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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.4504 ? 78120 ? f_dihedral_angle_d ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 5.42378406092e-13 ? ? 1 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ? ? 5.14459531279e-13 ? ? 2 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ? ? 9.94385704295e-13 ? ? 3 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ? ? 7.12674159341e-13 ? ? 4 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ? ? 1.06920963498e-12 ? ? 5 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_7 ? ? 5.12849201459e-13 ? ? 6 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_8 ? ? 4.60623853947e-13 ? ? 7 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_9 ? ? 8.82482387441e-13 ? ? 8 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_10 ? ? 6.71502811357e-11 ? ? 9 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_11 ? ? 9.70930477722e-13 ? ? 10 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_12 ? ? 4.44640257621e-10 ? ? 11 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_13 ? ? 1.98720652292e-12 ? ? 12 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_14 ? ? 9.85872360248e-13 ? ? 13 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_15 ? ? 8.48814810096e-13 ? ? 14 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_16 ? ? 6.89846556024e-13 ? ? 15 'NCS constraints' ? 1A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_17 ? ? 1.24309638389e-11 ? ? 16 'NCS constraints' ? 1A ? ? 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AB . n # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email beme@nmr.phys.chem.ethz.ch _pdbx_contact_author.name_first Beat _pdbx_contact_author.name_last Meier _pdbx_contact_author.name_mi H. _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-9107-4464 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 180-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 180 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2023-04-05 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _software.citation_id _software.classification _software.compiler_name _software.compiler_version _software.contact_author _software.contact_author_email _software.date _software.description _software.dependencies _software.hardware _software.language _software.location _software.mods _software.name _software.os _software.os_version _software.type _software.version _software.pdbx_ordinal ? refinement ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? phenix.real_space_refine ? ? ? 1.20.1_4487 1 ? refinement ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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The capsid was refined with phenix and Isolde. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' # _em_3d_reconstruction.entry_id 8AAC _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.7 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 70868 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.name 'African cichlid nackednavirus' _em_entity_assembly.details ? 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