data_8ABD # _entry.id 8ABD # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.362 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8ABD pdb_00008abd 10.2210/pdb8abd/pdb WWPDB D_1292123133 ? ? BMRB 34740 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type BMRB 'Solution structure of Phen-DC3 intercalating into a quadruplex-duplex hybrid' 34740 unspecified PDB . 8ABN unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.entry_id 8ABD _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-07-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Vianney, Y.M.' 1 0000-0002-4576-9935 'Weisz, K.' 2 0000-0002-2736-6606 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nucleic Acids Res.' _citation.journal_id_ASTM NARHAD _citation.journal_id_CSD 0389 _citation.journal_id_ISSN 1362-4962 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 50 _citation.language ? _citation.page_first 11948 _citation.page_last 11964 _citation.title 'High-affinity binding at quadruplex-duplex junctions: rather the rule than the exception.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/nar/gkac1088 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36416262 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Vianney, Y.M.' 1 ? primary 'Weisz, K.' 2 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn 'DNA (36-MER)' 11210.249 1 ? ? ? ? 2 non-polymer syn 'N2,N9-bis(1-methylquinolin-3-yl)-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide' 550.609 1 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer yes _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(THM)(DT)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DC) (DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can XTAGGTGGGTAGGGTGGGCTAGTCATTTTGACTAGG _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 THM n 1 2 DT n 1 3 DA n 1 4 DG n 1 5 DG n 1 6 DT n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DG n 1 10 DT n 1 11 DA n 1 12 DG n 1 13 DG n 1 14 DG n 1 15 DT n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DG n 1 19 DC n 1 20 DT n 1 21 DA n 1 22 DG n 1 23 DT n 1 24 DC n 1 25 DA n 1 26 DT n 1 27 DT n 1 28 DT n 1 29 DT n 1 30 DG n 1 31 DA n 1 32 DC n 1 33 DT n 1 34 DA n 1 35 DG n 1 36 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 36 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 8ABD _struct_ref.pdbx_db_accession 8ABD _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 8ABD _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 36 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 8ABD _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 36 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 36 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 PQ3 non-polymer . 'N2,N9-bis(1-methylquinolin-3-yl)-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide' Phen-DC3 'C34 H26 N6 O2' 550.609 THM 'DNA OH 5 prime terminus' . THYMIDINE ;DEOXYTHYMIDINE; 2'-DEOXYTHYMIDINE ; 'C10 H14 N2 O5' 242.229 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 2 1 1 '2D 1H-1H COSY' 1 isotropic 3 1 1 '2D 1H-13C HSQC' 1 isotropic # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 303 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.contents '0.5 mM no DNA (37-MER), 90% H2O/10% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '90% H2O/10% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.label PDC3-QD3sbl _pdbx_nmr_sample_details.type solution _pdbx_nmr_sample_details.details '10 mM potassium phosphate buffer pH 7.0' # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model 'AVANCE NEO' _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # _pdbx_nmr_refine.entry_id 8ABD _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 8ABD _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 8ABD _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 refinement Amber 18 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 2 'structure calculation' 'X-PLOR NIH' 3.0.3 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 3 'chemical shift assignment' 'CcpNmr Analysis' 2.4.2 CCPN 4 'data analysis' TopSpin 4.0.7 'Bruker Biospin' 5 'peak picking' 'CcpNmr Analysis' 2.4.2 CCPN # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8ABD _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8ABD _struct.title 'Solution structure of Phen-DC3 intercalating into a quadruplex-duplex hybrid' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8ABD _struct_keywords.text 'G-quadruplex, Duplex, Quadruplex-Duplex Junction, Intercalation, Phen-DC3, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? A THM 1 "O3'" ? ? ? 1_555 A DT 2 P ? ? A THM 1 A DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DT 2 O4 ? ? ? 1_555 A DG 12 N2 ? ? A DT 2 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DA 3 N6 ? ? ? 1_555 A DG 16 O6 ? ? A DA 3 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_9_PAIR ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DA 3 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A DA 3 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_9_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 4 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 4 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N2 ? ? A DG 4 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A DG 4 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 5 N1 ? ? ? 1_555 A DG 8 O6 ? ? A DG 5 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 5 N2 ? ? ? 1_555 A DG 8 N7 ? ? A DG 5 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 5 N7 ? ? ? 1_555 A DG 17 N2 ? ? A DG 5 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 5 O6 ? ? ? 1_555 A DG 17 N1 ? ? A DG 5 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 A DG 12 O6 ? ? A DG 7 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 A DG 12 N7 ? ? A DG 7 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 13 O6 ? ? A DG 8 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 13 N7 ? ? A DG 8 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 9 N1 ? ? ? 1_555 A DG 14 O6 ? ? A DG 9 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 9 N2 ? ? ? 1_555 A DG 14 N7 ? ? A DG 9 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 9 N7 ? ? ? 1_555 A DG 36 N2 ? ? A DG 9 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 9 O6 ? ? ? 1_555 A DG 36 N1 ? ? A DG 9 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 A DG 16 O6 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 A DG 16 N7 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 13 N1 ? ? ? 1_555 A DG 17 O6 ? ? A DG 13 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 13 N2 ? ? ? 1_555 A DG 17 N7 ? ? A DG 13 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 14 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 14 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 18 N1 ? ? ? 1_555 A DG 36 O6 ? ? A DG 18 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 18 N2 ? ? ? 1_555 A DG 36 N7 ? ? A DG 18 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DC 19 N3 ? ? ? 1_555 A DG 35 N1 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DC 19 N4 ? ? ? 1_555 A DG 35 O6 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DC 19 O2 ? ? ? 1_555 A DG 35 N2 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DT 20 N3 ? ? ? 1_555 A DA 34 N1 ? ? A DT 20 A DA 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DT 20 O4 ? ? ? 1_555 A DA 34 N6 ? ? A DT 20 A DA 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DA 21 N1 ? ? ? 1_555 A DT 33 N3 ? ? A DA 21 A DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DA 21 N6 ? ? ? 1_555 A DT 33 O4 ? ? A DA 21 A DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DG 22 N1 ? ? ? 1_555 A DC 32 N3 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DG 22 N2 ? ? ? 1_555 A DC 32 O2 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DG 22 O6 ? ? ? 1_555 A DC 32 N4 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DT 23 N3 ? ? ? 1_555 A DA 31 N1 ? ? A DT 23 A DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DT 23 O4 ? ? ? 1_555 A DA 31 N6 ? ? A DT 23 A DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DC 24 N3 ? ? ? 1_555 A DG 30 N1 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DC 24 N4 ? ? ? 1_555 A DG 30 O6 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DC 24 O2 ? ? ? 1_555 A DG 30 N2 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DA 25 N1 ? ? ? 1_555 A DT 29 N3 ? ? A DA 25 A DT 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A DA 25 N6 ? ? ? 1_555 A DT 29 O4 ? ? A DA 25 A DT 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # _atom_sites.entry_id 8ABD _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 THM 1 1 1 THM DT5 A . n A 1 2 DT 2 2 2 DT DT A . n A 1 3 DA 3 3 3 DA DA A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DG 5 5 5 DG DG A . n A 1 6 DT 6 6 6 DT DT A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DG 9 9 9 DG DG A . n A 1 10 DT 10 10 10 DT DT A . n A 1 11 DA 11 11 11 DA DA A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DG 13 13 13 DG DG A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n A 1 15 DT 15 15 15 DT DT A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC DC A . n A 1 20 DT 20 20 20 DT DT A . n A 1 21 DA 21 21 21 DA DA A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n A 1 23 DT 23 23 23 DT DT A . n A 1 24 DC 24 24 24 DC DC A . n A 1 25 DA 25 25 25 DA DA A . n A 1 26 DT 26 26 26 DT DT A . n A 1 27 DT 27 27 27 DT DT A . n A 1 28 DT 28 28 28 DT DT A . n A 1 29 DT 29 29 29 DT DT A . n A 1 30 DG 30 30 30 DG DG A . n A 1 31 DA 31 31 31 DA DA A . n A 1 32 DC 32 32 32 DC DC A . n A 1 33 DT 33 33 33 DT DT A . n A 1 34 DA 34 34 34 DA DA A . n A 1 35 DG 35 35 35 DG DG A . n A 1 36 DG 36 36 36 DG DG3 A . n # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email weisz@uni-greifswald.de _pdbx_contact_author.name_first Klaus _pdbx_contact_author.name_last Weisz _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-2736-6606 # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id B _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 2 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id PQ3 _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 101 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 37 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id PQ3 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id LIG _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id A _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 330 ? 1 MORE 3 ? 1 'SSA (A^2)' 6810 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2022-11-02 2 'Structure model' 1 1 2022-12-07 3 'Structure model' 1 2 2022-12-14 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 3 'Structure model' citation_author # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 2 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 3 2 'Structure model' '_citation.title' 4 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 5 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 6 3 'Structure model' '_citation.page_first' 7 3 'Structure model' '_citation.page_last' 8 3 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' # _pdbx_entry_details.entry_id 8ABD _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y # _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample.component 'DNA (37-MER)' _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration 0.5 _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range ? _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling no # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 2 1 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 3 1 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 4 1 "C3'" A DG 5 ? ? "O3'" A DG 5 ? ? P A DT 6 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 5 1 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 113.09 108.30 4.79 0.30 N 6 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.61 108.30 3.31 0.30 N 7 1 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 8 1 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 9 1 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 10 1 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 11 1 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 12 1 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 13 1 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 14 1 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.14 118.60 -5.46 0.60 N 15 1 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 16 1 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 17 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 18 1 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.31 121.90 -5.59 0.70 N 19 1 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 20 1 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 21 1 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 22 1 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 23 1 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.72 118.60 -4.88 0.60 N 24 1 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 25 1 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.25 108.30 2.95 0.30 N 26 1 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 27 1 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.39 121.90 -5.51 0.70 N 28 1 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 29 1 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 30 1 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.61 118.60 -4.99 0.60 N 31 1 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.06 108.30 3.76 0.30 N 32 1 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 33 1 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.82 108.30 3.52 0.30 N 34 1 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 35 1 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 36 1 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 37 1 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 38 1 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 39 1 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 40 1 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 41 1 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.65 121.90 -5.25 0.70 N 42 1 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 43 1 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 44 1 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 45 1 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 46 1 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 114.11 108.30 5.81 0.30 N 47 2 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 48 2 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 49 2 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 50 2 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 51 2 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 111.68 118.60 -6.92 0.60 N 52 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 53 2 "C3'" A DG 4 ? ? "O3'" A DG 4 ? ? P A DG 5 ? ? 126.90 119.70 7.20 1.20 Y 54 2 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 55 2 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 56 2 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 57 2 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 58 2 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 59 2 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 60 2 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 61 2 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 62 2 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 63 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 64 2 "C3'" A DG 12 ? ? "O3'" A DG 12 ? ? P A DG 13 ? ? 127.03 119.70 7.33 1.20 Y 65 2 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 66 2 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 67 2 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.03 122.90 -3.87 0.60 N 68 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 69 2 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 70 2 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.52 121.90 -5.38 0.70 N 71 2 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 72 2 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 118.20 122.90 -4.70 0.60 N 73 2 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 74 2 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.10 117.70 3.40 0.50 N 75 2 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 114.11 118.60 -4.49 0.60 N 76 2 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 77 2 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 78 2 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 79 2 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.67 118.60 -4.93 0.60 N 80 2 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.85 108.30 4.55 0.30 N 81 2 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 82 2 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 83 2 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 118.68 122.90 -4.22 0.60 N 84 2 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 118.80 122.90 -4.10 0.60 N 85 2 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 112.45 108.30 4.15 0.30 N 86 2 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.44 108.30 3.14 0.30 N 87 2 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 88 2 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 89 2 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.53 118.60 -5.07 0.60 N 90 2 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 91 2 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.53 121.90 -5.37 0.70 N 92 2 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 93 2 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 94 2 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.68 118.60 -4.92 0.60 N 95 2 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 96 3 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 114.89 108.30 6.59 0.30 N 97 3 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 98 3 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 99 3 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.36 118.60 -6.24 0.60 N 100 3 "C3'" A DG 4 ? ? "O3'" A DG 4 ? ? P A DG 5 ? ? 127.44 119.70 7.74 1.20 Y 101 3 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 102 3 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 118.74 122.90 -4.16 0.60 N 103 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.98 108.30 2.68 0.30 N 104 3 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 105 3 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 118.86 122.90 -4.04 0.60 N 106 3 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 107 3 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.40 117.00 -3.60 0.50 N 108 3 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 109 3 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.78 118.60 -5.82 0.60 N 110 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 111 3 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 112 3 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 113 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 114 3 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 115 3 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 112.56 108.30 4.26 0.30 N 116 3 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.12 122.90 -3.78 0.60 N 117 3 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 118 3 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 119 3 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 120 3 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.69 118.60 -4.91 0.60 N 121 3 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 122 3 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 123 3 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.95 117.00 -3.05 0.50 N 124 3 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 125 3 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 114.09 118.60 -4.51 0.60 N 126 3 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 127 3 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 118.17 122.90 -4.73 0.60 N 128 3 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 114.97 108.30 6.67 0.30 N 129 3 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 130 3 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 118.86 122.90 -4.04 0.60 N 131 3 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 132 3 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 133 3 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 134 3 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.51 118.60 -5.09 0.60 N 135 3 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 136 3 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 137 3 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 138 3 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.13 118.60 -5.47 0.60 N 139 3 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 140 4 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 141 4 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 142 4 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 143 4 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 144 4 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.56 118.60 -6.04 0.60 N 145 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 146 4 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 147 4 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 148 4 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 149 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 150 4 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.73 108.30 3.43 0.30 N 151 4 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 152 4 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 153 4 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 154 4 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 155 4 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 156 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 157 4 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 158 4 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 159 4 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 160 4 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 113.19 108.30 4.89 0.30 N 161 4 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 162 4 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 163 4 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 164 4 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.74 118.60 -4.86 0.60 N 165 4 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 166 4 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 167 4 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.65 118.90 3.75 0.60 N 168 4 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.45 121.90 -5.45 0.70 N 169 4 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 170 4 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.55 117.70 3.85 0.50 N 171 4 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.99 118.60 -4.61 0.60 N 172 4 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 113.78 108.30 5.48 0.30 N 173 4 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 174 4 "C3'" A DT 27 ? ? "O3'" A DT 27 ? ? P A DT 28 ? ? 127.10 119.70 7.40 1.20 Y 175 4 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 176 4 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 177 4 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N 178 4 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 179 4 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 180 4 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 181 4 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 182 4 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 183 4 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 184 4 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 185 4 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 186 5 N3 A DT 2 ? ? C2 A DT 2 ? ? O2 A DT 2 ? ? 118.54 122.30 -3.76 0.60 N 187 5 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 118.16 122.90 -4.74 0.60 N 188 5 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 113.69 108.30 5.39 0.30 N 189 5 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 190 5 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 191 5 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.09 118.60 -5.51 0.60 N 192 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 193 5 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 194 5 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 114.17 108.30 5.87 0.30 N 195 5 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 196 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 197 5 "C3'" A DG 7 ? ? "O3'" A DG 7 ? ? P A DG 8 ? ? 127.72 119.70 8.02 1.20 Y 198 5 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 199 5 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 200 5 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 201 5 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 202 5 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.04 118.60 -5.56 0.60 N 203 5 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 204 5 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 205 5 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 206 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 207 5 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.31 121.90 -5.59 0.70 N 208 5 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 209 5 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 210 5 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 211 5 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.59 118.60 -5.01 0.60 N 212 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 213 5 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 214 5 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.57 118.90 3.67 0.60 N 215 5 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.70 N 216 5 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 217 5 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 218 5 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 219 5 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.28 118.60 -5.32 0.60 N 220 5 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 221 5 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 222 5 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 223 5 "C3'" A DT 27 ? ? "O3'" A DT 27 ? ? P A DT 28 ? ? 127.07 119.70 7.37 1.20 Y 224 5 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 225 5 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 226 5 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.17 108.30 3.87 0.30 N 227 5 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 228 5 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 229 5 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 230 5 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.53 118.90 3.63 0.60 N 231 5 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 232 5 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 233 5 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 234 5 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.78 118.60 -4.82 0.60 N 235 5 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 236 5 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 237 6 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 115.28 108.30 6.98 0.30 N 238 6 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 239 6 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.57 117.70 3.87 0.50 N 240 6 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.03 118.60 -6.57 0.60 N 241 6 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 242 6 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 243 6 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 244 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 245 6 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 246 6 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 247 6 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 248 6 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.58 117.70 3.88 0.50 N 249 6 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 250 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 251 6 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 252 6 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 253 6 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 254 6 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 255 6 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 256 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 257 6 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 258 6 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 259 6 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 260 6 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 261 6 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 262 6 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.37 118.60 -5.23 0.60 N 263 6 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 264 6 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 265 6 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.58 118.90 3.68 0.60 N 266 6 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.39 121.90 -5.51 0.70 N 267 6 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 111.12 108.30 2.82 0.30 N 268 6 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 269 6 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 270 6 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.20 118.60 -5.40 0.60 N 271 6 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 272 6 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 273 6 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 274 6 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 118.56 122.90 -4.34 0.60 N 275 6 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 276 6 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 277 6 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.08 108.30 3.78 0.30 N 278 6 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 279 6 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 280 6 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 281 6 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.54 121.90 -5.36 0.70 N 282 6 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 283 6 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 284 6 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.40 118.60 -5.20 0.60 N 285 6 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 286 7 N3 A DT 2 ? ? C2 A DT 2 ? ? O2 A DT 2 ? ? 118.53 122.30 -3.77 0.60 N 287 7 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 288 7 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.67 108.30 4.37 0.30 N 289 7 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 290 7 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 291 7 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 292 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 293 7 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.71 108.30 2.41 0.30 N 294 7 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 295 7 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 296 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 297 7 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 298 7 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.53 108.30 2.23 0.30 N 299 7 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 300 7 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.69 108.30 3.39 0.30 N 301 7 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 302 7 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 303 7 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 304 7 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 305 7 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 306 7 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.54 121.90 -5.36 0.70 N 307 7 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 113.44 108.30 5.14 0.30 N 308 7 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 309 7 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 310 7 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.76 118.60 -4.84 0.60 N 311 7 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N 312 7 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 313 7 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.64 118.90 3.74 0.60 N 314 7 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.40 121.90 -5.50 0.70 N 315 7 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 316 7 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 317 7 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 318 7 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 319 7 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 320 7 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 321 7 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 322 7 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 323 7 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 324 7 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 325 7 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.68 108.30 4.38 0.30 N 326 7 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 327 7 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 328 7 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 329 7 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 330 7 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 331 7 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 332 7 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.59 118.60 -5.01 0.60 N 333 7 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 334 8 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 335 8 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 336 8 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 337 8 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.28 118.60 -6.32 0.60 N 338 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 339 8 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 340 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 341 8 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 342 8 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 343 8 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 344 8 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 345 8 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 346 8 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 114.07 118.60 -4.53 0.60 N 347 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 348 8 "C3'" A DG 12 ? ? "O3'" A DG 12 ? ? P A DG 13 ? ? 128.16 119.70 8.46 1.20 Y 349 8 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.67 122.30 -3.63 0.60 N 350 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 351 8 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.50 121.90 -5.40 0.70 N 352 8 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 113.74 108.30 5.44 0.30 N 353 8 N3 A DT 20 ? ? C2 A DT 20 ? ? O2 A DT 20 ? ? 118.65 122.30 -3.65 0.60 N 354 8 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.95 117.00 -3.05 0.50 N 355 8 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 356 8 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 357 8 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 358 8 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 359 8 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.62 118.90 3.72 0.60 N 360 8 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.70 N 361 8 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 362 8 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 363 8 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 364 8 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 365 8 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 118.71 122.90 -4.19 0.60 N 366 8 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 367 8 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 368 8 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 369 8 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 113.07 108.30 4.77 0.30 N 370 8 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 371 8 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 372 8 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.40 118.60 -5.20 0.60 N 373 8 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.52 118.90 3.62 0.60 N 374 8 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.56 121.90 -5.34 0.70 N 375 8 C6 A DT 33 ? ? C5 A DT 33 ? ? C7 A DT 33 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 376 8 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.93 117.00 -3.07 0.50 N 377 8 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 378 8 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.44 118.60 -5.16 0.60 N 379 9 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 114.43 108.30 6.13 0.30 N 380 9 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 381 9 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 382 9 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.28 118.60 -5.32 0.60 N 383 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 384 9 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 385 9 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 386 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 387 9 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 388 9 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 389 9 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 390 9 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 391 9 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 392 9 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 393 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 394 9 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 395 9 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 396 9 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 397 9 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 398 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 399 9 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 400 9 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 401 9 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 112.78 108.30 4.48 0.30 N 402 9 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 403 9 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 404 9 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.73 118.60 -4.87 0.60 N 405 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 406 9 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N 407 9 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 408 9 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 409 9 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 410 9 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.22 118.60 -5.38 0.60 N 411 9 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 412 9 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 413 9 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 414 9 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 415 9 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 416 9 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 417 9 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 418 9 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 419 9 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 420 9 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.62 118.60 -4.98 0.60 N 421 9 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.67 121.90 -5.23 0.70 N 422 9 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 423 9 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 424 9 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.22 118.60 -5.38 0.60 N 425 9 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 426 10 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 114.44 108.30 6.14 0.30 N 427 10 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 428 10 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 429 10 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.67 117.70 3.97 0.50 N 430 10 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 111.89 118.60 -6.71 0.60 N 431 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 432 10 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 433 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 434 10 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 435 10 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 436 10 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 118.43 122.90 -4.47 0.60 N 437 10 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 438 10 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 439 10 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 440 10 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.10 118.60 -5.50 0.60 N 441 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 442 10 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 443 10 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 444 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 445 10 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.36 108.30 4.06 0.30 N 446 10 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.34 121.90 -5.56 0.70 N 447 10 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 448 10 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 449 10 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 450 10 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.70 118.60 -4.90 0.60 N 451 10 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 452 10 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 453 10 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 454 10 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 455 10 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 456 10 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 457 10 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.19 118.60 -5.41 0.60 N 458 10 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.19 108.30 3.89 0.30 N 459 10 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 460 10 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 461 10 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 462 10 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 463 10 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 464 10 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.48 108.30 4.18 0.30 N 465 10 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 466 10 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 467 10 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.40 118.60 -5.20 0.60 N 468 10 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 469 10 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 470 10 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 471 10 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.73 118.60 -4.87 0.60 N 472 10 "O4'" A DG 35 ? ? "C1'" A DG 35 ? ? N9 A DG 35 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 473 10 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DT A 23 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 2 1 DA A 25 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 3 2 DG A 4 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 4 2 DG A 18 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 5 2 DT A 26 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 6 3 DT A 2 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 7 3 DT A 33 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 8 4 DG A 4 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 9 4 DG A 7 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 10 4 DA A 25 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 11 4 DT A 29 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 12 5 DT A 2 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 13 5 DT A 23 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 14 5 DA A 25 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 15 5 DT A 33 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 16 6 DT A 2 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 17 6 DT A 23 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 18 6 DT A 33 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 19 6 DG A 36 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 20 7 DT A 2 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 21 7 DA A 25 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 22 7 DG A 36 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 23 8 DG A 4 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 24 8 DG A 7 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 25 8 DT A 15 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 26 8 DT A 23 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 27 8 DG A 36 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 28 9 DG A 4 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 29 9 DG A 7 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 30 9 DT A 26 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 31 9 DG A 36 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 32 10 DT A 33 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8ABD 'b-form double helix' 8ABD 'z-form double helix' 8ABD 'hairpin loop' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DG 9 1_555 A DG 36 1_555 1.904 -3.149 -0.446 0.006 -5.287 -92.165 1 A_DG9:DG36_A A 9 ? A 36 ? 6 3 1 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 -1.959 3.240 -0.081 5.427 -4.491 88.711 2 A_DG14:DG18_A A 14 ? A 18 ? 6 3 1 A DG 17 1_555 A DG 13 1_555 1.825 -3.301 0.066 -3.379 6.493 -90.524 3 A_DG17:DG13_A A 17 ? A 13 ? 6 3 1 A DG 4 1_555 A DG 7 1_555 -1.945 3.209 0.204 3.824 9.536 89.590 4 A_DG4:DG7_A A 4 ? A 7 ? 6 3 1 A DG 16 1_555 A DG 12 1_555 1.831 -3.435 -0.050 5.674 10.013 -88.230 5 A_DG16:DG12_A A 16 ? A 12 ? 6 3 1 A DC 19 1_555 A DG 35 1_555 0.236 -0.071 0.163 -3.910 -2.129 -0.930 6 A_DC19:DG35_A A 19 ? A 35 ? 19 1 1 A DT 20 1_555 A DA 34 1_555 -0.127 0.013 0.062 3.016 -3.151 1.858 7 A_DT20:DA34_A A 20 ? A 34 ? 20 1 1 A DA 21 1_555 A DT 33 1_555 0.195 0.000 0.097 5.908 -13.721 -1.225 8 A_DA21:DT33_A A 21 ? A 33 ? 20 1 1 A DG 22 1_555 A DC 32 1_555 -0.389 -0.105 0.020 -6.855 -10.031 -0.441 9 A_DG22:DC32_A A 22 ? A 32 ? 19 1 1 A DT 23 1_555 A DA 31 1_555 -0.207 0.026 0.063 -5.846 -6.788 -0.030 10 A_DT23:DA31_A A 23 ? A 31 ? 20 1 1 A DC 24 1_555 A DG 30 1_555 0.368 -0.118 -0.230 2.785 4.678 -1.403 11 A_DC24:DG30_A A 24 ? A 30 ? 19 1 1 A DA 25 1_555 A DT 29 1_555 0.268 0.055 -0.063 20.746 2.421 0.043 12 A_DA25:DT29_A A 25 ? A 29 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DG 9 1_555 A DG 36 1_555 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 1.819 -3.301 0.511 0.987 1.847 -179.815 1.650 0.909 0.511 -0.923 0.494 -179.815 1 AA_DG9DG14:DG18DG36_AA A 9 ? A 36 ? A 14 ? A 18 ? 1 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 A DG 17 1_555 A DG 13 1_555 -0.916 0.626 3.233 2.981 -3.844 25.565 2.403 2.819 2.983 -8.588 -6.660 26.016 2 AA_DG14DG17:DG13DG18_AA A 14 ? A 18 ? A 17 ? A 13 ? 1 A DG 17 1_555 A DG 13 1_555 A DG 4 1_555 A DG 7 1_555 2.030 -3.186 2.694 -8.616 -9.904 -153.296 1.665 1.018 2.664 5.088 -4.427 -153.474 3 AA_DG17DG4:DG7DG13_AA A 17 ? A 13 ? A 4 ? A 7 ? 1 A DG 4 1_555 A DG 7 1_555 A DG 16 1_555 A DG 12 1_555 1.849 -3.206 0.802 -10.777 -7.286 -178.137 1.603 0.924 0.801 3.644 -5.389 -178.149 4 AA_DG4DG16:DG12DG7_AA A 4 ? A 7 ? A 16 ? A 12 ? 1 A DC 19 1_555 A DG 35 1_555 A DT 20 1_555 A DA 34 1_555 0.155 0.153 3.228 0.282 2.489 20.845 -0.622 -0.306 3.226 6.847 -0.777 20.993 5 AA_DC19DT20:DA34DG35_AA A 19 ? A 35 ? A 20 ? A 34 ? 1 A DT 20 1_555 A DA 34 1_555 A DA 21 1_555 A DT 33 1_555 -0.241 0.798 3.298 -1.795 1.760 44.942 0.882 0.151 3.333 2.300 2.346 45.009 6 AA_DT20DA21:DT33DA34_AA A 20 ? A 34 ? A 21 ? A 33 ? 1 A DA 21 1_555 A DT 33 1_555 A DG 22 1_555 A DC 32 1_555 0.281 -1.417 3.607 -0.615 3.007 30.415 -3.333 -0.665 3.448 5.714 1.169 30.565 7 AA_DA21DG22:DC32DT33_AA A 21 ? A 33 ? A 22 ? A 32 ? 1 A DG 22 1_555 A DC 32 1_555 A DT 23 1_555 A DA 31 1_555 -0.269 -0.744 3.345 1.024 0.887 36.709 -1.304 0.569 3.318 1.408 -1.626 36.733 8 AA_DG22DT23:DA31DC32_AA A 22 ? A 32 ? A 23 ? A 31 ? 1 A DT 23 1_555 A DA 31 1_555 A DC 24 1_555 A DG 30 1_555 1.085 0.759 3.238 2.362 2.795 33.916 0.845 -1.472 3.354 4.775 -4.034 34.107 9 AA_DT23DC24:DG30DA31_AA A 23 ? A 31 ? A 24 ? A 30 ? 1 A DC 24 1_555 A DG 30 1_555 A DA 25 1_555 A DT 29 1_555 -0.729 0.350 3.061 -2.396 3.935 30.064 -0.082 0.934 3.128 7.530 4.584 30.407 10 AA_DC24DA25:DT29DG30_AA A 24 ? A 30 ? A 25 ? A 29 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'German Research Foundation (DFG)' _pdbx_audit_support.country Germany _pdbx_audit_support.grant_number 410497337 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id PQ3 _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id PQ3 _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name 'N2,N9-bis(1-methylquinolin-3-yl)-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id PQ3 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #