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Expi293 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GRIA1_RAT P19490 P19490-2 1 ;MPYIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSK GVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQEALISIIDHYKWQTFVYIYDADRGLSVLQR VLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIVKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPARIMQQWRTSDSRDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNA GDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGD NSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRF SPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTV ERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSA LSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASGGGGSGENGRVV SQDFPKSMQSIPCMSHSSGMPLGATGL ; 1 2 UNP CCG3_RAT Q8VHX0 ? 2 ;RMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTHSGLWRTCCLEGAFRGVCKKID HFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGLCVAASEFHRSRHSVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANA GDPGQRDSKKSYSYGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRARSHSELLKKSTFARLPPYRYRFRRRSSSRSTE PRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKLTMGTLLNSDRDHAFLQFHNSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV ; 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8C1Q A 1 ? 915 ? 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'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 OLC non-polymer . '(2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate' 1-Oleoyl-R-glycerol 'C21 H40 O4' 356.540 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PLM non-polymer . 'PALMITIC ACID' ? 'C16 H32 O2' 256.424 POV non-polymer . '(2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate' POPC 'C42 H82 N O8 P' 760.076 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZK1 non-polymer . '{[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid' '[[3,4-Dihydro-7-(4-morpholinyl)-2,3-dioxo-6-(trifluorom ethyl)-1(2H)-quinoxalinyl]methyl]phosphonic acid' 'C14 H15 F3 N3 O6 P' 409.254 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8C1Q _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 135.112 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.922 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details 'HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT' _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.001 0.016 17953 ? r_bond_other_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.415 1.647 25480 ? r_angle_refined_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.586 1.565 41320 ? r_angle_other_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.574 5.000 2315 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.054 2.698 129 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.519 10.000 2975 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.075 0.200 2825 ? r_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 0.020 21576 ? r_gen_planes_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 0.020 4428 ? r_gen_planes_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.398 12.806 9308 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.395 12.806 9308 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.631 22.956 11601 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.630 22.958 11602 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.605 14.321 9551 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.604 14.321 9552 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 25.002 25.634 13878 ? r_scangle_other ? ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 2.800 _refine_ls_shell.d_res_low 2.873 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 16383 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.790 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # _struct.entry_id 8C1Q _struct.title 'Resting state homomeric GluA1 AMPA receptor in complex with TARP gamma 3' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8C1Q _struct_keywords.text 'AMPAR, ion channels, neurotransmission, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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AC8 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 461 ? 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THR B 502 ? VAL B 470 THR B 476 AA6 4 LYS B 752 ? THR B 758 ? LYS B 726 THR B 732 AA6 5 ASP B 512 ? PHE B 513 ? ASP B 486 PHE B 487 AA7 1 ARG B 463 ? LEU B 464 ? ARG B 437 LEU B 438 AA7 2 ILE B 418 ? THR B 420 ? ILE B 392 THR B 394 AA7 3 VAL B 496 ? THR B 502 ? VAL B 470 THR B 476 AA7 4 LYS B 752 ? THR B 758 ? LYS B 726 THR B 732 AA7 5 MET B 518 ? LEU B 520 ? MET B 492 LEU B 494 AA8 1 MET B 429 ? LEU B 430 ? MET B 403 LEU B 404 AA8 2 TYR B 443 ? GLU B 444 ? TYR B 417 GLU B 418 AA9 1 ALA B 474 ? ASP B 476 ? ALA B 448 ASP B 450 AA9 2 ALA B 481 ? ASN B 483 ? ALA B 455 ASN B 457 AB1 1 ALA B 668 ? GLY B 670 ? ALA B 642 GLY B 644 AB1 2 TYR B 722 ? GLU B 727 ? TYR B 696 GLU B 701 AB1 3 ILE B 522 ? LYS B 527 ? ILE B 496 LYS B 501 AB1 4 THR B 742 ? VAL B 745 ? THR B 716 VAL B 719 AB2 1 SER C 461 ? ILE C 466 ? SER C 435 ILE C 440 AB2 2 THR C 416 ? THR C 421 ? THR C 390 THR C 395 AB2 3 VAL C 496 ? THR C 502 ? VAL C 470 THR C 476 AB2 4 LYS C 752 ? PRO C 759 ? LYS C 726 PRO C 733 AB2 5 ILE C 511 ? 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THR D 420 ? TYR D 391 THR D 394 AB8 3 VAL D 496 ? THR D 502 ? VAL D 470 THR D 476 AB8 4 LYS D 752 ? THR D 758 ? LYS D 726 THR D 732 AB8 5 MET D 518 ? LEU D 520 ? MET D 492 LEU D 494 AB9 1 MET D 429 ? LEU D 430 ? MET D 403 LEU D 404 AB9 2 TYR D 443 ? GLU D 444 ? TYR D 417 GLU D 418 AC1 1 ARG D 475 ? ASP D 476 ? ARG D 449 ASP D 450 AC1 2 ALA D 481 ? TRP D 482 ? ALA D 455 TRP D 456 AC2 1 ALA D 668 ? GLY D 670 ? ALA D 642 GLY D 644 AC2 2 TYR D 722 ? GLU D 727 ? TYR D 696 GLU D 701 AC2 3 ILE D 522 ? LYS D 527 ? ILE D 496 LYS D 501 AC2 4 THR D 742 ? VAL D 745 ? THR D 716 VAL D 719 AC3 1 LEU E 33 ? TYR E 34 ? LEU E 34 TYR E 35 AC3 2 SER E 173 ? TYR E 174 ? SER E 174 TYR E 175 AC4 1 ARG E 36 ? GLY E 37 ? ARG E 37 GLY E 38 AC4 2 VAL E 56 ? SER E 60 ? VAL E 57 SER E 61 AC4 3 ARG E 64 ? CYS E 67 ? ARG E 65 CYS E 68 AC4 4 CYS E 76 ? LYS E 78 ? CYS E 77 LYS E 79 AC5 1 CYS F 76 ? LYS F 78 ? CYS F 77 LYS F 79 AC5 2 ARG F 64 ? CYS F 67 ? ARG F 65 CYS F 68 AC5 3 VAL F 56 ? SER F 60 ? VAL F 57 SER F 61 AC5 4 LEU F 33 ? GLY F 37 ? LEU F 34 GLY F 38 AC5 5 TYR F 172 ? TYR F 174 ? TYR F 173 TYR F 175 AC6 1 LEU G 33 ? TYR G 34 ? LEU G 34 TYR G 35 AC6 2 SER G 173 ? TYR G 174 ? SER G 174 TYR G 175 AC7 1 ARG G 36 ? GLY G 37 ? ARG G 37 GLY G 38 AC7 2 VAL G 56 ? SER G 60 ? VAL G 57 SER G 61 AC7 3 ARG G 64 ? CYS G 67 ? ARG G 65 CYS G 68 AC7 4 CYS G 76 ? LYS G 78 ? CYS G 77 LYS G 79 AC8 1 CYS H 76 ? LYS H 78 ? CYS H 77 LYS H 79 AC8 2 ARG H 64 ? CYS H 67 ? ARG H 65 CYS H 68 AC8 3 VAL H 56 ? SER H 60 ? VAL H 57 SER H 61 AC8 4 LEU H 33 ? GLY H 37 ? LEU H 34 GLY H 38 AC8 5 TYR H 172 ? TYR H 174 ? 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O LYS C 726 N LEU C 520 ? N LEU C 494 AB4 1 2 N MET C 429 ? N MET C 403 O GLU C 444 ? O GLU C 418 AB5 1 2 N ASP C 476 ? N ASP C 450 O ALA C 481 ? O ALA C 455 AB6 1 2 N ALA C 668 ? N ALA C 642 O ALA C 723 ? O ALA C 697 AB6 2 3 O TYR C 724 ? O TYR C 698 N MET C 525 ? N MET C 499 AB6 3 4 N ILE C 526 ? N ILE C 500 O MET C 743 ? O MET C 717 AB7 1 2 O ARG D 463 ? O ARG D 437 N VAL D 419 ? N VAL D 393 AB7 2 3 N THR D 420 ? N THR D 394 O VAL D 496 ? O VAL D 470 AB7 3 4 N ALA D 497 ? N ALA D 471 O ALA D 757 ? O ALA D 731 AB7 4 5 O THR D 758 ? O THR D 732 N ASP D 512 ? N ASP D 486 AB8 1 2 O ARG D 463 ? O ARG D 437 N VAL D 419 ? N VAL D 393 AB8 2 3 N THR D 420 ? N THR D 394 O VAL D 496 ? O VAL D 470 AB8 3 4 N ALA D 497 ? N ALA D 471 O ALA D 757 ? O ALA D 731 AB8 4 5 O LYS D 752 ? O LYS D 726 N LEU D 520 ? N LEU D 494 AB9 1 2 N MET D 429 ? N MET D 403 O GLU D 444 ? O GLU D 418 AC1 1 2 N ASP D 476 ? N ASP D 450 O ALA D 481 ? O ALA D 455 AC2 1 2 N ALA D 668 ? N ALA D 642 O ALA D 723 ? 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