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EMDB EMD-15767 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-03-20 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8AZK _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-09-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Bovine 20S proteasome, untreated' _pdbx_database_related.db_id EMD-15767 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email ami.navon@weizmann.ac.il _pdbx_contact_author.name_first Ami _pdbx_contact_author.name_last Navon _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-6316-7818 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Szenkier, N.' 1 ? 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'Navon, A.' 9 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To be published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Bovine 20S proteasome, untreated' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Szenkier, N.' 1 ? primary 'Arie, M.' 2 ? primary 'Matzov, D.' 3 ? 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;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQLVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDP DHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; J,X ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; A,O ? 3 'polypeptide(L)' no no ;AERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGP DYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKAT AMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;AERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGP DYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKAT AMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; B,P ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; C,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA 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;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH ; ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH ; F,T ? 8 'polypeptide(L)' no no ;SSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGL LADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGY WGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAK ESLKEEDESDDDNM ; ;SSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGL LADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGY WGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAK ESLKEEDESDDDNM ; G,U ? 9 'polypeptide(L)' no no ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA ; ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA ; H,V ? 10 'polypeptide(L)' no no ;TTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTAN RMLKQMLFRYRGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIA AGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTRLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS ; ;TTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTAN RMLKQMLFRYRGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIA AGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTRLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS ; I,W ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS ; ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS ; K,Y ? 12 'polypeptide(L)' no no ;TTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAAS KLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAI YQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP ; ;TTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAAS KLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAI YQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP ; L,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;RFSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNN KAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQN VEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; ;RFSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNN KAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQN VEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; M,1 ? 14 'polypeptide(L)' no no ;TQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDG HSYSPRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVL SQTEARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQTATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE ; ;TQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDG HSYSPRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVL SQTEARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQTATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE ; N,2 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 ILE n 1 4 MET n 1 5 SER n 1 6 TYR n 1 7 ASN n 1 8 GLY n 1 9 GLY n 1 10 ALA n 1 11 VAL n 1 12 MET n 1 13 ALA n 1 14 MET n 1 15 LYS n 1 16 GLY n 1 17 LYS n 1 18 ASN n 1 19 CYS n 1 20 VAL n 1 21 ALA n 1 22 ILE n 1 23 ALA n 1 24 ALA n 1 25 ASP n 1 26 ARG n 1 27 ARG n 1 28 PHE n 1 29 GLY n 1 30 ILE n 1 31 GLN n 1 32 ALA n 1 33 GLN n 1 34 LEU n 1 35 VAL n 1 36 THR n 1 37 THR n 1 38 ASP n 1 39 PHE n 1 40 GLN n 1 41 LYS n 1 42 ILE n 1 43 PHE n 1 44 PRO n 1 45 MET n 1 46 GLY n 1 47 ASP n 1 48 ARG n 1 49 LEU n 1 50 TYR n 1 51 ILE n 1 52 GLY n 1 53 LEU n 1 54 ALA n 1 55 GLY n 1 56 LEU n 1 57 ALA n 1 58 THR n 1 59 ASP n 1 60 VAL n 1 61 GLN n 1 62 THR n 1 63 VAL n 1 64 ALA n 1 65 GLN n 1 66 ARG n 1 67 LEU n 1 68 LYS n 1 69 PHE n 1 70 ARG n 1 71 LEU n 1 72 ASN n 1 73 LEU n 1 74 TYR n 1 75 GLU n 1 76 LEU n 1 77 LYS n 1 78 GLU n 1 79 GLY n 1 80 ARG n 1 81 GLN n 1 82 ILE n 1 83 LYS n 1 84 PRO n 1 85 TYR n 1 86 THR n 1 87 LEU n 1 88 MET n 1 89 SER n 1 90 MET n 1 91 VAL n 1 92 ALA n 1 93 ASN n 1 94 LEU n 1 95 LEU n 1 96 TYR n 1 97 GLU n 1 98 LYS n 1 99 ARG n 1 100 PHE n 1 101 GLY n 1 102 PRO n 1 103 TYR n 1 104 TYR n 1 105 THR n 1 106 GLU n 1 107 PRO n 1 108 VAL n 1 109 ILE n 1 110 ALA n 1 111 GLY n 1 112 LEU n 1 113 ASP n 1 114 PRO n 1 115 LYS n 1 116 THR n 1 117 PHE n 1 118 LYS n 1 119 PRO n 1 120 PHE n 1 121 ILE n 1 122 CYS n 1 123 SER n 1 124 LEU n 1 125 ASP n 1 126 LEU n 1 127 ILE n 1 128 GLY n 1 129 CYS n 1 130 PRO n 1 131 MET n 1 132 VAL n 1 133 THR n 1 134 ASP n 1 135 ASP n 1 136 PHE n 1 137 VAL n 1 138 VAL n 1 139 SER n 1 140 GLY n 1 141 THR n 1 142 CYS n 1 143 ALA n 1 144 GLU n 1 145 GLN n 1 146 MET n 1 147 TYR n 1 148 GLY n 1 149 MET n 1 150 CYS n 1 151 GLU n 1 152 SER n 1 153 LEU n 1 154 TRP n 1 155 GLU n 1 156 PRO n 1 157 ASN n 1 158 MET n 1 159 ASP n 1 160 PRO n 1 161 ASP n 1 162 HIS n 1 163 LEU n 1 164 PHE n 1 165 GLU n 1 166 THR n 1 167 ILE n 1 168 SER n 1 169 GLN n 1 170 ALA n 1 171 MET n 1 172 LEU 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