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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Chou, S.Z.' 1 0000-0002-5307-376X primary 'Chatterjee, M.' 2 ? primary 'Pollard, T.D.' 3 0000-0002-1785-2969 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8E9B _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8E9B _symmetry.cell_setting 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;MTFRTLDVDSITEPVLTEQDIFPIRNETAEQVQAAVSQLIPQARSAIQTGNALQGLKTLLSYVPYGNDVQEVRTQYLNAF VDVLSNIRAADIPAFVKECSTEEIDNIVNFIYRGLANPQAYNSSVLLNWHEKVVEISGIGCIVRVLNSRPDL ; G ? 8 'polypeptide(L)' no yes ;DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIE(HIC)GII TNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSG DGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKE ITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF ; ;DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWD DMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVT HNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSY ELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITAL APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF ; M,N,O,P,Q,R,H,I ? # loop_ 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'972 / ATCC 24843' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 375 chicken 'Gallus gallus' 9031 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ARP3_SCHPO P32390 ? 1 ;MASFNVPIIMDNGTGYSKLGYAGNDAPSYVFPTVIATRSAGASSGPAVSSKPSYMASKGSGHLSSKRATEDLDFFIGNDA LKKASAGYSLDYPIRHGQIENWDHMERFWQQSLFKYLRCEPEDHYFLLTEPPLNPPENRENTAEIMFESFNCAGLYIAVQ AVLALAASWTSSKVTDRSLTGTVVDSGDGVTHIIPVAEGYVIGSSIKTMPLAGRDVTYFVQSLLRDRNEPDSSLKTAERI KEECCYVCPDIVKEFSRFDREPDRYLKYASESITGHSTTIDVGFERFLAPEIFFNPEIASSDFLTPLPELVDNVVQSSPI DVRKGLYKNIVLSGGSTLFKNFGNRLQRDLKRIVDERIHRSEMLSGAKSGGVDVNVISHKRQRNAVWFGGSLLAQTPEFG SYCHTKADYEEYGASIARRYQIFGNSL ; 1 2 UNP ARP2_SCHPO Q9UUJ1 ? 2 ;MESAPIVLDNGTGFVKVGYAKDNFPRFQFPSIVGRPILRAEEKTGNVQIKDVMVGDEAEAVRSLLQVKYPMENGIIRDFE EMNQLWDYTFFEKLKIDPRGRKILLTEPPMNPVANREKMCETMFERYGFGGVYVAIQAVLSLYAQGLSSGVVVDSGDGVT HIVPVYESVVLNHLVGRLDVAGRDATRYLISLLLRKGYAFNRTADFETVREMKEKLCYVSYDLELDHKLSEETTVLMRNY TLPDGRVIKVGSERYECPECLFQPHLVGSEQPGLSEFIFDTIQAADVDIRKYLYRAIVLSGGSSMYAGLPSRLEKEIKQL WFERVLHGDPARLPNFKVKIEDAPRRRHAVFIGGAVLADIMAQNDHMWVSKAEWEEYGVRALDKLGPRTT ; 1 3 UNP ARPC1_SCHPO P78774 ? 3 ;MATSQVLHILPKPSYEHAFNSQRTEFVTTTATNQVELYEQDGNGWKHARTFSDHDKIVTCVDWAPKSNRIVTCSQDRNAY VYEKRPDGTWKQTLVLLRLNRAATFVRWSPNEDKFAVGSGARVISVCYFEQENDWWVSKHLKRPLRSTILSLDWHPNNVL LAAGCADRKAYVLSAYVRDVDAKPEASVWGSRLPFNTVCAEYPSGGWVHAVGFSPSGNALAYAGHDSSVTIAYPSAPEQP PRALITVKLSQLPLRSLLWANESAIVAAGYNYSPILLQGNESGWAHTRDLDAGTSKTSFTHTGNTGEGREEEGPVSFTAL RSTFRNMDLKGSSQSISSLPTVHQNMIATLRPYAGTPGNITAFTSSGTDGRVVLWTL ; 1 4 UNP ARPC2_SCHPO O14241 ? 4 ;MLSLDYNNIFIYELLTERFSSENPSSIDQVVTDFDGVTFHISTPEEKTKILISLSMKCYPELVNYGTLDLLKQIYGAYVH EPEMGYNFSILIDLQQLPATDEEKEQLAMSISMLKRNVLAAPFHRAFTKQAELADLARKDPENAPMLDKQATSQELMAIH YRDEETIVLWPEHDRVTVVFSTKFREETDRIFGKVFLQEFVDARRRPAIQTAPQVLFSYRDPPLEIRDIQGIQKGDDFGF VTFVLFERHFTPQNREDCISHIQVFRNTLHFHIKASKAYMHQRMRKRVADFQKVLNRAKPDVELERKTATGRSFVRA ; 1 5 UNP ARPC3_SCHPO Q9Y7J4 ? 5 ;MPAYHSSFLSLTDVPTTGNIAMLPLKTKFRGPAYPADESQMDIIDECIGLFRANCFFRNFEIKGPADRTLIYGTLFISEC LGRVNGLNYRDAERQLNSLALENFSIPGSAGFPLNALYAPPLSPQDAEIMRTYLTQFRQELAYRLLSHVYATEKDHPSKW WTCFSKRRFMNKAL ; 1 6 UNP ARPC4_SCHPO Q92352 ? 6 ;MSNTLRPYLNAVRSTLTASLALEEFSSEIVERQSQPEVEVGRSPEILLKPLVVSRNEQEQCLIESSVNSVRFSIRIKQVD EIERILVRKFMQFLMGRAESFFILRRKPVQGYDISFLITNYHTEEMLKHKLVDFIIEFMEEVDAEISEMKLFLNGRARLV AETYLSCF ; 1 7 UNP ARPC5_SCHPO Q10316 ? 7 ;MTFRTLDVDSITEPVLTEQDIFPIRNETAEQVQAAVSQLIPQARSAIQTGNALQGLKTLLSYVPYGNDVQEVRTQYLNAF VDVLSNIRAADIPAFVKECSTEEIDNIVNFIYRGLANPQAYNSSVLLNWHEKVVEISGIGCIVRVLNSRPDL ; 1 8 UNP ACTS_CHICK P68139 ? 8 ;DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWD DMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVT HNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSY ELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITAL APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF ; 3 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8E9B A 1 ? 427 ? 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'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8E9B _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8E9B _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 40028 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.642 ? 54326 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.124 ? 5524 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 6016 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 6988 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8E9B _struct.title 'Cryo-EM structure of S. pombe Arp2/3 complex in the branch junction' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8E9B _struct_keywords.text 'Arp2-3 complex, branch juction, polymerization, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 8 ? J N N 8 ? K N N 8 ? L N N 8 ? M N N 8 ? N N N 8 ? O N N 8 ? P N N 9 ? Q N N 10 ? R N N 9 ? S N N 11 ? T N N 9 ? U N N 10 ? V N N 9 ? W N N 10 ? X N N 9 ? Y N N 10 ? Z N N 9 ? AA N N 10 ? BA N N 9 ? CA N N 10 ? DA N N 9 ? EA N N 10 ? FA N N 9 ? GA N N 10 ? HA N N 9 ? IA N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 77 ? LYS A 83 ? GLY A 77 LYS A 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 101 ? TYR A 116 ? ASN A 101 TYR A 116 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 120 ? ASP A 123 ? GLU A 120 ASP A 123 5 ? 4 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 135 ? SER A 149 ? PRO A 135 SER A 149 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 VAL A 162 ? TRP A 169 ? VAL A 162 TRP A 169 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 203 ? ILE A 206 ? GLY A 203 ILE A 206 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 212 ? ARG A 227 ? ALA A 212 ARG A 227 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 233 ? CYS A 244 ? SER A 233 CYS A 244 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 250 ? GLU A 261 ? ASP A 250 GLU A 261 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 PHE A 284 ? ALA A 289 ? PHE A 284 ALA A 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO A 290 ? ASN A 295 ? PRO A 290 ASN A 295 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO A 306 ? SER A 318 ? PRO A 306 SER A 318 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO A 319 ? ASP A 321 ? PRO A 319 ASP A 321 5 ? 3 HELX_P HELX_P14 AB5 VAL A 322 ? ASN A 329 ? VAL A 322 ASN A 329 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY A 334 ? LEU A 338 ? GLY A 334 LEU A 338 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN A 341 ? GLY A 366 ? ASN A 341 GLY A 366 1 ? 26 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN A 384 ? GLN A 395 ? 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