data_8AP7 # _entry.id 8AP7 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.361 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8AP7 pdb_00008ap7 10.2210/pdb8ap7/pdb WWPDB D_1292123093 ? ? EMDB EMD-15560 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'membrane region of the Trypanosoma brucei mitochondrial ATP synthase dimer' _pdbx_database_related.db_id EMD-15560 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8AP7 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-08-09 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Muehleip, A.' 1 ? 'Gahura, O.' 2 ? 'Zikova, A.' 3 ? 'Amunts, A.' 4 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 13 _citation.language ? _citation.page_first 5989 _citation.page_last 5989 _citation.title 'An ancestral interaction module promotes oligomerization in divergent mitochondrial ATP synthases.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-022-33588-z _citation.pdbx_database_id_PubMed 36220811 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Gahura, O.' 1 0000-0002-2925-4763 primary 'Muhleip, A.' 2 0000-0002-1877-2282 primary 'Hierro-Yap, C.' 3 ? primary 'Panicucci, B.' 4 ? primary 'Jain, M.' 5 ? primary 'Hollaus, D.' 6 0000-0001-7403-6434 primary 'Slapnickova, M.' 7 ? primary 'Zikova, A.' 8 0000-0002-8686-0225 primary 'Amunts, A.' 9 0000-0002-5302-1740 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8AP7 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8AP7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit a' 28708.406 2 ? ? ? ? 2 polymer nat subunit-8 13750.958 2 ? ? ? ? 3 polymer nat subunit-d 43379.324 2 ? ? ? ? 4 polymer nat ATPTB1 46883.637 2 ? ? ? ? 5 polymer nat subunit-f 17182.668 2 ? ? ? ? 6 polymer nat subunit-i/j 12661.607 2 ? ? ? ? 7 polymer nat ATPTB6 20307.389 2 ? ? ? ? 8 polymer nat subunit-k 14531.121 2 ? ? ? ? 9 polymer nat subunit-e 10448.932 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 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_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MFLFFFCDLFWLRLLLCMYYCVWSRLCFIVYFNCLMLIFDFLLFCLFDLYLFVGLCLFLLLWFMLFNLYSLILYYCITYL NLYLLFCIVFLLYIAFLFLFCFLCDFFLFNNLLVGDSFMDVFFIRFLLCFLECFSLLCRCLSTFLRLFCNLLSSHFLLLM FFDFFYFIFVFFFYGVFCYWFILFIFVFCFCLLFYVFLYLLDLFAAILQLFIFCNMILQLIMDFLLFLLFV ; ;MFLFFFCDLFWLRLLLCMYYCVWSRLCFIVYFNCLMLIFDFLLFCLFDLYLFVGLCLFLLLWFMLFNLYSLILYYCITYL NLYLLFCIVFLLYIAFLFLFCFLCDFFLFNNLLVGDSFMDVFFIRFLLCFLECFSLLCRCLSTFLRLFCNLLSSHFLLLM FFDFFYFIFVFFFYGVFCYWFILFIFVFCFCLLFYVFLYLLDLFAAILQLFIFCNMILQLIMDFLLFLLFV ; A,a ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MLRRLGANVSNMARPMNKYAVTVSPRRHLEPMSTWYLASWAMVWYYAFFFWMPMVWTDIMVPSFVYNKLPVIHFLQEKRA EQKLRRVLDETYTEWTEELDQAHVTDAITRSLNI ; ;MLRRLGANVSNMARPMNKYAVTVSPRRHLEPMSTWYLASWAMVWYYAFFFWMPMVWTDIMVPSFVYNKLPVIHFLQEKRA EQKLRRVLDETYTEWTEELDQAHVTDAITRSLNI ; C,c ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MRRVSSPNITIQSVRWISGVSPLLYFPPTTTSTTNREDQINKNTNIAIQMIKRYKGEVPPHYTRKSSATIEQVEKEIDAL LGGAEKLRKTSTDDQPMDKLTLMERCLRHALWSYHKEEGRYDFDQIGRWVVYTPEDEVKLAQLKREVEAKEKLAALRKRR EEEGLPGGPVPRINWPQEYSSFIDREPVVAKRIRYDTLASTTLERDEKQIESTLQQYRRASQDKRLDDLVDLLERFKPVL AREAIMQRLTIKHLEGQLGVWRYMDWCPEVRDRAELEVDITGWQWWSPLEERRLLPVRLRSVNEVREIMSKTQAKKSAEA AERNPIVTQTSTGDNARDRLLKEVLALQARINQRDEVEPSQTEQKKKAHH ; ;MRRVSSPNITIQSVRWISGVSPLLYFPPTTTSTTNREDQINKNTNIAIQMIKRYKGEVPPHYTRKSSATIEQVEKEIDAL LGGAEKLRKTSTDDQPMDKLTLMERCLRHALWSYHKEEGRYDFDQIGRWVVYTPEDEVKLAQLKREVEAKEKLAALRKRR EEEGLPGGPVPRINWPQEYSSFIDREPVVAKRIRYDTLASTTLERDEKQIESTLQQYRRASQDKRLDDLVDLLERFKPVL AREAIMQRLTIKHLEGQLGVWRYMDWCPEVRDRAELEVDITGWQWWSPLEERRLLPVRLRSVNEVREIMSKTQAKKSAEA AERNPIVTQTSTGDNARDRLLKEVLALQARINQRDEVEPSQTEQKKKAHH ; D,d ? 4 'polypeptide(L)' no yes ;(AME)QGSWSVLKKNCSNFFPGLLAFAQQTQEAYGIWLRIYNRQQKYGPTDFVEQSETFSPDYHKRFHSQDKNMWVDKEL CTEVSQKEVARLMTYKLDMWRMAHCAGALLATGGYAIPFGLFWLANDTWVPSSFNLTGEELRAWREAQDLYRYRSAPSYL TDTKWHFDFHAYPWNETQERAWDDLFEKNDVRRDPKVVRPAAEMYDGFIKFELIRRKSLRHLCRSMNIPTFPMLARLCNG TRVRDYWNLAWCEDYMVITQRLHESMTDEELYDYAWRRYLAPYDKNLNREQLMERVEDYFEFLGPDFVAHGKAPNLVILT NYVLGYYNDPAYLEGDISELDKNDYDHLASWGKDAFLRRLEFENGPLRDQVEAHTQRLLAERAAIAKGDNAAAVEGRHTA ; ;MQGSWSVLKKNCSNFFPGLLAFAQQTQEAYGIWLRIYNRQQKYGPTDFVEQSETFSPDYHKRFHSQDKNMWVDKELCTEV SQKEVARLMTYKLDMWRMAHCAGALLATGGYAIPFGLFWLANDTWVPSSFNLTGEELRAWREAQDLYRYRSAPSYLTDTK WHFDFHAYPWNETQERAWDDLFEKNDVRRDPKVVRPAAEMYDGFIKFELIRRKSLRHLCRSMNIPTFPMLARLCNGTRVR DYWNLAWCEDYMVITQRLHESMTDEELYDYAWRRYLAPYDKNLNREQLMERVEDYFEFLGPDFVAHGKAPNLVILTNYVL GYYNDPAYLEGDISELDKNDYDHLASWGKDAFLRRLEFENGPLRDQVEAHTQRLLAERAAIAKGDNAAAVEGRHTA ; E,e ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MVLFSTYRSSRLVSKEFLHGPVMRFRALGEYYFQRAWNGTLNWALPGEYRLYAVMIPFIYFYHRWHNDHTLDRDHVEKAM IMRWGGTLEDVRKLSAKDQLRVRCFTDIEKLYSAYGPKDTYLQPPGDTLPGKDFYRKAGGAQAHH ; ;MVLFSTYRSSRLVSKEFLHGPVMRFRALGEYYFQRAWNGTLNWALPGEYRLYAVMIPFIYFYHRWHNDHTLDRDHVEKAM IMRWGGTLEDVRKLSAKDQLRVRCFTDIEKLYSAYGPKDTYLQPPGDTLPGKDFYRKAGGAQAHH ; F,f ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MVYTRWKCDRLPVFQLKLFTQEYPMHAAVGIFTIIFLWKHMSHCSEETERKYGWWAGYPYWRDPIARRNETKYKQMIINN DVDITHPKWTGCSVEQLEELSRVV ; ;MVYTRWKCDRLPVFQLKLFTQEYPMHAAVGIFTIIFLWKHMSHCSEETERKYGWWAGYPYWRDPIARRNETKYKQMIINN DVDITHPKWTGCSVEQLEELSRVV ; I,i ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTKYELKMQYFDEWMIRWRKFQTESDWEIEKGRQWWRRFNMAVSGALFCGLVLYTSGTATLKRQYGLPHFFDIGVDGQAK ETMLKTLTSRWRYTPQGYGRVLITGVPTYILFVTLEHYRERRRMQQYLQQNTVFGEQMRRLLSTGKIEEYLPVNIKATLP ASQQAIYNY ; ;MTKYELKMQYFDEWMIRWRKFQTESDWEIEKGRQWWRRFNMAVSGALFCGLVLYTSGTATLKRQYGLPHFFDIGVDGQAK ETMLKTLTSRWRYTPQGYGRVLITGVPTYILFVTLEHYRERRRMQQYLQQNTVFGEQMRRLLSTGKIEEYLPVNIKATLP ASQQAIYNY ; J,j ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLRRSSAALIRRTPVRHSGGELFVRPKLEEIPPADQCRGFFGPLNDSLKFLRLLDIKWMMNRAVAMRREYLIATPTLFTF IWMFTWKGAVIYFWGDRAPPRRMDWNTEETGRLPLGFKPTPAPL ; ;MLRRSSAALIRRTPVRHSGGELFVRPKLEEIPPADQCRGFFGPLNDSLKFLRLLDIKWMMNRAVAMRREYLIATPTLFTF IWMFTWKGAVIYFWGDRAPPRRMDWNTEETGRLPLGFKPTPAPL ; K,k ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSAKAAPKTLHQVRNVAYFFAAWLGVQKGYIEKSANDRLWVEHQRKVRQQNVERQQALDSIKLMQQGVRATTPGQLEGVP AELQQLAEAFTK ; ;MSAKAAPKTLHQVRNVAYFFAAWLGVQKGYIEKSANDRLWVEHQRKVRQQNVERQQALDSIKLMQQGVRATTPGQLEGVP AELQQLAEAFTK ; L,l ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSSTKCAVACKIMTPLCNAASKVQARSAKKLAALTDAGIQKTISEHNANGTDAAVSSTKRYLAEQRQLFHYRVVRFFDEC HYIISGEYFAQYTKVNLIWDLRFLTKLVVLFLIGTVLGRQSIFPPIDPDSPLVEALVTKVNPNY ; ;MSSTKCAVACKIMTPLCNAASKVQARSAKKLAALTDAGIQKTISEHNANGTDAAVSSTKRYLAEQRQLFHYRVVRFFDEC HYIISGEYFAQYTKVNLIWDLRFLTKLVVLFLIGTVLGRQSIFPPIDPDSPLVEALVTKVNPNY ; M,m ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MLRKTPLFAMATTRKALVGNGPTFSTGGECMNTCDIQNAFPMNDRGVRSSSPFQEPNTAIYDSYLAWTYFQPMDVHIEKL PAPEAKYYQRHTKKPWDVSSTELTEIQSRKKYFQTLGYLVAFIYLYFLMPKEKSFSGLSGPDGHWIMLPKGRPELF ; ;MLRKTPLFAMATTRKALVGNGPTFSTGGECMNTCDIQNAFPMNDRGVRSSSPFQEPNTAIYDSYLAWTYFQPMDVHIEKL PAPEAKYYQRHTKKPWDVSSTELTEIQSRKKYFQTLGYLVAFIYLYFLMPKEKSFSGLSGPDGHWIMLPKGRPELF ; N,n ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MSSGFHFHDVSNDAIKGMPPSEALHKHLENAQLAHRICLAKALKAGEPPVEKCALTWGEVLIRYQAWSEYRPPFQDSVAQ AKYKKYWSKKRQEEDDKNPFK ; ;MSSGFHFHDVSNDAIKGMPPSEALHKHLENAQLAHRICLAKALKAGEPPVEKCALTWGEVLIRYQAWSEYRPPFQDSVAQ AKYKKYWSKKRQEEDDKNPFK ; O,o ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MLRRLVPRVMMAPMGGATALCTSRGYNMLVFRDPKRRPQLSEEERAKVVVNQAEWPEEFKDFDPDDPYKNSPEIIKGMSS WNLFLWGVECAFIYQFYELVFPKSI ; ;MLRRLVPRVMMAPMGGATALCTSRGYNMLVFRDPKRRPQLSEEERAKVVVNQAEWPEEFKDFDPDDPYKNSPEIIKGMSS WNLFLWGVECAFIYQFYELVFPKSI ; P,p ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MTENIEAVMSDFWSNPADHFRPNLKALTLYAERQHYVDRWLHVKERWLAPWYLPWWSPLFQLGTWYSQRSRNLFLVENHL SYRPYKFRRNDEDRNNPY ; ;MTENIEAVMSDFWSNPADHFRPNLKALTLYAERQHYVDRWLHVKERWLAPWYLPWWSPLFQLGTWYSQRSRNLFLVENHL SYRPYKFRRNDEDRNNPY ; Q,q ? 15 'polypeptide(L)' no no MLLGGFVPRRFSQFNRDPCWMFFIFSVGFWLGEYPAMMIKYNARDLVYDPHRYVWSHHDDHH MLLGGFVPRRFSQFNRDPCWMFFIFSVGFWLGEYPAMMIKYNARDLVYDPHRYVWSHHDDHH R,r ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PHE n 1 3 LEU n 1 4 PHE n 1 5 PHE n 1 6 PHE n 1 7 CYS n 1 8 ASP n 1 9 LEU n 1 10 PHE n 1 11 TRP n 1 12 LEU n 1 13 ARG n 1 14 LEU n 1 15 LEU n 1 16 LEU n 1 17 CYS n 1 18 MET n 1 19 TYR n 1 20 TYR n 1 21 CYS n 1 22 VAL n 1 23 TRP n 1 24 SER n 1 25 ARG n 1 26 LEU n 1 27 CYS n 1 28 PHE n 1 29 ILE n 1 30 VAL n 1 31 TYR n 1 32 PHE n 1 33 ASN n 1 34 CYS n 1 35 LEU n 1 36 MET n 1 37 LEU n 1 38 ILE n 1 39 PHE n 1 40 ASP n 1 41 PHE n 1 42 LEU n 1 43 LEU n 1 44 PHE n 1 45 CYS n 1 46 LEU n 1 47 PHE n 1 48 ASP n 1 49 LEU n 1 50 TYR n 1 51 LEU n 1 52 PHE n 1 53 VAL n 1 54 GLY n 1 55 LEU n 1 56 CYS n 1 57 LEU n 1 58 PHE n 1 59 LEU n 1 60 LEU n 1 61 LEU n 1 62 TRP n 1 63 PHE n 1 64 MET n 1 65 LEU n 1 66 PHE n 1 67 ASN n 1 68 LEU n 1 69 TYR n 1 70 SER n 1 71 LEU n 1 72 ILE n 1 73 LEU n 1 74 TYR n 1 75 TYR n 1 76 CYS n 1 77 ILE n 1 78 THR n 1 79 TYR n 1 80 LEU n 1 81 ASN n 1 82 LEU n 1 83 TYR n 1 84 LEU n 1 85 LEU n 1 86 PHE n 1 87 CYS n 1 88 ILE n 1 89 VAL n 1 90 PHE n 1 91 LEU n 1 92 LEU n 1 93 TYR n 1 94 ILE n 1 95 ALA n 1 96 PHE n 1 97 LEU n 1 98 PHE n 1 99 LEU n 1 100 PHE n 1 101 CYS n 1 102 PHE n 1 103 LEU n 1 104 CYS n 1 105 ASP n 1 106 PHE n 1 107 PHE n 1 108 LEU n 1 109 PHE n 1 110 ASN n 1 111 ASN n 1 112 LEU n 1 113 LEU n 1 114 VAL n 1 115 GLY n 1 116 ASP n 1 117 SER n 1 118 PHE n 1 119 MET n 1 120 ASP n 1 121 VAL n 1 122 PHE n 1 123 PHE n 1 124 ILE n 1 125 ARG n 1 126 PHE n 1 127 LEU n 1 128 LEU n 1 129 CYS n 1 130 PHE n 1 131 LEU n 1 132 GLU n 1 133 CYS n 1 134 PHE n 1 135 SER n 1 136 LEU n 1 137 LEU n 1 138 CYS n 1 139 ARG n 1 140 CYS n 1 141 LEU n 1 142 SER n 1 143 THR n 1 144 PHE n 1 145 LEU n 1 146 ARG n 1 147 LEU n 1 148 PHE n 1 149 CYS n 1 150 ASN n 1 151 LEU n 1 152 LEU n 1 153 SER n 1 154 SER n 1 155 HIS n 1 156 PHE n 1 157 LEU n 1 158 LEU n 1 159 LEU n 1 160 MET n 1 161 PHE n 1 162 PHE n 1 163 ASP n 1 164 PHE n 1 165 PHE n 1 166 TYR n 1 167 PHE n 1 168 ILE n 1 169 PHE n 1 170 VAL n 1 171 PHE n 1 172 PHE n 1 173 PHE n 1 174 TYR n 1 175 GLY n 1 176 VAL n 1 177 PHE n 1 178 CYS n 1 179 TYR n 1 180 TRP n 1 181 PHE n 1 182 ILE n 1 183 LEU n 1 184 PHE n 1 185 ILE n 1 186 PHE n 1 187 VAL 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'Trypanosoma brucei brucei' 5702 ? ? '927/4 GUTat10.1' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 101 ? 'Trypanosoma brucei brucei' 5702 ? ? '927/4 GUTat10.1' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 105 ? 'Trypanosoma brucei brucei' 5702 ? ? MHOM/CI/86/DAL972 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 98 ? 'Trypanosoma brucei brucei' 5702 ? ? '927/4 GUTat10.1' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 62 ? 'Trypanosoma brucei brucei' 5702 ? ? Lister427 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATP6_TRYBB P24499 ? 1 ;MFLFFFCDLFWLRLLLCMYYCVSRLCFIVYFNCLMLIFDFLLFCLFDLYLFVGLCLFLLLWFMLFNLYSLILYYCITYLN LYLLFCIVFLLYIAFLFLFCFLCDFFLFNNLLVGDSFMDVFFIRFLLCFLECFSLLCRCLSTFLRLFCNLLSSHFLLLMF FDFFYFIFVFFFYGVFCYFILFIFVFCFCLLFYVFLYLLDLFAAILQLFIFCNMILQLIMDFLLFLLFV ; 1 2 UNP Q585K5_TRYB2 Q585K5 ? 2 ;MLRRLGANVSNMARPMNKYAVTVSPRRHLEPMSTWYLASWAMVWYYAFFFWMPMVWTDIMVPSFVYNKLPVIHFLQEKRA EQKLRRVLDETYTEWTEELDQAHVTDAITRSLNI ; 1 3 UNP Q57ZW9_TRYB2 Q57ZW9 ? 3 ;MRRVSSPNITIQSVRWISGVSPLLYFPPTTTSTTNREDQINKNTNIAIQMIKRYKGEVPPHYTRKSSATIEQVEKEIDAL LGGAEKLRKTSTDDQPMDKLTLMERCLRHALWSYHKEEGRYDFDQIGRWVVYTPEDEVKLAQLKREVEAKEKLAALRKRR EEEGLPGGPVPRINWPQEYSSFIDREPVVAKRIRYDTLASTTLERDEKQIESTLQQYRRASQDKRLDDLVDLLERFKPVL AREAIMQRLTIKHLEGQLGVWRYMDWCPEVRDRAELEVDITGWQWWSPLEERRLLPVRLRSVNEVREIMSKTQAKKSAEA AERNPIVTQTSTGDNARDRLLKEVLALQARINQRDEVEPSQTEQKKKAHH ; 1 4 UNP Q38CI8_TRYB2 Q38CI8 ? 4 ;MQGSWSVLKKNCSNFFPGLLAFAQQTQEAYGIWLRIYNRQQKYGPTDFVEQSETFSPDYHKRFHSQDKNMWVDKELCTEV SQKEVARLMTYKLDMWRMAHCAGALLATGGYAIPFGLFWLANDTWVPSSFNLTGEELRAWREAQDLYRYRSAPSYLTDTK WHFDFHAYPWNETQERAWDDLFEKNDVRRDPKVVRPAAEMYDGFIKFELIRRKSLRHLCRSMNIPTFPMLARLCNGTRVR DYWNLAWCEDYMVITQRLHESMTDEELYDYAWRRYLAPYDKNLNREQLMERVEDYFEFLGPDFVAHGKAPNLVILTNYVL GYYNDPAYLEGDISELDKNDYDHLASWGKDAFLRRLEFENGPLRDQVEAHTQRLLAERAAIAKGDNAAAVEGRHTA ; 1 5 UNP Q57ZE2_TRYB2 Q57ZE2 ? 5 ;MVLFSTYRSSRLVSKEFLHGPVMRFRALGEYYFQRAWNGTLNWALPGEYRLYAVMIPFIYFYHRWHNDHTLDRDHVEKAM IMRWGGTLEDVRKLSAKDQLRVRCFTDIEKLYSAYGPKDTYLQPPGDTLPGKDFYRKAGGAQAHH ; 1 6 UNP Q57ZM4_TRYB2 Q57ZM4 ? 6 ;MVYTRWKCDRLPVFQLKLFTQEYPMHAAVGIFTIIFLWKHMSHCSEETERKYGWWAGYPYWRDPIARRNETKYKQMIINN DVDITHPKWTGCSVEQLEELSRVV ; 1 7 UNP D0A5R7_TRYB9 D0A5R7 ? 7 ;MTKYELKMQYFDEWMIRWRKFQTESDWEIEKGRQWWRRFNMAVSGALFCGLVLYTSGTATLKRQYGLPHFFDIGVDGQAK ETMLKTLTSRWRYTPQGYGRVLITGVPTYILFVTLEHYRERRRMQQYLQQNTVFGEQMRRLLSTGKIEEYLPVNIKATLP ASQQAIYNY ; 1 8 UNP Q57VT0_TRYB2 Q57VT0 ? 8 ;MLRRSSAALIRRTPVRHSGGELFVRPKLEEIPPADQCRGFFGPLNDSLKFLRLLDIKWMMNRAVAMRREYLIATPTLFTF IWMFTWKGAVIYFWGDRAPPRRMDWNTEETGRLPLGFKPTPAPL ; 1 9 UNP Q387J1_TRYB2 Q387J1 ? 9 ;MSAKAAPKTLHQVRNVAYFFAAWLGVQKGYIEKSANDRLWVEHQRKVRQQNVERQQALDSIKLMQQGVRATTPGQLEGVP AELQQLAEAFTK ; 15 10 UNP C9ZJA0_TRYB9 C9ZJA0 ? 10 ;MSSTKCAVACKIMTPLCNAASKVQARSAKKLAALTDAGIQKTISEHNANGTDAAVSSTKRYLAEQRQLFHYRVVRFFDEC HYIISGEYFAQYTKVNLIWDLRFLTKLVVLFLIGTVLGRQSIFPPIDPDSPLVEALVTKVNPNY ; 1 11 UNP Q582T1_TRYB2 Q582T1 ? 11 ;MLRKTPLFAMATTRKALVGNGPTFSTGGECMNTCDIQNAFPMNDRGVRSSSPFQEPNTAIYDSYLAWTYFQPMDVHIEKL PAPEAKYYQRHTKKPWDVSSTELTEIQSRKKYFQTLGYLVAFIYLYFLMPKEKSFSGLSGPDGHWIMLPKGRPELF ; 1 12 UNP Q57Z84_TRYB2 Q57Z84 ? 12 ;MSSGFHFHDVSNDAIKGMPPSEALHKHLENAQLAHRICLAKALKAGEPPVEKCALTWGEVLIRYQAWSEYRPPFQDSVAQ AKYKKYWSKKRQEEDDKNPFK ; 1 13 UNP C9ZLR9_TRYB9 C9ZLR9 ? 13 ;MLRRLVPRVMMAPMGGATALCTSRGYNMLVFRDPKRRPQLSEEERAKVVVNQAEWPEEFKDFDPDDPYKNSPEIIKGMSS WNLFLWGVECAFIYQFYELVFPKSI ; 65 14 UNP Q583U4_TRYB2 Q583U4 ? 14 ;MTENIEAVMSDFWSNPADHFRPNLKALTLYAERQHYVDRWLHVKERWLAPWYLPWWSPLFQLGTWYSQRSRNLFLVENHL SYRPYKFRRNDEDRNNPY ; 1 15 PDB 8AP7 8AP7 ? 15 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8AP7 A 1 ? 231 ? 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'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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D AME 1 C ? ? ? 1_555 D GLN 2 N ? ? E AME 1 E GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale2 covale both ? S AME 1 C ? ? ? 1_555 S GLN 2 N ? ? e AME 1 e GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 227 D . ? PHE 227 E PRO 228 D ? 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PHE A 5 ? PHE A 2 PHE A 5 AA1 2 LYS N 25 ? TYR N 30 ? LYS Q 25 TYR Q 30 AA1 3 HIS K 144 ? TRP K 145 ? HIS N 144 TRP N 145 AA2 1 LEU A 43 ? PHE A 44 ? LEU A 43 PHE A 44 AA2 2 LEU A 228 ? LEU A 229 ? LEU A 228 LEU A 229 AA3 1 ALA K 66 ? PHE K 70 ? ALA N 66 PHE N 70 AA3 2 THR K 58 ? ASP K 62 ? THR N 58 ASP N 62 AA3 3 LYS M 35 ? ARG M 36 ? LYS P 35 ARG P 36 AA4 1 ASN M 27 ? MET M 28 ? ASN P 27 MET P 28 AA4 2 PHE M 31 ? ARG M 32 ? PHE P 31 ARG P 32 AA5 1 PHE P 2 ? PHE P 5 ? PHE a 2 PHE a 5 AA5 2 LYS CA 25 ? TYR CA 30 ? LYS q 25 TYR q 30 AA5 3 HIS Z 144 ? TRP Z 145 ? HIS n 144 TRP n 145 AA6 1 LEU P 43 ? PHE P 44 ? LEU a 43 PHE a 44 AA6 2 LEU P 228 ? LEU P 229 ? LEU a 228 LEU a 229 AA7 1 ALA Z 66 ? PHE Z 70 ? ALA n 66 PHE n 70 AA7 2 THR Z 58 ? ASP Z 62 ? THR n 58 ASP n 62 AA7 3 LYS BA 35 ? ARG BA 36 ? LYS p 35 ARG p 36 AA8 1 ASN BA 27 ? MET BA 28 ? ASN p 27 MET p 28 AA8 2 PHE BA 31 ? ARG BA 32 ? 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N PHE A 4 O LEU N 27 ? O LEU Q 27 AA1 2 3 O TYR N 30 ? O TYR Q 30 N HIS K 144 ? N HIS N 144 AA2 1 2 N PHE A 44 ? N PHE A 44 O LEU A 228 ? O LEU A 228 AA3 1 2 O TRP K 67 ? O TRP N 67 N TYR K 61 ? N TYR N 61 AA3 2 3 N ASP K 62 ? N ASP N 62 O LYS M 35 ? O LYS P 35 AA4 1 2 N MET M 28 ? N MET P 28 O PHE M 31 ? O PHE P 31 AA5 1 2 N PHE P 4 ? N PHE a 4 O LEU CA 27 ? O LEU q 27 AA5 2 3 O TYR CA 30 ? O TYR q 30 N HIS Z 144 ? N HIS n 144 AA6 1 2 N PHE P 44 ? N PHE a 44 O LEU P 228 ? O LEU a 228 AA7 1 2 O TRP Z 67 ? O TRP n 67 N TYR Z 61 ? N TYR n 61 AA7 2 3 N ASP Z 62 ? N ASP n 62 O LYS BA 35 ? O LYS p 35 AA8 1 2 N MET BA 28 ? N MET p 28 O PHE BA 31 ? 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