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273 ? P60422 1 ? 273 ? 0 272 2 2 8C91 D 1 ? 209 ? P60438 1 ? 209 ? 1 209 3 3 8C91 E 1 ? 201 ? P60723 1 ? 201 ? 1 201 4 4 8C91 J 1 ? 142 ? P0AA10 1 ? 142 ? 1 142 5 5 8C91 K 1 ? 123 ? P0ADY3 1 ? 123 ? 1 123 6 6 8C91 L 1 ? 144 ? P02413 1 ? 144 ? 1 144 7 7 8C91 N 1 ? 127 ? P0AG44 1 ? 127 ? 1 127 8 8 8C91 P 1 ? 115 ? P0A7K6 1 ? 115 ? 0 114 9 9 8C91 Q 1 ? 118 ? P0A7L3 1 ? 118 ? 0 117 10 10 8C91 R 1 ? 103 ? P0AG48 1 ? 103 ? 1 103 11 11 8C91 S 1 ? 110 ? P61175 1 ? 110 ? 1 110 12 12 8C91 T 1 ? 100 ? P0ADZ0 1 ? 100 ? 1 100 13 13 8C91 U 1 ? 104 ? P60624 1 ? 104 ? 0 103 14 14 8C91 Y 1 ? 63 ? P0A7M6 1 ? 63 ? 1 63 15 15 8C91 0 1 ? 57 ? P0A7N4 1 ? 57 ? 0 56 16 16 8C91 2 1 ? 46 ? P0A7P5 1 ? 46 ? 1 46 17 17 8C91 Z 1 ? 59 ? P0AG51 1 ? 59 ? 0 58 18 18 8C91 A 1 ? 2904 ? 1109114233 2686031 ? 2683128 ? 1 2904 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8C91 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8C91 _struct.title 'Cryo-EM captures early ribosome assembly in action' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8C91 _struct_keywords.text 'ribosome, ribosome assembly, ribosome biogenesis, total reconstitution, RNA, ribosomal protein.' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 133 ? ILE A 135 ? ARG C 132 ILE C 134 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS B 56 ? VAL B 60 ? LYS D 56 VAL D 60 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 THR B 61 ? GLY B 72 ? THR D 61 GLY D 72 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 VAL B 98 ? ASP B 103 ? VAL D 98 ASP D 103 5 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY B 120 ? ASN B 126 ? GLY D 120 ASN D 126 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 15 ? GLY C 20 ? SER E 15 GLY E 20 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU C 25 ? ARG C 40 ? GLU E 25 ARG E 40 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN C 97 ? GLN C 115 ? ASN E 97 GLN E 115 1 ? 19 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS C 130 ? MET C 141 ? LYS E 130 MET E 141 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP C 154 ? ALA C 160 ? ASP E 154 ALA E 160 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP C 176 ? PHE C 183 ? ASP E 176 PHE E 183 1 ? 8 HELX_P HELX_P12 AB3 THR C 189 ? ALA C 201 ? THR E 189 ALA E 201 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS D 7 ? VAL D 11 ? LYS J 7 VAL J 11 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 THR D 24 ? GLY D 38 ? THR J 24 GLY J 38 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN D 58 ? VAL D 62 ? ASN J 58 VAL J 62 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 88 ? ARG D 96 ? THR J 88 ARG J 96 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 ARG D 96 ? LEU D 109 ? ARG J 96 LEU J 109 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY D 112 ? ARG D 120 ? GLY J 112 ARG J 120 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN D 131 ? GLN D 136 ? ASN J 131 GLN J 136 5 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 SER E 109 ? LYS E 111 ? SER K 109 LYS K 111 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 PHE E 112 ? SER E 117 ? PHE K 112 SER K 117 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS F 29 ? ARG F 33 ? LYS L 29 ARG L 33 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 THR F 94 ? ASN F 99 ? THR L 94 ASN L 99 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 ILE F 135 ? GLY F 139 ? ILE L 135 GLY L 139 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN G 13 ? GLU G 32 ? ASN N 13 GLU N 32 1 ? 20 HELX_P HELX_P26 AC8 LEU G 38 ? ALA G 55 ? LEU N 38 ALA N 55 1 ? 18 HELX_P HELX_P27 AC9 SER G 59 ? ALA G 68 ? SER N 59 ALA N 68 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP G 72 ? LEU G 79 ? ASP N 72 LEU N 79 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 GLU G 82 ? SER G 89 ? GLU N 82 SER N 89 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN H 3 ? GLN H 12 ? ASN P 2 GLN P 11 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG H 53 ? HIS H 56 ? ARG P 52 HIS P 55 5 ? 4 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU H 97 ? ARG H 103 ? LEU P 96 ARG P 102 5 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 THR H 104 ? ALA H 108 ? THR P 103 ALA P 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ARG I 6 ? 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'A-A MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? 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