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_entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 305 ? 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'927/4 GUTat10.1' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A161CM65_TRYBB A0A161CM65 ? 1 ;MSGKLRLYKEKLEGYNRFYSIVKTIKMVTLAKYRAAQGRIRTRDFSLRYTELAFSKPQASRDAVVAAKNALVYIPITTNR GSCGALNSNIVRCIDSVVSSKMVLMPVGKRGIDSFSKLYPDEFRYGIINDMKESMHFGYATFVIENAYEVSKDADRYQVI FNRFVSAGVQRNAVYNIPSYEKWKEDLADAASSDNQKNRYLFANALQNEEEQLIRDFFDFHAALAVLNAVGENELSEQAA RLVAVEGQLTNISSLQQRTSSLYNKTRQFGITAALIEILSAMSSLEGNAMKGVRRNKFWEGAVTK ; 1 2 UNP Q586H1_TRYB2 Q586H1 ? 2 ;MFRTFGRRLVSCTLPLLQSAPHDLPEGFEFMEHKVVNKDIHAPHENLETLRLTLTRQDEFLLREEPVKCVTVTGTNGEYG IYPGHAYKIVQLNPSPLTVEYTDGTTKKYFVSGGFAHINNEGSCDVNTVECTLLDDLDLAIAEKELAAQQAALGSAKDDK AKSVVEIRISVIEAVIAALKHH ; 1 3 UNP ATP5E_TRYBB P0DPG3 ? 3 MIRRSCALLSSSWRDHGISYLKYLNVCTETLHSTVKESRRAKYERWSKPCYTAQRPDGAGGQETIDKVPIHTKDY 1 4 UNP Q38C84_TRYB2 Q38C84 ? 4 ;MMRRLALQSSIRRATPFATPLVASTKALNPMCSAITIREASTVAISVQGLHYVGTGLAAIALAGVGLGIGTIFGNLLVAC ARQPNLTKMLFNYAILGFALTEAIGLFALMLAFLMLFS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8AP9 G 1 ? 305 ? 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UTP non-polymer . ;URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE ; ? 'C9 H15 N2 O15 P3' 484.141 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8AP9 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8AP9 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 9851 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.415 ? 13354 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.618 ? 3416 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.037 ? 1610 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1674 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8AP9 _struct.title 'rotor of the Trypanosoma brucei mitochondrial ATP synthase dimer' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8AP9 _struct_keywords.text 'ATP synthase, mitochondria, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 3 ? GLN A 37 ? GLY G 3 GLN G 37 1 ? 35 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 38 ? ARG A 43 ? GLY G 38 ARG G 43 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 48 ? SER A 55 ? ARG G 48 SER G 55 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 61 ? ALA A 66 ? ARG G 61 ALA G 66 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA A 85 ? VAL A 97 ? ALA G 85 VAL G 97 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 108 ? TYR A 119 ? GLY G 108 TYR G 119 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 HIS A 136 ? SER A 151 ? HIS G 136 SER G 151 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 179 ? SER A 193 ? SER G 179 SER G 193 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 ARG A 199 ? GLU A 209 ? ARG G 199 GLU G 209 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU A 210 ? SER A 280 ? GLU G 210 SER G 280 1 ? 71 HELX_P HELX_P11 AB2 GLU B 26 ? MET B 31 ? GLU H 26 MET H 31 5 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP B 138 ? SER B 155 ? ASP H 138 SER H 155 1 ? 18 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP B 158 ? HIS B 182 ? ASP H 158 HIS H 182 1 ? 25 HELX_P HELX_P14 AB5 TRP C 13 ? GLY C 17 ? TRP I 13 GLY I 17 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 SER C 19 ? THR C 34 ? SER I 19 THR I 34 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS C 36 ? GLU C 44 ? LYS I 36 GLU I 44 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 ARG C 45 ? SER C 47 ? ARG I 45 SER I 47 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY D 49 ? GLN D 83 ? GLY O 49 GLN O 83 1 ? 35 HELX_P HELX_P19 AC1 LYS D 88 ? LEU D 116 ? LYS O 88 LEU O 116 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY E 49 ? ALA E 81 ? GLY P 49 ALA P 81 1 ? 33 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN E 83 ? ASN E 85 ? GLN P 83 ASN P 85 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU E 86 ? PHE E 117 ? LEU P 86 PHE P 117 1 ? 32 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 50 ? ALA F 61 ? LEU Q 50 ALA Q 61 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA F 61 ? GLN F 83 ? ALA Q 61 GLN Q 83 1 ? 23 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU F 86 ? PHE F 117 ? LEU Q 86 PHE Q 117 1 ? 32 HELX_P HELX_P26 AC8 LEU G 50 ? ILE G 60 ? LEU R 50 ILE R 60 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA G 61 ? GLN G 83 ? ALA R 61 GLN R 83 1 ? 23 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU G 86 ? SER G 118 ? LEU R 86 SER R 118 1 ? 33 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY H 49 ? GLN H 83 ? GLY S 49 GLN S 83 1 ? 35 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU H 86 ? PHE H 117 ? LEU S 86 PHE S 117 1 ? 32 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY I 49 ? ALA I 59 ? GLY T 49 ALA T 59 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 ILE I 60 ? GLN I 83 ? ILE T 60 GLN T 83 1 ? 24 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU I 86 ? PHE I 117 ? LEU T 86 PHE T 117 1 ? 32 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY J 49 ? ILE J 60 ? 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