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'ATCC 10712 / CBS 650.69 / DSM 40230 / JCM 4526 / NBRC 13096 / PD 04745' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 9 1 sample 1 100 'Streptomyces venezuelae' ? 54571 ? 10 1 sample 1 100 'Streptomyces venezuelae' ? 54571 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP F2RJV9_STRVP F2RJV9 ? 1 ;MLIAQRPSLTEEVVDEFRSRFVIEPLEPGFGYTLGNSLRRTLLSSIPGAAVTSIRIDGVLHEFTTVPGVKEDVTDLILNI KQLVVSSEHDEPVVMYLRKQGPGLVTAADIAPPAGVEVHNPDLVLATLNGKGKLEMELTVERGRGYVSAVQNKQVGQEIG RIPVDSIYSPVLKVTYKVEATRVEQRTDFDKLIVDVETKQAMRPRDAMASAGKTLVELFGLARELNIDAEGIDMGPSPTD AALAADLALPIEELELTVRSYNCLKREGIHSVGELVARSEADLLDIRNFGAKSIDEVKAKLAGMGLALKDSPPGFDPTAA ADAFGADDDADAGFVETEQY ; 1 2 UNP F2RIS5_STRVP F2RIS5 ? 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'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8DY7 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8DY7 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 31989 ? f_bond_d ? ? 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J DG 82 N1 ? ? ? 1_555 K DC 19 N3 ? ? O DG 82 P DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog136 hydrog ? ? J DG 82 N2 ? ? ? 1_555 K DC 19 O2 ? ? O DG 82 P DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog137 hydrog ? ? J DG 82 O6 ? ? ? 1_555 K DC 19 N4 ? ? O DG 82 P DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog138 hydrog ? ? J DC 83 N3 ? ? ? 1_555 K DG 18 N1 ? ? O DC 83 P DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog139 hydrog ? ? J DC 83 N4 ? ? ? 1_555 K DG 18 O6 ? ? O DC 83 P DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog140 hydrog ? ? J DC 83 O2 ? ? ? 1_555 K DG 18 N2 ? ? O DC 83 P DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog141 hydrog ? ? J DA 84 N1 ? ? ? 1_555 K DT 17 N3 ? ? O DA 84 P DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog142 hydrog ? ? J DA 84 N6 ? ? ? 1_555 K DT 17 O4 ? ? O DA 84 P DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog143 hydrog ? ? J DG 85 N1 ? ? ? 1_555 K DC 16 N3 ? ? O DG 85 P DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog144 hydrog ? ? J DG 85 N2 ? ? ? 1_555 K DC 16 O2 ? ? O DG 85 P DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog145 hydrog ? ? J DG 85 O6 ? ? ? 1_555 K DC 16 N4 ? ? O DG 85 P DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog146 hydrog ? ? J DC 86 N3 ? ? ? 1_555 K DG 15 N1 ? ? O DC 86 P DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog147 hydrog ? ? J DC 86 N4 ? ? ? 1_555 K DG 15 O6 ? ? O DC 86 P DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog148 hydrog ? ? J DC 86 O2 ? ? ? 1_555 K DG 15 N2 ? ? O DC 86 P DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog149 hydrog ? ? J DA 87 N1 ? ? ? 1_555 K DT 14 N3 ? ? O DA 87 P DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog150 hydrog ? ? J DA 87 N6 ? ? ? 1_555 K DT 14 O4 ? ? O DA 87 P DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog151 hydrog ? ? J DG 88 N1 ? ? ? 1_555 K DC 13 N3 ? ? O DG 88 P DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog152 hydrog ? ? J DG 88 N2 ? ? ? 1_555 K DC 13 O2 ? ? O DG 88 P DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog153 hydrog ? ? J DG 88 O6 ? ? ? 1_555 K DC 13 N4 ? ? O DG 88 P DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog154 hydrog ? ? J DC 89 N3 ? ? ? 1_555 K DG 12 N1 ? ? O DC 89 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog155 hydrog ? ? J DC 89 N4 ? ? ? 1_555 K DG 12 O6 ? ? O DC 89 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog156 hydrog ? ? J DC 89 O2 ? ? ? 1_555 K DG 12 N2 ? ? O DC 89 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog157 hydrog ? ? J DG 90 N1 ? ? ? 1_555 K DC 11 N3 ? ? O DG 90 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog158 hydrog ? ? J DG 90 N2 ? ? ? 1_555 K DC 11 O2 ? ? O DG 90 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog159 hydrog ? ? J DG 90 O6 ? ? ? 1_555 K DC 11 N4 ? ? O DG 90 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog160 hydrog ? ? J DG 91 N1 ? ? ? 1_555 K DC 10 N3 ? ? O DG 91 P DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog161 hydrog ? ? 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J DT 94 O4 ? ? ? 1_555 K DA 7 N6 ? ? O DT 94 P DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 24 A . ? GLU 24 A PRO 25 A ? PRO 25 A 1 -4.90 2 GLU 24 B . ? GLU 24 B PRO 25 B ? PRO 25 B 1 -6.42 3 SER 99 C . ? SER 99 C PRO 100 C ? PRO 100 C 1 -4.16 4 VAL 109 D . ? VAL 110 D PRO 110 D ? PRO 111 D 1 -0.55 5 ALA 500 D . ? ALA 501 D PRO 501 D ? PRO 502 D 1 1.68 6 ASN 13 E . ? ASN 13 E PRO 14 E ? PRO 14 E 1 -3.99 7 GLY 56 E . ? GLY 56 E PRO 57 E ? PRO 57 E 1 -0.94 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 8 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 8 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 5 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC6 6 7 ? parallel AC6 7 8 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD2 5 6 ? parallel AD2 6 7 ? anti-parallel AD2 7 8 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 8 ? 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