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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CAC1D_HUMAN Q01668 ? 1 ;MMMMMMMKKMQHQRQQQADHANEANYARGTRLPLSGEGPTSQPNSSKQTVLSWQAAIDAARQAKAAQTMSTSAPPPVGSL SQRKRQQYAKSKKQGNSSNSRPARALFCLSLNNPIRRACISIVEWKPFDIFILLAIFANCVALAIYIPFPEDDSNSTNHN LEKVEYAFLIIFTVETFLKIIAYGLLLHPNAYVRNGWNLLDFVIVIVGLFSVILEQLTKETEGGNHSSGKSGGFDVKALR AFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVIIIYAIIGLELFIGKMHKTCFFADSDIVAEEDPAPCAFS GNGRQCTANGTECRSGWVGPNGGITNFDNFAFAMLTVFQCITMEGWTDVLYWMNDAMGFELPWVYFVSLVIFGSFFVLNL VLGVLSGEFSKEREKAKARGDFQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEEEGGEEGKRNTSMPTSETESVNTENVS GEGENRGCCGSLCQAISKSKLSRRWRRWNRFNRRRCRAAVKSVTFYWLVIVLVFLNTLTISSEHYNQPDWLTQIQDIANK VLLALFTCEMLVKMYSLGLQAYFVSLFNRFDCFVVCGGITETILVELEIMSPLGISVFRCVRLLRIFKVTRHWTSLSNLV ASLLNSMKSIASLLLLLFLFIIIFSLLGMQLFGGKFNFDETQTKRSTFDNFPQALLTVFQILTGEDWNAVMYDGIMAYGG PSSSGMIVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLNTAQKEEAEEKERKKIARKESLENKKNNKPEVNQIANSD NKVTIDDYREEDEDKDPYPPCDVPVGEEEEEEEEDEPEVPAGPRPRRISELNMKEKIAPIPEGSAFFILSKTNPIRVGCH KLINHHIFTNLILVFIMLSSAALAAEDPIRSHSFRNTILGYFDYAFTAIFTVEILLKMTTFGAFLHKGAFCRNYFNLLDM LVVGVSLVSFGIQSSAISVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVFVAIRTIGNIMIVTTLLQFMFACIGVQLFKGK FYRCTDEAKSNPEECRGLFILYKDGDVDSPVVRERIWQNSDFNFDNVLSAMMALFTVSTFEGWPALLYKAIDSNGENIGP IYNHRVEISIFFIIYIIIVAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEKEYKNCELDKNQRQCVEYALKARPLRRYIPKNPYQYKFWY VVNSSPFEYMMFVLIMLNTLCLAMQHYEQSKMFNDAMDILNMVFTGVFTVEMVLKVIAFKPKGYFSDAWNTFDSLIVIGS IIDVALSEADPTESENVPVPTATPGNSEESNRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTLLWTFIKSFQALPYVALLIAML FFIYAVIGMQMFGKVAMRDNNQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCATGEAWQEIMLACLPGKLCDPESDYNPGEEYTCGSNFA IVYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILGPHHLDEFKRIWSEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGK LCPHRVACKRLVAMNMPLNSDGTVMFNATLFALVRTALKIKTEGNLEQANEELRAVIKKIWKKTSMKLLDQVVPPAGDDE VTVGKFYATFLIQDYFRKFKKRKEQGLVGKYPAKNTTIALQAGLRTLHDIGPEIRRAISCDLQDDEPEETKREEEDDVFK RNGALLGNHVNHVNSDRRDSLQQTNTTHRPLHVQRPSIPPASDTEKPLFPPAGNSVCHNHHNHNSIGKQVPTSTNANLNN ANMSKAAHGKRPSIGNLEHVSENGHHSSHKHDREPQRRSSVKRTRYYETYIRSDSGDEQLPTICREDPEIHGYFRDPHCL GEQEYFSSEECYEDDSSPTWSRQNYGYYSRYPGRNIDSERPRGYHHPQGFLEDDDSPVCYDSRRSPRRRLLPPTPASHRR SSFNFECLRRQSSQEEVPSSPIFPHRTALPLHLMQQQIMAVAGLDSSKAQKYSPSHSTRSWATPPATPPYRDWTPCYTPL IQVEQSEALDQVNGSLPSLHRSSWYTDEPDISYRTFTPASLTVPSSFRNKNSDKQRSADSLVEAVLISEGLGRYARDPKF VSATKHEIADACDLTIDEMESAASTLLNGNVRPRANGDVGPLSHRQDYELQDFGPGYSDEEPDPGRDEEDLADEMICITT L ; 1 2 UNP CA2D1_HUMAN P54289 ? 2 ;MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVE IAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQIS YQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRR RPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKD AVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQ WMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLK NQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKPIGVGIPTINLRKRRPNIQNPKSQEPVTLD FLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETIT QARYSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYW SKQKNIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGIMVSKAVEI YIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDP SLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEM EDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDG PNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL ; 1 3 UNP CACB3_HUMAN P54284 ? 3 ;MYDDSYVPGFEDSEAGSADSYTSRPSLDSDVSLEEDRESARREVESQAQQQLERAKHKPVAFAVRTNVSYCGVLDEECPV QGSGVNFEAKDFLHIKEKYSNDWWIGRLVKEGGDIAFIPSPQRLESIRLKQEQKARRSGNPSSLSDIGNRRSPPPSLAKQ KQKQAEHVPPYDVVPSMRPVVLVGPSLKGYEVTDMMQKALFDFLKHRFDGRISITRVTADLSLAKRSVLNNPGKRTIIER SSARSSIAEVQSEIERIFELAKSLQLVVLDADTINHPAQLAKTSLAPIIVFVKVSSPKVLQRLIRSRGKSQMKHLTVQMM AYDKLVQCPPESFDVILDENQLEDACEHLAEYLEVYWRATHHPAPGPGLLGPPSAIPGLQNQQLLGERGEEHSPLERDSL MPSDEASESSRQAWTGSSQRSSRHLEEDYADAYQDLYQPHRQHTSGLPSANGHDPQDRLLAQDSEHNHSDRNWQRNRPWP KDSY ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8E59 A 1 ? 2161 ? Q01668 1 ? 2161 ? 1 2161 2 2 8E59 D 1 ? 1103 ? P54289 1 ? 1103 ? 1 1103 3 3 8E59 C 1 ? 484 ? P54284 1 ? 484 ? 1 484 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 3PE non-polymer . 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine '3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE; 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE' 'C41 H82 N O8 P' 748.065 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BBI non-polymer . '(2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone' ? 'C25 H29 I2 N O3' 645.312 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8E59 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8E59 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 20744 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.555 ? 28094 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.129 ? 2810 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 3199 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 3556 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8E59 _struct.title 'Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 in the presence of Amiodarone at 3.1 Angstrom resolution' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8E59 _struct_keywords.text 'Cav1.3, Channels, Calcium Ion-Selective, TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 5 ? H N N 5 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 9 ? L N N 10 ? M N N 10 ? N N N 8 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 126 ? ILE A 145 ? LYS A 126 ILE A 145 1 ? 20 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 155 ? ILE A 181 ? ASN A 155 ILE A 181 1 ? 27 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 195 ? THR A 218 ? ASN A 195 THR A 218 1 ? 24 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 237 ? ARG A 246 ? LYS A 237 ARG A 246 5 ? 10 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO A 247 ? LEU A 248 ? PRO A 247 LEU A 248 5 ? 2 HELX_P HELX_P6 AA6 ARG A 249 ? VAL A 254 ? ARG A 249 VAL A 254 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL A 254 ? ALA A 267 ? VAL A 254 ALA A 267 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 AA8 MET A 268 ? PRO A 270 ? MET A 268 PRO A 270 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU A 271 ? PHE A 293 ? LEU A 271 PHE A 293 1 ? 23 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 349 ? THR A 362 ? ASN A 349 THR A 362 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 365 ? MET A 377 ? GLY A 365 MET A 377 1 ? 13 HELX_P HELX_P12 AB3 LEU A 381 ? SER A 394 ? LEU A 381 SER A 394 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 394 ? GLY A 420 ? SER A 394 GLY A 420 1 ? 27 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY A 420 ? LEU A 431 ? GLY A 420 LEU A 431 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 GLU A 432 ? ALA A 445 ? GLU A 432 ALA A 445 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 522 ? SER A 541 ? SER A 522 SER A 541 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO A 548 ? TYR A 575 ? PRO A 548 TYR A 575 1 ? 28 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU A 579 ? SER A 585 ? LEU A 579 SER A 585 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 585 ? LEU A 607 ? SER A 585 LEU A 607 1 ? 23 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU A 613 ? LEU A 623 ? LEU A 613 LEU A 623 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 AC3 ILE A 626 ? ARG A 631 ? ILE A 626 ARG A 631 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU A 636 ? SER A 646 ? LEU A 636 SER A 646 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 646 ? GLY A 673 ? SER A 646 GLY A 673 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN A 690 ? GLY A 704 ? ASN A 690 GLY A 704 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP A 706 ? ALA A 717 ? ASP A 706 ALA A 717 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 SER A 722 ? VAL A 728 ? SER A 722 VAL A 728 5 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 CYS A 729 ? LYS A 772 ? CYS A 729 LYS A 772 1 ? 44 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL A 877 ? ASN A 884 ? VAL A 877 ASN A 884 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 ILE A 887 ? ALA A 904 ? ILE A 887 ALA A 904 1 ? 18 HELX_P HELX_P30 AD3 SER A 913 ? GLY A 942 ? SER A 913 GLY A 942 1 ? 30 HELX_P HELX_P31 AD4 TYR A 954 ? SER A 969 ? TYR A 954 SER A 969 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 VAL A 980 ? ARG A 987 ? VAL A 980 ARG A 987 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 VAL A 988 ? ILE A 995 ? VAL A 988 ILE A 995 5 ? 8 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA A 998 ? PHE A 1037 ? 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ASP A 1267 SER A 1287 1 ? 21 HELX_P HELX_P48 AF3 ILE A 1315 ? ARG A 1322 ? ILE A 1315 ARG A 1322 1 ? 8 HELX_P HELX_P49 AF4 MET A 1324 ? SER A 1331 ? MET A 1324 SER A 1331 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY A 1335 ? LEU A 1350 ? GLY A 1335 LEU A 1350 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 TYR A 1352 ? GLY A 1373 ? TYR A 1352 GLY A 1373 1 ? 22 HELX_P HELX_P52 AF7 THR A 1391 ? GLY A 1405 ? THR A 1391 GLY A 1405 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 AF8 ALA A 1407 ? CYS A 1415 ? ALA A 1407 CYS A 1415 1 ? 9 HELX_P HELX_P54 AF9 PHE A 1439 ? ASN A 1466 ? PHE A 1439 ASN A 1466 1 ? 28 HELX_P HELX_P55 AG1 ASN A 1466 ? THR A 1471 ? ASN A 1466 THR A 1471 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 AG2 GLY A 1478 ? TYR A 1492 ? GLY A 1478 TYR A 1492 1 ? 15 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP A 1504 ? ARG A 1511 ? ASP A 1504 ARG A 1511 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 AG4 VAL A 1526 ? MET A 1534 ? VAL A 1526 MET A 1534 1 ? 9 HELX_P HELX_P59 AG5 PHE A 1546 ? LEU A 1558 ? PHE A 1546 LEU A 1558 1 ? 13 HELX_P HELX_P60 AG6 LEU A 1566 ? VAL A 1576 ? LEU A 1566 VAL A 1576 1 ? 11 HELX_P HELX_P61 AG7 LYS A 1583 ? LEU A 1589 ? LYS A 1583 LEU A 1589 1 ? 7 HELX_P HELX_P62 AG8 SER B 29 ? GLY B 53 ? SER D 29 GLY D 53 1 ? 25 HELX_P HELX_P63 AG9 GLY B 53 ? GLN B 65 ? GLY D 53 GLN D 65 1 ? 13 HELX_P HELX_P64 AH1 ASN B 74 ? ALA B 110 ? ASN D 74 ALA D 110 1 ? 37 HELX_P HELX_P65 AH2 SER B 176 ? THR B 186 ? SER D 176 THR D 186 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 AH3 ALA B 188 ? ASP B 200 ? ALA D 188 ASP D 200 1 ? 13 HELX_P HELX_P67 AH4 ASP B 237 ? ARG B 240 ? ASP D 237 ARG D 240 5 ? 4 HELX_P HELX_P68 AH5 ARG B 241 ? ALA B 249 ? ARG D 241 ALA D 249 1 ? 9 HELX_P HELX_P69 AH6 SER B 261 ? SER B 265 ? SER D 261 SER D 265 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 AH7 GLY B 266 ? GLU B 281 ? GLY D 266 GLU D 281 1 ? 16 HELX_P HELX_P71 AH8 ASN B 311 ? ASN B 323 ? ASN D 311 ASN D 323 1 ? 13 HELX_P HELX_P72 AH9 ASP B 332 ? LEU B 344 ? ASP D 332 LEU D 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P73 AI1 ALA B 369 ? ASN B 377 ? ALA D 369 ASN D 377 1 ? 9 HELX_P HELX_P74 AI2 ARG B 396 ? GLU B 405 ? 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SER C 296 SER C 306 1 ? 11 HELX_P HELX_P103 AL4 GLN C 311 ? LYS C 313 ? GLN C 311 LYS C 313 5 ? 3 HELX_P HELX_P104 AL5 HIS C 314 ? GLN C 327 ? HIS C 314 GLN C 327 1 ? 14 HELX_P HELX_P105 AL6 PRO C 329 ? PHE C 333 ? PRO C 329 PHE C 333 5 ? 5 HELX_P HELX_P106 AL7 GLN C 341 ? THR C 360 ? GLN C 341 THR C 360 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale8 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B NAG 2 B NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale9 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale10 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale11 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 2 F NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale12 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 3 F NAG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale13 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale14 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? metalc1 metalc ? ? A ASP 153 OD2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASP 153 D CA 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? ? metalc2 metalc ? ? A GLU 364 OE1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 364 A CA 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? ? metalc3 metalc ? ? A GLU 364 OE2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 364 A CA 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? ? metalc4 metalc ? ? A GLU 705 OE1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 705 A CA 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? ? metalc5 metalc ? ? A GLU 1101 OE1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 1101 A CA 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? ? metalc6 metalc ? ? A GLU 1101 OE2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 1101 A CA 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? ? metalc7 metalc ? ? B SER 261 OG ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? D SER 261 D CA 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? ? metalc8 metalc ? ? B SER 263 OG ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? D SER 263 D CA 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc9 metalc ? ? B THR 331 OG1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? D THR 331 D CA 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 218 B . ? TYR 218 D PRO 219 B ? PRO 219 D 1 -1.40 2 GLY 1040 B . ? GLY 1040 D PRO 1041 B ? PRO 1041 D 1 -0.51 3 GLY 184 C . ? 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ALA D 215 TYR D 218 AA7 4 GLN B 206 ? SER B 210 ? GLN D 206 SER D 210 AA7 5 ILE B 484 ? SER B 493 ? ILE D 484 SER D 493 AA7 6 LEU B 458 ? PHE B 467 ? LEU D 458 PHE D 467 AA7 7 TYR B 450 ? LEU B 451 ? TYR D 450 LEU D 451 AA8 1 ILE B 150 ? GLU B 151 ? ILE D 150 GLU D 151 AA8 2 GLN B 158 ? ILE B 159 ? GLN D 158 ILE D 159 AA9 1 ALA B 298 ? ASP B 300 ? ALA D 298 ASP D 300 AA9 2 ASN B 290 ? PHE B 294 ? ASN D 290 PHE D 294 AA9 3 LEU B 255 ? ASP B 259 ? LEU D 255 ASP D 259 AA9 4 ILE B 357 ? THR B 362 ? ILE D 357 THR D 362 AA9 5 ARG B 383 ? VAL B 389 ? ARG D 383 VAL D 389 AA9 6 TYR B 410 ? ILE B 413 ? TYR D 410 ILE D 413 AB1 1 VAL B 521 ? LEU B 523 ? VAL D 521 LEU D 523 AB1 2 TYR B 511 ? ILE B 515 ? TYR D 511 ILE D 515 AB1 3 SER B 618 ? PRO B 624 ? SER D 618 PRO D 624 AB1 4 ILE B 600 ? PRO B 611 ? ILE D 600 PRO D 611 AB1 5 GLY B 584 ? LYS B 593 ? GLY D 584 LYS D 593 AB2 1 TYR B 658 ? ILE B 661 ? TYR D 658 ILE D 661 AB2 2 ILE B 740 ? VAL B 743 ? ILE D 740 VAL D 743 AB2 3 VAL B 729 ? THR B 736 ? 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? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number 5R01GM130762 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 4 NAG 1 B NAG 1 D NAG 1102 n D 4 NAG 2 B NAG 2 D NAG 1103 n D 4 NAG 3 B NAG 3 D NAG 1104 n E 5 NAG 1 E NAG 1 D NAG 1105 n E 5 NAG 2 E NAG 2 D NAG 1106 n F 6 NAG 1 F NAG 1 D NAG 1107 n F 6 NAG 2 F NAG 2 D NAG 1108 n F 6 NAG 3 F NAG 3 D NAG 1109 n F 6 NAG 4 F NAG 4 D NAG 1110 n G 5 NAG 1 G NAG 1 D NAG 1111 n G 5 NAG 2 G NAG 2 D NAG 1112 n H 5 NAG 1 H NAG 1 D NAG 1114 n H 5 NAG 2 H NAG 2 D NAG 1115 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1-1/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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