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JA BMA . . JA BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 1 . N PRO 1 . N SER 283 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 2 . RA NAG . . RA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 3 . FA NAG . . FA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 4 . FA NAG . . FA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 5 . FA BMA . . FA BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_3 1 . O PRO 1 . O SER 283 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_3 2 . SA NAG . . SA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_3 3 . GA NAG . . GA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_3 4 . GA NAG . . GA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_3 5 . GA BMA . . GA BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_4 1 . P PRO 1 . P SER 283 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_4 2 . TA NAG . . TA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_4 3 . HA NAG . . HA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_4 4 . HA NAG . . HA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_4 5 . HA BMA . . HA BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_5 1 . Q PRO 1 . Q SER 283 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_5 2 . UA NAG . . UA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_5 3 . IA NAG . . IA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_5 4 . IA NAG . . IA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_5 5 . IA BMA . . IA BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_6 1 . C PRO 1 . C SER 283 ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_6 2 . LA NAG . . LA NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_6 3 . U NAG . . U NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_6 4 . U NAG . . U NAG . ? ? ? ? ? ? ? ? ens_3 d_6 5 . U BMA . . U BMA . ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_1 d_6 d_1 5 ens_2 d_2 d_1 6 ens_2 d_3 d_1 7 ens_2 d_4 d_1 8 ens_2 d_5 d_1 9 ens_2 d_6 d_1 10 ens_3 d_2 d_1 11 ens_3 d_3 d_1 12 ens_3 d_4 d_1 13 ens_3 d_5 d_1 14 ens_3 d_6 d_1 15 # _struct.entry_id 8DPU _struct.title 'The crystal structure of the IL-11 signalling complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8DPU _struct_keywords.text 'Complex, GP130, glycoprotein 130, signalling, cancer, CYTOKINE, CYTOKINE-RECEPTOR complex' _struct_keywords.pdbx_keywords CYTOKINE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'expression tag' 348 54 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? hexameric 6 2 author_defined_assembly ? hexameric 6 3 author_defined_assembly ? hexameric 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,S,T,U,V,EA,FA,GA,HA,IA,JA 2 1 G,H,I,J,K,L,W,X,Y,Z,KA,LA,MA,NA,OA,PA 3 1 M,N,O,P,Q,R,AA,BA,CA,DA,QA,RA,SA,TA,UA,VA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'equilibrium centrifugation' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 30 ? 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LEU C 190 LEU C 194 1 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS D 30 ? HIS D 38 ? LYS D 29 HIS D 37 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN D 40 ? ASN D 42 ? ASN D 39 ASN D 41 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO D 54 ? GLU D 56 ? PRO D 53 GLU D 55 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 AC1 THR D 86 ? GLN D 89 ? THR D 85 GLN D 88 5 ? 4 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP D 194 ? TYR D 197 ? ASP D 193 TYR D 196 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO D 226 ? VAL D 231 ? PRO D 225 VAL D 230 5 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO D 252 ? ALA D 257 ? PRO D 251 ALA D 256 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA E 17 ? PHE E 44 ? ALA E 16 PHE E 43 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA E 62 ? LEU E 68 ? ALA E 61 LEU E 67 5 ? 7 HELX_P HELX_P25 AC7 GLN E 69 ? GLY E 95 ? GLN E 68 GLY E 94 1 ? 27 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY E 96 ? GLU E 103 ? GLY E 95 GLU E 102 5 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO E 104 ? LEU E 127 ? PRO E 103 LEU E 126 1 ? 24 HELX_P HELX_P28 AD1 SER E 146 ? LEU E 179 ? SER E 145 LEU E 178 1 ? 34 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP F 63 ? GLU F 67 ? 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M ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? M ASN 61 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? M ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? M ASN 135 M NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.587 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? O ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? O ASN 105 O NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? O ASN 172 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? O ASN 172 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? P ASN 22 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? P ASN 21 P NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? P ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? P ASN 61 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? P ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? P ASN 135 P NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.587 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? R ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? R ASN 105 R NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? R ASN 172 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? R ASN 172 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? N-Glycosylation covale31 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale32 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale33 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale34 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale35 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale36 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale37 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale38 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale39 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale40 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale41 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale42 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale43 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale44 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale45 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale46 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale47 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . 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CYS R 148 ? 1_555 CYS R 158 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 11 A . ? SER 10 A PRO 12 A ? PRO 11 A 1 -0.26 2 GLU 103 B . ? GLU 102 B PRO 104 B ? PRO 103 B 1 2.66 3 SER 11 D . ? SER 10 D PRO 12 D ? PRO 11 D 1 -0.25 4 GLU 103 E . ? GLU 102 E PRO 104 E ? PRO 103 E 1 2.66 5 SER 11 G . ? 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AI6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? 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