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_software.contact_author ? _software.contact_author_email ? _software.date ? _software.description ? _software.dependencies ? _software.hardware ? _software.language ? _software.location ? _software.mods ? _software.name PHENIX _software.os ? _software.os_version ? _software.type ? _software.version dev_4290: _software.pdbx_ordinal 1 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8EGS _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8EGS _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? 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A0A1S6L1I1 1 ? 588 ? 1 588 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete point assembly' ? octadecameric 18 2 'point asymmetric unit' ? trimeric 3 3 'point asymmetric unit, std point frame' ? trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-6)' A,B,C 2 1 A,B,C 3 P A,B,C # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.41208538 -0.91114524 0.00000000 127.24829 0.91114524 0.41208538 0.00000000 -337.39205 0.00000000 0.00000000 1.00000000 -250.75454 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.86602540 0.00000000 348.30369 0.86602540 0.50000000 0.00000000 -93.32769 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.86602540 0.00000000 603.27969 0.86602540 -0.50000000 0.00000000 161.64831 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 509.95200 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 509.95201 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.86602540 0.00000000 161.64830 -0.86602540 -0.50000000 0.00000000 603.27970 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.86602540 0.00000000 -93.32770 -0.86602540 0.50000000 0.00000000 348.30369 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER C 28 ? 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AA8 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA C 44 ? 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ASN Y 209 MET Y 213 AA6 4 MET C 264 ? LEU C 266 ? MET Y 264 LEU Y 266 AA6 5 LEU C 251 ? ALA C 253 ? LEU Y 251 ALA Y 253 AA7 1 ARG C 281 ? VAL C 282 ? ARG Y 281 VAL Y 282 AA7 2 VAL C 332 ? ILE C 339 ? VAL Y 332 ILE Y 339 AA7 3 GLU C 345 ? PRO C 350 ? GLU Y 345 PRO Y 350 AA7 4 ILE C 381 ? ASP C 384 ? ILE Y 381 ASP Y 384 AA8 1 ASN C 413 ? ILE C 415 ? ASN Y 413 ILE Y 415 AA8 2 TYR C 465 ? ASP C 467 ? 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O ILE Y 45 N PHE C 11 ? N PHE Y 11 AA1 2 3 N HIS C 8 ? N HIS Y 8 O LYS C 80 ? O LYS Y 80 AA1 3 4 N PHE C 79 ? N PHE Y 79 O TYR C 88 ? O TYR Y 88 AA1 4 5 N PHE C 91 ? N PHE Y 91 O VAL C 108 ? O VAL Y 108 AA2 1 2 N THR C 23 ? N THR Y 23 O TRP C 568 ? O TRP Y 568 AA2 2 3 O VAL C 565 ? O VAL Y 565 N LEU C 538 ? N LEU Y 538 AA2 3 4 O ARG C 541 ? O ARG Y 541 N PHE C 128 ? N PHE Y 128 AA3 1 2 N VAL C 61 ? N VAL Y 61 O MET C 105 ? O MET Y 105 AA3 2 3 O ARG C 104 ? O ARG Y 104 N GLU C 96 ? N GLU Y 96 AA4 1 2 N LEU C 161 ? N LEU Y 161 O ILE C 497 ? O ILE Y 497 AA4 2 3 O THR C 494 ? O THR Y 494 N TYR C 312 ? N TYR Y 312 AA5 1 2 O LYS C 237 ? O LYS Y 237 N GLN C 176 ? N GLN Y 176 AA5 2 3 N LEU C 172 ? N LEU Y 172 O ILE C 241 ? O ILE Y 241 AA6 1 2 O LYS C 237 ? O LYS Y 237 N GLN C 176 ? N GLN Y 176 AA6 2 3 N SER C 177 ? N SER Y 177 O ASN C 209 ? O ASN Y 209 AA6 3 4 N VAL C 212 ? N VAL Y 212 O MET C 264 ? O MET Y 264 AA6 4 5 O THR C 265 ? O THR Y 265 N GLU C 252 ? N GLU Y 252 AA7 1 2 N VAL C 282 ? N VAL Y 282 O VAL C 332 ? O VAL Y 332 AA7 2 3 N LYS C 335 ? N LYS Y 335 O TYR C 349 ? O TYR Y 349 AA7 3 4 N VAL C 346 ? N VAL Y 346 O PHE C 383 ? O PHE Y 383 AA8 1 2 N LEU C 414 ? N LEU Y 414 O LYS C 466 ? O LYS Y 466 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG Y SER 178 ? ? OD1 Y ASN 234 ? ? 2.02 2 1 OG Y SER 196 ? ? 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? 70.51 173.15 2 1 ASN Y 75 ? ? -120.05 -51.49 3 1 ASN Y 192 ? ? -160.99 119.10 4 1 SER Y 195 ? ? 66.73 -141.61 5 1 TYR Y 203 ? ? 68.09 -0.07 6 1 ASN Y 294 ? ? -101.59 74.97 7 1 ASN Y 358 ? ? 80.98 1.07 8 1 LEU Y 377 ? ? 78.48 -5.42 9 1 SER Y 385 ? ? 60.61 65.91 10 1 VAL Y 534 ? ? -107.78 -62.68 # _pdbx_point_symmetry.entry_id 8EGS _pdbx_point_symmetry.Schoenflies_symbol C _pdbx_point_symmetry.circular_symmetry 6 # _em_3d_fitting.entry_id 8EGS _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8EGS _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 101037 _em_3d_reconstruction.resolution 3.92 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? 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