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'polypeptide(L)' no no ;MARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFI NGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; ;MARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFI NGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW KKAYVTLKEGQNLDFVGGAE ; ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW 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MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA V ? 23 'polypeptide(L)' no no MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE W ? 24 'polypeptide(L)' no no MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNIPGSK MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNIPGSK X ? 25 'polypeptide(L)' no no MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK a ? 26 'polypeptide(L)' no no MAKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAKIK MAKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAKIK b ? 27 'polypeptide(L)' no no MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK c ? 28 'polypeptide(L)' no no MPKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA MPKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA d ? 29 'polypeptide(L)' no no MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG e ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAV KDAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDA LFVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRSQDLASQAEESFVEA E ; ;MATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAV KDAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDA LFVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRSQDLASQAEESFVEA E ; f ? 31 'polypeptide(L)' no no ;MGQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKK GEDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGA EIARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEILGGMAAVEQPEKPAAQPKKQQRKGRK ; ;MGQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKK 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'polypeptide(L)' no no ;MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRF NDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEE ; ;MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRF NDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEE ; j ? 35 'polypeptide(L)' no no ;MPRRRVIGQRKILPDPKFGSELLAKFVNILMVDGKKSTAESIVYSALETLAQRSGKSELEAFEVALENVRPTVEVKSRRV GGSTYQVPVEVRPVRRNALAMRWIVEAARKRGDKSMALRLANELSDAAENKGTAVKKREDVHRMAEANKAFAHYRWLSLR SFSHQAGASSKQPALGYLN ; ;MPRRRVIGQRKILPDPKFGSELLAKFVNILMVDGKKSTAESIVYSALETLAQRSGKSELEAFEVALENVRPTVEVKSRRV GGSTYQVPVEVRPVRRNALAMRWIVEAARKRGDKSMALRLANELSDAAENKGTAVKKREDVHRMAEANKAFAHYRWLSLR SFSHQAGASSKQPALGYLN ; k ? 36 'polypeptide(L)' no no ;MSMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSR PGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA ; ;MSMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSR PGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA ; l ? 37 'polypeptide(L)' no no ;MAENQYYGTGRRKSSAARVFIKPGNGKIVINQRSLEQYFGRETARMVVRQPLELVDMVEKLDLYITVKGGGISGQAGAIR HGITRALMEYDESLRSELRKAGFVTRDARQVERKKVGLRKARRRPQFSKR ; ;MAENQYYGTGRRKSSAARVFIKPGNGKIVINQRSLEQYFGRETARMVVRQPLELVDMVEKLDLYITVKGGGISGQAGAIR HGITRALMEYDESLRSELRKAGFVTRDARQVERKKVGLRKARRRPQFSKR ; m ? 38 'polypeptide(L)' no no ;MQNQRIRIRLKAFDHRLIDQATAEIVETAKRTGAQVRGPIPLPTRKERFTVLISPHVNKDARDQYEIRTHLRLVDIVEPT EKTVDALMRLDLAAGVDVQISLG ; ;MQNQRIRIRLKAFDHRLIDQATAEIVETAKRTGAQVRGPIPLPTRKERFTVLISPHVNKDARDQYEIRTHLRLVDIVEPT EKTVDALMRLDLAAGVDVQISLG ; n ? 39 'polypeptide(L)' no no ;MAKAPIRARKRVRKQVSDGVAHIHASFNNTIVTITDRQGNALGWATAGGSGFRGSRKSTPFAAQVAAERCADAVKEYGIK NLEVMVKGPGPGRESTIRALNAAGFRITNITDVTPIPHNGCRPPKKRRV ; ;MAKAPIRARKRVRKQVSDGVAHIHASFNNTIVTITDRQGNALGWATAGGSGFRGSRKSTPFAAQVAAERCADAVKEYGIK NLEVMVKGPGPGRESTIRALNAAGFRITNITDVTPIPHNGCRPPKKRRV ; o ? 40 'polypeptide(L)' no no ;MATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVI LIRGGRVKDLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA ; ;MATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVI LIRGGRVKDLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA ; p ? 41 'polypeptide(L)' no no ;MARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRL MDLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; ;MARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRL MDLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; q ? 42 'polypeptide(L)' no no ;MAKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLS RIKVREAAMRGEIPGLKKASW ; ;MAKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLS RIKVREAAMRGEIPGLKKASW ; r ? 43 'polypeptide(L)' no no ;MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQ LIERLGLRR ; ;MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQ LIERLGLRR ; s ? 44 'polypeptide(L)' no no ;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; 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MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY y ? 50 polyribonucleotide no no ;GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCG GUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGA AUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCC AGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGA UACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUG AAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAA GAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGC GUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUC UUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACU AACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGA 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23 MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE 1 24 UNP RL31_ECOLI P0A7M9 ? 24 MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNIPGSK 1 25 UNP RL32_ECOLI P0A7N4 ? 25 MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK 1 26 UNP RL33_ECOLI P0A7N9 ? 26 MAKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAKIK 1 27 UNP RL34_ECOLI P0A7P5 ? 27 MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK 1 28 UNP RL35_ECOLI P0A7Q1 ? 28 MPKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA 1 29 UNP RL36_ECOLI P0A7Q6 ? 29 MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG 1 30 UNP RS2_ECOLI P0A7V0 ? 30 ;MATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAV KDAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDA LFVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRSQDLASQAEESFVEA E ; 1 31 UNP RS3_ECOLI P0A7V3 ? 31 ;MGQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKK GEDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGA EIARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEILGGMAAVEQPEKPAAQPKKQQRKGRK ; 1 32 UNP RS4_ECOLI P0A7V8 ? 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ZA C 47 N4 ? ? ? 1_555 ZA G 361 O6 ? ? 2 C 47 2 G 361 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3002 hydrog ? ? ZA C 47 O2 ? ? ? 1_555 ZA G 361 N2 ? ? 2 C 47 2 G 361 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3003 hydrog ? ? ZA U 49 O4 ? ? ? 1_555 ZA G 362 N2 ? ? 2 U 49 2 G 362 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog3004 hydrog ? ? ZA U 49 O4 ? ? ? 1_555 ZA U 365 N3 ? ? 2 U 49 2 U 365 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog3005 hydrog ? ? ZA A 50 N3 ? ? ? 1_555 ZA G 360 N2 ? ? 2 A 50 2 G 360 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog3006 hydrog ? ? ZA A 51 N6 ? ? ? 1_555 ZA U 114 O2 ? ? 2 A 51 2 U 114 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog3007 hydrog ? ? ZA C 52 N3 ? ? ? 1_555 ZA G 359 N1 ? ? 2 C 52 2 G 359 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3008 hydrog ? ? ZA C 52 N4 ? ? ? 1_555 ZA G 359 O6 ? ? 2 C 52 2 G 359 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3009 hydrog ? ? ZA C 52 O2 ? ? ? 1_555 ZA G 359 N2 ? ? 2 C 52 2 G 359 1_555 ? ? ? ? ? ? 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ZA A 1346 N6 ? ? ? 1_555 ZA A 1375 N7 ? ? 2 A 1346 2 A 1375 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog4281 hydrog ? ? ZA A 1346 N7 ? ? ? 1_555 ZA A 1375 N6 ? ? 2 A 1346 2 A 1375 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog4282 hydrog ? ? ZA U 1348 N3 ? ? ? 1_555 ZA A 1374 N7 ? ? 2 U 1348 2 A 1374 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog4283 hydrog ? ? ZA U 1348 O2 ? ? ? 1_555 ZA A 1374 N6 ? ? 2 U 1348 2 A 1374 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog4284 hydrog ? ? ZA A 1349 N6 ? ? ? 1_555 ZA G 1373 N3 ? ? 2 A 1349 2 G 1373 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog4285 hydrog ? ? ZA A 1349 N7 ? ? ? 1_555 ZA G 1373 N2 ? ? 2 A 1349 2 G 1373 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog4286 hydrog ? ? ZA A 1350 N1 ? ? ? 1_555 ZA U 1372 N3 ? ? 2 A 1350 2 U 1372 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4287 hydrog ? ? ZA A 1350 N6 ? ? ? 1_555 ZA U 1372 O4 ? ? 2 A 1350 2 U 1372 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4288 hydrog ? ? 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PRO 52 O 1 -0.52 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 7 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 6 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 7 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 3 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 4 ? AF8 ? 5 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 3 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 4 ? AG8 ? 4 ? AG9 ? 3 ? AH1 ? 6 ? AH2 ? 6 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 6 ? 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LYS A 5 ? VAL A 3 LYS A 5 AA1 2 VAL A 17 ? VAL A 19 ? VAL A 17 VAL A 19 AA2 1 LEU A 34 ? LYS A 36 ? LEU A 34 LYS A 36 AA2 2 ALA A 61 ? ARG A 63 ? ALA A 61 ARG A 63 AA3 1 ARG A 101 ? LEU A 105 ? ARG A 101 LEU A 105 AA3 2 ILE A 91 ? TYR A 96 ? ILE A 91 TYR A 96 AA3 3 ALA A 76 ? GLU A 82 ? ALA A 76 GLU A 82 AA3 4 GLN A 115 ? ILE A 116 ? GLN A 115 ILE A 116 AA4 1 THR A 129 ? PRO A 131 ? THR A 129 PRO A 131 AA4 2 ARG A 189 ? LEU A 192 ? ARG A 189 LEU A 192 AA4 3 THR A 140 ? HIS A 142 ? THR A 140 HIS A 142 AA4 4 VAL A 162 ? ASP A 168 ? VAL A 162 ASP A 168 AA4 5 TYR A 171 ? ARG A 175 ? TYR A 171 ARG A 175 AA4 6 MET A 181 ? GLU A 185 ? MET A 181 GLU A 185 AA4 7 ILE A 267 ? ARG A 269 ? ILE A 267 ARG A 269 AA5 1 LEU B 4 ? PHE B 15 ? LEU B 4 PHE B 15 AA5 2 SER B 21 ? GLU B 28 ? SER B 21 GLU B 28 AA5 3 LEU B 186 ? LYS B 190 ? LEU B 186 LYS B 190 AA5 4 ARG B 169 ? ASP B 181 ? ARG B 169 ASP B 181 AA5 5 LYS B 106 ? THR B 112 ? LYS B 106 THR B 112 AA5 6 ASP B 200 ? PRO B 205 ? 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VAL O 58 ARG O 68 AD1 4 THR O 32 ? PHE O 35 ? THR O 32 PHE O 35 AD2 1 VAL O 72 ? ARG O 78 ? VAL O 72 ARG O 78 AD2 2 TYR O 83 ? HIS O 89 ? TYR O 83 HIS O 89 AD3 1 GLU P 2 ? ALA P 10 ? GLU P 2 ALA P 10 AD3 2 SER P 101 ? SER P 108 ? SER P 101 SER P 108 AD3 3 LYS P 70 ? GLU P 78 ? LYS P 70 GLU P 78 AD4 1 MET P 82 ? PRO P 87 ? MET P 82 PRO P 87 AD4 2 ALA P 93 ? LYS P 98 ? ALA P 93 LYS P 98 AD5 1 LEU Q 11 ? PRO Q 14 ? LEU Q 11 PRO Q 14 AD5 2 THR Q 29 ? VAL Q 34 ? THR Q 29 VAL Q 34 AD5 3 TRP Q 80 ? LEU Q 87 ? TRP Q 80 LEU Q 87 AD5 4 VAL Q 55 ? VAL Q 63 ? VAL Q 55 VAL Q 63 AD6 1 VAL Q 67 ? HIS Q 70 ? VAL Q 67 HIS Q 70 AD6 2 ARG Q 73 ? ARG Q 76 ? ARG Q 73 ARG Q 76 AD7 1 ILE R 65 ? GLN R 66 ? ILE R 65 GLN R 66 AD7 2 LYS R 33 ? VAL R 36 ? LYS R 33 VAL R 36 AD7 3 ARG R 22 ? VAL R 28 ? ARG R 22 VAL R 28 AD7 4 GLU R 10 ? VAL R 13 ? GLU R 10 VAL R 13 AD7 5 VAL R 70 ? ASN R 74 ? VAL R 70 ASN R 74 AD7 6 LYS R 79 ? ASP R 81 ? LYS R 79 ASP R 81 AD8 1 LEU R 41 ? GLN R 46 ? 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_pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 54-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 54 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB ; # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 233380 ? 1 MORE -1923 ? 1 'SSA (A^2)' 856960 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 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_pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_entry_details.entry_id 8BIL _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y # loop_ _em_3d_fitting.id _em_3d_fitting.entry_id _em_3d_fitting.method _em_3d_fitting.target_criteria _em_3d_fitting.details _em_3d_fitting.overall_b_value _em_3d_fitting.ref_space _em_3d_fitting.ref_protocol 1 8BIL ? ? ;Following rigid body fitting we used online Namdiantor tool to perform initial flexible fitting: https://namdinator.au.dk/namdinator/ ; ? REAL 'RIGID BODY FIT' 2 8BIL ? ? ? ? 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'1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 50, 51' 3 1 NATURAL COMPLEX '30S subunit' ? ? ? '30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 52' 4 2 NATURAL COMPLEX '23S and 5S rRNA' ? ? ? '50, 51' 5 3 NATURAL COMPLEX '16S rRNA' ? ? ? 52 6 1 NATURAL COMPLEX 'mRNA and tRNA' ? ? ? 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N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 CYS N CA sing N N 145 CYS N H sing N N 146 CYS N H2 sing N N 147 CYS CA C sing N N 148 CYS CA CB sing N N 149 CYS CA HA sing N N 150 CYS C O doub N N 151 CYS C OXT sing N N 152 CYS CB SG sing N N 153 CYS CB HB2 sing N N 154 CYS CB HB3 sing N N 155 CYS SG HG sing N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 FME N CN sing N N 158 FME N CA sing N N 159 FME N H sing N N 160 FME CN O1 doub N N 161 FME CN HCN sing N N 162 FME CA CB sing N N 163 FME CA C sing N N 164 FME CA HA sing N N 165 FME CB CG sing N N 166 FME CB HB2 sing N N 167 FME CB HB3 sing N N 168 FME CG SD sing N N 169 FME CG HG2 sing N N 170 FME CG HG3 sing N N 171 FME SD CE sing N N 172 FME CE HE1 sing N N 173 FME CE HE2 sing N N 174 FME CE HE3 sing N N 175 FME C O doub N N 176 FME C OXT sing N N 177 FME OXT HXT sing N N 178 G OP3 P sing N N 179 G OP3 HOP3 sing N N 180 G P OP1 doub N N 181 G P OP2 sing N N 182 G P "O5'" sing N 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'SYMMETRY DETERMINATION' ? 26 1 1 1 ? ? 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 27 1 1 1 ? ? # _em_specimen.concentration 10 _em_specimen.details ;Initiation complex containing: 1x TAKM7 buffer 1 mM DTT (dithiothreitol) 1 mM GTP (guanosine 5'-triphosphate) 2.0 uM 70S ribosomes 3.0 uM IF1, IF2, IF3 mix 6.0 uM A-site AAA mRNA 3.0 uM fMet-tRNAfMet Mixed 1:1 with a ternary complex containing: 1x TAKM7 buffer 3 mM PEP (phosphoenolpyruvate) 1 mM GTP (guanosine 5'-triphosphate) 1 mM DTT (dithiothreitol) 1% PK (pyruvate kinase) 0.02 uM EF-Ts 1.5 uM EF-Tu not containing 0.3 uM Lys-tRNALys Incubated on ice for 60 seconds Final concentration of the sample: 20 A260 (absorbance at 260 nm, 10 mm path), 10 A280 (absorbance at 280 nm, 10 mm path) ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8BIL 'double helix' 8BIL 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 XA G 1 1_555 XA C 2902 1_555 -0.178 -0.214 -0.602 -3.136 -3.773 0.538 1 0_G1:C2902_0 0 1 ? 0 2902 ? 19 1 1 XA G 2 1_555 XA C 2901 1_555 -0.215 -0.106 -0.264 -6.783 -4.999 -0.362 2 0_G2:C2901_0 0 2 ? 0 2901 ? 19 1 1 XA U 3 1_555 XA A 2900 1_555 -0.406 0.584 -0.017 -2.421 -8.275 -4.963 3 0_U3:A2900_0 0 3 ? 0 2900 ? 20 1 1 XA U 4 1_555 XA A 2899 1_555 -0.251 0.529 0.003 0.070 -6.284 -5.397 4 0_U4:A2899_0 0 4 ? 0 2899 ? 20 1 1 XA A 5 1_555 XA U 2898 1_555 0.141 0.519 0.189 -1.399 -5.897 1.300 5 0_A5:U2898_0 0 5 ? 0 2898 ? 20 1 1 XA A 6 1_555 XA U 2897 1_555 0.256 0.478 0.215 0.433 -3.850 -1.262 6 0_A6:U2897_0 0 6 ? 0 2897 ? 20 1 1 XA G 7 1_555 XA C 2896 1_555 -0.155 -0.043 0.173 3.118 -3.648 -1.458 7 0_G7:C2896_0 0 7 ? 0 2896 ? 19 1 1 XA C 8 1_555 XA G 2895 1_555 0.221 -0.070 0.174 0.152 -7.297 -1.194 8 0_C8:G2895_0 0 8 ? 0 2895 ? 19 1 1 XA G 9 1_555 XA A 2800 1_555 3.998 -3.412 0.081 -4.441 -0.244 -69.779 9 0_G9:A2800_0 0 9 ? 0 2800 ? 10 6 1 XA U 12 1_555 XA A 526 1_555 3.707 -1.354 -0.824 -6.647 11.372 -102.372 10 0_U12:A526_0 0 12 ? 0 526 ? 24 4 1 XA G 15 1_555 XA U 525 1_555 -2.637 -0.362 -0.480 -5.224 -4.236 -0.190 11 0_G15:U525_0 0 15 ? 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0 515 ? ? ? 1 XA G 26 1_555 XA A 514 1_555 6.895 -4.387 -0.149 -14.857 6.445 -2.561 22 0_G26:A514_0 0 26 ? 0 514 ? 11 10 1 XA G 27 1_555 XA A 513 1_555 6.686 -4.601 0.259 20.864 18.004 -4.342 23 0_G27:A513_0 0 27 ? 0 513 ? 11 10 1 XA A 28 1_555 XA G 512 1_555 -6.541 -4.029 1.430 -17.570 3.318 11.561 24 0_A28:G512_0 0 28 ? 0 512 ? 11 9 1 XA U 29 1_555 XA U 511 1_555 -2.575 -1.743 0.506 -5.475 -2.822 11.114 25 0_U29:U511_0 0 29 ? 0 511 ? 16 1 1 XA G 30 1_555 XA C 510 1_555 -0.161 -0.041 0.157 -5.299 8.450 -1.152 26 0_G30:C510_0 0 30 ? 0 510 ? 19 1 1 XA C 31 1_555 XA G 474 1_555 0.209 -0.021 0.211 -3.652 3.402 -0.392 27 0_C31:G474_0 0 31 ? 0 474 ? 19 1 1 XA C 32 1_555 XA G 473 1_555 0.130 0.014 0.142 -1.723 -3.031 0.921 28 0_C32:G473_0 0 32 ? 0 473 ? 19 1 1 XA C 33 1_555 XA A 447 1_555 3.249 -0.335 -0.198 7.401 -3.893 -92.038 29 0_C33:A447_0 0 33 ? 0 447 ? 25 4 1 XA A 454 1_555 XA G 446 1_555 -3.908 3.901 0.590 -30.346 -13.665 73.005 30 0_A454:G446_0 0 454 ? 0 446 ? 10 6 1 XA G 35 1_555 XA C 445 1_555 -0.246 -0.007 0.147 6.372 12.892 0.878 31 0_G35:C445_0 0 35 ? 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