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I ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ? ? 1.15406089579e-12 ? ? 3 'NCS constraints' ? I ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ? ? 7.92143267781e-12 ? ? 4 'NCS constraints' ? I ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ? ? 1.13852664966e-12 ? ? 5 'NCS constraints' ? I ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 1.17928176156e-12 ? ? 6 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ? ? 5.20515468961e-12 ? ? 7 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ? ? 1.188467327e-12 ? ? 8 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ? ? 5.59890653646e-12 ? ? 9 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ? ? 8.3516737315e-12 ? ? 10 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_2 # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given 0.999925378281 -0.0122162348189 3.84323718547e-05 0.0122162349749 0.99992537901 -3.82586968841e-06 -3.83827662706e-05 4.29508308066e-06 0.999999999254 0.798461682244 -0.790907631639 -4.83775715579 ? 2 given 0.99970149704 -0.0244317645815 7.54631114424e-05 0.0244317653274 0.99970149983 -8.97762961144e-06 -7.52212463576e-05 1.08186467921e-05 0.999999997112 1.60660179435 -1.57228156571 -9.67581545811 ? 3 given 0.999925365406 0.0122172957757 -3.60758932585e-05 -0.0122172955536 0.999925366039 6.36830149541e-06 3.61510041947e-05 -5.92707634951e-06 0.999999999329 -0.789347269333 0.801257395366 4.8380981523 ? 4 given 0.999701435787 0.0244342757898 -7.38433702316e-05 -0.0244342751179 0.99970143848 9.98723317036e-06 7.40653542525e-05 -8.17994211606e-06 0.999999997224 -1.56900216753 1.61209554332 9.6757385056 ? 5 given 0.999328391184 0.0366436184605 -0.000108626605682 -0.0366436167454 0.999328396993 1.77382435841e-05 0.000109203645157 -1.37458587164e-05 0.999999993943 -2.33863431302 2.43185907167 14.5138963312 ? 6 given 0.99992539292 -0.0122150511167 3.34535432725e-05 0.012215051294 0.999925393465 -5.10029031917e-06 -3.33887471126e-05 5.50854654844e-06 0.999999999427 0.798804809542 -0.791116396873 -4.8381265698 ? 7 given 0.999925357686 0.0122179175358 -3.93395741884e-05 -0.0122179173738 0.999925358452 4.35563546923e-06 3.93898546166e-05 -3.87466268757e-06 0.999999999217 -0.78892629437 0.800704158978 4.83779619251 ? 8 given 0.999701469283 0.024432898884 -7.59310535837e-05 -0.0244328981473 0.999701472128 1.06155390463e-05 7.61677544399e-05 -8.75715428342e-06 0.999999997061 -1.56861439766 1.61155604052 9.67572728329 ? 9 given 0.999328353674 0.0366446253441 -0.000113911347582 -0.0366446236851 0.999328360089 1.66178277676e-05 0.000114443794247 -1.24324279991e-05 0.999999993374 -2.33826712647 2.43165478371 14.5135102758 ? 10 given 0.998806150603 0.0488492712269 -0.000149058007479 -0.0488492683673 0.998806161606 2.27675798095e-05 0.000149992235988 -1.54590241385e-05 0.999999988632 -3.09811488087 3.26102151496 19.3513703169 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "E" ; ens_1 d_2 ;chain "B" ; ens_1 d_3 ;chain "C" ; ens_1 d_4 ;chain "D" ; ens_1 d_5 ;chain "A" ; ens_1 d_6 ;chain "F" ; ens_2 d_1 ;chain "K" ; ens_2 d_2 ;chain "J" ; ens_2 d_3 ;chain "I" ; ens_2 d_4 ;chain "L" ; ens_2 d_5 ;chain "M" ; ens_2 d_6 ;chain "N" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id ens_1 d_1 1 . I VAL 1 . I LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 1 . E VAL 1 . E LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_1 d_3 1 . A VAL 1 . A LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_1 d_4 1 . G VAL 1 . G LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_1 d_5 1 . C VAL 1 . C LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_1 d_6 1 . K VAL 1 . K LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_1 1 . B VAL 1 . B LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_2 1 . F VAL 1 . F LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_3 1 . D VAL 1 . D LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_4 1 . H VAL 1 . H LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_5 1 . J VAL 1 . J LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_2 d_6 1 . L VAL 1 . L LYS 72 ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_1 d_6 d_1 5 ens_2 d_2 d_1 6 ens_2 d_3 d_1 7 ens_2 d_4 d_1 8 ens_2 d_5 d_1 9 ens_2 d_6 d_1 10 # _struct.entry_id 8CYY _struct.title 'CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B mixed type I/II with extended core from DLB case V' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8CYY _struct_keywords.text 'alpha-synuclein, Cerebrospinal Fluid (CSF), DLB, PROTEIN FIBRIL' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN FIBRIL' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 6 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA5 5 6 ? parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL C 16 ? ALA C 17 ? VAL A 16 ALA A 17 AA1 2 VAL E 16 ? ALA E 17 ? VAL B 16 ALA B 17 AA1 3 VAL A 16 ? ALA A 17 ? VAL C 16 ALA C 17 AA1 4 VAL G 16 ? ALA G 17 ? VAL D 16 ALA D 17 AA1 5 VAL I 16 ? ALA I 17 ? VAL E 16 ALA E 17 AA1 6 VAL K 16 ? ALA K 17 ? VAL F 16 ALA F 17 AA2 1 LYS C 21 ? THR C 22 ? LYS A 21 THR A 22 AA2 2 LYS E 21 ? THR E 22 ? LYS B 21 THR B 22 AA2 3 LYS A 21 ? THR A 22 ? LYS C 21 THR C 22 AA2 4 LYS G 21 ? THR G 22 ? LYS D 21 THR D 22 AA2 5 LYS I 21 ? THR I 22 ? LYS E 21 THR E 22 AA2 6 LYS K 21 ? THR K 22 ? LYS F 21 THR F 22 AA3 1 VAL C 40 ? LYS C 45 ? VAL A 40 LYS A 45 AA3 2 VAL E 40 ? LYS E 45 ? VAL B 40 LYS B 45 AA3 3 VAL A 40 ? LYS A 45 ? VAL C 40 LYS C 45 AA3 4 VAL G 40 ? LYS G 45 ? VAL D 40 LYS D 45 AA3 5 VAL I 40 ? LYS I 45 ? VAL E 40 LYS E 45 AA3 6 VAL K 40 ? LYS K 45 ? VAL F 40 LYS F 45 AA4 1 VAL C 48 ? HIS C 50 ? VAL A 48 HIS A 50 AA4 2 VAL E 48 ? HIS E 50 ? VAL B 48 HIS B 50 AA4 3 VAL A 48 ? HIS A 50 ? VAL C 48 HIS C 50 AA4 4 VAL G 48 ? HIS G 50 ? VAL D 48 HIS D 50 AA4 5 VAL I 48 ? HIS I 50 ? VAL E 48 HIS E 50 AA4 6 VAL K 48 ? HIS K 50 ? VAL F 48 HIS F 50 AA5 1 ALA C 53 ? VAL C 55 ? ALA A 53 VAL A 55 AA5 2 ALA E 53 ? VAL E 55 ? ALA B 53 VAL B 55 AA5 3 ALA A 53 ? VAL A 55 ? ALA C 53 VAL C 55 AA5 4 ALA G 53 ? VAL G 55 ? ALA D 53 VAL D 55 AA5 5 ALA I 53 ? VAL I 55 ? ALA E 53 VAL E 55 AA5 6 ALA K 53 ? VAL K 55 ? ALA F 53 VAL F 55 AA6 1 GLU C 61 ? VAL C 66 ? GLU A 61 VAL A 66 AA6 2 GLU E 61 ? VAL E 66 ? GLU B 61 VAL B 66 AA6 3 GLU A 61 ? VAL A 66 ? GLU C 61 VAL C 66 AA6 4 GLU G 61 ? VAL G 66 ? GLU D 61 VAL D 66 AA6 5 GLU I 61 ? VAL I 66 ? GLU E 61 VAL E 66 AA6 6 GLU K 61 ? VAL K 66 ? GLU F 61 VAL F 66 AA7 1 ALA C 69 ? VAL C 71 ? ALA A 69 VAL A 71 AA7 2 ALA E 69 ? VAL E 71 ? ALA B 69 VAL B 71 AA7 3 ALA A 69 ? VAL A 71 ? ALA C 69 VAL C 71 AA7 4 ALA G 69 ? VAL G 71 ? ALA D 69 VAL D 71 AA7 5 ALA I 69 ? VAL I 71 ? ALA E 69 VAL E 71 AA7 6 ALA K 69 ? VAL K 71 ? ALA F 69 VAL F 71 AA8 1 VAL C 77 ? GLN C 79 ? 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