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THR D 592 ASN D 608 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 314 A . ? ASP 314 A PRO 315 A ? PRO 315 A 1 -4.36 2 ASP 314 B . ? ASP 314 B PRO 315 B ? PRO 315 B 1 -3.88 3 ASP 314 C . ? ASP 314 C PRO 315 C ? PRO 315 C 1 -1.49 4 ASP 314 D . ? ASP 314 D PRO 315 D ? PRO 315 D 1 9.32 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 123 ? GLU A 134 ? VAL A 123 GLU A 134 AA1 2 SER A 517 ? VAL A 529 ? SER A 517 VAL A 529 AA1 3 ASP A 237 ? ASN A 250 ? ASP A 237 ASN A 250 AA1 4 SER A 452 ? VAL A 455 ? SER A 452 VAL A 455 AA2 1 VAL A 123 ? GLU A 134 ? VAL A 123 GLU A 134 AA2 2 SER A 517 ? VAL A 529 ? SER A 517 VAL A 529 AA2 3 ASP A 237 ? ASN A 250 ? ASP A 237 ASN A 250 AA2 4 THR A 467 ? PRO A 468 ? THR A 467 PRO A 468 AA3 1 TRP A 211 ? ARG A 216 ? TRP A 211 ARG A 216 AA3 2 TYR A 164 ? ASN A 169 ? TYR A 164 ASN A 169 AA3 3 GLN A 149 ? SER A 156 ? GLN A 149 SER A 156 AA3 4 THR A 504 ? SER A 513 ? THR A 504 SER A 513 AA3 5 PHE A 259 ? TYR A 265 ? PHE A 259 TYR A 265 AA3 6 GLU A 442 ? LEU A 445 ? GLU A 442 LEU A 445 AA4 1 ILE A 270 ? ALA A 271 ? ILE A 270 ALA A 271 AA4 2 SER A 422 ? GLU A 423 ? SER A 422 GLU A 423 AA5 1 ILE A 318 ? SER A 321 ? ILE A 318 SER A 321 AA5 2 PHE A 325 ? ARG A 328 ? PHE A 325 ARG A 328 AA5 3 THR A 298 ? TRP A 301 ? THR A 298 TRP A 301 AA5 4 PHE A 286 ? ARG A 290 ? PHE A 286 ARG A 290 AA5 5 SER A 401 ? ILE A 406 ? SER A 401 ILE A 406 AA6 1 TYR A 341 ? THR A 342 ? TYR A 341 THR A 342 AA6 2 VAL A 368 ? THR A 374 ? VAL A 368 THR A 374 AA6 3 THR A 383 ? THR A 387 ? THR A 383 THR A 387 AA6 4 LEU A 393 ? LEU A 396 ? LEU A 393 LEU A 396 AA7 1 GLU A 358 ? GLY A 361 ? GLU A 358 GLY A 361 AA7 2 MET A 349 ? ASP A 353 ? MET A 349 ASP A 353 AA7 3 PHE A 408 ? ASN A 410 ? PHE A 408 ASN A 410 AA8 1 GLY A 473 ? ALA A 474 ? GLY A 473 ALA A 474 AA8 2 ARG A 495 ? ASP A 496 ? ARG A 495 ASP A 496 AA9 1 VAL B 123 ? ILE B 127 ? VAL B 123 ILE B 127 AA9 2 SER B 517 ? VAL B 529 ? SER B 517 VAL B 529 AA9 3 ASP B 237 ? ALA B 249 ? ASP B 237 ALA B 249 AA9 4 THR B 467 ? PRO B 468 ? THR B 467 PRO B 468 AB1 1 ILE B 130 ? GLU B 134 ? ILE B 130 GLU B 134 AB1 2 SER B 517 ? VAL B 529 ? SER B 517 VAL B 529 AB1 3 ASP B 237 ? ALA B 249 ? ASP B 237 ALA B 249 AB1 4 TYR B 453 ? VAL B 455 ? TYR B 453 VAL B 455 AB1 5 VAL B 564 ? TYR B 565 ? VAL B 564 TYR B 565 AB2 1 TRP B 211 ? VAL B 217 ? TRP B 211 VAL B 217 AB2 2 THR B 162 ? ASN B 169 ? THR B 162 ASN B 169 AB2 3 GLN B 149 ? SER B 156 ? GLN B 149 SER B 156 AB2 4 THR B 504 ? SER B 513 ? THR B 504 SER B 513 AB2 5 PHE B 259 ? TYR B 265 ? PHE B 259 TYR B 265 AB2 6 GLU B 442 ? LEU B 445 ? GLU B 442 LEU B 445 AB3 1 ILE B 270 ? GLN B 274 ? ILE B 270 GLN B 274 AB3 2 SER B 419 ? PRO B 425 ? SER B 419 PRO B 425 AB3 3 GLY B 473 ? THR B 478 ? GLY B 473 THR B 478 AB3 4 ILE B 494 ? ASP B 496 ? ILE B 494 ASP B 496 AB4 1 TRP B 317 ? SER B 321 ? TRP B 317 SER B 321 AB4 2 PHE B 325 ? HIS B 329 ? PHE B 325 HIS B 329 AB4 3 THR B 298 ? TRP B 301 ? THR B 298 TRP B 301 AB4 4 PHE B 286 ? ARG B 290 ? PHE B 286 ARG B 290 AB4 5 SER B 401 ? ILE B 406 ? SER B 401 ILE B 406 AB5 1 ILE B 339 ? THR B 342 ? ILE B 339 THR B 342 AB5 2 VAL B 368 ? GLY B 375 ? VAL B 368 GLY B 375 AB5 3 ALA B 382 ? THR B 387 ? ALA B 382 THR B 387 AB5 4 THR B 392 ? ALA B 397 ? THR B 392 ALA B 397 AB6 1 PHE B 352 ? ASP B 353 ? PHE B 352 ASP B 353 AB6 2 GLU B 358 ? TRP B 359 ? GLU B 358 TRP B 359 AB7 1 SER C 122 ? ASP C 124 ? SER C 122 ASP C 124 AB7 2 GLU C 527 ? VAL C 529 ? GLU C 527 VAL C 529 AB7 3 TYR C 238 ? ARG C 239 ? TYR C 238 ARG C 239 AB8 1 ILE C 130 ? GLU C 133 ? ILE C 130 GLU C 133 AB8 2 SER C 517 ? GLN C 524 ? SER C 517 GLN C 524 AB8 3 LYS C 243 ? ASN C 250 ? LYS C 243 ASN C 250 AB8 4 LEU C 454 ? VAL C 455 ? LEU C 454 VAL C 455 AB9 1 TRP C 211 ? VAL C 217 ? TRP C 211 VAL C 217 AB9 2 THR C 162 ? ASN C 169 ? THR C 162 ASN C 169 AB9 3 GLN C 149 ? SER C 156 ? GLN C 149 SER C 156 AB9 4 THR C 504 ? SER C 513 ? THR C 504 SER C 513 AB9 5 PHE C 259 ? TYR C 265 ? PHE C 259 TYR C 265 AB9 6 GLU C 442 ? LEU C 445 ? GLU C 442 LEU C 445 AC1 1 ILE C 270 ? ALA C 271 ? ILE C 270 ALA C 271 AC1 2 SER C 422 ? PRO C 425 ? SER C 422 PRO C 425 AC1 3 ILE C 475 ? THR C 478 ? ILE C 475 THR C 478 AC2 1 GLU C 278 ? GLY C 279 ? GLU C 278 GLY C 279 AC2 2 GLU C 414 ? THR C 415 ? GLU C 414 THR C 415 AC3 1 ILE C 318 ? PRO C 319 ? ILE C 318 PRO C 319 AC3 2 PHE C 325 ? ARG C 328 ? PHE C 325 ARG C 328 AC3 3 THR C 298 ? TRP C 301 ? THR C 298 TRP C 301 AC3 4 PHE C 286 ? THR C 289 ? PHE C 286 THR C 289 AC3 5 VAL C 405 ? ILE C 406 ? VAL C 405 ILE C 406 AC4 1 ILE C 339 ? THR C 342 ? ILE C 339 THR C 342 AC4 2 VAL C 368 ? GLY C 375 ? VAL C 368 GLY C 375 AC4 3 ALA C 382 ? THR C 387 ? ALA C 382 THR C 387 AC4 4 THR C 392 ? ALA C 397 ? THR C 392 ALA C 397 AC5 1 MET C 349 ? GLN C 350 ? MET C 349 GLN C 350 AC5 2 ARG C 409 ? ASN C 410 ? ARG C 409 ASN C 410 AC6 1 PHE C 352 ? ASP C 353 ? PHE C 352 ASP C 353 AC6 2 GLU C 358 ? TRP C 359 ? GLU C 358 TRP C 359 AC7 1 SER D 122 ? ILE D 127 ? SER D 122 ILE D 127 AC7 2 GLN D 524 ? VAL D 529 ? GLN D 524 VAL D 529 AC7 3 ASP D 237 ? TYR D 242 ? ASP D 237 TYR D 242 AC7 4 THR D 467 ? PRO D 468 ? THR D 467 PRO D 468 AC8 1 ILE D 130 ? GLU D 133 ? ILE D 130 GLU D 133 AC8 2 SER D 517 ? LYS D 521 ? SER D 517 LYS D 521 AC8 3 ILE D 245 ? ASN D 250 ? ILE D 245 ASN D 250 AC8 4 GLY D 451 ? LEU D 454 ? GLY D 451 LEU D 454 AC8 5 VAL D 564 ? GLY D 566 ? VAL D 564 GLY D 566 AC9 1 TRP D 211 ? VAL D 217 ? TRP D 211 VAL D 217 AC9 2 THR D 162 ? ASN D 169 ? THR D 162 ASN D 169 AC9 3 SER D 151 ? SER D 156 ? SER D 151 SER D 156 AC9 4 THR D 504 ? ARG D 510 ? THR D 504 ARG D 510 AC9 5 HIS D 264 ? TYR D 265 ? HIS D 264 TYR D 265 AD1 1 TRP D 211 ? VAL D 217 ? TRP D 211 VAL D 217 AD1 2 THR D 162 ? ASN D 169 ? THR D 162 ASN D 169 AD1 3 SER D 151 ? SER D 156 ? SER D 151 SER D 156 AD1 4 THR D 504 ? ARG D 510 ? THR D 504 ARG D 510 AD1 5 PHE D 259 ? ILE D 261 ? PHE D 259 ILE D 261 AD1 6 THR D 444 ? LEU D 445 ? THR D 444 LEU D 445 AD2 1 ILE D 270 ? THR D 273 ? ILE D 270 THR D 273 AD2 2 ASN D 420 ? VAL D 424 ? ASN D 420 VAL D 424 AD2 3 GLY D 473 ? PHE D 477 ? GLY D 473 PHE D 477 AD2 4 ARG D 495 ? ASP D 496 ? ARG D 495 ASP D 496 AD3 1 SER D 280 ? VAL D 283 ? SER D 280 VAL D 283 AD3 2 PHE D 408 ? ALA D 413 ? PHE D 408 ALA D 413 AD3 3 MET D 349 ? ASP D 353 ? MET D 349 ASP D 353 AD3 4 GLU D 358 ? TRP D 359 ? GLU D 358 TRP D 359 AD4 1 TRP D 317 ? PRO D 319 ? TRP D 317 PRO D 319 AD4 2 TRP D 327 ? HIS D 329 ? TRP D 327 HIS D 329 AD4 3 VAL D 297 ? TRP D 301 ? VAL D 297 TRP D 301 AD4 4 PHE D 286 ? THR D 289 ? PHE D 286 THR D 289 AD4 5 VAL D 405 ? ILE D 406 ? VAL D 405 ILE D 406 AD5 1 TYR D 341 ? THR D 342 ? TYR D 341 THR D 342 AD5 2 VAL D 368 ? THR D 374 ? VAL D 368 THR D 374 AD5 3 THR D 383 ? THR D 387 ? THR D 383 THR D 387 AD5 4 LEU D 393 ? LEU D 396 ? LEU D 393 LEU D 396 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N GLU A 133 ? 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_pdbx_audit_revision_details.details ? # _em_3d_fitting.entry_id 8ACH _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value 161 _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Correlation coefficient' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 8AC6 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8ACH _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ;Particles from an I1 icosahedral consensus map (EMD-15266) were symmetry expanded to C1 and further 3D classified without alignment using a soft mask covering the icosahedral asymmetric unit. The particles for this class were randomly split into half sets for the subsequent reconstruction and postprocessing steps. Note that the symmetry expansion step generates a 60-fold larger particle stack. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 96960 _em_3d_reconstruction.resolution 3.91 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details NULL _em_buffer.pH 5.6 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'expressed in Spodoptera frugiperda Sf21 cells' _em_entity_assembly.name 'Nudaurelia capensis omega virus' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 8ACH _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_magnification 75000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_virus_entity.entity_assembly_id 1 _em_virus_entity.empty NO _em_virus_entity.enveloped NO _em_virus_entity.virus_isolate OTHER _em_virus_entity.virus_type 'VIRUS-LIKE PARTICLE' _em_virus_entity.id 1 _em_virus_entity.virus_host_category ? _em_virus_entity.details ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 8ACH _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 8ACH _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8ACH _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG B SER 151 ? ? 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OG1 D THR 604 ? ? 2.19 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER A 142 ? ? -166.30 118.41 2 1 ARG A 161 ? ? -91.44 55.65 3 1 ALA A 191 ? ? 58.66 -107.17 4 1 THR A 253 ? ? 35.62 -129.33 5 1 LEU A 254 ? ? 40.95 -104.90 6 1 ASP A 320 ? ? -122.28 -51.58 7 1 ASP A 483 ? ? -68.55 73.06 8 1 ARG A 484 ? ? -82.17 47.08 9 1 ASN A 531 ? ? 63.25 -119.25 10 1 LEU B 231 ? ? 63.38 -70.93 11 1 GLN B 433 ? ? -96.64 30.67 12 1 LEU B 450 ? ? 57.87 17.27 13 1 ALA B 474 ? ? -69.83 94.35 14 1 ASN B 531 ? ? 61.94 -131.39 15 1 SER B 542 ? ? -62.78 -178.67 16 1 LEU B 544 ? ? -34.95 130.07 17 1 THR C 102 ? ? 71.94 -3.05 18 1 ALA C 105 ? ? 60.97 -136.67 19 1 PRO C 115 ? ? -79.30 45.72 20 1 LYS C 120 ? ? -125.84 -169.49 21 1 PRO C 136 ? ? -69.20 68.35 22 1 THR C 137 ? ? -68.02 1.45 23 1 LEU C 231 ? ? 70.75 -4.88 24 1 THR C 323 ? ? 75.75 -3.97 25 1 ASP C 487 ? ? 62.17 -126.91 26 1 PHE C 491 ? ? 58.84 -148.68 27 1 ASN C 533 ? ? 59.53 12.08 28 1 ALA D 107 ? ? -79.21 -169.24 29 1 PRO D 136 ? ? -69.41 80.78 30 1 ALA D 141 ? ? 54.81 -149.12 31 1 ILE D 143 ? ? -55.70 108.76 32 1 PRO D 158 ? ? -69.36 70.66 33 1 PHE D 160 ? ? -94.26 -60.33 34 1 TYR D 242 ? ? -171.34 143.40 35 1 ALA D 266 ? ? -92.90 52.17 36 1 ASN D 275 ? ? -136.85 -40.12 37 1 SER D 303 ? ? 75.53 -7.62 38 1 PRO D 306 ? ? -68.19 -176.47 39 1 SER D 312 ? ? 51.59 -101.28 40 1 ASP D 314 ? ? -162.94 82.25 41 1 THR D 323 ? ? 74.54 -5.80 42 1 PHE D 325 ? ? -98.44 36.64 43 1 THR D 336 ? ? -85.87 47.13 44 1 PRO D 428 ? ? -69.48 80.81 45 1 ASN D 438 ? ? -49.29 109.90 46 1 ILE D 441 ? ? 61.76 69.97 47 1 ASP D 487 ? ? 59.01 -127.45 48 1 PHE D 491 ? ? 59.71 -172.25 49 1 ASN D 533 ? ? 77.10 -13.91 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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The average of these two values is given. ; _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 16478 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? RELION 3.0.3 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf 1.06 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.14 ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot 0.9 ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0.3 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0.3 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION 3.0.3 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? 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