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# loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A7M4DUC2_PIG A0A7M4DUC2 ? 1 ;MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTE CPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEM DNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEP RYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDN ELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNID RLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWS TFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEV MNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGIL CKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKA HNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPF GFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVR NSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMR EDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLL FNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLG VPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMP DFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMD DDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSN DIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLM EAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPW NQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAY EPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP NYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYS PSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTS PKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN ; 1 2 UNP A0A0B8RVL1_PIG A0A0B8RVL1 ? 2 ;MQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLK FEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLT DRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGA KKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAK PGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGM FKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNS PIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKI FVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKERE YNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSA MGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFR SVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELEGTNRRY TKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIII NPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTY YQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAI ANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV ; 8 3 UNP A0A481DF93_PIG A0A481DF93 ? 3 ;MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLTSDDIVD KLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPSDYVEQDDILIVKLRKGQELR LRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLR PETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN ; 46 4 UNP A0A287ADR4_PIG A0A287ADR4 ? 4 ;MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETI ASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY ; 43 5 UNP I3LSI7_PIG I3LSI7 ? 5 ;MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEP KVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELL ARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ ; 1 6 UNP F1SKN8_PIG F1SKN8 ? 6 ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD ; 1 7 PDB 8B3D 8B3D ? 7 ? 1 8 UNP A0A4X1ULF2_PIG A0A4X1ULF2 ? 8 ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; 1 9 UNP RPB9_PIG P60899 ? 9 ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; 1 10 UNP A0A7K6NXI9_PEDTO A0A7K6NXI9 ? 10 MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK 1 11 UNP A0A4X1UK25_PIG A0A4X1UK25 ? 11 ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; 1 12 UNP I3LN51_PIG I3LN51 ? 12 MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR 1 13 UNP A0A024R7E8_HUMAN A0A024R7E8 ? 13 ;MGRRKSKRKPPPKKKMTGTLETQFTCPFCNHEKSCDVKMDRARNTGVISCTVCLEEFQTPITYLSEPVDVYSDWIDACEA ANQ ; 22 14 PDB 8B3D 8B3D ? 14 ? 1 15 PDB 8B3D 8B3D ? 15 ? 1 16 PDB 8B3D 8B3D ? 16 ? 1 17 UNP ERCC8_HUMAN Q13216 ? 17 ;MLGFLSARQTGLEDPLRLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGGGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSRQS YYTCKAVCSIGRDHPDVHRYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKVWDTNTLQTADVFNFEETVYSHHMSPVSTKHCLVA VGTRGPKVQLCDLKSGSCSHILQGHRQEILAVSWSPRYDYILATASADSRVKLWDVRRASGCLITLDQHNGKKSQAVESA NTAHNGKVNGLCFTSDGLHLLTVGTDNRMRLWNSSNGENTLVNYGKVCNNSKKGLKFTVSCGCSSEFVFVPYGSTIAVYT VYSGEQITMLKGHYKTVDCCVFQSNFQELYSGSRDCNILAWVPSLYEPVPDDDETTTKSQLNPAFEDAWSSSDEEG ; 1 18 UNP ERCC6_HUMAN Q03468 ? 18 ;MPNEGIPHSSQTQEQDCLQSQPVSNNEEMAIKQESGGDGEVEEYLSFRSVGDGLSTSAVGCASAAPRRGPALLHIDRHQI QAVEPSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDNAIHEASRASQLVDVEKEYRSVLDDLTSCTTSLRQINKIIEQLSPQ AATSRDINRKLDSVKRQKYNKEQQLKKITAKQKHLQAILGGAEVKIELDHASLEEDAEPGPSSLGSMLMPVQETAWEELI RTGQMTPFGTQIPQKQEKKPRKIMLNEASGFEKYLADQAKLSFERKKQGCNKRAARKAPAPVTPPAPVQNKNKPNKKARV LSKKEERLKKHIKKLQKRALQFQGKVGLPKARRPWESDMRPEAEGDSEGEESEYFPTEEEEEEEDDEVEGAEADLSGDGT DYELKPLPKGGKRQKKVPVQEIDDDFFPSSGEEAEAASVGEGGGGGRKVGRYRDDGDEDYYKQRLRRWNKLRLQDKEKRL KLEDDSEESDAEFDEGFKVPGFLFKKLFKYQQTGVRWLWELHCQQAGGILGDEMGLGKTIQIIAFLAGLSYSKIRTRGSN YRFEGLGPTVIVCPTTVMHQWVKEFHTWWPPFRVAILHETGSYTHKKEKLIRDVAHCHGILITSYSYIRLMQDDISRYDW HYVILDEGHKIRNPNAAVTLACKQFRTPHRIILSGSPMQNNLRELWSLFDFIFPGKLGTLPVFMEQFSVPITMGGYSNAS PVQVKTAYKCACVLRDTINPYLLRRMKSDVKMSLSLPDKNEQVLFCRLTDEQHKVYQNFVDSKEVYRILNGEMQIFSGLI ALRKICNHPDLFSGGPKNLKGLPDDELEEDQFGYWKRSGKMIVVESLLKIWHKQGQRVLLFSQSRQMLDILEVFLRAQKY TYLKMDGTTTIASRQPLITRYNEDTSIFVFLLTTRVGGLGVNLTGANRVVIYDPDWNPSTDTQARERAWRIGQKKQVTVY RLLTAGTIEEKIYHRQIFKQFLTNRVLKDPKQRRFFKSNDLYELFTLTSPDASQSTETSAIFAGTGSDVQTPKCHLKRRI QPAFGADHDVPKRKKFPASNISVNDATSSEEKSEAKGAEVNAVTSNRSDPLKDDPHMSSNVTSNDRLGEETNAVSGPEEL SVISGNGECSNSSGTGKTSMPSGDESIDEKLGLSYKRERPSQAQTEAFWENKQMENNFYKHKSKTKHHSVAEEETLEKHL RPKQKPKNSKHCRDAKFEGTRIPHLVKKRRYQKQDSENKSEAKEQSNDDYVLEKLFKKSVGVHSVMKHDAIMDGASPDYV LVEAEANRVAQDALKALRLSRQRCLGAVSGVPTWTGHRGISGAPAGKKSRFGKKRNSNFSVQHPSSTSPTEKCQDGIMKK EGKDNVPEHFSGRAEDADSSSGPLASSSLLAKMRARNHLILPERLESESGHLQEASALLPTTEHDDLLVEMRNFIAFQAH TDGQASTREILQEFESKLSASQSCVFRELLRNLCTFHRTSGGEGIWKLKPEYC ; 1 19 UNP UVSSA_HUMAN Q2YD98 ? 19 ;MDQKLSKLVEELTTSGEPRLNPEKMKELKKICKSSEEQLSRAYRLLIAQLTQEHAEIRLSAFQIVEELFVRSHQFRMLVV SNFQEFLELTLGTDPAQPLPPPREAAQRLRQATTRAVEGWNEKFGEAYKKLALGYHFLRHNKKVDFQDTNARSLAERKRE EEKQKHLDKIYQERASQAEREMQEMSGEIESCLTEVESCFRLLVPFDFDPNPETESLGMASGMSDALRSSCAGQVGPCRS GTPDPRDGEQPCCSRDLPASAGHPRAGGGAQPSQTATGDPSDEDEDSDLEEFVRSHGLGSHKYTLDVELCSEGLKVQENE DNLALIHAARDTLKLIRNKFLPAVCSWIQRFTRVGTHGGCLKRAIDLKAELELVLRKYKELDIEPEGGERRRTEALGDAE EDEDDEDFVEVPEKEGYEPHIPDHLRPEYGLEAAPEKDTVVRCLRTRTRMDEEVSDPTSAAAQLRQLRDHLPPPSSASPS RALPEPQEAQKLAAERARAPVVPYGVDLHYWGQELPTAGKIVKSDSQHRFWKPSEVEEEVVNADISEMLRSRHITFAGKF EPVQHWCRAPRPDGRLCERQDRLKCPFHGKIVPRDDEGRPLDPEDRAREQRRQLQKQERPEWQDPELMRDVEAATGQDLG SSRYSGKGRGKKRRYPSLTNLKAQADTARARIGRKVFAKAAVRRVVAAMNRMDQKKHEKFSNQFNYALN ; 1 20 UNP DDB1_HUMAN Q16531 ? 20 ;MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFIL TAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLE ELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYH NGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNG VVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHA SIDLPGIKGLWPLRSDPNRETDDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVS QEPKALVSEWKEPQAKNISVASCNSSQVVVAVGRALYYLQIHPQELRQISHTEMEHEVACLDITPLGDSNGLSPLCAIGL WTDISARILKLPSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFESSHYLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRT FRSLSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGTIDEIQKLHIRTVPLYES PRKICYQEVSQCFGVLSSRIEVQDTSGGTTALRPSASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHNLLIIDQHTFE VLHAHQFLQNEYALSLVSCKLGKDPNTYFIVGTAMVYPEEAEPKQGRIVVFQYSDGKLQTVAEKEVKGAVYSMVEFNGKL LASINSTVRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEIL DDDNFLGAENAFNLFVCQKDSAATTDEERQHLQEVGLFHLGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGSVLFGTVNGMIGLV TSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDGDLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGM KREATADDLIKVVEELTRIH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8B3D A 1 ? 1970 ? A0A7M4DUC2 1 ? 1984 ? 1 1970 2 2 8B3D B 1 ? 1167 ? A0A0B8RVL1 8 ? 1174 ? 8 1174 3 3 8B3D C 1 ? 275 ? A0A481DF93 46 ? 320 ? 1 275 4 4 8B3D D 1 ? 142 ? A0A287ADR4 43 ? 184 ? 1 142 5 5 8B3D E 1 ? 210 ? I3LSI7 1 ? 210 ? 1 210 6 6 8B3D F 1 ? 127 ? F1SKN8 1 ? 127 ? 1 127 7 7 8B3D G 1 ? 254 ? 8B3D -81 ? 172 ? -81 172 8 8 8B3D H 1 ? 150 ? A0A4X1ULF2 1 ? 150 ? 1 150 9 9 8B3D I 1 ? 125 ? P60899 1 ? 125 ? 1 125 10 10 8B3D J 1 ? 67 ? A0A7K6NXI9 1 ? 67 ? 1 67 11 11 8B3D K 1 ? 117 ? A0A4X1UK25 1 ? 117 ? 1 117 12 12 8B3D L 1 ? 58 ? I3LN51 1 ? 58 ? 1 58 13 13 8B3D M 1 ? 83 ? A0A024R7E8 22 ? 104 ? 1 83 14 14 8B3D N 1 ? 52 ? 8B3D 1 ? 52 ? 1 52 15 15 8B3D P 1 ? 10 ? 8B3D 1 ? 10 ? 1 10 16 16 8B3D T 1 ? 52 ? 8B3D 1 ? 52 ? 1 52 17 17 8B3D a 1 ? 396 ? Q13216 1 ? 396 ? 1 396 18 18 8B3D b 1 ? 1493 ? Q03468 1 ? 1493 ? 1 1493 19 19 8B3D c 1 ? 709 ? Q2YD98 1 ? 709 ? 1 709 20 20 8B3D d 1 ? 1140 ? Q16531 1 ? 1140 ? 1 1140 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 TYR 1636 deletion ? 1 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1637 deletion ? 2 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1638 deletion ? 3 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 THR 1639 deletion ? 4 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1640 deletion ? 5 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1641 deletion ? 6 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1642 deletion ? 7 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 TYR 1643 deletion ? 8 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1644 deletion ? 9 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1645 deletion ? 10 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 THR 1646 deletion ? 11 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1647 deletion ? 12 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1648 deletion ? 13 1 8B3D ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1649 deletion ? 14 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BEF non-polymer . 'BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION' ? 'Be F3 -1' 66.007 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 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ZN ? ? c HIS 588 c ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? ? hydrog1 hydrog ? ? N DC 1 N3 ? ? ? 1_555 P DG 52 N1 ? ? N DC 1 T DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? N DC 1 N4 ? ? ? 1_555 P DG 52 O6 ? ? N DC 1 T DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? N DC 1 O2 ? ? ? 1_555 P DG 52 N2 ? ? N DC 1 T DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? N DT 2 N3 ? ? ? 1_555 P DA 51 N1 ? ? N DT 2 T DA 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? N DT 2 O4 ? ? ? 1_555 P DA 51 N6 ? ? N DT 2 T DA 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? N DA 3 N1 ? ? ? 1_555 P DT 50 N3 ? ? N DA 3 T DT 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? N DA 3 N6 ? ? ? 1_555 P DT 50 O4 ? ? N DA 3 T DT 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? N DG 4 N1 ? ? ? 1_555 P DC 49 N3 ? ? N DG 4 T DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? N DG 4 N2 ? ? ? 1_555 P DC 49 O2 ? ? N DG 4 T DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? N DG 4 O6 ? ? ? 1_555 P DC 49 N4 ? ? N DG 4 T DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? N DT 5 N3 ? ? ? 1_555 P DA 48 N1 ? ? N DT 5 T DA 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? N DT 5 O4 ? ? ? 1_555 P DA 48 N6 ? ? N DT 5 T DA 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? N DT 6 N3 ? ? ? 1_555 P DA 47 N1 ? ? N DT 6 T DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? N DT 6 O4 ? ? ? 1_555 P DA 47 N6 ? ? N DT 6 T DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? N DG 7 N1 ? ? ? 1_555 P DC 46 N3 ? ? N DG 7 T DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? N DG 7 N2 ? ? ? 1_555 P DC 46 O2 ? ? N DG 7 T DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? N DG 7 O6 ? ? ? 1_555 P DC 46 N4 ? ? N DG 7 T DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? N DA 8 N1 ? ? ? 1_555 P DT 45 N3 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog109 hydrog ? ? O G 9 N2 ? ? ? 1_555 P DC 26 O2 ? ? P G 9 T DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog110 hydrog ? ? O G 9 O6 ? ? ? 1_555 P DC 26 N4 ? ? P G 9 T DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog111 hydrog ? ? O A 10 N1 ? ? ? 1_555 P DT 25 N3 ? ? P A 10 T DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog112 hydrog ? ? O A 10 N6 ? ? ? 1_555 P DT 25 O4 ? ? P A 10 T DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 461 A . ? GLN 461 A PRO 462 A ? PRO 462 A 1 -1.31 2 LYS 581 A . ? LYS 581 A PRO 582 A ? PRO 582 A 1 0.91 3 ARG 52 E . ? ARG 52 E PRO 53 E ? PRO 53 E 1 3.01 4 PRO 101 S . ? 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CE B LYS 95 ? ? 138.47 111.90 26.57 3.00 N 95 1 CD B LYS 95 ? ? CE B LYS 95 ? ? NZ B LYS 95 ? ? 127.77 111.70 16.07 2.30 N 96 1 CB B MET 109 ? ? CG B MET 109 ? ? SD B MET 109 ? ? 137.53 112.40 25.13 3.00 N 97 1 CG B MET 109 ? ? SD B MET 109 ? ? CE B MET 109 ? ? 111.88 100.20 11.68 1.60 N 98 1 OG1 B THR 159 ? ? CB B THR 159 ? ? CG2 B THR 159 ? ? 91.22 110.00 -18.78 2.30 N 99 1 CB B ARG 169 ? ? CG B ARG 169 ? ? CD B ARG 169 ? ? 132.83 111.60 21.23 2.60 N 100 1 CG B ARG 169 ? ? CD B ARG 169 ? ? NE B ARG 169 ? ? 140.28 111.80 28.48 2.10 N 101 1 CA B GLU 173 ? ? CB B GLU 173 ? ? CG B GLU 173 ? ? 130.99 113.40 17.59 2.20 N 102 1 CA B MET 200 ? ? CB B MET 200 ? ? CG B MET 200 ? ? 123.89 113.30 10.59 1.70 N 103 1 CG B ARG 255 ? ? CD B ARG 255 ? ? NE B ARG 255 ? ? 126.08 111.80 14.28 2.10 N 104 1 NE B ARG 255 ? ? CZ B ARG 255 ? ? NH2 B ARG 255 ? ? 124.96 120.30 4.66 0.50 N 105 1 CA B GLU 296 ? ? CB B GLU 296 ? ? CG B GLU 296 ? ? 134.55 113.40 21.15 2.20 N 106 1 CB B VAL 301 ? ? CA B VAL 301 ? ? C B VAL 301 ? ? 97.85 111.40 -13.55 1.90 N 107 1 CA B VAL 301 ? ? CB B VAL 301 ? ? CG1 B VAL 301 ? ? 120.65 110.90 9.75 1.50 N 108 1 CA B VAL 301 ? ? CB B VAL 301 ? ? CG2 B VAL 301 ? ? 121.83 110.90 10.93 1.50 N 109 1 CA B CYS 357 ? ? CB B CYS 357 ? ? SG B CYS 357 ? ? 125.55 114.20 11.35 1.10 N 110 1 CB B ARG 380 ? ? CG B ARG 380 ? ? CD B ARG 380 ? ? 129.81 111.60 18.21 2.60 N 111 1 CG B ARG 380 ? ? CD B ARG 380 ? ? NE B ARG 380 ? ? 124.47 111.80 12.67 2.10 N 112 1 CB B TYR 388 ? ? CG B TYR 388 ? ? CD2 B TYR 388 ? ? 114.05 121.00 -6.95 0.60 N 113 1 CB B LEU 393 ? ? CG B LEU 393 ? ? CD1 B LEU 393 ? ? 124.62 111.00 13.62 1.70 N 114 1 CB B LEU 393 ? ? CG B LEU 393 ? ? CD2 B LEU 393 ? ? 125.73 111.00 14.73 1.70 N 115 1 CA B VAL 520 ? ? CB B VAL 520 ? ? CG1 B VAL 520 ? ? 120.04 110.90 9.14 1.50 N 116 1 CB B TRP 548 ? ? CG B TRP 548 ? ? CD2 B TRP 548 ? ? 118.23 126.60 -8.37 1.30 N 117 1 N B TRP 548 ? ? CA B TRP 548 ? ? C B TRP 548 ? ? 92.76 111.00 -18.24 2.70 N 118 1 CA B GLU 555 ? ? CB B GLU 555 ? ? CG B GLU 555 ? ? 127.35 113.40 13.95 2.20 N 119 1 CA B CYS 572 ? ? CB B CYS 572 ? ? SG B CYS 572 ? ? 122.84 114.20 8.64 1.10 N 120 1 CD B LYS 578 ? ? CE B LYS 578 ? ? NZ B LYS 578 ? ? 129.54 111.70 17.84 2.30 N 121 1 CG B ARG 613 ? ? CD B ARG 613 ? ? NE B ARG 613 ? ? 124.70 111.80 12.90 2.10 N 122 1 NE B ARG 613 ? ? CZ B ARG 613 ? ? NH2 B ARG 613 ? ? 124.57 120.30 4.27 0.50 N 123 1 CD B LYS 632 ? ? CE B LYS 632 ? ? NZ B LYS 632 ? ? 130.12 111.70 18.42 2.30 N 124 1 CG B ARG 770 ? ? CD B ARG 770 ? ? NE B ARG 770 ? ? 127.05 111.80 15.25 2.10 N 125 1 NE B ARG 770 ? ? CZ B ARG 770 ? ? NH2 B ARG 770 ? ? 124.17 120.30 3.87 0.50 N 126 1 CG1 B VAL 780 ? ? CB B VAL 780 ? ? CG2 B VAL 780 ? ? 93.43 110.90 -17.47 1.60 N 127 1 CD B LYS 815 ? ? CE B LYS 815 ? ? NZ B LYS 815 ? ? 126.75 111.70 15.05 2.30 N 128 1 CD B LYS 917 ? ? CE B LYS 917 ? ? NZ B LYS 917 ? ? 133.04 111.70 21.34 2.30 N 129 1 CA B GLU 995 ? ? CB B GLU 995 ? ? CG B GLU 995 ? ? 129.26 113.40 15.86 2.20 N 130 1 CG B LYS 1010 ? ? CD B LYS 1010 ? ? CE B LYS 1010 ? ? 132.09 111.90 20.19 3.00 N 131 1 NE B ARG 1091 ? ? CZ B ARG 1091 ? ? NH2 B ARG 1091 ? ? 117.14 120.30 -3.16 0.50 N 132 1 CB B LEU 1121 ? ? CG B LEU 1121 ? ? CD2 B LEU 1121 ? ? 125.89 111.00 14.89 1.70 N 133 1 CG B ARG 1138 ? ? CD B ARG 1138 ? ? NE B ARG 1138 ? ? 135.30 111.80 23.50 2.10 N 134 1 CA B MET 1163 ? ? CB B MET 1163 ? ? CG B MET 1163 ? ? 125.81 113.30 12.51 1.70 N 135 1 CA C GLU 109 ? ? CB C GLU 109 ? ? CG C GLU 109 ? ? 131.77 113.40 18.37 2.20 N 136 1 CB C GLN 111 ? ? CA C GLN 111 ? ? C C GLN 111 ? ? 124.28 110.40 13.88 2.00 N 137 1 N C GLN 111 ? ? CA C GLN 111 ? ? CB C GLN 111 ? ? 98.44 110.60 -12.16 1.80 N 138 1 CA C GLN 111 ? ? CB C GLN 111 ? ? CG C GLN 111 ? ? 140.27 113.40 26.87 2.20 N 139 1 CA C LYS 225 ? ? CB C LYS 225 ? ? CG C LYS 225 ? ? 138.90 113.40 25.50 2.20 N 140 1 CG C ARG 228 ? ? CD C ARG 228 ? ? NE C ARG 228 ? ? 124.71 111.80 12.91 2.10 N 141 1 CD C ARG 228 ? ? NE C ARG 228 ? ? CZ C ARG 228 ? ? 135.21 123.60 11.61 1.40 N 142 1 CB C ARG 240 ? ? CG C ARG 240 ? ? CD C ARG 240 ? ? 136.04 111.60 24.44 2.60 N 143 1 CG C ARG 240 ? ? CD C ARG 240 ? ? NE C ARG 240 ? ? 148.82 111.80 37.02 2.10 N 144 1 CD C ARG 240 ? ? NE C ARG 240 ? ? CZ C ARG 240 ? ? 114.64 123.60 -8.96 1.40 N 145 1 CB C LYS 254 ? ? CG C LYS 254 ? ? CD C LYS 254 ? ? 128.26 111.60 16.66 2.60 N 146 1 CA C GLN 268 ? ? CB C GLN 268 ? ? CG C GLN 268 ? ? 128.12 113.40 14.72 2.20 N 147 1 CB D LEU 20 ? ? CG D LEU 20 ? ? CD2 D LEU 20 ? ? 98.96 111.00 -12.04 1.70 N 148 1 CA D LEU 41 ? ? CB D LEU 41 ? ? CG D LEU 41 ? ? 95.60 115.30 -19.70 2.30 N 149 1 CD1 D LEU 41 ? ? CG D LEU 41 ? ? CD2 D LEU 41 ? ? 84.52 110.50 -25.98 3.00 N 150 1 CB D LEU 41 ? ? CG D LEU 41 ? ? CD1 D LEU 41 ? ? 149.81 111.00 38.81 1.70 N 151 1 CB D LEU 41 ? ? CG D LEU 41 ? ? CD2 D LEU 41 ? ? 80.51 111.00 -30.49 1.70 N 152 1 CB D ARG 44 ? ? CG D ARG 44 ? ? CD D ARG 44 ? ? 131.71 111.60 20.11 2.60 N 153 1 NE D ARG 44 ? ? CZ D ARG 44 ? ? NH1 D ARG 44 ? ? 117.21 120.30 -3.09 0.50 N 154 1 CB D LEU 65 ? ? CG D LEU 65 ? ? CD1 D LEU 65 ? ? 134.03 111.00 23.03 1.70 N 155 1 CB D LEU 65 ? ? CG D LEU 65 ? ? CD2 D LEU 65 ? ? 78.51 111.00 -32.49 1.70 N 156 1 CA D LEU 88 ? ? CB D LEU 88 ? ? CG D LEU 88 ? ? 129.20 115.30 13.90 2.30 N 157 1 CB D LEU 88 ? ? CG D LEU 88 ? ? CD1 D LEU 88 ? ? 90.07 111.00 -20.93 1.70 N 158 1 CB D LEU 88 ? ? CG D LEU 88 ? ? CD2 D LEU 88 ? ? 125.34 111.00 14.34 1.70 N 159 1 CA D LEU 92 ? ? CB D LEU 92 ? ? CG D LEU 92 ? ? 141.87 115.30 26.57 2.30 N 160 1 CB D LEU 92 ? ? CG D LEU 92 ? ? CD1 D LEU 92 ? ? 123.79 111.00 12.79 1.70 N 161 1 CA E GLU 5 ? ? CB E GLU 5 ? ? CG E GLU 5 ? ? 128.30 113.40 14.90 2.20 N 162 1 CB E LEU 10 ? ? CG E LEU 10 ? ? CD1 E LEU 10 ? ? 98.68 111.00 -12.32 1.70 N 163 1 N E LYS 12 ? ? CA E LYS 12 ? ? CB E LYS 12 ? ? 122.90 110.60 12.30 1.80 N 164 1 CA E LYS 12 ? ? CB E LYS 12 ? ? CG E LYS 12 ? ? 133.10 113.40 19.70 2.20 N 165 1 CD E LYS 47 ? ? CE E LYS 47 ? ? NZ E LYS 47 ? ? 136.05 111.70 24.35 2.30 N 166 1 CA E LYS 85 ? ? CB E LYS 85 ? ? CG E LYS 85 ? ? 127.44 113.40 14.04 2.20 N 167 1 CA E LYS 88 ? ? CB E LYS 88 ? ? CG E LYS 88 ? ? 132.76 113.40 19.36 2.20 N 168 1 CD E LYS 88 ? ? CE E LYS 88 ? ? NZ E LYS 88 ? ? 126.51 111.70 14.81 2.30 N 169 1 CA E GLU 96 ? ? CB E GLU 96 ? ? CG E GLU 96 ? ? 127.82 113.40 14.42 2.20 N 170 1 CG E ARG 101 ? ? CD E ARG 101 ? ? NE E ARG 101 ? ? 124.43 111.80 12.63 2.10 N 171 1 CD E ARG 101 ? ? NE E ARG 101 ? ? CZ E ARG 101 ? ? 134.77 123.60 11.17 1.40 N 172 1 NE E ARG 101 ? ? CZ E ARG 101 ? ? NH1 E ARG 101 ? ? 125.08 120.30 4.78 0.50 N 173 1 NE E ARG 101 ? ? CZ E ARG 101 ? ? NH2 E ARG 101 ? ? 114.34 120.30 -5.96 0.50 N 174 1 CD1 E LEU 103 ? ? CG E LEU 103 ? ? CD2 E LEU 103 ? ? 92.44 110.50 -18.06 3.00 N 175 1 CB E LEU 103 ? ? CG E LEU 103 ? ? CD1 E LEU 103 ? ? 126.13 111.00 15.13 1.70 N 176 1 CB E LEU 103 ? ? CG E LEU 103 ? ? 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_em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 42 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8B3D 'double helix' 8B3D 'a-form double helix' 8B3D 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 N DC 1 1_555 P DG 52 1_555 0.218 -0.255 0.773 2.838 1.448 1.423 1 N_DC1:DG52_T N 1 ? 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