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RRR DG 1 RRR DDG 13 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 'Local NCS retraints between domains: 1 2' 2 'Local NCS retraints between domains: 3 4' 3 'Local NCS retraints between domains: 5 6' 4 'Local NCS retraints between domains: 7 8' 5 'Local NCS retraints between domains: 9 10' 6 'Local NCS retraints between domains: 11 12' 7 'Local NCS retraints between domains: 13 14' 8 'Local NCS retraints between domains: 15 16' 9 'Local NCS retraints between domains: 17 18' 10 'Local NCS retraints between domains: 19 20' 11 'Local NCS retraints between domains: 21 22' 12 'Local NCS retraints between domains: 23 24' 13 'Local NCS retraints between domains: 25 26' 14 'Local NCS retraints between domains: 27 28' 15 'Local NCS retraints between domains: 29 30' 16 'Local NCS retraints between domains: 31 32' 17 'Local NCS retraints between domains: 33 34' 18 'Local NCS retraints between domains: 35 36' 19 'Local NCS retraints between domains: 37 38' 20 'Local NCS retraints between domains: 39 40' 21 'Local NCS retraints between domains: 41 42' 22 'Local NCS retraints between domains: 43 44' 23 'Local NCS retraints between domains: 45 46' 24 'Local NCS retraints between domains: 47 48' 25 'Local NCS retraints between domains: 49 50' 26 'Local NCS retraints between domains: 51 52' 27 'Local NCS retraints between domains: 53 54' 28 'Local NCS retraints between domains: 55 56' 29 'Local NCS retraints between domains: 57 58' 30 'Local NCS retraints between domains: 59 60' 31 'Local NCS retraints between domains: 61 62' 32 'Local NCS retraints between domains: 63 64' 33 'Local NCS retraints between domains: 65 66' 34 'Local NCS retraints between domains: 67 68' 35 'Local NCS retraints between domains: 69 70' 36 'Local NCS retraints between domains: 71 72' 37 'Local NCS retraints between domains: 73 74' 38 'Local NCS retraints between domains: 75 76' 39 'Local NCS retraints between domains: 77 78' 40 'Local NCS retraints between domains: 79 80' 41 'Local NCS retraints between domains: 81 82' 42 'Local NCS retraints between domains: 83 84' 43 'Local NCS retraints between domains: 85 86' 44 'Local NCS retraints between domains: 87 88' 45 'Local NCS retraints between domains: 89 90' # _struct.entry_id 7ZX0 _struct.title 'Crystal structure of Pol theta polymerase domain in complex with compound 5' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ZX0 _struct_keywords.text 'DNA polymerase, protein-DNA complex, DNA repair, inhibitor, TRANSFERASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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UNP O75417 ARG 2306 deletion ? 276 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 3 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 4 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 5 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 6 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 6050 ? 1 MORE -26 ? 1 'SSA (A^2)' 29660 ? 2 'ABSA (A^2)' 5830 ? 2 MORE -26 ? 2 'SSA (A^2)' 29890 ? 3 'ABSA (A^2)' 5950 ? 3 MORE -24 ? 3 'SSA (A^2)' 29860 ? 4 'ABSA (A^2)' 6000 ? 4 MORE -25 ? 4 'SSA (A^2)' 29640 ? 5 'ABSA (A^2)' 5900 ? 5 MORE -25 ? 5 'SSA (A^2)' 29780 ? 6 'ABSA (A^2)' 5780 ? 6 MORE -25 ? 6 'SSA (A^2)' 29660 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,G,H,S,T,U,FA 2 1 B,I,J,V,W 3 1 C,K,L,X,Y 4 1 D,M,N,Z,AA 5 1 E,O,P,BA,CA 6 1 F,Q,R,DA,EA # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 none ? 2 2 none ? 3 3 none ? 4 4 none ? 5 5 none ? 6 6 none ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 14 ? 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AAA MG 2601 AAA DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? ? metalc4 metalc ? ? S MG . MG ? ? ? 1_555 T DG3 . O2B ? ? AAA MG 2601 AAA DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? metalc5 metalc ? ? S MG . MG ? ? ? 1_555 FA HOH . O ? ? AAA MG 2601 AAA HOH 2701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc6 metalc ? ? B ASP 466 OD2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? BBB ASP 2330 BBB MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc7 metalc ? ? B TYR 467 O ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? BBB TYR 2331 BBB MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? ? metalc8 metalc ? ? B ASP 676 OD2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? BBB ASP 2540 BBB MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? ? metalc9 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 W DG3 . O2G ? ? BBB MG 2601 BBB DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? ? metalc10 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 W DG3 . O2A ? ? BBB MG 2601 BBB DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? ? metalc11 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 W DG3 . O2B ? ? BBB MG 2601 BBB DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? ? metalc12 metalc ? ? 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DDD MG 2601 DDD DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? ? metalc21 metalc ? ? Z MG . MG ? ? ? 1_555 AA DG3 . O2B ? ? DDD MG 2601 DDD DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? metalc22 metalc ? ? Z MG . MG ? ? ? 1_555 AA DG3 . O2A ? ? DDD MG 2601 DDD DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? ? metalc23 metalc ? ? E ASP 466 OD2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? EEE ASP 2330 EEE MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc24 metalc ? ? E TYR 467 O ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? EEE TYR 2331 EEE MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.510 ? ? metalc25 metalc ? ? E ASP 676 OD2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? EEE ASP 2540 EEE MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? ? metalc26 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA DG3 . O2B ? ? EEE MG 2601 EEE DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? metalc27 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA DG3 . O2G ? ? EEE MG 2601 EEE DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? ? metalc28 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA DG3 . O2A ? ? EEE MG 2601 EEE DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? ? metalc29 metalc ? ? F ASP 466 OD2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? FFF ASP 2330 FFF MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc30 metalc ? ? F TYR 467 O ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? FFF TYR 2331 FFF MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? ? metalc31 metalc ? ? F ASP 676 OD2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? FFF ASP 2540 FFF MG 2601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? ? metalc32 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA DG3 . O2G ? ? FFF MG 2601 FFF DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.100 ? ? metalc33 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA DG3 . O2B ? ? FFF MG 2601 FFF DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? metalc34 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA DG3 . O2A ? ? FFF MG 2601 FFF DG3 2602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? ? hydrog1 hydrog ? ? G DC 4 N3 ? ? ? 1_555 H DDG 13 N1 ? ? GGG DC 5 HHH DDG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? G DC 4 N4 ? ? ? 1_555 H DDG 13 O6 ? ? GGG DC 5 HHH DDG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? G DC 4 O2 ? ? ? 1_555 H DDG 13 N2 ? ? GGG DC 5 HHH DDG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? G DA 5 N1 ? ? ? 1_555 H DT 12 N3 ? ? GGG DA 6 HHH DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? G DA 5 N6 ? ? ? 1_555 H DT 12 O4 ? ? GGG DA 6 HHH DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? G DA 6 N1 ? ? ? 1_555 H DT 11 N3 ? ? GGG DA 7 HHH DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? G DA 6 N6 ? ? ? 1_555 H DT 11 O4 ? ? GGG DA 7 HHH DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? G DT 7 N3 ? ? ? 1_555 H DA 10 N1 ? ? GGG DT 8 HHH DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? G DT 7 O4 ? ? ? 1_555 H DA 10 N6 ? ? GGG DT 8 HHH DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? G DG 8 N1 ? ? ? 1_555 H DC 9 N3 ? ? GGG DG 9 HHH DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? G DG 8 N2 ? ? ? 1_555 H DC 9 O2 ? ? GGG DG 9 HHH DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? G DG 8 O6 ? ? ? 1_555 H DC 9 N4 ? ? 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G DG 12 N2 ? ? ? 1_555 H DC 5 O2 ? ? GGG DG 13 HHH DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? G DG 12 O6 ? ? ? 1_555 H DC 5 N4 ? ? GGG DG 13 HHH DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? G DC 13 N3 ? ? ? 1_555 H DG 4 N1 ? ? GGG DC 14 HHH DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? G DC 13 N4 ? ? ? 1_555 H DG 4 O6 ? ? GGG DC 14 HHH DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? G DC 13 O2 ? ? ? 1_555 H DG 4 N2 ? ? GGG DC 14 HHH DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? G DC 14 N3 ? ? ? 1_555 H DG 3 N1 ? ? GGG DC 15 HHH DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? G DC 14 N4 ? ? ? 1_555 H DG 3 O6 ? ? GGG DC 15 HHH DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? G DC 14 O2 ? ? ? 1_555 H DG 3 N2 ? ? GGG DC 15 HHH DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? G DG 15 N1 ? ? ? 1_555 H DC 2 N3 ? ? GGG DG 16 HHH DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? 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DG "O3'" "HO3'" sing N N 211 DG "C2'" "C1'" sing N N 212 DG "C2'" "H2'" sing N N 213 DG "C2'" "H2''" sing N N 214 DG "C1'" N9 sing N N 215 DG "C1'" "H1'" sing N N 216 DG N9 C8 sing Y N 217 DG N9 C4 sing Y N 218 DG C8 N7 doub Y N 219 DG C8 H8 sing N N 220 DG N7 C5 sing Y N 221 DG C5 C6 sing N N 222 DG C5 C4 doub Y N 223 DG C6 O6 doub N N 224 DG C6 N1 sing N N 225 DG N1 C2 sing N N 226 DG N1 H1 sing N N 227 DG C2 N2 sing N N 228 DG C2 N3 doub N N 229 DG N2 H21 sing N N 230 DG N2 H22 sing N N 231 DG N3 C4 sing N N 232 DG3 PG O1G doub N N 233 DG3 PG O2G sing N N 234 DG3 PG O3G sing N N 235 DG3 PG O3B sing N N 236 DG3 O2G HOG2 sing N N 237 DG3 O3G HOG3 sing N N 238 DG3 O3B PB sing N N 239 DG3 PB O1B doub N N 240 DG3 PB O2B sing N N 241 DG3 PB O3A sing N N 242 DG3 O2B HOB2 sing N N 243 DG3 O3A PA sing N N 244 DG3 PA O1A doub N N 245 DG3 PA O2A sing N N 246 DG3 PA "O5'" sing N N 247 DG3 O2A HOA2 sing N N 248 DG3 "O5'" "C5'" sing N N 249 DG3 "C5'" "C4'" sing N N 250 DG3 "C5'" "H5'1" sing N N 251 DG3 "C5'" "H5'2" sing N N 252 DG3 "C4'" "O4'" sing N N 253 DG3 "C4'" "C3'" sing N N 254 DG3 "C4'" "H4'" sing N N 255 DG3 "O4'" "C1'" sing N N 256 DG3 "C3'" "C2'" sing N N 257 DG3 "C3'" "H3'1" sing N N 258 DG3 "C3'" "H3'2" sing N N 259 DG3 "C2'" "C1'" sing N N 260 DG3 "C2'" "H2'1" sing N N 261 DG3 "C2'" "H2'2" sing N N 262 DG3 "C1'" N9 sing N N 263 DG3 "C1'" "H1'" sing N N 264 DG3 N9 C8 sing Y N 265 DG3 N9 C4 sing Y N 266 DG3 C8 N7 doub Y N 267 DG3 C8 H8 sing N N 268 DG3 N7 C5 sing Y N 269 DG3 C5 C6 sing N N 270 DG3 C5 C4 doub Y N 271 DG3 C6 O6 doub N N 272 DG3 C6 N1 sing N N 273 DG3 N1 C2 sing N N 274 DG3 N1 HN1 sing N N 275 DG3 C2 N2 sing N N 276 DG3 C2 N3 doub N N 277 DG3 N2 HN21 sing N N 278 DG3 N2 HN22 sing N N 279 DG3 N3 C4 sing N N 280 DT OP3 P sing N N 281 DT OP3 HOP3 sing N N 282 DT P OP1 doub N N 283 DT P OP2 sing N N 284 DT P "O5'" sing N N 285 DT OP2 HOP2 sing N N 286 DT "O5'" "C5'" sing N N 287 DT "C5'" "C4'" sing N N 288 DT "C5'" "H5'" sing N N 289 DT "C5'" "H5''" sing 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