? ALA C 184 ? LEU C 180 ALA C 184 AA5 9 VAL C 230 ? ILE C 232 ? VAL C 230 ILE C 232 AA6 1 HIS B 39 ? THR B 41 ? HIS B 39 THR B 41 AA6 2 ARG B 83 ? ASN B 85 ? ARG B 83 ASN B 85 AA7 1 GLY B 48 ? ILE B 49 ? GLY B 48 ILE B 49 AA7 2 ILE B 65 ? GLN B 66 ? ILE B 65 GLN B 66 AA8 1 THR B 52 ? ASN B 55 ? THR B 52 ASN B 55 AA8 2 VAL B 59 ? ALA B 63 ? VAL B 59 ALA B 63 AA8 3 VAL B 267 ? CYS B 271 ? VAL B 267 CYS B 271 AA8 4 LEU B 251 ? TYR B 255 ? LEU B 251 TYR B 255 AA8 5 VAL B 241 ? ASP B 246 ? 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