data_8E1P # _entry.id 8E1P # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.380 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8E1P pdb_00008e1p 10.2210/pdb8e1p/pdb WWPDB D_1000267681 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8E1P _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-08-11 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Sarkar, A.' 1 ? 'Kumar, S.' 2 ? 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'UNP residues 509-661' ? 8 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 4 ? ? ? ? 9 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 9 ? ? ? ? 10 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1235.105 1 ? ? ? ? 11 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1600.438 1 ? ? ? ? 12 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1072.964 1 ? ? ? ? 13 branched man 'alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose' 504.438 1 ? ? ? ? 14 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 30 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 7 _entity_name_com.name 'Env polyprotein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYYMHWVRQAPGQGLEWMGWINPNSGGTNYAQKFQGRVTMTRDTSISTAY MELSRLRSDDTAVYYCARRMRSQDREWDFQHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVT VSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; ;QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYYMHWVRQAPGQGLEWMGWINPNSGGTNYAQKFQGRVTMTRDTSISTAY MELSRLRSDDTAVYYCARRMRSQDREWDFQHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVT VSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; F,H,N ? 2 'polypeptide(L)' no no ;ESALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYEVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGL QAEDEADYYCSSYEFFGGGTKVFVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC ; ;ESALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYEVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGL QAEDEADYYCSSYEFFGGGTKVFVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC ; I ? 3 'polypeptide(L)' no no ;ESALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYEVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGL QAEEDADYYCSSYEFFGGGTKVFVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC ; ;ESALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYEVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGL QAEEDADYYCSSYEFFGGGTKVFVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC ; L,O ? 4 'polypeptide(L)' no no ;SYVSPLSVALGETARISCGRQALGSRAVQWYQHKPGQAPILLIYNNQDRPSGIPERFSGTPDINFGTTATLTISGVEVGD EADYYCHMWDSRSGFSWSFGGATRLTVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;SYVSPLSVALGETARISCGRQALGSRAVQWYQHKPGQAPILLIYNNQDRPSGIPERFSGTPDINFGTTATLTISGVEVGD EADYYCHMWDSRSGFSWSFGGATRLTVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; A,C,J ? 5 'polypeptide(L)' no no ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETKKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKRQKVHALFYKLDIVPINENQNTSYRLINCN TAAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSEDI RDNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQWFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTI IRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCDTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPI QGVIRCVSNITGLILTRDGGSTDSTTETFRPSGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETKKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKRQKVHALFYKLDIVPINENQNTSYRLINCN TAAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSEDI RDNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQWFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTI IRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCDTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPI QGVIRCVSNITGLILTRDGGSTDSTTETFRPSGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; E,G,M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;QVQLQESGPGLVRPSETLSVTCIVSGGSISNYYWTWIRQSPGKGLEWIGYISDRETTTYNPSLNSRAVISRDTSKNQLSL QLRSVTTADTAIYFCATARRGQRIYGVVSFGEFFYYYYMDVWGKGTAVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; ;QVQLQESGPGLVRPSETLSVTCIVSGGSISNYYWTWIRQSPGKGLEWIGYISDRETTTYNPSLNSRAVISRDTSKNQLSL QLRSVTTADTAIYFCATARRGQRIYGVVSFGEFFYYYYMDVWGKGTAVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; B,D,K ? 7 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; Y,X,Z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 VAL n 1 3 GLN n 1 4 LEU n 1 5 VAL n 1 6 GLN n 1 7 SER n 1 8 GLY n 1 9 ALA n 1 10 GLU n 1 11 VAL n 1 12 LYS n 1 13 LYS n 1 14 PRO n 1 15 GLY n 1 16 ALA n 1 17 SER n 1 18 VAL n 1 19 LYS n 1 20 VAL n 1 21 SER n 1 22 CYS n 1 23 LYS n 1 24 ALA n 1 25 SER n 1 26 GLY n 1 27 TYR n 1 28 THR n 1 29 PHE n 1 30 THR n 1 31 GLY n 1 32 TYR n 1 33 TYR n 1 34 MET n 1 35 HIS n 1 36 TRP n 1 37 VAL n 1 38 ARG n 1 39 GLN n 1 40 ALA n 1 41 PRO n 1 42 GLY n 1 43 GLN n 1 44 GLY n 1 45 LEU n 1 46 GLU n 1 47 TRP n 1 48 MET n 1 49 GLY n 1 50 TRP n 1 51 ILE n 1 52 ASN n 1 53 PRO n 1 54 ASN n 1 55 SER n 1 56 GLY n 1 57 GLY n 1 58 THR n 1 59 ASN n 1 60 TYR n 1 61 ALA n 1 62 GLN n 1 63 LYS n 1 64 PHE n 1 65 GLN n 1 66 GLY n 1 67 ARG n 1 68 VAL n 1 69 THR n 1 70 MET n 1 71 THR n 1 72 ARG n 1 73 ASP n 1 74 THR n 1 75 SER n 1 76 ILE n 1 77 SER n 1 78 THR n 1 79 ALA n 1 80 TYR n 1 81 MET n 1 82 GLU n 1 83 LEU n 1 84 SER n 1 85 ARG n 1 86 LEU n 1 87 ARG n 1 88 SER n 1 89 ASP n 1 90 ASP n 1 91 THR n 1 92 ALA n 1 93 VAL n 1 94 TYR n 1 95 TYR n 1 96 CYS n 1 97 ALA n 1 98 ARG n 1 99 ARG n 1 100 MET n 1 101 ARG n 1 102 SER n 1 103 GLN n 1 104 ASP n 1 105 ARG n 1 106 GLU n 1 107 TRP n 1 108 ASP n 1 109 PHE n 1 110 GLN n 1 111 HIS n 1 112 TRP n 1 113 GLY n 1 114 GLN n 1 115 GLY n 1 116 THR n 1 117 LEU n 1 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Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8E1P 8E1P ? 1 ? 1 2 PDB 8E1P 8E1P ? 2 ? 1 3 PDB 8E1P 8E1P ? 3 ? 1 4 PDB 8E1P 8E1P ? 4 ? 1 5 PDB 8E1P 8E1P ? 5 ? 1 6 PDB 8E1P 8E1P ? 6 ? 1 7 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 7 ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICTTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; 509 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8E1P F 1 ? 225 ? 8E1P 1 ? 225 ? 1 225 2 1 8E1P H 1 ? 225 ? 8E1P 1 ? 225 ? 1 225 3 2 8E1P I 1 ? 210 ? 8E1P 1 ? 212 ? 1 212 4 3 8E1P L 1 ? 210 ? 8E1P 1 ? 212 ? 1 212 5 1 8E1P N 1 ? 225 ? 8E1P 1 ? 225 ? 1 225 6 3 8E1P O 1 ? 210 ? 8E1P 1 ? 212 ? 1 212 7 4 8E1P A 1 ? 214 ? 8E1P 4 ? 212 ? 4 212 8 4 8E1P C 1 ? 214 ? 8E1P 4 ? 212 ? 4 212 9 5 8E1P E 1 ? 474 ? 8E1P 31 ? 513 ? 31 513 10 5 8E1P G 1 ? 474 ? 8E1P 31 ? 513 ? 31 513 11 4 8E1P J 1 ? 214 ? 8E1P 4 ? 212 ? 4 212 12 5 8E1P M 1 ? 474 ? 8E1P 31 ? 513 ? 31 513 13 6 8E1P B 1 ? 236 ? 8E1P 1 ? 217 ? 1 217 14 6 8E1P D 1 ? 236 ? 8E1P 1 ? 217 ? 1 217 15 6 8E1P K 1 ? 236 ? 8E1P 1 ? 217 ? 1 217 16 7 8E1P Y 1 ? 153 ? 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'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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E ASN 262 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? I ASN 258 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? E ASN 295 E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? I ASN 264 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? E ASN 301 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? I ASN 294 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? E ASN 332 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? I ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? E ASN 339 E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? I ASN 317 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? E ASN 355 E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? I ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? E ASN 363 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? I ASN 354 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? E ASN 392 E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? 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N-Glycosylation covale21 covale one ? J ASN 294 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? G ASN 332 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? J ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? G ASN 339 G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? J ASN 317 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? G ASN 355 G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? J ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? G ASN 363 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? J ASN 354 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? G ASN 392 G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? J ASN 409 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? G ASN 448 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? L ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? M ASN 88 M NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? L ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? M ASN 133 M NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? L ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? M ASN 156 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? L ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? M ASN 160 M NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? L ASN 197 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? M ASN 234 M NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? L ASN 225 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? M ASN 262 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? L ASN 258 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? M ASN 295 M NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? L ASN 264 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? M ASN 301 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? L ASN 294 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? M ASN 332 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? L ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? M ASN 339 M NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? L ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? M ASN 363 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? L ASN 354 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? M ASN 392 M NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? L ASN 409 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? M ASN 448 M NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? P ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? Y ASN 611 Y NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? P ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? Y ASN 618 Y NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? P ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? Y ASN 637 Y NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? Q ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? X ASN 611 X NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? Q ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? X ASN 637 X NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? R ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? Z ASN 611 Z NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? R ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? Z ASN 618 Z NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale47 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale48 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale49 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale50 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale51 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale52 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? R BMA 3 R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale53 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? R BMA 3 R MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale54 covale both ? U MAN . O2 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? R MAN 4 R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale55 covale both ? U MAN . O2 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? R MAN 5 R MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale56 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale57 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale58 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale59 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale60 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale61 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale62 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale63 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 2 a NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale64 covale both ? AA NAG . O3 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a NAG 3 a MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale65 covale both ? AA NAG . O6 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a NAG 3 a MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale66 covale both ? AA MAN . O2 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a MAN 4 a MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale67 covale both ? AA MAN . O2 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a MAN 5 a MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale68 covale both ? AA MAN . O3 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a MAN 7 a MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale69 covale both ? AA MAN . O6 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a MAN 7 a MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale70 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale71 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale72 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale73 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale74 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale75 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale76 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale77 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale78 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale79 covale both ? GA BMA . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale80 covale both ? GA MAN . O3 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 4 g MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale81 covale both ? GA MAN . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 4 g MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale82 covale both ? HA MAN . O2 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h MAN 1 h MAN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale83 covale both ? HA MAN . O2 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h MAN 2 h MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale84 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 142 A . ? GLY 142 F GLY 143 A ? GLY 143 F 1 -8.81 2 PHE 155 A . ? PHE 155 F PRO 156 A ? PRO 156 F 1 -5.98 3 GLU 157 A . ? GLU 157 F PRO 158 A ? 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