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G103A ? 'The mutation reported is found to occur spontaneous when expressing histones in E. coli.' 36 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? 0 ? ? 37 polymer man 'Histone H2A type 1' 14093.436 2 ? ? ? 'The mutation reported is found to occur spontaneous when expressing histones in E. coli.' 38 polymer man 'Histone H2B 1.1' 13965.265 2 ? ? ? ? 39 non-polymer syn 'IRON/SULFUR CLUSTER' 351.640 1 ? ? ? ? 40 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 17 ? ? ? ? 41 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;TFIIH subunit XPB,Basic transcription factor 2 89 kDa subunit,BTF2 p89,DNA excision repair protein ERCC-3,DNA repair protein complementing XP-B cells,TFIIH basal transcription factor complex 89 kDa subunit,TFIIH 89 kDa subunit,TFIIH p89,Xeroderma pigmentosum group B-complementing protein ; 2 ;Basic transcription factor 2 80 kDa subunit,BTF2 p80,CXPD,DNA excision repair protein ERCC-2,DNA repair protein complementing XP-D cells,TFIIH basal transcription factor complex 80 kDa subunit,TFIIH p80,Xeroderma pigmentosum group D-complementing protein ; 3 ;Basic transcription factor 2 62 kDa subunit,BTF2 p62,General transcription factor 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LRAAASKLEQGKRVSEMPAAKRLRLDTGPQSLSGKSTPQPPSGKTTPNSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTK KTGLSSEQTVNVLAQILKRLNPERKMINDKMHFSLKE ; ;MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKKYNIMAFNAADKVNFATWNQARLERDLSNKKIYQEEEMPESGAGSEFNRKLREEAR RKKYGIVLKEFRPEDQPWLLRVNGKSGRKFKGIKKGGVTENTSYYIFTQCPDGAFEAFPVHNWYNFTPLARHRTLTAEEA EEEWERRNKVLNHFSIMQQRRLKDQDQDEDEEEKEKRGRRKASELRIHDLEDDLEMSSDASDASGEEGGRVPKAKKKAPL AKGGRKKKKKKGSDDEAFEDSDDGDFEGQEVDYMSDGSSSSQEEPESKAKAPQQEEGPKGVDEQSDSSEESEEEKPPEED KEEEEEKKAPTPQEKKRRKDSSEESDSSEESDIDSEASSALFMAKKKTPPKRERKPSGGSSRGNSRPGTPSAEGGSTSST LRAAASKLEQGKRVSEMPAAKRLRLDTGPQSLSGKSTPQPPSGKTTPNSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTK KTGLSSEQTVNVLAQILKRLNPERKMINDKMHFSLKE ; Q ? 27 'polypeptide(L)' no no ;MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKASGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPRE HPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQ YNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKEIGVQNVKGIHKNTWELKPEYR HYQGEEKSD ; ;MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKASGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPRE HPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQ YNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKEIGVQNVKGIHKNTWELKPEYR HYQGEEKSD ; R ? 28 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC) (DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA) (DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA) (DG)(DA)(DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DA)(DC)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC) (DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DC) (DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DG) ; ;ATCGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTA CGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCGATCAGCGATGCGGAA GAGAGTGAGGACGAACGCGCCCCCACCCCCTTTTATAGCCCCCCTTCAGGAACACCCG ; T ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG QLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV AAPTPAQAQITATGQQQPQAQPAQTQAPLVLQVDGTGDTSSEEDEDEEEDYDDDEEEDKEKDGAEDGQVEEEPLNSEDDV SDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDYIFSKAIGDAEW ; ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG QLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV AAPTPAQAQITATGQQQPQAQPAQTQAPLVLQVDGTGDTSSEEDEDEEEDYDDDEEEDKEKDGAEDGQVEEEPLNSEDDV SDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDYIFSKAIGDAEW ; U ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MAYQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINAALAQRVRNRVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVE FREVTELIKVDKVKIVACDGKNTGSNTTE ; ;MAYQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINAALAQRVRNRVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVE FREVTELIKVDKVKIVACDGKNTGSNTTE ; V ? 31 'polypeptide(L)' no no ;MADPDVLTEVPAALKRLAKYVIRGFYGIEHALALDILIRNSCVKEEDMLELLKFDRKQLRSVLNNLKGDKFIKCRMRVET AADGKTTRHNYYFINYRTLVNVVKYKLDHMRRRIETDERDSTNRASFKCPVCSSTFTDLEANQLFDPMTGTFRCTFCHTE VEEDESAMPKKDARTLLARFNEQIEPIYALLRETEDVNLAYEILEPEPTEIPALKQSKDHAATTAGAASLAGGHHREAWA TKGPSYEDLYTQNVVINMDDQEDLHRASLEGKSAKERPIWLRESTVQGAYGSEDMKEGGIDMDAFQEREEGHAGPDDNEE VMRALLIHEKKTSSAMAGSVGAAAPVTAANGSDSESETSESDDDSPPRPAAVAVHKREEDEEEDDEFEEVADDPIVMVAG RPFSYSEVSQRPELVAQMTPEEKEAYIAMGQRMFEDLFE ; ;MADPDVLTEVPAALKRLAKYVIRGFYGIEHALALDILIRNSCVKEEDMLELLKFDRKQLRSVLNNLKGDKFIKCRMRVET AADGKTTRHNYYFINYRTLVNVVKYKLDHMRRRIETDERDSTNRASFKCPVCSSTFTDLEANQLFDPMTGTFRCTFCHTE VEEDESAMPKKDARTLLARFNEQIEPIYALLRETEDVNLAYEILEPEPTEIPALKQSKDHAATTAGAASLAGGHHREAWA TKGPSYEDLYTQNVVINMDDQEDLHRASLEGKSAKERPIWLRESTVQGAYGSEDMKEGGIDMDAFQEREEGHAGPDDNEE VMRALLIHEKKTSSAMAGSVGAAAPVTAANGSDSESETSESDDDSPPRPAAVAVHKREEDEEEDDEFEEVADDPIVMVAG RPFSYSEVSQRPELVAQMTPEEKEAYIAMGQRMFEDLFE ; W ? 32 'polypeptide(L)' no no ;MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSDHSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAK IVNYMKTRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQ RGLGGILLEDIEEALPNSQKAVKALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQ GISSMQESGPKKVAPIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK ; ;MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSDHSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAK IVNYMKTRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQ RGLGGILLEDIEEALPNSQKAVKALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQ GISSMQESGPKKVAPIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK ; X ? 33 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXX Y ? 34 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXX Z ? 35 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; a,e ? 36 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; b,f ? 37 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESAKSAKSK ; ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESAKSAKSK ; c,g ? 38 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; d,h ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 LYS n 1 4 ARG n 1 5 ASP n 1 6 ARG n 1 7 ALA n 1 8 ASP n 1 9 ARG n 1 10 ASP n 1 11 LYS n 1 12 LYS n 1 13 LYS n 1 14 SER n 1 15 ARG n 1 16 LYS n 1 17 ARG n 1 18 HIS n 1 19 TYR n 1 20 GLU n 1 21 ASP n 1 22 GLU n 1 23 GLU n 1 24 ASP n 1 25 ASP n 1 26 GLU n 1 27 GLU n 1 28 ASP n 1 29 ALA n 1 30 PRO n 1 31 GLY n 1 32 ASN n 1 33 ASP n 1 34 PRO n 1 35 GLN n 1 36 GLU n 1 37 ALA n 1 38 VAL n 1 39 PRO n 1 40 SER n 1 41 ALA n 1 42 ALA n 1 43 GLY n 1 44 LYS n 1 45 GLN n 1 46 VAL n 1 47 ASP n 1 48 GLU n 1 49 SER n 1 50 GLY n 1 51 THR n 1 52 LYS n 1 53 VAL n 1 54 ASP n 1 55 GLU n 1 56 TYR n 1 57 GLY n 1 58 ALA n 1 59 LYS n 1 60 ASP n 1 61 TYR n 1 62 ARG n 1 63 LEU n 1 64 GLN n 1 65 MET n 1 66 PRO n 1 67 LEU n 1 68 LYS n 1 69 ASP n 1 70 ASP n 1 71 HIS n 1 72 THR n 1 73 SER n 1 74 ARG n 1 75 PRO n 1 76 LEU n 1 77 TRP n 1 78 VAL n 1 79 ALA n 1 80 PRO n 1 81 ASP n 1 82 GLY n 1 83 HIS n 1 84 ILE n 1 85 PHE n 1 86 LEU n 1 87 GLU n 1 88 ALA n 1 89 PHE n 1 90 SER n 1 91 PRO n 1 92 VAL n 1 93 TYR n 1 94 LYS n 1 95 TYR n 1 96 ALA n 1 97 GLN n 1 98 ASP n 1 99 PHE n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 ALA n 1 103 ILE n 1 104 ALA n 1 105 GLU n 1 106 PRO n 1 107 VAL n 1 108 CYS n 1 109 ARG n 1 110 PRO n 1 111 THR n 1 112 HIS n 1 113 VAL n 1 114 HIS n 1 115 GLU n 1 116 TYR n 1 117 LYS n 1 118 LEU n 1 119 THR n 1 120 ALA n 1 121 TYR n 1 122 SER n 1 123 LEU n 1 124 TYR n 1 125 ALA n 1 126 ALA n 1 127 VAL n 1 128 SER n 1 129 VAL n 1 130 GLY n 1 131 LEU n 1 132 GLN n 1 133 THR n 1 134 SER n 1 135 ASP n 1 136 ILE n 1 137 THR n 1 138 GLU n 1 139 TYR n 1 140 LEU n 1 141 ARG n 1 142 LYS n 1 143 LEU n 1 144 SER n 1 145 LYS n 1 146 THR n 1 147 GLY n 1 148 VAL n 1 149 PRO n 1 150 ASP n 1 151 GLY n 1 152 ILE n 1 153 MET n 1 154 GLN n 1 155 PHE n 1 156 ILE n 1 157 LYS n 1 158 LEU n 1 159 CYS n 1 160 THR n 1 161 VAL n 1 162 SER n 1 163 TYR n 1 164 GLY n 1 165 LYS n 1 166 VAL n 1 167 LYS n 1 168 LEU n 1 169 VAL n 1 170 LEU n 1 171 LYS n 1 172 HIS n 1 173 ASN n 1 174 ARG n 1 175 TYR n 1 176 PHE n 1 177 VAL n 1 178 GLU n 1 179 SER n 1 180 CYS n 1 181 HIS n 1 182 PRO n 1 183 ASP n 1 184 VAL n 1 185 ILE n 1 186 GLN n 1 187 HIS n 1 188 LEU n 1 189 LEU n 1 190 GLN n 1 191 ASP n 1 192 PRO n 1 193 VAL n 1 194 ILE n 1 195 ARG n 1 196 GLU n 1 197 CYS n 1 198 ARG n 1 199 LEU n 1 200 ARG n 1 201 ASN n 1 202 SER n 1 203 GLU 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32 ;MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSDHSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAK IVNYMKTRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQ RGLGGILLEDIEEALPNSQKAVKALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQ GISSMQESGPKKVAPIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK ; 1 34 PDB 8BVW 8BVW ? 33 ? 1 35 PDB 8BVW 8BVW ? 34 ? 1 36 UNP H32_XENLA P84233 ? 35 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 37 UNP H4_XENLA P62799 ? 36 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 38 UNP H2A1_XENLA P06897 ? 37 ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESAKSAKSK ; 1 39 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 38 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8BVW 0 1 ? 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P02281 1 ? 126 ? 1 126 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 TYR 1636 deletion ? 1 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1637 deletion ? 2 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1638 deletion ? 3 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 THR 1639 deletion ? 4 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1640 deletion ? 5 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 PRO 1641 deletion ? 6 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1642 deletion ? 7 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 TYR 1643 deletion ? 8 11 8BVW ? A ? ? UNP A0A7M4DUC2 SER 1644 deletion ? 9 11 8BVW ? A ? ? 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8BVW _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8BVW _struct.title 'RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8BVW _struct_keywords.text 'Mammalian PIC, +1 nucleosome, transcription initiation, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? 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IB N N 40 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 92 ? ALA A 104 ? VAL 0 92 ALA 0 104 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 119 ? VAL A 129 ? THR 0 119 VAL 0 129 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 132 ? SER A 144 ? GLN 0 132 SER 0 144 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 149 ? SER A 162 ? PRO 0 149 SER 0 162 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO A 182 ? LEU A 189 ? PRO 0 182 LEU 0 189 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 191 ? 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ZN ? ? A CYS 111 A ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc29 metalc ? ? K CYS 114 SG ? ? ? 1_555 ZA ZN . ZN ? ? A CYS 114 A ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc30 metalc ? ? K CYS 154 SG ? ? ? 1_555 ZA ZN . ZN ? ? A CYS 154 A ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc31 metalc ? ? K ASP 495 O ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 495 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? ? metalc32 metalc ? ? K ASP 495 OD1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 495 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.741 ? ? metalc33 metalc ? ? K ASP 497 OD1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 497 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.730 ? ? metalc34 metalc ? ? K ASP 497 OD2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 497 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? ? metalc35 metalc ? ? K ASP 499 OD1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 499 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? metalc36 metalc ? ? K ASP 499 OD2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A ASP 499 A MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? ? metalc37 metalc ? ? L CYS 1119 SG ? ? ? 1_555 BB ZN . 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J CYS 44 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? ? metalc56 metalc ? ? T CYS 45 SG ? ? ? 1_555 FB ZN . ZN ? ? J CYS 45 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc57 metalc ? ? V CYS 19 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? L CYS 19 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? ? metalc58 metalc ? ? V CYS 22 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? L CYS 22 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? ? metalc59 metalc ? ? V CYS 36 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? L CYS 36 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc60 metalc ? ? W HIS 18 ND1 ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? M HIS 18 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc61 metalc ? ? W CYS 34 SG ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? M CYS 34 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? ? metalc62 metalc ? ? EA CYS 129 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? W CYS 129 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc63 metalc ? ? EA CYS 132 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? W CYS 132 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc64 metalc ? ? EA CYS 154 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? W CYS 154 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc65 metalc ? ? EA CYS 157 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? W CYS 157 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? hydrog1 hydrog ? ? X DG 12 N1 ? ? ? 1_555 BA DC 207 N3 ? ? N DG -9 T DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? X DG 12 N2 ? ? ? 1_555 BA DC 207 O2 ? ? N DG -9 T DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? X DG 12 O6 ? ? ? 1_555 BA DC 207 N4 ? ? N DG -9 T DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? X DA 13 N1 ? ? ? 1_555 BA DT 206 N3 ? ? N DA -8 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? X DA 13 N6 ? ? ? 1_555 BA DT 206 O4 ? ? N DA -8 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? X DA 14 N1 ? ? ? 1_555 BA DT 205 N3 ? ? N DA -7 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? X DA 14 N6 ? ? ? 1_555 BA DT 205 O4 ? ? N DA -7 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? X DG 15 N1 ? ? ? 1_555 BA DC 204 N3 ? ? 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X DG 18 N1 ? ? ? 1_555 BA DC 201 N3 ? ? N DG -3 T DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? X DG 18 N2 ? ? ? 1_555 BA DC 201 O2 ? ? N DG -3 T DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? X DG 18 O6 ? ? ? 1_555 BA DC 201 N4 ? ? N DG -3 T DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? X DG 19 N1 ? ? ? 1_555 BA DC 200 N3 ? ? N DG -2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? X DG 19 N2 ? ? ? 1_555 BA DC 200 O2 ? ? N DG -2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? X DG 19 O6 ? ? ? 1_555 BA DC 200 N4 ? ? N DG -2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? X DG 20 N1 ? ? ? 1_555 BA DC 199 N3 ? ? N DG -1 T DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? X DG 20 N2 ? ? ? 1_555 BA DC 199 O2 ? ? N DG -1 T DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? X DG 20 O6 ? ? ? 1_555 BA DC 199 N4 ? ? N DG -1 T DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? X DC 21 N3 ? ? ? 1_555 BA DG 198 N1 ? ? N DC 0 T DG 0 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? X DC 21 N4 ? ? ? 1_555 BA DG 198 O6 ? ? N DC 0 T DG 0 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? X DC 21 O2 ? ? ? 1_555 BA DG 198 N2 ? ? N DC 0 T DG 0 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? X DT 22 N3 ? ? ? 1_555 BA DA 197 N1 ? ? N DT 1 T DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? X DT 22 O4 ? ? ? 1_555 BA DA 197 N6 ? ? N DT 1 T DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? X DA 23 N1 ? ? ? 1_555 BA DT 196 N3 ? ? N DA 2 T DT -2 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? X DT 24 N3 ? ? ? 1_555 BA DA 195 N1 ? ? N DT 3 T DA -3 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? X DA 25 N1 ? ? ? 1_555 BA DT 194 N3 ? ? N DA 4 T DT -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? X DA 25 N6 ? ? ? 1_555 BA DT 194 O4 ? ? 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X 24 75 DG 75 54 54 DG DG N . n X 24 76 DA 76 55 55 DA DA N . n X 24 77 DG 77 56 56 DG DG N . n X 24 78 DA 78 57 57 DA DA N . n X 24 79 DA 79 58 58 DA DA N . n X 24 80 DT 80 59 59 DT DT N . n X 24 81 DC 81 60 60 DC DC N . n X 24 82 DC 82 61 61 DC DC N . n X 24 83 DC 83 62 62 DC DC N . n X 24 84 DG 84 63 63 DG DG N . n X 24 85 DG 85 64 64 DG DG N . n X 24 86 DT 86 65 65 DT DT N . n X 24 87 DG 87 66 66 DG DG N . n X 24 88 DC 88 67 67 DC DC N . n X 24 89 DC 89 68 68 DC DC N . n X 24 90 DG 90 69 69 DG DG N . n X 24 91 DA 91 70 70 DA DA N . n X 24 92 DG 92 71 71 DG DG N . n X 24 93 DG 93 72 72 DG DG N . n X 24 94 DC 94 73 73 DC DC N . n X 24 95 DC 95 74 74 DC DC N . n X 24 96 DG 96 75 75 DG DG N . n X 24 97 DC 97 76 76 DC DC N . n X 24 98 DT 98 77 77 DT DT N . n X 24 99 DC 99 78 78 DC DC N . n X 24 100 DA 100 79 79 DA DA N . n X 24 101 DA 101 80 80 DA DA N . n X 24 102 DT 102 81 81 DT DT N . n X 24 103 DT 103 82 82 DT DT N . n X 24 104 DG 104 83 83 DG DG N . n X 24 105 DG 105 84 84 DG DG N 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