data_8F0H
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_entry.id 8F0H
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PDB 8F0H pdb_00008f0h 10.2210/pdb8f0h/pdb
WWPDB D_1000267437 ? ?
EMDB EMD-28757 ? ?
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_pdbx_audit_revision_history.revision_date
1 'Structure model' 1 0 2023-05-03
2 'Structure model' 1 1 2024-11-20
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_pdbx_audit_revision_details.ordinal 1
_pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1
_pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model'
_pdbx_audit_revision_details.provider repository
_pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release'
_pdbx_audit_revision_details.description ?
_pdbx_audit_revision_details.details ?
#
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_pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_group.data_content_type
_pdbx_audit_revision_group.group
1 2 'Structure model' 'Data collection'
2 2 'Structure model' 'Structure summary'
#
loop_
_pdbx_audit_revision_category.ordinal
_pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_category.data_content_type
_pdbx_audit_revision_category.category
1 2 'Structure model' chem_comp_atom
2 2 'Structure model' chem_comp_bond
3 2 'Structure model' em_admin
4 2 'Structure model' pdbx_entry_details
5 2 'Structure model' pdbx_modification_feature
#
loop_
_pdbx_audit_revision_item.ordinal
_pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_item.data_content_type
_pdbx_audit_revision_item.item
1 2 'Structure model' '_em_admin.last_update'
2 2 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification'
#
_pdbx_database_status.status_code REL
_pdbx_database_status.status_code_sf ?
_pdbx_database_status.status_code_mr ?
_pdbx_database_status.entry_id 8F0H
_pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-11-02
_pdbx_database_status.SG_entry N
_pdbx_database_status.deposit_site RCSB
_pdbx_database_status.process_site RCSB
_pdbx_database_status.status_code_cs ?
_pdbx_database_status.status_code_nmr_data ?
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_pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y
#
_pdbx_database_related.db_name EMDB
_pdbx_database_related.details
'Structure of SARS-CoV-2 spike with antibody Fabs 2A10 and 1H2 (Local refinement of the RBD and Fabs 1H2 and 2A10)'
_pdbx_database_related.db_id EMD-28757
_pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume'
#
_pdbx_contact_author.id 3
_pdbx_contact_author.email erica@lji.org
_pdbx_contact_author.name_first Erica
_pdbx_contact_author.name_last 'Ollmann Saphire'
_pdbx_contact_author.name_mi ?
_pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader'
_pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-1206-7451
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
_audit_author.identifier_ORCID
'Yu, X.' 1 0000-0002-6778-5004
'Zyla, D.' 2 0000-0001-8471-469X
'Hastie, K.M.' 3 0000-0002-3406-1210
'Saphire, E.O.' 4 0000-0002-1206-7451
#
_citation.abstract ?
_citation.abstract_id_CAS ?
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_citation.book_title ?
_citation.coordinate_linkage ?
_citation.country US
_citation.database_id_Medline ?
_citation.details ?
_citation.id primary
_citation.journal_abbrev 'Cell Rep'
_citation.journal_id_ASTM ?
_citation.journal_id_CSD ?
_citation.journal_id_ISSN 2211-1247
_citation.journal_full ?
_citation.journal_issue ?
_citation.journal_volume 42
_citation.language ?
_citation.page_first 112421
_citation.page_last 112421
_citation.title
'Potent Omicron-neutralizing antibodies isolated from a patient vaccinated 6 months before Omicron emergence.'
_citation.year 2023
_citation.database_id_CSD ?
_citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.celrep.2023.112421
_citation.pdbx_database_id_PubMed 37083327
_citation.pdbx_database_id_patent ?
_citation.unpublished_flag ?
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
_citation_author.identifier_ORCID
primary 'Hastie, K.M.' 1 ?
primary 'Yu, X.' 2 ?
primary 'Ana-Sosa-Batiz, F.' 3 ?
primary 'Zyla, D.S.' 4 ?
primary 'Harkins, S.S.' 5 ?
primary 'Hariharan, C.' 6 ?
primary 'Wasserman, H.' 7 ?
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primary 'Miller, R.' 9 ?
primary 'Maule, E.' 10 ?
primary 'Kim, K.' 11 ?
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primary 'Shresta, S.' 13 ?
primary 'Saphire, E.O.' 14 ?
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.pdbx_ec
_entity.pdbx_mutation
_entity.pdbx_fragment
_entity.details
1 polymer man 'Antibody Fab 1H2 heavy chain' 13783.513 1 ? ? ? ?
2 polymer man 'Spike glycoprotein' 134065.656 1 ? ? ? ?
3 polymer man 'Antibody Fab 1H2 light chain' 10796.722 1 ? ? ? ?
4 polymer man 'Antibody Fab 2A10 heavy chain' 12750.298 1 ? ? ? ?
5 polymer man 'Antibody Fab 2A10 light chain' 11920.188 1 ? ? ? ?
6 branched syn
'2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 570.542 1
? ? ? ?
#
_entity_name_com.entity_id 2
_entity_name_com.name 'S glycoprotein,E2,Peplomer protein'
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_target_identifier
1 'polypeptide(L)' no no
;QVQLQQSGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVSGITWNSGTIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLY
LQMRSLRAEDTALYYCAKDSGRKLLWGREDYYMGVWGKGTTVTV
;
;QVQLQQSGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVSGITWNSGTIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLY
LQMRSLRAEDTALYYCAKDSGRKLLWGREDYYMGVWGKGTTVTV
;
B ?
2 'polypeptide(L)' no no
;MGVKVLFALICIAVAEAQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGT
KRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESE
FRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINIT
RFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTS
NFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVY
ADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAG
STPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESN
KKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVY
STGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPGSASSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPT
NFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKD
FGGFNFSQILPDPSKPSKRSPIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSA
LLAGTITSGWTFGAGPALQIPFPMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTPSALGKLQDVVNQNA
QALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDPPEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQ
SKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIIT
TDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNES
LIDLQELGKYEQ
;
;MGVKVLFALICIAVAEAQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGT
KRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESE
FRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINIT
RFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTS
NFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVY
ADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAG
STPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESN
KKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVY
STGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPGSASSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPT
NFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKD
FGGFNFSQILPDPSKPSKRSPIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSA
LLAGTITSGWTFGAGPALQIPFPMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTPSALGKLQDVVNQNA
QALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDPPEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQ
SKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIIT
TDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNES
LIDLQELGKYEQ
;
C ?
3 'polypeptide(L)' no no
;SYELTQPPSVSVAPGKTARITCGGSNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVIYYDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAG
DEADYYCQVWDSSSDHVVFGG
;
;SYELTQPPSVSVAPGKTARITCGGSNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVIYYDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAG
DEADYYCQVWDSSSDHVVFGG
;
D ?
4 'polypeptide(L)' no no
;QVQLVESGGGLIQPGGSLRLSCAASEFIVSSNYMSWVRQAPGKGLEWVSLLYSGGTTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFL
QMNSLRAEDTAMYYCARDRGPWLHDYWGQGTLVTV
;
;QVQLVESGGGLIQPGGSLRLSCAASEFIVSSNYMSWVRQAPGKGLEWVSLLYSGGTTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFL
QMNSLRAEDTAMYYCARDRGPWLHDYWGQGTLVTV
;
H ?
5 'polypeptide(L)' no no
;DIVMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDINKYCNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTINSLQP
EDIATYYCQQYDNLPPTFGGGTKVEIKRT
;
;DIVMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDINKYCNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTINSLQP
EDIATYYCQQYDNLPPTFGGGTKVEIKRT
;
L ?
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 GLN n
1 2 VAL n
1 3 GLN n
1 4 LEU n
1 5 GLN n
1 6 GLN n
1 7 SER n
1 8 GLY n
1 9 GLY n
1 10 GLY n
1 11 LEU n
1 12 VAL n
1 13 GLN n
1 14 PRO n
1 15 GLY n
1 16 ARG n
1 17 SER n
1 18 LEU n
1 19 ARG n
1 20 LEU n
1 21 SER n
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1 24 ALA n
1 25 SER n
1 26 GLY n
1 27 PHE n
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1 29 PHE n
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1 31 ASP n
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1 37 VAL n
1 38 ARG n
1 39 GLN n
1 40 ALA n
1 41 PRO n
1 42 GLY n
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1 44 GLY n
1 45 LEU n
1 46 GLU n
1 47 TRP n
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1 49 SER n
1 50 GLY n
1 51 ILE n
1 52 THR n
1 53 TRP n
1 54 ASN n
1 55 SER n
1 56 GLY n
1 57 THR n
1 58 ILE n
1 59 GLY n
1 60 TYR n
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1 62 ASP n
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1 66 GLY n
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1 68 PHE n
1 69 THR n
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1 71 SER n
1 72 ARG n
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1 77 ASN n
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1 81 LEU n
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1 84 ARG n
1 85 SER n
1 86 LEU n
1 87 ARG n
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1 91 THR n
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1 95 TYR n
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1 97 ALA n
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1 108 ARG n
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1 121 THR n
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2 5 VAL n
2 6 LEU n
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2 15 ALA n
2 16 GLU n
2 17 ALA n
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2 20 VAL n
2 21 ASN n
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2 24 THR n
2 25 ARG n
2 26 THR n
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2 30 PRO n
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2 37 THR n
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2 41 TYR n
2 42 TYR n
2 43 PRO n
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2 54 SER n
2 55 THR n
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1 1 sample 'Biological sequence' 1 124 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ?
'chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
2 1 sample 'Biological sequence' 1 1212 '2019-nCoV, SARS-CoV-2' ? 'S, 2' ? ? ? ? ? ?
'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' 2697049 ? ? ? ? ? ? ? 'chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
3 1 sample 'Biological sequence' 1 101 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ?
'chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
4 1 sample 'Biological sequence' 1 115 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ?
'chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
5 1 sample 'Biological sequence' 1 109 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ?
'chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
#
_pdbx_entity_branch.entity_id 6
_pdbx_entity_branch.type oligosaccharide
#
loop_
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_pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor
_pdbx_entity_branch_descriptor.type
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_pdbx_entity_branch_descriptor.program_version
1 6 'DGlcpNAcb1-4[LFucpa1-6]DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0
2 6 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1221m-1a_1-5]/1-1-2/a4-b1_a6-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0
3 6 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}[(6+1)][a-L-Fucp]{}}' LINUCS PDB-CARE ?
#
loop_
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_pdbx_entity_branch_link.entity_id
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_pdbx_entity_branch_link.value_order
_pdbx_entity_branch_link.details
1 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ?
2 6 3 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ?
#
loop_
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_chem_comp.name
_chem_comp.pdbx_synonyms
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093
ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209
ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118
ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103
CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158
FUC 'L-saccharide, alpha linking' . alpha-L-fucopyranose
'alpha-L-fucose; 6-deoxy-alpha-L-galactopyranose; L-fucose; fucose' 'C6 H12 O5' 164.156
GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144
GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129
GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067
HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162
ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173
LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173
LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195
MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211
NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE
;
'C8 H15 N O6' 221.208
PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189
PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130
SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093
THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119
TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225
TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189
VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146
#
loop_
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_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
FUC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 LFucpa
FUC 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-L-fucopyranose
FUC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-L-Fucp
FUC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Fuc
NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb
NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine
NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc
NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
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B 2 7 PHE 7 3 ? ? ? C . n
B 2 8 ALA 8 4 ? ? ? C . n
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B 2 11 CYS 11 7 ? ? ? C . n
B 2 12 ILE 12 8 ? ? ? C . n
B 2 13 ALA 13 9 ? ? ? C . n
B 2 14 VAL 14 10 ? ? ? C . n
B 2 15 ALA 15 11 ? ? ? C . n
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B 2 17 ALA 17 13 ? ? ? C . n
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B 2 19 CYS 19 15 ? ? ? C . n
B 2 20 VAL 20 16 ? ? ? C . n
B 2 21 ASN 21 17 ? ? ? C . n
B 2 22 LEU 22 18 ? ? ? C . n
B 2 23 THR 23 19 ? ? ? C . n
B 2 24 THR 24 20 ? ? ? C . n
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B 2 30 PRO 30 26 ? ? ? C . n
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B 2 206 LYS 206 202 ? ? ? C . n
B 2 207 ILE 207 203 ? ? ? C . n
B 2 208 TYR 208 204 ? ? ? C . n
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B 2 210 LYS 210 206 ? ? ? C . n
B 2 211 HIS 211 207 ? ? ? C . n
B 2 212 THR 212 208 ? ? ? C . n
B 2 213 PRO 213 209 ? ? ? C . n
B 2 214 ILE 214 210 ? ? ? C . n
B 2 215 ASN 215 211 ? ? ? C . n
B 2 216 LEU 216 212 ? ? ? C . n
B 2 217 VAL 217 213 ? ? ? C . n
B 2 218 ARG 218 214 ? ? ? C . n
B 2 219 ASP 219 215 ? ? ? C . n
B 2 220 LEU 220 216 ? ? ? C . n
B 2 221 PRO 221 217 ? ? ? C . n
B 2 222 GLN 222 218 ? ? ? C . n
B 2 223 GLY 223 219 ? ? ? C . n
B 2 224 PHE 224 220 ? ? ? C . n
B 2 225 SER 225 221 ? ? ? C . n
B 2 226 ALA 226 222 ? ? ? C . n
B 2 227 LEU 227 223 ? ? ? C . n
B 2 228 GLU 228 224 ? ? ? C . n
B 2 229 PRO 229 225 ? ? ? C . n
B 2 230 LEU 230 226 ? ? ? C . n
B 2 231 VAL 231 227 ? ? ? C . n
B 2 232 ASP 232 228 ? ? ? C . n
B 2 233 LEU 233 229 ? ? ? C . n
B 2 234 PRO 234 230 ? ? ? C . n
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B 2 236 GLY 236 232 ? ? ? C . n
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B 2 240 THR 240 236 ? ? ? C . n
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B 2 517 LEU 517 513 513 LEU LEU C . n
B 2 518 SER 518 514 514 SER SER C . n
B 2 519 PHE 519 515 515 PHE PHE C . n
B 2 520 GLU 520 516 516 GLU GLU C . n
B 2 521 LEU 521 517 517 LEU LEU C . n
B 2 522 LEU 522 518 518 LEU LEU C . n
B 2 523 HIS 523 519 519 HIS HIS C . n
B 2 524 ALA 524 520 520 ALA ALA C . n
B 2 525 PRO 525 521 521 PRO PRO C . n
B 2 526 ALA 526 522 522 ALA ALA C . n
B 2 527 THR 527 523 523 THR THR C . n
B 2 528 VAL 528 524 524 VAL VAL C . n
B 2 529 CYS 529 525 525 CYS CYS C . n
B 2 530 GLY 530 526 526 GLY GLY C . n
B 2 531 PRO 531 527 527 PRO PRO C . n
B 2 532 LYS 532 528 ? ? ? C . n
B 2 533 LYS 533 529 ? ? ? C . n
B 2 534 SER 534 530 ? ? ? C . n
B 2 535 THR 535 531 ? ? ? C . n
B 2 536 ASN 536 532 ? ? ? C . n
B 2 537 LEU 537 533 ? ? ? C . n
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B 2 539 LYS 539 535 ? ? ? C . n
B 2 540 ASN 540 536 ? ? ? C . n
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B 2 816 PRO 816 812 ? ? ? C . n
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B 2 818 LYS 818 814 ? ? ? C . n
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B 2 846 GLY 846 842 ? ? ? C . n
B 2 847 ASP 847 843 ? ? ? C . n
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B 2 1163 HIS 1163 1159 ? ? ? C . n
B 2 1164 THR 1164 1160 ? ? ? C . n
B 2 1165 SER 1165 1161 ? ? ? C . n
B 2 1166 PRO 1166 1162 ? ? ? C . n
B 2 1167 ASP 1167 1163 ? ? ? C . n
B 2 1168 VAL 1168 1164 ? ? ? C . n
B 2 1169 ASP 1169 1165 ? ? ? C . n
B 2 1170 LEU 1170 1166 ? ? ? C . n
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B 2 1172 ASP 1172 1168 ? ? ? C . n
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B 2 1179 SER 1179 1175 ? ? ? C . n
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C 3 1 SER 1 1 ? ? ? D . n
C 3 2 TYR 2 2 2 TYR TYR D . n
C 3 3 GLU 3 3 3 GLU GLU D . n
C 3 4 LEU 4 4 4 LEU LEU D . n
C 3 5 THR 5 5 5 THR THR D . n
C 3 6 GLN 6 6 6 GLN GLN D . n
C 3 7 PRO 7 7 7 PRO PRO D . n
C 3 8 PRO 8 8 8 PRO PRO D . n
C 3 9 SER 9 9 9 SER SER D . n
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C 3 93 SER 93 93 93 SER SER D . n
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C 3 100 GLY 100 100 100 GLY GLY D . n
C 3 101 GLY 101 101 101 GLY GLY D . n
D 4 1 GLN 1 1 ? ? ? H . n
D 4 2 VAL 2 2 2 VAL VAL H . n
D 4 3 GLN 3 3 3 GLN GLN H . n
D 4 4 LEU 4 4 4 LEU LEU H . n
D 4 5 VAL 5 5 5 VAL VAL H . n
D 4 6 GLU 6 6 6 GLU GLU H . n
D 4 7 SER 7 7 7 SER SER H . n
D 4 8 GLY 8 8 8 GLY GLY H . n
D 4 9 GLY 9 9 9 GLY GLY H . n
D 4 10 GLY 10 10 10 GLY GLY H . n
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D 4 20 LEU 20 20 20 LEU LEU H . n
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D 4 22 CYS 22 22 22 CYS CYS H . n
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D 4 30 SER 30 30 30 SER SER H . n
D 4 31 SER 31 31 31 SER SER H . n
D 4 32 ASN 32 32 32 ASN ASN H . n
D 4 33 TYR 33 33 33 TYR TYR H . n
D 4 34 MET 34 34 34 MET MET H . n
D 4 35 SER 35 35 35 SER SER H . n
D 4 36 TRP 36 36 36 TRP TRP H . n
D 4 37 VAL 37 37 37 VAL VAL H . n
D 4 38 ARG 38 38 38 ARG ARG H . n
D 4 39 GLN 39 39 39 GLN GLN H . n
D 4 40 ALA 40 40 40 ALA ALA H . n
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D 4 50 LEU 50 50 50 LEU LEU H . n
D 4 51 LEU 51 51 51 LEU LEU H . n
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D 4 53 SER 53 53 53 SER SER H . n
D 4 54 GLY 54 54 54 GLY GLY H . n
D 4 55 GLY 55 55 55 GLY GLY H . n
D 4 56 THR 56 56 56 THR THR H . n
D 4 57 THR 57 57 57 THR THR H . n
D 4 58 TYR 58 58 58 TYR TYR H . n
D 4 59 TYR 59 59 59 TYR TYR H . n
D 4 60 ALA 60 60 60 ALA ALA H . n
D 4 61 ASP 61 61 61 ASP ASP H . n
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D 4 70 SER 70 70 70 SER SER H . n
D 4 71 ARG 71 71 71 ARG ARG H . n
D 4 72 ASP 72 72 72 ASP ASP H . n
D 4 73 ASN 73 73 73 ASN ASN H . n
D 4 74 SER 74 74 74 SER SER H . n
D 4 75 LYS 75 75 75 LYS LYS H . n
D 4 76 ASN 76 76 76 ASN ASN H . n
D 4 77 THR 77 77 77 THR THR H . n
D 4 78 LEU 78 78 78 LEU LEU H . n
D 4 79 PHE 79 79 79 PHE PHE H . n
D 4 80 LEU 80 80 80 LEU LEU H . n
D 4 81 GLN 81 81 81 GLN GLN H . n
D 4 82 MET 82 82 82 MET MET H . n
D 4 83 ASN 83 83 83 ASN ASN H . n
D 4 84 SER 84 84 84 SER SER H . n
D 4 85 LEU 85 85 85 LEU LEU H . n
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D 4 89 ASP 89 89 89 ASP ASP H . n
D 4 90 THR 90 90 90 THR THR H . n
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D 4 93 TYR 93 93 93 TYR TYR H . n
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D 4 99 ARG 99 99 99 ARG ARG H . n
D 4 100 GLY 100 100 100 GLY GLY H . n
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D 4 109 GLN 109 109 109 GLN GLN H . n
D 4 110 GLY 110 110 110 GLY GLY H . n
D 4 111 THR 111 111 111 THR THR H . n
D 4 112 LEU 112 112 112 LEU LEU H . n
D 4 113 VAL 113 113 113 VAL VAL H . n
D 4 114 THR 114 114 114 THR THR H . n
D 4 115 VAL 115 115 115 VAL VAL H . n
E 5 1 ASP 1 1 1 ASP ASP L . n
E 5 2 ILE 2 2 2 ILE ILE L . n
E 5 3 VAL 3 3 3 VAL VAL L . n
E 5 4 MET 4 4 4 MET MET L . n
E 5 5 THR 5 5 5 THR THR L . n
E 5 6 GLN 6 6 6 GLN GLN L . n
E 5 7 SER 7 7 7 SER SER L . n
E 5 8 PRO 8 8 8 PRO PRO L . n
E 5 9 SER 9 9 9 SER SER L . n
E 5 10 SER 10 10 10 SER SER L . n
E 5 11 LEU 11 11 11 LEU LEU L . n
E 5 12 SER 12 12 12 SER SER L . n
E 5 13 ALA 13 13 13 ALA ALA L . n
E 5 14 SER 14 14 14 SER SER L . n
E 5 15 VAL 15 15 15 VAL VAL L . n
E 5 16 GLY 16 16 16 GLY GLY L . n
E 5 17 ASP 17 17 17 ASP ASP L . n
E 5 18 ARG 18 18 18 ARG ARG L . n
E 5 19 VAL 19 19 19 VAL VAL L . n
E 5 20 THR 20 20 20 THR THR L . n
E 5 21 ILE 21 21 21 ILE ILE L . n
E 5 22 THR 22 22 22 THR THR L . n
E 5 23 CYS 23 23 23 CYS CYS L . n
E 5 24 GLN 24 24 24 GLN GLN L . n
E 5 25 ALA 25 25 25 ALA ALA L . n
E 5 26 SER 26 26 26 SER SER L . n
E 5 27 GLN 27 27 27 GLN GLN L . n
E 5 28 ASP 28 28 28 ASP ASP L . n
E 5 29 ILE 29 29 29 ILE ILE L . n
E 5 30 ASN 30 30 30 ASN ASN L . n
E 5 31 LYS 31 31 31 LYS LYS L . n
E 5 32 TYR 32 32 32 TYR TYR L . n
E 5 33 CYS 33 33 33 CYS CYS L . n
E 5 34 ASN 34 34 34 ASN ASN L . n
E 5 35 TRP 35 35 35 TRP TRP L . n
E 5 36 TYR 36 36 36 TYR TYR L . n
E 5 37 GLN 37 37 37 GLN GLN L . n
E 5 38 GLN 38 38 38 GLN GLN L . n
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E 5 40 PRO 40 40 40 PRO PRO L . n
E 5 41 GLY 41 41 41 GLY GLY L . n
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E 5 46 LEU 46 46 46 LEU LEU L . n
E 5 47 LEU 47 47 47 LEU LEU L . n
E 5 48 ILE 48 48 48 ILE ILE L . n
E 5 49 TYR 49 49 49 TYR TYR L . n
E 5 50 ASP 50 50 50 ASP ASP L . n
E 5 51 ALA 51 51 51 ALA ALA L . n
E 5 52 SER 52 52 52 SER SER L . n
E 5 53 ASN 53 53 53 ASN ASN L . n
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E 5 57 GLY 57 57 57 GLY GLY L . n
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E 5 59 PRO 59 59 59 PRO PRO L . n
E 5 60 SER 60 60 60 SER SER L . n
E 5 61 ARG 61 61 61 ARG ARG L . n
E 5 62 PHE 62 62 62 PHE PHE L . n
E 5 63 SER 63 63 63 SER SER L . n
E 5 64 GLY 64 64 64 GLY GLY L . n
E 5 65 SER 65 65 65 SER SER L . n
E 5 66 GLY 66 66 66 GLY GLY L . n
E 5 67 SER 67 67 67 SER SER L . n
E 5 68 GLY 68 68 68 GLY GLY L . n
E 5 69 THR 69 69 69 THR THR L . n
E 5 70 ASP 70 70 70 ASP ASP L . n
E 5 71 PHE 71 71 71 PHE PHE L . n
E 5 72 THR 72 72 72 THR THR L . n
E 5 73 PHE 73 73 73 PHE PHE L . n
E 5 74 THR 74 74 74 THR THR L . n
E 5 75 ILE 75 75 75 ILE ILE L . n
E 5 76 ASN 76 76 76 ASN ASN L . n
E 5 77 SER 77 77 77 SER SER L . n
E 5 78 LEU 78 78 78 LEU LEU L . n
E 5 79 GLN 79 79 79 GLN GLN L . n
E 5 80 PRO 80 80 80 PRO PRO L . n
E 5 81 GLU 81 81 81 GLU GLU L . n
E 5 82 ASP 82 82 82 ASP ASP L . n
E 5 83 ILE 83 83 83 ILE ILE L . n
E 5 84 ALA 84 84 84 ALA ALA L . n
E 5 85 THR 85 85 85 THR THR L . n
E 5 86 TYR 86 86 86 TYR TYR L . n
E 5 87 TYR 87 87 87 TYR TYR L . n
E 5 88 CYS 88 88 88 CYS CYS L . n
E 5 89 GLN 89 89 89 GLN GLN L . n
E 5 90 GLN 90 90 90 GLN GLN L . n
E 5 91 TYR 91 91 91 TYR TYR L . n
E 5 92 ASP 92 92 92 ASP ASP L . n
E 5 93 ASN 93 93 93 ASN ASN L . n
E 5 94 LEU 94 94 94 LEU LEU L . n
E 5 95 PRO 95 95 95 PRO PRO L . n
E 5 96 PRO 96 96 96 PRO PRO L . n
E 5 97 THR 97 97 97 THR THR L . n
E 5 98 PHE 98 98 98 PHE PHE L . n
E 5 99 GLY 99 99 99 GLY GLY L . n
E 5 100 GLY 100 100 100 GLY GLY L . n
E 5 101 GLY 101 101 101 GLY GLY L . n
E 5 102 THR 102 102 102 THR THR L . n
E 5 103 LYS 103 103 103 LYS LYS L . n
E 5 104 VAL 104 104 104 VAL VAL L . n
E 5 105 GLU 105 105 ? ? ? L . n
E 5 106 ILE 106 106 ? ? ? L . n
E 5 107 LYS 107 107 ? ? ? L . n
E 5 108 ARG 108 108 ? ? ? L . n
E 5 109 THR 109 109 ? ? ? L . n
#
loop_
_pdbx_branch_scheme.asym_id
_pdbx_branch_scheme.entity_id
_pdbx_branch_scheme.mon_id
_pdbx_branch_scheme.num
_pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_branch_scheme.auth_asym_id
_pdbx_branch_scheme.auth_mon_id
_pdbx_branch_scheme.auth_seq_num
_pdbx_branch_scheme.hetero
F 6 NAG 1 M NAG 1 M NAG 1400 n
F 6 NAG 2 M NAG 2 M NAG 1401 n
F 6 FUC 3 M FUC 3 M FUC 1402 n
#
_software.citation_id ?
_software.classification refinement
_software.compiler_name ?
_software.compiler_version ?
_software.contact_author ?
_software.contact_author_email ?
_software.date ?
_software.description ?
_software.dependencies ?
_software.hardware ?
_software.language ?
_software.location ?
_software.mods ?
_software.name PHENIX
_software.os ?
_software.os_version ?
_software.type ?
_software.version 1.18.2_3874:
_software.pdbx_ordinal 1
#
_cell.angle_alpha 90.00
_cell.angle_alpha_esd ?
_cell.angle_beta 90.00
_cell.angle_beta_esd ?
_cell.angle_gamma 90.00
_cell.angle_gamma_esd ?
_cell.entry_id 8F0H
_cell.details ?
_cell.formula_units_Z ?
_cell.length_a 1.00
_cell.length_a_esd ?
_cell.length_b 1.00
_cell.length_b_esd ?
_cell.length_c 1.00
_cell.length_c_esd ?
_cell.volume ?
_cell.volume_esd ?
_cell.Z_PDB ?
_cell.reciprocal_angle_alpha ?
_cell.reciprocal_angle_beta ?
_cell.reciprocal_angle_gamma ?
_cell.reciprocal_angle_alpha_esd ?
_cell.reciprocal_angle_beta_esd ?
_cell.reciprocal_angle_gamma_esd ?
_cell.reciprocal_length_a ?
_cell.reciprocal_length_b ?
_cell.reciprocal_length_c ?
_cell.reciprocal_length_a_esd ?
_cell.reciprocal_length_b_esd ?
_cell.reciprocal_length_c_esd ?
_cell.pdbx_unique_axis ?
_cell.pdbx_esd_method ?
#
_symmetry.entry_id 8F0H
_symmetry.cell_setting ?
_symmetry.Int_Tables_number 1
_symmetry.space_group_name_Hall ?
_symmetry.space_group_name_H-M 'P 1'
_symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ?
#
_exptl.absorpt_coefficient_mu ?
_exptl.absorpt_correction_T_max ?
_exptl.absorpt_correction_T_min ?
_exptl.absorpt_correction_type ?
_exptl.absorpt_process_details ?
_exptl.entry_id 8F0H
_exptl.crystals_number ?
_exptl.details ?
_exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY'
_exptl.method_details ?
#
_refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY'
_refine.entry_id 8F0H
_refine.pdbx_diffrn_id ?
_refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ?
_refine.ls_number_reflns_obs ?
_refine.ls_number_reflns_all ?
_refine.pdbx_ls_sigma_I ?
_refine.pdbx_ls_sigma_F ?
_refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ?
_refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ?
_refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ?
_refine.ls_d_res_low ?
_refine.ls_d_res_high .
_refine.ls_percent_reflns_obs ?
_refine.ls_R_factor_obs ?
_refine.ls_R_factor_all ?
_refine.ls_R_factor_R_work ?
_refine.ls_R_factor_R_free ?
_refine.ls_R_factor_R_free_error ?
_refine.ls_R_factor_R_free_error_details ?
_refine.ls_percent_reflns_R_free ?
_refine.ls_number_reflns_R_free ?
_refine.ls_number_parameters ?
_refine.ls_number_restraints ?
_refine.occupancy_min ?
_refine.occupancy_max ?
_refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ?
_refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ?
_refine.B_iso_mean ?
_refine.aniso_B[1][1] ?
_refine.aniso_B[2][2] ?
_refine.aniso_B[3][3] ?
_refine.aniso_B[1][2] ?
_refine.aniso_B[1][3] ?
_refine.aniso_B[2][3] ?
_refine.solvent_model_details ?
_refine.solvent_model_param_ksol ?
_refine.solvent_model_param_bsol ?
_refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ?
_refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ?
_refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ?
_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ?
_refine.details ?
_refine.pdbx_starting_model ?
_refine.pdbx_method_to_determine_struct ?
_refine.pdbx_isotropic_thermal_model ?
_refine.pdbx_stereochemistry_target_values ?
_refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ?
_refine.pdbx_R_Free_selection_details ?
_refine.pdbx_overall_ESU_R ?
_refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ?
_refine.overall_SU_ML ?
_refine.pdbx_overall_phase_error ?
_refine.overall_SU_B ?
_refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ?
_refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ?
_refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ?
_refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ?
#
loop_
_refine_ls_restr.pdbx_refine_id
_refine_ls_restr.criterion
_refine_ls_restr.dev_ideal
_refine_ls_restr.dev_ideal_target
_refine_ls_restr.number
_refine_ls_restr.rejects
_refine_ls_restr.type
_refine_ls_restr.weight
_refine_ls_restr.pdbx_restraint_function
'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 5084 ? f_bond_d ? ?
'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.426 ? 6908 ? f_angle_d ? ?
'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.056 ? 1813 ? f_dihedral_angle_d ? ?
'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.038 ? 741 ? f_chiral_restr ? ?
'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 892 ? f_plane_restr ? ?
#
_struct.entry_id 8F0H
_struct.title
'Structure of SARS-CoV-2 spike with antibody Fabs 2A10 and 1H2 (Local refinement of the RBD and Fabs 1H2 and 2A10)'
_struct.pdbx_model_details ?
_struct.pdbx_formula_weight ?
_struct.pdbx_formula_weight_method ?
_struct.pdbx_model_type_details ?
_struct.pdbx_CASP_flag N
#
_struct_keywords.entry_id 8F0H
_struct_keywords.text
'VIRAL PROTEIN, glycoprotein, immune system, antibody, SARS-CoV-2, COVID, VIRAL PROTEIN-Immune System complex, coronavirus'
_struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM'
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A N N 1 ?
B N N 2 ?
C N N 3 ?
D N N 4 ?
E N N 5 ?
F N N 6 ?
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_db_isoform
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.pdbx_align_begin
1 PDB 8F0H 8F0H ? 1 ? 1
2 UNP SPIKE_SARS2 P0DTC2 ? 2
;QCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFA
STEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQ
PFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGD
SSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNIT
NLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPG
QTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQ
SYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTT
DAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGA
EHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTK
TSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPS
KRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAA
LQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAI
SSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFP
QSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIV
NNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQ
;
14
3 PDB 8F0H 8F0H ? 3 ? 1
4 PDB 8F0H 8F0H ? 4 ? 1
5 PDB 8F0H 8F0H ? 5 ? 1
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code
_struct_ref_seq.pdbx_strand_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code
_struct_ref_seq.pdbx_db_accession
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code
_struct_ref_seq.db_align_end
_struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code
_struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end
1 1 8F0H B 1 ? 124 ? 8F0H 1 ? 896 ? 1 896
2 2 8F0H C 18 ? 1212 ? P0DTC2 14 ? 1208 ? 14 1208
3 3 8F0H D 1 ? 101 ? 8F0H 1 ? 101 ? 1 101
4 4 8F0H H 1 ? 115 ? 8F0H 1 ? 115 ? 1 115
5 5 8F0H L 1 ? 109 ? 8F0H 1 ? 109 ? 1 109
#
loop_
_struct_ref_seq_dif.align_id
_struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code
_struct_ref_seq_dif.mon_id
_struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id
_struct_ref_seq_dif.seq_num
_struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code
_struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name
_struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code
_struct_ref_seq_dif.db_mon_id
_struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num
_struct_ref_seq_dif.details
_struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num
_struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal
2 8F0H MET C 1 ? UNP P0DTC2 ? ? 'initiating methionine' -3 1
2 8F0H GLY C 2 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' -2 2
2 8F0H VAL C 3 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' -1 3
2 8F0H LYS C 4 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 0 4
2 8F0H VAL C 5 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1 5
2 8F0H LEU C 6 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 2 6
2 8F0H PHE C 7 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 3 7
2 8F0H ALA C 8 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 4 8
2 8F0H LEU C 9 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 5 9
2 8F0H ILE C 10 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 6 10
2 8F0H CYS C 11 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 7 11
2 8F0H ILE C 12 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 8 12
2 8F0H ALA C 13 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 9 13
2 8F0H VAL C 14 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 10 14
2 8F0H ALA C 15 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 11 15
2 8F0H GLU C 16 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 12 16
2 8F0H ALA C 17 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 13 17
2 8F0H GLY C 686 ? UNP P0DTC2 ARG 682 conflict 682 18
2 8F0H SER C 687 ? UNP P0DTC2 ARG 683 conflict 683 19
2 8F0H SER C 689 ? UNP P0DTC2 ARG 685 conflict 685 20
2 8F0H PRO C 821 ? UNP P0DTC2 PHE 817 conflict 817 21
2 8F0H PRO C 896 ? UNP P0DTC2 ALA 892 conflict 892 22
2 8F0H PRO C 903 ? UNP P0DTC2 ALA 899 conflict 899 23
2 8F0H PRO C 946 ? UNP P0DTC2 ALA 942 conflict 942 24
2 8F0H PRO C 990 ? UNP P0DTC2 LYS 986 conflict 986 25
2 8F0H PRO C 991 ? UNP P0DTC2 VAL 987 conflict 987 26
#
_pdbx_struct_assembly.id 1
_pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly
_pdbx_struct_assembly.method_details ?
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5
#
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F
#
_pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1
_pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1
_pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration'
_pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ?
#
_pdbx_struct_oper_list.id 1
_pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation'
_pdbx_struct_oper_list.name 1_555
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ?
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000
#
loop_
_struct_conf.conf_type_id
_struct_conf.id
_struct_conf.pdbx_PDB_helix_id
_struct_conf.beg_label_comp_id
_struct_conf.beg_label_asym_id
_struct_conf.beg_label_seq_id
_struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code
_struct_conf.end_label_comp_id
_struct_conf.end_label_asym_id
_struct_conf.end_label_seq_id
_struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code
_struct_conf.beg_auth_comp_id
_struct_conf.beg_auth_asym_id
_struct_conf.beg_auth_seq_id
_struct_conf.end_auth_comp_id
_struct_conf.end_auth_asym_id
_struct_conf.end_auth_seq_id
_struct_conf.pdbx_PDB_helix_class
_struct_conf.details
_struct_conf.pdbx_PDB_helix_length
HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? TYR A 32 ? THR B 28 TYR B 32 5 ? 5
HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 87 ? THR A 91 ? ARG B 87 THR B 91 5 ? 5
HELX_P HELX_P3 AA3 PHE B 342 ? ASN B 347 ? PHE C 338 ASN C 343 1 ? 6
HELX_P HELX_P4 AA4 ASP B 368 ? SER B 375 ? ASP C 364 SER C 371 1 ? 8
HELX_P HELX_P5 AA5 THR B 389 ? LEU B 394 ? THR C 385 LEU C 390 1 ? 6
HELX_P HELX_P6 AA6 ASP B 409 ? ILE B 414 ? ASP C 405 ILE C 410 5 ? 6
HELX_P HELX_P7 AA7 GLY B 420 ? ASN B 426 ? GLY C 416 ASN C 422 1 ? 7
HELX_P HELX_P8 AA8 ARG D 86 ? THR D 90 ? ARG H 86 THR H 90 5 ? 5
HELX_P HELX_P9 AA9 GLN E 79 ? ILE E 83 ? GLN L 79 ILE L 83 5 ? 5
#
_struct_conf_type.id HELX_P
_struct_conf_type.criteria ?
_struct_conf_type.reference ?
#
loop_
_struct_conn.id
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.details
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
_struct_conn.pdbx_role
disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? B CYS 22 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ?
disulf2 disulf ? ? B CYS 340 SG ? ? ? 1_555 B CYS 365 SG ? ? C CYS 336 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ?
disulf3 disulf ? ? B CYS 383 SG ? ? ? 1_555 B CYS 436 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ?
disulf4 disulf ? ? B CYS 395 SG ? ? ? 1_555 B CYS 529 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ?
disulf5 disulf ? ? B CYS 484 SG ? ? ? 1_555 B CYS 492 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ?
disulf6 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 87 SG ? ? D CYS 22 D CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ?
disulf7 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 95 SG ? ? H CYS 22 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ?
disulf8 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ?
covale1 covale one ? B ASN 347 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? C ASN 343 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation
covale2 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ?
covale3 covale both ? F NAG . O6 ? ? ? 1_555 F FUC . C1 ? ? M NAG 1 M FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ?
#
loop_
_struct_conn_type.id
_struct_conn_type.criteria
_struct_conn_type.reference
disulf ? ?
covale ? ?
#
loop_
_pdbx_modification_feature.ordinal
_pdbx_modification_feature.label_comp_id
_pdbx_modification_feature.label_asym_id
_pdbx_modification_feature.label_seq_id
_pdbx_modification_feature.label_alt_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id
_pdbx_modification_feature.auth_comp_id
_pdbx_modification_feature.auth_asym_id
_pdbx_modification_feature.auth_seq_id
_pdbx_modification_feature.PDB_ins_code
_pdbx_modification_feature.symmetry
_pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id
_pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code
_pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry
_pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom
_pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom
_pdbx_modification_feature.modified_residue_id
_pdbx_modification_feature.ref_pcm_id
_pdbx_modification_feature.ref_comp_id
_pdbx_modification_feature.type
_pdbx_modification_feature.category
1 NAG F . ? ASN B 347 ? NAG M 1 ? 1_555 ASN C 343 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate
2 CYS A 22 ? CYS A 96 ? CYS B 22 ? 1_555 CYS B 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
3 CYS B 340 ? CYS B 365 ? CYS C 336 ? 1_555 CYS C 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
4 CYS B 383 ? CYS B 436 ? CYS C 379 ? 1_555 CYS C 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
5 CYS B 395 ? CYS B 529 ? CYS C 391 ? 1_555 CYS C 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
6 CYS B 484 ? CYS B 492 ? CYS C 480 ? 1_555 CYS C 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
7 CYS C 22 ? CYS C 87 ? CYS D 22 ? 1_555 CYS D 87 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
8 CYS D 22 ? CYS D 95 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 95 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
9 CYS E 23 ? CYS E 88 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge'
#
_struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1
_struct_mon_prot_cis.label_comp_id SER
_struct_mon_prot_cis.label_seq_id 7
_struct_mon_prot_cis.label_asym_id E
_struct_mon_prot_cis.label_alt_id .
_struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ?
_struct_mon_prot_cis.auth_comp_id SER
_struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 7
_struct_mon_prot_cis.auth_asym_id L
_struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO
_struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 8
_struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 E
_struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ?
_struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO
_struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 8
_struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 L
_struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1
_struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -2.22
#
loop_
_struct_sheet.id
_struct_sheet.type
_struct_sheet.number_strands
_struct_sheet.details
AA1 ? 4 ?
AA2 ? 5 ?
AA3 ? 5 ?
AA4 ? 5 ?
AA5 ? 2 ?
AA6 ? 2 ?
AA7 ? 2 ?
AA8 ? 3 ?
AA9 ? 4 ?
AB1 ? 4 ?
AB2 ? 6 ?
AB3 ? 4 ?
AB4 ? 4 ?
AB5 ? 5 ?
#
loop_
_struct_sheet_order.sheet_id
_struct_sheet_order.range_id_1
_struct_sheet_order.range_id_2
_struct_sheet_order.offset
_struct_sheet_order.sense
AA1 1 2 ? anti-parallel
AA1 2 3 ? anti-parallel
AA1 3 4 ? anti-parallel
AA2 1 2 ? anti-parallel
AA2 2 3 ? anti-parallel
AA2 3 4 ? anti-parallel
AA2 4 5 ? anti-parallel
AA3 1 2 ? anti-parallel
AA3 2 3 ? anti-parallel
AA3 3 4 ? anti-parallel
AA3 4 5 ? anti-parallel
AA4 1 2 ? anti-parallel
AA4 2 3 ? anti-parallel
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AA4 4 5 ? anti-parallel
AA5 1 2 ? parallel
AA6 1 2 ? anti-parallel
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AA8 2 3 ? anti-parallel
AA9 1 2 ? anti-parallel
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AB1 1 2 ? anti-parallel
AB1 2 3 ? anti-parallel
AB1 3 4 ? anti-parallel
AB2 1 2 ? parallel
AB2 2 3 ? anti-parallel
AB2 3 4 ? anti-parallel
AB2 4 5 ? anti-parallel
AB2 5 6 ? anti-parallel
AB3 1 2 ? parallel
AB3 2 3 ? anti-parallel
AB3 3 4 ? anti-parallel
AB4 1 2 ? anti-parallel
AB4 2 3 ? anti-parallel
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AB5 1 2 ? anti-parallel
AB5 2 3 ? anti-parallel
AB5 3 4 ? anti-parallel
AB5 4 5 ? anti-parallel
#
loop_
_struct_sheet_range.sheet_id
_struct_sheet_range.id
_struct_sheet_range.beg_label_comp_id
_struct_sheet_range.beg_label_asym_id
_struct_sheet_range.beg_label_seq_id
_struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code
_struct_sheet_range.end_label_comp_id
_struct_sheet_range.end_label_asym_id
_struct_sheet_range.end_label_seq_id
_struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code
_struct_sheet_range.beg_auth_comp_id
_struct_sheet_range.beg_auth_asym_id
_struct_sheet_range.beg_auth_seq_id
_struct_sheet_range.end_auth_comp_id
_struct_sheet_range.end_auth_asym_id
_struct_sheet_range.end_auth_seq_id
AA1 1 GLN A 3 ? SER A 7 ? GLN B 3 SER B 7
AA1 2 SER A 17 ? SER A 25 ? SER B 17 SER B 25
AA1 3 SER A 78 ? ARG A 84 ? SER B 78 ARG B 84
AA1 4 THR A 69 ? ASP A 73 ? THR B 69 ASP B 73
AA2 1 THR A 57 ? TYR A 60 ? THR B 57 TYR B 60
AA2 2 LEU A 45 ? ILE A 51 ? LEU B 45 ILE B 51
AA2 3 ALA A 33 ? GLN A 39 ? ALA B 33 GLN B 39
AA2 4 ALA A 92 ? ASP A 99 ? ALA B 92 ASP B 99
AA2 5 MET A 113 ? VAL A 115 ? MET B 113 VAL B 115
AA3 1 THR A 57 ? TYR A 60 ? THR B 57 TYR B 60
AA3 2 LEU A 45 ? ILE A 51 ? LEU B 45 ILE B 51
AA3 3 ALA A 33 ? GLN A 39 ? ALA B 33 GLN B 39
AA3 4 ALA A 92 ? ASP A 99 ? ALA B 92 ASP B 99
AA3 5 THR A 120 ? VAL A 122 ? THR B 120 VAL B 122
AA4 1 ASN B 358 ? ILE B 362 ? ASN C 354 ILE C 358
AA4 2 VAL B 399 ? ARG B 407 ? VAL C 395 ARG C 403
AA4 3 PRO B 511 ? SER B 518 ? PRO C 507 SER C 514
AA4 4 GLY B 435 ? ASN B 441 ? GLY C 431 ASN C 437
AA4 5 CYS B 383 ? TYR B 384 ? CYS C 379 TYR C 380
AA5 1 CYS B 365 ? VAL B 366 ? CYS C 361 VAL C 362
AA5 2 VAL B 528 ? CYS B 529 ? VAL C 524 CYS C 525
AA6 1 LEU B 456 ? ARG B 458 ? LEU C 452 ARG C 454
AA6 2 LEU B 496 ? SER B 498 ? LEU C 492 SER C 494
AA7 1 TYR B 477 ? GLN B 478 ? TYR C 473 GLN C 474
AA7 2 CYS B 492 ? TYR B 493 ? CYS C 488 TYR C 489
AA8 1 ALA C 18 ? GLY C 23 ? ALA D 18 GLY D 23
AA8 2 THR C 69 ? ILE C 74 ? THR D 69 ILE D 74
AA8 3 PHE C 61 ? ASN C 65 ? PHE D 61 ASN D 65
AA9 1 VAL C 44 ? ILE C 47 ? VAL D 44 ILE D 47
AA9 2 HIS C 33 ? GLN C 37 ? HIS D 33 GLN D 37
AA9 3 ASP C 84 ? ASP C 91 ? ASP D 84 ASP D 91
AA9 4 HIS C 96 ? VAL C 98 ? HIS D 96 VAL D 98
AB1 1 GLN D 3 ? SER D 7 ? GLN H 3 SER H 7
AB1 2 LEU D 18 ? SER D 25 ? LEU H 18 SER H 25
AB1 3 THR D 77 ? MET D 82 ? THR H 77 MET H 82
AB1 4 PHE D 67 ? ASP D 72 ? PHE H 67 ASP H 72
AB2 1 GLY D 10 ? LEU D 11 ? GLY H 10 LEU H 11
AB2 2 THR D 111 ? THR D 114 ? THR H 111 THR H 114
AB2 3 ALA D 91 ? ARG D 97 ? ALA H 91 ARG H 97
AB2 4 MET D 34 ? GLN D 39 ? MET H 34 GLN H 39
AB2 5 LEU D 45 ? LEU D 51 ? LEU H 45 LEU H 51
AB2 6 THR D 57 ? TYR D 59 ? THR H 57 TYR H 59
AB3 1 GLY D 10 ? LEU D 11 ? GLY H 10 LEU H 11
AB3 2 THR D 111 ? THR D 114 ? THR H 111 THR H 114
AB3 3 ALA D 91 ? ARG D 97 ? ALA H 91 ARG H 97
AB3 4 TYR D 106 ? TRP D 107 ? TYR H 106 TRP H 107
AB4 1 MET E 4 ? SER E 7 ? MET L 4 SER L 7
AB4 2 THR E 20 ? ALA E 25 ? THR L 20 ALA L 25
AB4 3 ASP E 70 ? THR E 74 ? ASP L 70 THR L 74
AB4 4 SER E 63 ? SER E 67 ? SER L 63 SER L 67
AB5 1 ASN E 53 ? LEU E 54 ? ASN L 53 LEU L 54
AB5 2 LYS E 45 ? TYR E 49 ? LYS L 45 TYR L 49
AB5 3 ASN E 34 ? GLN E 38 ? ASN L 34 GLN L 38
AB5 4 THR E 85 ? GLN E 89 ? THR L 85 GLN L 89
AB5 5 THR E 102 ? LYS E 103 ? THR L 102 LYS L 103
#
loop_
_pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id
_pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id
AA1 1 2 N SER A 7 ? N SER B 7 O SER A 21 ? O SER B 21
AA1 2 3 N LEU A 18 ? N LEU B 18 O MET A 83 ? O MET B 83
AA1 3 4 O TYR A 80 ? O TYR B 80 N SER A 71 ? N SER B 71
AA2 1 2 O ILE A 58 ? O ILE B 58 N GLY A 50 ? N GLY B 50
AA2 2 3 O VAL A 48 ? O VAL B 48 N TRP A 36 ? N TRP B 36
AA2 3 4 N ALA A 33 ? N ALA B 33 O ASP A 99 ? O ASP B 99
AA2 4 5 N LYS A 98 ? N LYS B 98 O VAL A 115 ? O VAL B 115
AA3 1 2 O ILE A 58 ? O ILE B 58 N GLY A 50 ? N GLY B 50
AA3 2 3 O VAL A 48 ? O VAL B 48 N TRP A 36 ? N TRP B 36
AA3 3 4 N ALA A 33 ? N ALA B 33 O ASP A 99 ? O ASP B 99
AA3 4 5 N ALA A 92 ? N ALA B 92 O VAL A 122 ? O VAL B 122
AA4 1 2 N LYS B 360 ? N LYS C 356 O ALA B 401 ? O ALA C 397
AA4 2 3 N ASP B 402 ? N ASP C 398 O VAL B 516 ? O VAL C 512
AA4 3 4 O VAL B 515 ? O VAL C 511 N ILE B 438 ? N ILE C 434
AA4 4 5 O GLY B 435 ? O GLY C 431 N TYR B 384 ? N TYR C 380
AA5 1 2 N CYS B 365 ? N CYS C 361 O CYS B 529 ? O CYS C 525
AA6 1 2 N TYR B 457 ? N TYR C 453 O GLN B 497 ? O GLN C 493
AA7 1 2 N TYR B 477 ? N TYR C 473 O TYR B 493 ? O TYR C 489
AA8 1 2 N ILE C 20 ? N ILE D 20 O LEU C 72 ? O LEU D 72
AA8 2 3 O THR C 73 ? O THR D 73 N SER C 62 ? N SER D 62
AA9 1 2 O ILE C 47 ? O ILE D 47 N TRP C 34 ? N TRP D 34
AA9 2 3 N HIS C 33 ? N HIS D 33 O GLN C 88 ? O GLN D 88
AA9 3 4 N VAL C 89 ? N VAL D 89 O VAL C 98 ? O VAL D 98
AB1 1 2 N VAL D 5 ? N VAL H 5 O ALA D 23 ? O ALA H 23
AB1 2 3 N LEU D 18 ? N LEU H 18 O MET D 82 ? O MET H 82
AB1 3 4 O PHE D 79 ? O PHE H 79 N SER D 70 ? N SER H 70
AB2 1 2 N GLY D 10 ? N GLY H 10 O THR D 114 ? O THR H 114
AB2 2 3 O THR D 111 ? O THR H 111 N TYR D 93 ? N TYR H 93
AB2 3 4 O TYR D 94 ? O TYR H 94 N VAL D 37 ? N VAL H 37
AB2 4 5 N MET D 34 ? N MET H 34 O LEU D 51 ? O LEU H 51
AB2 5 6 N LEU D 50 ? N LEU H 50 O TYR D 58 ? O TYR H 58
AB3 1 2 N GLY D 10 ? N GLY H 10 O THR D 114 ? O THR H 114
AB3 2 3 O THR D 111 ? O THR H 111 N TYR D 93 ? N TYR H 93
AB3 3 4 N ARG D 97 ? N ARG H 97 O TYR D 106 ? O TYR H 106
AB4 1 2 N SER E 7 ? N SER L 7 O THR E 22 ? O THR L 22
AB4 2 3 N ILE E 21 ? N ILE L 21 O PHE E 73 ? O PHE L 73
AB4 3 4 O THR E 74 ? O THR L 74 N SER E 63 ? N SER L 63
AB5 1 2 O ASN E 53 ? O ASN L 53 N TYR E 49 ? N TYR L 49
AB5 2 3 O LYS E 45 ? O LYS L 45 N GLN E 37 ? N GLN L 37
AB5 3 4 N GLN E 38 ? N GLN L 38 O THR E 85 ? O THR L 85
AB5 4 5 N TYR E 86 ? N TYR L 86 O THR E 102 ? O THR L 102
#
_pdbx_entry_details.entry_id 8F0H
_pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N
_pdbx_entry_details.compound_details ?
_pdbx_entry_details.source_details ?
_pdbx_entry_details.nonpolymer_details ?
_pdbx_entry_details.sequence_details ?
_pdbx_entry_details.has_protein_modification Y
#
loop_
_pdbx_validate_torsion.id
_pdbx_validate_torsion.PDB_model_num
_pdbx_validate_torsion.auth_comp_id
_pdbx_validate_torsion.auth_asym_id
_pdbx_validate_torsion.auth_seq_id
_pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code
_pdbx_validate_torsion.label_alt_id
_pdbx_validate_torsion.phi
_pdbx_validate_torsion.psi
1 1 ASN B 54 ? ? -93.82 33.27
2 1 ILE L 29 ? ? -105.00 69.40
3 1 ALA L 51 ? ? 56.28 10.93
4 1 SER L 52 ? ? -132.99 -41.18
5 1 ASN L 76 ? ? 55.78 -116.07
6 1 TYR L 91 ? ? 46.50 23.17
#
_em_3d_fitting.id 1
_em_3d_fitting.entry_id 8F0H
_em_3d_fitting.method ?
_em_3d_fitting.target_criteria ?
_em_3d_fitting.details ?
_em_3d_fitting.overall_b_value ?
_em_3d_fitting.ref_space ?
_em_3d_fitting.ref_protocol ?
#
_em_3d_reconstruction.entry_id 8F0H
_em_3d_reconstruction.id 1
_em_3d_reconstruction.method ?
_em_3d_reconstruction.algorithm ?
_em_3d_reconstruction.citation_id ?
_em_3d_reconstruction.details ?
_em_3d_reconstruction.resolution 3.18
_em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF'
_em_3d_reconstruction.magnification_calibration ?
_em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ?
_em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ?
_em_3d_reconstruction.num_particles 204842
_em_3d_reconstruction.euler_angles_details ?
_em_3d_reconstruction.num_class_averages ?
_em_3d_reconstruction.refinement_type ?
_em_3d_reconstruction.image_processing_id 1
_em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT
#
_em_buffer.id 1
_em_buffer.specimen_id 1
_em_buffer.name ?
_em_buffer.details 'TBS buffer pH 7.4'
_em_buffer.pH 7.4
#
loop_
_em_entity_assembly.id
_em_entity_assembly.parent_id
_em_entity_assembly.source
_em_entity_assembly.type
_em_entity_assembly.name
_em_entity_assembly.details
_em_entity_assembly.synonym
_em_entity_assembly.oligomeric_details
_em_entity_assembly.entity_id_list
1 0 RECOMBINANT COMPLEX 'Structure of SARS-CoV-2 D614G spike in complex with antibody Fabs 1H2 and 2A10' ? ? ? '1, 2, 3, 4, 5'
2 1 RECOMBINANT COMPLEX
'Antibody Fab 1H2 heavy chain, Antibody Fab 1H2 light chain, Antibody Fab 2A10 heavy chain, Antibody Fab 2A10 light chain' ? ? ?
'1, 3, 4, 5'
3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Spike glycoprotein' ? ? ? 2
#
_em_imaging.entry_id 8F0H
_em_imaging.id 1
_em_imaging.astigmatism ?
_em_imaging.electron_beam_tilt_params ?
_em_imaging.residual_tilt ?
_em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS'
_em_imaging.specimen_holder_type ?
_em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER'
_em_imaging.details ?
_em_imaging.date ?
_em_imaging.accelerating_voltage 300
_em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM'
_em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD'
_em_imaging.nominal_cs ?
_em_imaging.nominal_defocus_min 1000
_em_imaging.nominal_defocus_max 2500
_em_imaging.calibrated_defocus_min ?
_em_imaging.calibrated_defocus_max ?
_em_imaging.tilt_angle_min ?
_em_imaging.tilt_angle_max ?
_em_imaging.nominal_magnification ?
_em_imaging.calibrated_magnification ?
_em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN'
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_em_imaging.temperature ?
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1 1 Y 1 B GLN 1 ? A GLN 1
2 1 Y 1 C MET -3 ? B MET 1
3 1 Y 1 C GLY -2 ? B GLY 2
4 1 Y 1 C VAL -1 ? B VAL 3
5 1 Y 1 C LYS 0 ? B LYS 4
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9 1 Y 1 C ALA 4 ? B ALA 8
10 1 Y 1 C LEU 5 ? B LEU 9
11 1 Y 1 C ILE 6 ? B ILE 10
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178 1 Y 1 C GLN 173 ? B GLN 177
179 1 Y 1 C PRO 174 ? B PRO 178
180 1 Y 1 C PHE 175 ? B PHE 179
181 1 Y 1 C LEU 176 ? B LEU 180
182 1 Y 1 C MET 177 ? B MET 181
183 1 Y 1 C ASP 178 ? B ASP 182
184 1 Y 1 C LEU 179 ? B LEU 183
185 1 Y 1 C GLU 180 ? B GLU 184
186 1 Y 1 C GLY 181 ? B GLY 185
187 1 Y 1 C LYS 182 ? B LYS 186
188 1 Y 1 C GLN 183 ? B GLN 187
189 1 Y 1 C GLY 184 ? B GLY 188
190 1 Y 1 C ASN 185 ? B ASN 189
191 1 Y 1 C PHE 186 ? B PHE 190
192 1 Y 1 C LYS 187 ? B LYS 191
193 1 Y 1 C ASN 188 ? B ASN 192
194 1 Y 1 C LEU 189 ? B LEU 193
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203 1 Y 1 C ASP 198 ? B ASP 202
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258 1 Y 1 C ASP 253 ? B ASP 257
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283 1 Y 1 C LYS 278 ? B LYS 282
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286 1 Y 1 C GLU 281 ? B GLU 285
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314 1 Y 1 C GLU 309 ? B GLU 313
315 1 Y 1 C LYS 310 ? B LYS 314
316 1 Y 1 C GLY 311 ? B GLY 315
317 1 Y 1 C ILE 312 ? B ILE 316
318 1 Y 1 C TYR 313 ? B TYR 317
319 1 Y 1 C GLN 314 ? B GLN 318
320 1 Y 1 C THR 315 ? B THR 319
321 1 Y 1 C SER 316 ? B SER 320
322 1 Y 1 C ASN 317 ? B ASN 321
323 1 Y 1 C PHE 318 ? B PHE 322
324 1 Y 1 C ARG 319 ? B ARG 323
325 1 Y 1 C VAL 320 ? B VAL 324
326 1 Y 1 C GLN 321 ? B GLN 325
327 1 Y 1 C PRO 322 ? B PRO 326
328 1 Y 1 C THR 323 ? B THR 327
329 1 Y 1 C GLU 324 ? B GLU 328
330 1 Y 1 C SER 325 ? B SER 329
331 1 Y 1 C ILE 326 ? B ILE 330
332 1 Y 1 C VAL 327 ? B VAL 331
333 1 Y 1 C ARG 328 ? B ARG 332
334 1 Y 1 C PHE 329 ? B PHE 333
335 1 Y 1 C PRO 330 ? B PRO 334
336 1 Y 1 C ASN 331 ? B ASN 335
337 1 Y 1 C ILE 332 ? B ILE 336
338 1 Y 1 C THR 333 ? B THR 337
339 1 Y 1 C ASN 334 ? B ASN 338
340 1 Y 1 C LYS 528 ? B LYS 532
341 1 Y 1 C LYS 529 ? B LYS 533
342 1 Y 1 C SER 530 ? B SER 534
343 1 Y 1 C THR 531 ? B THR 535
344 1 Y 1 C ASN 532 ? B ASN 536
345 1 Y 1 C LEU 533 ? B LEU 537
346 1 Y 1 C VAL 534 ? B VAL 538
347 1 Y 1 C LYS 535 ? B LYS 539
348 1 Y 1 C ASN 536 ? B ASN 540
349 1 Y 1 C LYS 537 ? B LYS 541
350 1 Y 1 C CYS 538 ? B CYS 542
351 1 Y 1 C VAL 539 ? B VAL 543
352 1 Y 1 C ASN 540 ? B ASN 544
353 1 Y 1 C PHE 541 ? B PHE 545
354 1 Y 1 C ASN 542 ? B ASN 546
355 1 Y 1 C PHE 543 ? B PHE 547
356 1 Y 1 C ASN 544 ? B ASN 548
357 1 Y 1 C GLY 545 ? B GLY 549
358 1 Y 1 C LEU 546 ? B LEU 550
359 1 Y 1 C THR 547 ? B THR 551
360 1 Y 1 C GLY 548 ? B GLY 552
361 1 Y 1 C THR 549 ? B THR 553
362 1 Y 1 C GLY 550 ? B GLY 554
363 1 Y 1 C VAL 551 ? B VAL 555
364 1 Y 1 C LEU 552 ? B LEU 556
365 1 Y 1 C THR 553 ? B THR 557
366 1 Y 1 C GLU 554 ? B GLU 558
367 1 Y 1 C SER 555 ? B SER 559
368 1 Y 1 C ASN 556 ? B ASN 560
369 1 Y 1 C LYS 557 ? B LYS 561
370 1 Y 1 C LYS 558 ? B LYS 562
371 1 Y 1 C PHE 559 ? B PHE 563
372 1 Y 1 C LEU 560 ? B LEU 564
373 1 Y 1 C PRO 561 ? B PRO 565
374 1 Y 1 C PHE 562 ? B PHE 566
375 1 Y 1 C GLN 563 ? B GLN 567
376 1 Y 1 C GLN 564 ? B GLN 568
377 1 Y 1 C PHE 565 ? B PHE 569
378 1 Y 1 C GLY 566 ? B GLY 570
379 1 Y 1 C ARG 567 ? B ARG 571
380 1 Y 1 C ASP 568 ? B ASP 572
381 1 Y 1 C ILE 569 ? B ILE 573
382 1 Y 1 C ALA 570 ? B ALA 574
383 1 Y 1 C ASP 571 ? B ASP 575
384 1 Y 1 C THR 572 ? B THR 576
385 1 Y 1 C THR 573 ? B THR 577
386 1 Y 1 C ASP 574 ? B ASP 578
387 1 Y 1 C ALA 575 ? B ALA 579
388 1 Y 1 C VAL 576 ? B VAL 580
389 1 Y 1 C ARG 577 ? B ARG 581
390 1 Y 1 C ASP 578 ? B ASP 582
391 1 Y 1 C PRO 579 ? B PRO 583
392 1 Y 1 C GLN 580 ? B GLN 584
393 1 Y 1 C THR 581 ? B THR 585
394 1 Y 1 C LEU 582 ? B LEU 586
395 1 Y 1 C GLU 583 ? B GLU 587
396 1 Y 1 C ILE 584 ? B ILE 588
397 1 Y 1 C LEU 585 ? B LEU 589
398 1 Y 1 C ASP 586 ? B ASP 590
399 1 Y 1 C ILE 587 ? B ILE 591
400 1 Y 1 C THR 588 ? B THR 592
401 1 Y 1 C PRO 589 ? B PRO 593
402 1 Y 1 C CYS 590 ? B CYS 594
403 1 Y 1 C SER 591 ? B SER 595
404 1 Y 1 C PHE 592 ? B PHE 596
405 1 Y 1 C GLY 593 ? B GLY 597
406 1 Y 1 C GLY 594 ? B GLY 598
407 1 Y 1 C VAL 595 ? B VAL 599
408 1 Y 1 C SER 596 ? B SER 600
409 1 Y 1 C VAL 597 ? B VAL 601
410 1 Y 1 C ILE 598 ? B ILE 602
411 1 Y 1 C THR 599 ? B THR 603
412 1 Y 1 C PRO 600 ? B PRO 604
413 1 Y 1 C GLY 601 ? B GLY 605
414 1 Y 1 C THR 602 ? B THR 606
415 1 Y 1 C ASN 603 ? B ASN 607
416 1 Y 1 C THR 604 ? B THR 608
417 1 Y 1 C SER 605 ? B SER 609
418 1 Y 1 C ASN 606 ? B ASN 610
419 1 Y 1 C GLN 607 ? B GLN 611
420 1 Y 1 C VAL 608 ? B VAL 612
421 1 Y 1 C ALA 609 ? B ALA 613
422 1 Y 1 C VAL 610 ? B VAL 614
423 1 Y 1 C LEU 611 ? B LEU 615
424 1 Y 1 C TYR 612 ? B TYR 616
425 1 Y 1 C GLN 613 ? B GLN 617
426 1 Y 1 C ASP 614 ? B ASP 618
427 1 Y 1 C VAL 615 ? B VAL 619
428 1 Y 1 C ASN 616 ? B ASN 620
429 1 Y 1 C CYS 617 ? B CYS 621
430 1 Y 1 C THR 618 ? B THR 622
431 1 Y 1 C GLU 619 ? B GLU 623
432 1 Y 1 C VAL 620 ? B VAL 624
433 1 Y 1 C PRO 621 ? B PRO 625
434 1 Y 1 C VAL 622 ? B VAL 626
435 1 Y 1 C ALA 623 ? B ALA 627
436 1 Y 1 C ILE 624 ? B ILE 628
437 1 Y 1 C HIS 625 ? B HIS 629
438 1 Y 1 C ALA 626 ? B ALA 630
439 1 Y 1 C ASP 627 ? B ASP 631
440 1 Y 1 C GLN 628 ? B GLN 632
441 1 Y 1 C LEU 629 ? B LEU 633
442 1 Y 1 C THR 630 ? B THR 634
443 1 Y 1 C PRO 631 ? B PRO 635
444 1 Y 1 C THR 632 ? B THR 636
445 1 Y 1 C TRP 633 ? B TRP 637
446 1 Y 1 C ARG 634 ? B ARG 638
447 1 Y 1 C VAL 635 ? B VAL 639
448 1 Y 1 C TYR 636 ? B TYR 640
449 1 Y 1 C SER 637 ? B SER 641
450 1 Y 1 C THR 638 ? B THR 642
451 1 Y 1 C GLY 639 ? B GLY 643
452 1 Y 1 C SER 640 ? B SER 644
453 1 Y 1 C ASN 641 ? B ASN 645
454 1 Y 1 C VAL 642 ? B VAL 646
455 1 Y 1 C PHE 643 ? B PHE 647
456 1 Y 1 C GLN 644 ? B GLN 648
457 1 Y 1 C THR 645 ? B THR 649
458 1 Y 1 C ARG 646 ? B ARG 650
459 1 Y 1 C ALA 647 ? B ALA 651
460 1 Y 1 C GLY 648 ? B GLY 652
461 1 Y 1 C CYS 649 ? B CYS 653
462 1 Y 1 C LEU 650 ? B LEU 654
463 1 Y 1 C ILE 651 ? B ILE 655
464 1 Y 1 C GLY 652 ? B GLY 656
465 1 Y 1 C ALA 653 ? B ALA 657
466 1 Y 1 C GLU 654 ? B GLU 658
467 1 Y 1 C HIS 655 ? B HIS 659
468 1 Y 1 C VAL 656 ? B VAL 660
469 1 Y 1 C ASN 657 ? B ASN 661
470 1 Y 1 C ASN 658 ? B ASN 662
471 1 Y 1 C SER 659 ? B SER 663
472 1 Y 1 C TYR 660 ? B TYR 664
473 1 Y 1 C GLU 661 ? B GLU 665
474 1 Y 1 C CYS 662 ? B CYS 666
475 1 Y 1 C ASP 663 ? B ASP 667
476 1 Y 1 C ILE 664 ? B ILE 668
477 1 Y 1 C PRO 665 ? B PRO 669
478 1 Y 1 C ILE 666 ? B ILE 670
479 1 Y 1 C GLY 667 ? B GLY 671
480 1 Y 1 C ALA 668 ? B ALA 672
481 1 Y 1 C GLY 669 ? B GLY 673
482 1 Y 1 C ILE 670 ? B ILE 674
483 1 Y 1 C CYS 671 ? B CYS 675
484 1 Y 1 C ALA 672 ? B ALA 676
485 1 Y 1 C SER 673 ? B SER 677
486 1 Y 1 C TYR 674 ? B TYR 678
487 1 Y 1 C GLN 675 ? B GLN 679
488 1 Y 1 C THR 676 ? B THR 680
489 1 Y 1 C GLN 677 ? B GLN 681
490 1 Y 1 C THR 678 ? B THR 682
491 1 Y 1 C ASN 679 ? B ASN 683
492 1 Y 1 C SER 680 ? B SER 684
493 1 Y 1 C PRO 681 ? B PRO 685
494 1 Y 1 C GLY 682 ? B GLY 686
495 1 Y 1 C SER 683 ? B SER 687
496 1 Y 1 C ALA 684 ? B ALA 688
497 1 Y 1 C SER 685 ? B SER 689
498 1 Y 1 C SER 686 ? B SER 690
499 1 Y 1 C VAL 687 ? B VAL 691
500 1 Y 1 C ALA 688 ? B ALA 692
501 1 Y 1 C SER 689 ? B SER 693
502 1 Y 1 C GLN 690 ? B GLN 694
503 1 Y 1 C SER 691 ? B SER 695
504 1 Y 1 C ILE 692 ? B ILE 696
505 1 Y 1 C ILE 693 ? B ILE 697
506 1 Y 1 C ALA 694 ? B ALA 698
507 1 Y 1 C TYR 695 ? B TYR 699
508 1 Y 1 C THR 696 ? B THR 700
509 1 Y 1 C MET 697 ? B MET 701
510 1 Y 1 C SER 698 ? B SER 702
511 1 Y 1 C LEU 699 ? B LEU 703
512 1 Y 1 C GLY 700 ? B GLY 704
513 1 Y 1 C ALA 701 ? B ALA 705
514 1 Y 1 C GLU 702 ? B GLU 706
515 1 Y 1 C ASN 703 ? B ASN 707
516 1 Y 1 C SER 704 ? B SER 708
517 1 Y 1 C VAL 705 ? B VAL 709
518 1 Y 1 C ALA 706 ? B ALA 710
519 1 Y 1 C TYR 707 ? B TYR 711
520 1 Y 1 C SER 708 ? B SER 712
521 1 Y 1 C ASN 709 ? B ASN 713
522 1 Y 1 C ASN 710 ? B ASN 714
523 1 Y 1 C SER 711 ? B SER 715
524 1 Y 1 C ILE 712 ? B ILE 716
525 1 Y 1 C ALA 713 ? B ALA 717
526 1 Y 1 C ILE 714 ? B ILE 718
527 1 Y 1 C PRO 715 ? B PRO 719
528 1 Y 1 C THR 716 ? B THR 720
529 1 Y 1 C ASN 717 ? B ASN 721
530 1 Y 1 C PHE 718 ? B PHE 722
531 1 Y 1 C THR 719 ? B THR 723
532 1 Y 1 C ILE 720 ? B ILE 724
533 1 Y 1 C SER 721 ? B SER 725
534 1 Y 1 C VAL 722 ? B VAL 726
535 1 Y 1 C THR 723 ? B THR 727
536 1 Y 1 C THR 724 ? B THR 728
537 1 Y 1 C GLU 725 ? B GLU 729
538 1 Y 1 C ILE 726 ? B ILE 730
539 1 Y 1 C LEU 727 ? B LEU 731
540 1 Y 1 C PRO 728 ? B PRO 732
541 1 Y 1 C VAL 729 ? B VAL 733
542 1 Y 1 C SER 730 ? B SER 734
543 1 Y 1 C MET 731 ? B MET 735
544 1 Y 1 C THR 732 ? B THR 736
545 1 Y 1 C LYS 733 ? B LYS 737
546 1 Y 1 C THR 734 ? B THR 738
547 1 Y 1 C SER 735 ? B SER 739
548 1 Y 1 C VAL 736 ? B VAL 740
549 1 Y 1 C ASP 737 ? B ASP 741
550 1 Y 1 C CYS 738 ? B CYS 742
551 1 Y 1 C THR 739 ? B THR 743
552 1 Y 1 C MET 740 ? B MET 744
553 1 Y 1 C TYR 741 ? B TYR 745
554 1 Y 1 C ILE 742 ? B ILE 746
555 1 Y 1 C CYS 743 ? B CYS 747
556 1 Y 1 C GLY 744 ? B GLY 748
557 1 Y 1 C ASP 745 ? B ASP 749
558 1 Y 1 C SER 746 ? B SER 750
559 1 Y 1 C THR 747 ? B THR 751
560 1 Y 1 C GLU 748 ? B GLU 752
561 1 Y 1 C CYS 749 ? B CYS 753
562 1 Y 1 C SER 750 ? B SER 754
563 1 Y 1 C ASN 751 ? B ASN 755
564 1 Y 1 C LEU 752 ? B LEU 756
565 1 Y 1 C LEU 753 ? B LEU 757
566 1 Y 1 C LEU 754 ? B LEU 758
567 1 Y 1 C GLN 755 ? B GLN 759
568 1 Y 1 C TYR 756 ? B TYR 760
569 1 Y 1 C GLY 757 ? B GLY 761
570 1 Y 1 C SER 758 ? B SER 762
571 1 Y 1 C PHE 759 ? B PHE 763
572 1 Y 1 C CYS 760 ? B CYS 764
573 1 Y 1 C THR 761 ? B THR 765
574 1 Y 1 C GLN 762 ? B GLN 766
575 1 Y 1 C LEU 763 ? B LEU 767
576 1 Y 1 C ASN 764 ? B ASN 768
577 1 Y 1 C ARG 765 ? B ARG 769
578 1 Y 1 C ALA 766 ? B ALA 770
579 1 Y 1 C LEU 767 ? B LEU 771
580 1 Y 1 C THR 768 ? B THR 772
581 1 Y 1 C GLY 769 ? B GLY 773
582 1 Y 1 C ILE 770 ? B ILE 774
583 1 Y 1 C ALA 771 ? B ALA 775
584 1 Y 1 C VAL 772 ? B VAL 776
585 1 Y 1 C GLU 773 ? B GLU 777
586 1 Y 1 C GLN 774 ? B GLN 778
587 1 Y 1 C ASP 775 ? B ASP 779
588 1 Y 1 C LYS 776 ? B LYS 780
589 1 Y 1 C ASN 777 ? B ASN 781
590 1 Y 1 C THR 778 ? B THR 782
591 1 Y 1 C GLN 779 ? B GLN 783
592 1 Y 1 C GLU 780 ? B GLU 784
593 1 Y 1 C VAL 781 ? B VAL 785
594 1 Y 1 C PHE 782 ? B PHE 786
595 1 Y 1 C ALA 783 ? B ALA 787
596 1 Y 1 C GLN 784 ? B GLN 788
597 1 Y 1 C VAL 785 ? B VAL 789
598 1 Y 1 C LYS 786 ? B LYS 790
599 1 Y 1 C GLN 787 ? B GLN 791
600 1 Y 1 C ILE 788 ? B ILE 792
601 1 Y 1 C TYR 789 ? B TYR 793
602 1 Y 1 C LYS 790 ? B LYS 794
603 1 Y 1 C THR 791 ? B THR 795
604 1 Y 1 C PRO 792 ? B PRO 796
605 1 Y 1 C PRO 793 ? B PRO 797
606 1 Y 1 C ILE 794 ? B ILE 798
607 1 Y 1 C LYS 795 ? B LYS 799
608 1 Y 1 C ASP 796 ? B ASP 800
609 1 Y 1 C PHE 797 ? B PHE 801
610 1 Y 1 C GLY 798 ? B GLY 802
611 1 Y 1 C GLY 799 ? B GLY 803
612 1 Y 1 C PHE 800 ? B PHE 804
613 1 Y 1 C ASN 801 ? B ASN 805
614 1 Y 1 C PHE 802 ? B PHE 806
615 1 Y 1 C SER 803 ? B SER 807
616 1 Y 1 C GLN 804 ? B GLN 808
617 1 Y 1 C ILE 805 ? B ILE 809
618 1 Y 1 C LEU 806 ? B LEU 810
619 1 Y 1 C PRO 807 ? B PRO 811
620 1 Y 1 C ASP 808 ? B ASP 812
621 1 Y 1 C PRO 809 ? B PRO 813
622 1 Y 1 C SER 810 ? B SER 814
623 1 Y 1 C LYS 811 ? B LYS 815
624 1 Y 1 C PRO 812 ? B PRO 816
625 1 Y 1 C SER 813 ? B SER 817
626 1 Y 1 C LYS 814 ? B LYS 818
627 1 Y 1 C ARG 815 ? B ARG 819
628 1 Y 1 C SER 816 ? B SER 820
629 1 Y 1 C PRO 817 ? B PRO 821
630 1 Y 1 C ILE 818 ? B ILE 822
631 1 Y 1 C GLU 819 ? B GLU 823
632 1 Y 1 C ASP 820 ? B ASP 824
633 1 Y 1 C LEU 821 ? B LEU 825
634 1 Y 1 C LEU 822 ? B LEU 826
635 1 Y 1 C PHE 823 ? B PHE 827
636 1 Y 1 C ASN 824 ? B ASN 828
637 1 Y 1 C LYS 825 ? B LYS 829
638 1 Y 1 C VAL 826 ? B VAL 830
639 1 Y 1 C THR 827 ? B THR 831
640 1 Y 1 C LEU 828 ? B LEU 832
641 1 Y 1 C ALA 829 ? B ALA 833
642 1 Y 1 C ASP 830 ? B ASP 834
643 1 Y 1 C ALA 831 ? B ALA 835
644 1 Y 1 C GLY 832 ? B GLY 836
645 1 Y 1 C PHE 833 ? B PHE 837
646 1 Y 1 C ILE 834 ? B ILE 838
647 1 Y 1 C LYS 835 ? B LYS 839
648 1 Y 1 C GLN 836 ? B GLN 840
649 1 Y 1 C TYR 837 ? B TYR 841
650 1 Y 1 C GLY 838 ? B GLY 842
651 1 Y 1 C ASP 839 ? B ASP 843
652 1 Y 1 C CYS 840 ? B CYS 844
653 1 Y 1 C LEU 841 ? B LEU 845
654 1 Y 1 C GLY 842 ? B GLY 846
655 1 Y 1 C ASP 843 ? B ASP 847
656 1 Y 1 C ILE 844 ? B ILE 848
657 1 Y 1 C ALA 845 ? B ALA 849
658 1 Y 1 C ALA 846 ? B ALA 850
659 1 Y 1 C ARG 847 ? B ARG 851
660 1 Y 1 C ASP 848 ? B ASP 852
661 1 Y 1 C LEU 849 ? B LEU 853
662 1 Y 1 C ILE 850 ? B ILE 854
663 1 Y 1 C CYS 851 ? B CYS 855
664 1 Y 1 C ALA 852 ? B ALA 856
665 1 Y 1 C GLN 853 ? B GLN 857
666 1 Y 1 C LYS 854 ? B LYS 858
667 1 Y 1 C PHE 855 ? B PHE 859
668 1 Y 1 C ASN 856 ? B ASN 860
669 1 Y 1 C GLY 857 ? B GLY 861
670 1 Y 1 C LEU 858 ? B LEU 862
671 1 Y 1 C THR 859 ? B THR 863
672 1 Y 1 C VAL 860 ? B VAL 864
673 1 Y 1 C LEU 861 ? B LEU 865
674 1 Y 1 C PRO 862 ? B PRO 866
675 1 Y 1 C PRO 863 ? B PRO 867
676 1 Y 1 C LEU 864 ? B LEU 868
677 1 Y 1 C LEU 865 ? B LEU 869
678 1 Y 1 C THR 866 ? B THR 870
679 1 Y 1 C ASP 867 ? B ASP 871
680 1 Y 1 C GLU 868 ? B GLU 872
681 1 Y 1 C MET 869 ? B MET 873
682 1 Y 1 C ILE 870 ? B ILE 874
683 1 Y 1 C ALA 871 ? B ALA 875
684 1 Y 1 C GLN 872 ? B GLN 876
685 1 Y 1 C TYR 873 ? B TYR 877
686 1 Y 1 C THR 874 ? B THR 878
687 1 Y 1 C SER 875 ? B SER 879
688 1 Y 1 C ALA 876 ? B ALA 880
689 1 Y 1 C LEU 877 ? B LEU 881
690 1 Y 1 C LEU 878 ? B LEU 882
691 1 Y 1 C ALA 879 ? B ALA 883
692 1 Y 1 C GLY 880 ? B GLY 884
693 1 Y 1 C THR 881 ? B THR 885
694 1 Y 1 C ILE 882 ? B ILE 886
695 1 Y 1 C THR 883 ? B THR 887
696 1 Y 1 C SER 884 ? B SER 888
697 1 Y 1 C GLY 885 ? B GLY 889
698 1 Y 1 C TRP 886 ? B TRP 890
699 1 Y 1 C THR 887 ? B THR 891
700 1 Y 1 C PHE 888 ? B PHE 892
701 1 Y 1 C GLY 889 ? B GLY 893
702 1 Y 1 C ALA 890 ? B ALA 894
703 1 Y 1 C GLY 891 ? B GLY 895
704 1 Y 1 C PRO 892 ? B PRO 896
705 1 Y 1 C ALA 893 ? B ALA 897
706 1 Y 1 C LEU 894 ? B LEU 898
707 1 Y 1 C GLN 895 ? B GLN 899
708 1 Y 1 C ILE 896 ? B ILE 900
709 1 Y 1 C PRO 897 ? B PRO 901
710 1 Y 1 C PHE 898 ? B PHE 902
711 1 Y 1 C PRO 899 ? B PRO 903
712 1 Y 1 C MET 900 ? B MET 904
713 1 Y 1 C GLN 901 ? B GLN 905
714 1 Y 1 C MET 902 ? B MET 906
715 1 Y 1 C ALA 903 ? B ALA 907
716 1 Y 1 C TYR 904 ? B TYR 908
717 1 Y 1 C ARG 905 ? B ARG 909
718 1 Y 1 C PHE 906 ? B PHE 910
719 1 Y 1 C ASN 907 ? B ASN 911
720 1 Y 1 C GLY 908 ? B GLY 912
721 1 Y 1 C ILE 909 ? B ILE 913
722 1 Y 1 C GLY 910 ? B GLY 914
723 1 Y 1 C VAL 911 ? B VAL 915
724 1 Y 1 C THR 912 ? B THR 916
725 1 Y 1 C GLN 913 ? B GLN 917
726 1 Y 1 C ASN 914 ? B ASN 918
727 1 Y 1 C VAL 915 ? B VAL 919
728 1 Y 1 C LEU 916 ? B LEU 920
729 1 Y 1 C TYR 917 ? B TYR 921
730 1 Y 1 C GLU 918 ? B GLU 922
731 1 Y 1 C ASN 919 ? B ASN 923
732 1 Y 1 C GLN 920 ? B GLN 924
733 1 Y 1 C LYS 921 ? B LYS 925
734 1 Y 1 C LEU 922 ? B LEU 926
735 1 Y 1 C ILE 923 ? B ILE 927
736 1 Y 1 C ALA 924 ? B ALA 928
737 1 Y 1 C ASN 925 ? B ASN 929
738 1 Y 1 C GLN 926 ? B GLN 930
739 1 Y 1 C PHE 927 ? B PHE 931
740 1 Y 1 C ASN 928 ? B ASN 932
741 1 Y 1 C SER 929 ? B SER 933
742 1 Y 1 C ALA 930 ? B ALA 934
743 1 Y 1 C ILE 931 ? B ILE 935
744 1 Y 1 C GLY 932 ? B GLY 936
745 1 Y 1 C LYS 933 ? B LYS 937
746 1 Y 1 C ILE 934 ? B ILE 938
747 1 Y 1 C GLN 935 ? B GLN 939
748 1 Y 1 C ASP 936 ? B ASP 940
749 1 Y 1 C SER 937 ? B SER 941
750 1 Y 1 C LEU 938 ? B LEU 942
751 1 Y 1 C SER 939 ? B SER 943
752 1 Y 1 C SER 940 ? B SER 944
753 1 Y 1 C THR 941 ? B THR 945
754 1 Y 1 C PRO 942 ? B PRO 946
755 1 Y 1 C SER 943 ? B SER 947
756 1 Y 1 C ALA 944 ? B ALA 948
757 1 Y 1 C LEU 945 ? B LEU 949
758 1 Y 1 C GLY 946 ? B GLY 950
759 1 Y 1 C LYS 947 ? B LYS 951
760 1 Y 1 C LEU 948 ? B LEU 952
761 1 Y 1 C GLN 949 ? B GLN 953
762 1 Y 1 C ASP 950 ? B ASP 954
763 1 Y 1 C VAL 951 ? B VAL 955
764 1 Y 1 C VAL 952 ? B VAL 956
765 1 Y 1 C ASN 953 ? B ASN 957
766 1 Y 1 C GLN 954 ? B GLN 958
767 1 Y 1 C ASN 955 ? B ASN 959
768 1 Y 1 C ALA 956 ? B ALA 960
769 1 Y 1 C GLN 957 ? B GLN 961
770 1 Y 1 C ALA 958 ? B ALA 962
771 1 Y 1 C LEU 959 ? B LEU 963
772 1 Y 1 C ASN 960 ? B ASN 964
773 1 Y 1 C THR 961 ? B THR 965
774 1 Y 1 C LEU 962 ? B LEU 966
775 1 Y 1 C VAL 963 ? B VAL 967
776 1 Y 1 C LYS 964 ? B LYS 968
777 1 Y 1 C GLN 965 ? B GLN 969
778 1 Y 1 C LEU 966 ? B LEU 970
779 1 Y 1 C SER 967 ? B SER 971
780 1 Y 1 C SER 968 ? B SER 972
781 1 Y 1 C ASN 969 ? B ASN 973
782 1 Y 1 C PHE 970 ? B PHE 974
783 1 Y 1 C GLY 971 ? B GLY 975
784 1 Y 1 C ALA 972 ? B ALA 976
785 1 Y 1 C ILE 973 ? B ILE 977
786 1 Y 1 C SER 974 ? B SER 978
787 1 Y 1 C SER 975 ? B SER 979
788 1 Y 1 C VAL 976 ? B VAL 980
789 1 Y 1 C LEU 977 ? B LEU 981
790 1 Y 1 C ASN 978 ? B ASN 982
791 1 Y 1 C ASP 979 ? B ASP 983
792 1 Y 1 C ILE 980 ? B ILE 984
793 1 Y 1 C LEU 981 ? B LEU 985
794 1 Y 1 C SER 982 ? B SER 986
795 1 Y 1 C ARG 983 ? B ARG 987
796 1 Y 1 C LEU 984 ? B LEU 988
797 1 Y 1 C ASP 985 ? B ASP 989
798 1 Y 1 C PRO 986 ? B PRO 990
799 1 Y 1 C PRO 987 ? B PRO 991
800 1 Y 1 C GLU 988 ? B GLU 992
801 1 Y 1 C ALA 989 ? B ALA 993
802 1 Y 1 C GLU 990 ? B GLU 994
803 1 Y 1 C VAL 991 ? B VAL 995
804 1 Y 1 C GLN 992 ? B GLN 996
805 1 Y 1 C ILE 993 ? B ILE 997
806 1 Y 1 C ASP 994 ? B ASP 998
807 1 Y 1 C ARG 995 ? B ARG 999
808 1 Y 1 C LEU 996 ? B LEU 1000
809 1 Y 1 C ILE 997 ? B ILE 1001
810 1 Y 1 C THR 998 ? B THR 1002
811 1 Y 1 C GLY 999 ? B GLY 1003
812 1 Y 1 C ARG 1000 ? B ARG 1004
813 1 Y 1 C LEU 1001 ? B LEU 1005
814 1 Y 1 C GLN 1002 ? B GLN 1006
815 1 Y 1 C SER 1003 ? B SER 1007
816 1 Y 1 C LEU 1004 ? B LEU 1008
817 1 Y 1 C GLN 1005 ? B GLN 1009
818 1 Y 1 C THR 1006 ? B THR 1010
819 1 Y 1 C TYR 1007 ? B TYR 1011
820 1 Y 1 C VAL 1008 ? B VAL 1012
821 1 Y 1 C THR 1009 ? B THR 1013
822 1 Y 1 C GLN 1010 ? B GLN 1014
823 1 Y 1 C GLN 1011 ? B GLN 1015
824 1 Y 1 C LEU 1012 ? B LEU 1016
825 1 Y 1 C ILE 1013 ? B ILE 1017
826 1 Y 1 C ARG 1014 ? B ARG 1018
827 1 Y 1 C ALA 1015 ? B ALA 1019
828 1 Y 1 C ALA 1016 ? B ALA 1020
829 1 Y 1 C GLU 1017 ? B GLU 1021
830 1 Y 1 C ILE 1018 ? B ILE 1022
831 1 Y 1 C ARG 1019 ? B ARG 1023
832 1 Y 1 C ALA 1020 ? B ALA 1024
833 1 Y 1 C SER 1021 ? B SER 1025
834 1 Y 1 C ALA 1022 ? B ALA 1026
835 1 Y 1 C ASN 1023 ? B ASN 1027
836 1 Y 1 C LEU 1024 ? B LEU 1028
837 1 Y 1 C ALA 1025 ? B ALA 1029
838 1 Y 1 C ALA 1026 ? B ALA 1030
839 1 Y 1 C THR 1027 ? B THR 1031
840 1 Y 1 C LYS 1028 ? B LYS 1032
841 1 Y 1 C MET 1029 ? B MET 1033
842 1 Y 1 C SER 1030 ? B SER 1034
843 1 Y 1 C GLU 1031 ? B GLU 1035
844 1 Y 1 C CYS 1032 ? B CYS 1036
845 1 Y 1 C VAL 1033 ? B VAL 1037
846 1 Y 1 C LEU 1034 ? B LEU 1038
847 1 Y 1 C GLY 1035 ? B GLY 1039
848 1 Y 1 C GLN 1036 ? B GLN 1040
849 1 Y 1 C SER 1037 ? B SER 1041
850 1 Y 1 C LYS 1038 ? B LYS 1042
851 1 Y 1 C ARG 1039 ? B ARG 1043
852 1 Y 1 C VAL 1040 ? B VAL 1044
853 1 Y 1 C ASP 1041 ? B ASP 1045
854 1 Y 1 C PHE 1042 ? B PHE 1046
855 1 Y 1 C CYS 1043 ? B CYS 1047
856 1 Y 1 C GLY 1044 ? B GLY 1048
857 1 Y 1 C LYS 1045 ? B LYS 1049
858 1 Y 1 C GLY 1046 ? B GLY 1050
859 1 Y 1 C TYR 1047 ? B TYR 1051
860 1 Y 1 C HIS 1048 ? B HIS 1052
861 1 Y 1 C LEU 1049 ? B LEU 1053
862 1 Y 1 C MET 1050 ? B MET 1054
863 1 Y 1 C SER 1051 ? B SER 1055
864 1 Y 1 C PHE 1052 ? B PHE 1056
865 1 Y 1 C PRO 1053 ? B PRO 1057
866 1 Y 1 C GLN 1054 ? B GLN 1058
867 1 Y 1 C SER 1055 ? B SER 1059
868 1 Y 1 C ALA 1056 ? B ALA 1060
869 1 Y 1 C PRO 1057 ? B PRO 1061
870 1 Y 1 C HIS 1058 ? B HIS 1062
871 1 Y 1 C GLY 1059 ? B GLY 1063
872 1 Y 1 C VAL 1060 ? B VAL 1064
873 1 Y 1 C VAL 1061 ? B VAL 1065
874 1 Y 1 C PHE 1062 ? B PHE 1066
875 1 Y 1 C LEU 1063 ? B LEU 1067
876 1 Y 1 C HIS 1064 ? B HIS 1068
877 1 Y 1 C VAL 1065 ? B VAL 1069
878 1 Y 1 C THR 1066 ? B THR 1070
879 1 Y 1 C TYR 1067 ? B TYR 1071
880 1 Y 1 C VAL 1068 ? B VAL 1072
881 1 Y 1 C PRO 1069 ? B PRO 1073
882 1 Y 1 C ALA 1070 ? B ALA 1074
883 1 Y 1 C GLN 1071 ? B GLN 1075
884 1 Y 1 C GLU 1072 ? B GLU 1076
885 1 Y 1 C LYS 1073 ? B LYS 1077
886 1 Y 1 C ASN 1074 ? B ASN 1078
887 1 Y 1 C PHE 1075 ? B PHE 1079
888 1 Y 1 C THR 1076 ? B THR 1080
889 1 Y 1 C THR 1077 ? B THR 1081
890 1 Y 1 C ALA 1078 ? B ALA 1082
891 1 Y 1 C PRO 1079 ? B PRO 1083
892 1 Y 1 C ALA 1080 ? B ALA 1084
893 1 Y 1 C ILE 1081 ? B ILE 1085
894 1 Y 1 C CYS 1082 ? B CYS 1086
895 1 Y 1 C HIS 1083 ? B HIS 1087
896 1 Y 1 C ASP 1084 ? B ASP 1088
897 1 Y 1 C GLY 1085 ? B GLY 1089
898 1 Y 1 C LYS 1086 ? B LYS 1090
899 1 Y 1 C ALA 1087 ? B ALA 1091
900 1 Y 1 C HIS 1088 ? B HIS 1092
901 1 Y 1 C PHE 1089 ? B PHE 1093
902 1 Y 1 C PRO 1090 ? B PRO 1094
903 1 Y 1 C ARG 1091 ? B ARG 1095
904 1 Y 1 C GLU 1092 ? B GLU 1096
905 1 Y 1 C GLY 1093 ? B GLY 1097
906 1 Y 1 C VAL 1094 ? B VAL 1098
907 1 Y 1 C PHE 1095 ? B PHE 1099
908 1 Y 1 C VAL 1096 ? B VAL 1100
909 1 Y 1 C SER 1097 ? B SER 1101
910 1 Y 1 C ASN 1098 ? B ASN 1102
911 1 Y 1 C GLY 1099 ? B GLY 1103
912 1 Y 1 C THR 1100 ? B THR 1104
913 1 Y 1 C HIS 1101 ? B HIS 1105
914 1 Y 1 C TRP 1102 ? B TRP 1106
915 1 Y 1 C PHE 1103 ? B PHE 1107
916 1 Y 1 C VAL 1104 ? B VAL 1108
917 1 Y 1 C THR 1105 ? B THR 1109
918 1 Y 1 C GLN 1106 ? B GLN 1110
919 1 Y 1 C ARG 1107 ? B ARG 1111
920 1 Y 1 C ASN 1108 ? B ASN 1112
921 1 Y 1 C PHE 1109 ? B PHE 1113
922 1 Y 1 C TYR 1110 ? B TYR 1114
923 1 Y 1 C GLU 1111 ? B GLU 1115
924 1 Y 1 C PRO 1112 ? B PRO 1116
925 1 Y 1 C GLN 1113 ? B GLN 1117
926 1 Y 1 C ILE 1114 ? B ILE 1118
927 1 Y 1 C ILE 1115 ? B ILE 1119
928 1 Y 1 C THR 1116 ? B THR 1120
929 1 Y 1 C THR 1117 ? B THR 1121
930 1 Y 1 C ASP 1118 ? B ASP 1122
931 1 Y 1 C ASN 1119 ? B ASN 1123
932 1 Y 1 C THR 1120 ? B THR 1124
933 1 Y 1 C PHE 1121 ? B PHE 1125
934 1 Y 1 C VAL 1122 ? B VAL 1126
935 1 Y 1 C SER 1123 ? B SER 1127
936 1 Y 1 C GLY 1124 ? B GLY 1128
937 1 Y 1 C ASN 1125 ? B ASN 1129
938 1 Y 1 C CYS 1126 ? B CYS 1130
939 1 Y 1 C ASP 1127 ? B ASP 1131
940 1 Y 1 C VAL 1128 ? B VAL 1132
941 1 Y 1 C VAL 1129 ? B VAL 1133
942 1 Y 1 C ILE 1130 ? B ILE 1134
943 1 Y 1 C GLY 1131 ? B GLY 1135
944 1 Y 1 C ILE 1132 ? B ILE 1136
945 1 Y 1 C VAL 1133 ? B VAL 1137
946 1 Y 1 C ASN 1134 ? B ASN 1138
947 1 Y 1 C ASN 1135 ? B ASN 1139
948 1 Y 1 C THR 1136 ? B THR 1140
949 1 Y 1 C VAL 1137 ? B VAL 1141
950 1 Y 1 C TYR 1138 ? B TYR 1142
951 1 Y 1 C ASP 1139 ? B ASP 1143
952 1 Y 1 C PRO 1140 ? B PRO 1144
953 1 Y 1 C LEU 1141 ? B LEU 1145
954 1 Y 1 C GLN 1142 ? B GLN 1146
955 1 Y 1 C PRO 1143 ? B PRO 1147
956 1 Y 1 C GLU 1144 ? B GLU 1148
957 1 Y 1 C LEU 1145 ? B LEU 1149
958 1 Y 1 C ASP 1146 ? B ASP 1150
959 1 Y 1 C SER 1147 ? B SER 1151
960 1 Y 1 C PHE 1148 ? B PHE 1152
961 1 Y 1 C LYS 1149 ? B LYS 1153
962 1 Y 1 C GLU 1150 ? B GLU 1154
963 1 Y 1 C GLU 1151 ? B GLU 1155
964 1 Y 1 C LEU 1152 ? B LEU 1156
965 1 Y 1 C ASP 1153 ? B ASP 1157
966 1 Y 1 C LYS 1154 ? B LYS 1158
967 1 Y 1 C TYR 1155 ? B TYR 1159
968 1 Y 1 C PHE 1156 ? B PHE 1160
969 1 Y 1 C LYS 1157 ? B LYS 1161
970 1 Y 1 C ASN 1158 ? B ASN 1162
971 1 Y 1 C HIS 1159 ? B HIS 1163
972 1 Y 1 C THR 1160 ? B THR 1164
973 1 Y 1 C SER 1161 ? B SER 1165
974 1 Y 1 C PRO 1162 ? B PRO 1166
975 1 Y 1 C ASP 1163 ? B ASP 1167
976 1 Y 1 C VAL 1164 ? B VAL 1168
977 1 Y 1 C ASP 1165 ? B ASP 1169
978 1 Y 1 C LEU 1166 ? B LEU 1170
979 1 Y 1 C GLY 1167 ? B GLY 1171
980 1 Y 1 C ASP 1168 ? B ASP 1172
981 1 Y 1 C ILE 1169 ? B ILE 1173
982 1 Y 1 C SER 1170 ? B SER 1174
983 1 Y 1 C GLY 1171 ? B GLY 1175
984 1 Y 1 C ILE 1172 ? B ILE 1176
985 1 Y 1 C ASN 1173 ? B ASN 1177
986 1 Y 1 C ALA 1174 ? B ALA 1178
987 1 Y 1 C SER 1175 ? B SER 1179
988 1 Y 1 C VAL 1176 ? B VAL 1180
989 1 Y 1 C VAL 1177 ? B VAL 1181
990 1 Y 1 C ASN 1178 ? B ASN 1182
991 1 Y 1 C ILE 1179 ? B ILE 1183
992 1 Y 1 C GLN 1180 ? B GLN 1184
993 1 Y 1 C LYS 1181 ? B LYS 1185
994 1 Y 1 C GLU 1182 ? B GLU 1186
995 1 Y 1 C ILE 1183 ? B ILE 1187
996 1 Y 1 C ASP 1184 ? B ASP 1188
997 1 Y 1 C ARG 1185 ? B ARG 1189
998 1 Y 1 C LEU 1186 ? B LEU 1190
999 1 Y 1 C ASN 1187 ? B ASN 1191
1000 1 Y 1 C GLU 1188 ? B GLU 1192
1001 1 Y 1 C VAL 1189 ? B VAL 1193
1002 1 Y 1 C ALA 1190 ? B ALA 1194
1003 1 Y 1 C LYS 1191 ? B LYS 1195
1004 1 Y 1 C ASN 1192 ? B ASN 1196
1005 1 Y 1 C LEU 1193 ? B LEU 1197
1006 1 Y 1 C ASN 1194 ? B ASN 1198
1007 1 Y 1 C GLU 1195 ? B GLU 1199
1008 1 Y 1 C SER 1196 ? B SER 1200
1009 1 Y 1 C LEU 1197 ? B LEU 1201
1010 1 Y 1 C ILE 1198 ? B ILE 1202
1011 1 Y 1 C ASP 1199 ? B ASP 1203
1012 1 Y 1 C LEU 1200 ? B LEU 1204
1013 1 Y 1 C GLN 1201 ? B GLN 1205
1014 1 Y 1 C GLU 1202 ? B GLU 1206
1015 1 Y 1 C LEU 1203 ? B LEU 1207
1016 1 Y 1 C GLY 1204 ? B GLY 1208
1017 1 Y 1 C LYS 1205 ? B LYS 1209
1018 1 Y 1 C TYR 1206 ? B TYR 1210
1019 1 Y 1 C GLU 1207 ? B GLU 1211
1020 1 Y 1 C GLN 1208 ? B GLN 1212
1021 1 Y 1 D SER 1 ? C SER 1
1022 1 Y 1 H GLN 1 ? D GLN 1
1023 1 Y 1 L GLU 105 ? E GLU 105
1024 1 Y 1 L ILE 106 ? E ILE 106
1025 1 Y 1 L LYS 107 ? E LYS 107
1026 1 Y 1 L ARG 108 ? E ARG 108
1027 1 Y 1 L THR 109 ? E THR 109
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
ALA N N N N 1
ALA CA C N S 2
ALA C C N N 3
ALA O O N N 4
ALA CB C N N 5
ALA OXT O N N 6
ALA H H N N 7
ALA H2 H N N 8
ALA HA H N N 9
ALA HB1 H N N 10
ALA HB2 H N N 11
ALA HB3 H N N 12
ALA HXT H N N 13
ARG N N N N 14
ARG CA C N S 15
ARG C C N N 16
ARG O O N N 17
ARG CB C N N 18
ARG CG C N N 19
ARG CD C N N 20
ARG NE N N N 21
ARG CZ C N N 22
ARG NH1 N N N 23
ARG NH2 N N N 24
ARG OXT O N N 25
ARG H H N N 26
ARG H2 H N N 27
ARG HA H N N 28
ARG HB2 H N N 29
ARG HB3 H N N 30
ARG HG2 H N N 31
ARG HG3 H N N 32
ARG HD2 H N N 33
ARG HD3 H N N 34
ARG HE H N N 35
ARG HH11 H N N 36
ARG HH12 H N N 37
ARG HH21 H N N 38
ARG HH22 H N N 39
ARG HXT H N N 40
ASN N N N N 41
ASN CA C N S 42
ASN C C N N 43
ASN O O N N 44
ASN CB C N N 45
ASN CG C N N 46
ASN OD1 O N N 47
ASN ND2 N N N 48
ASN OXT O N N 49
ASN H H N N 50
ASN H2 H N N 51
ASN HA H N N 52
ASN HB2 H N N 53
ASN HB3 H N N 54
ASN HD21 H N N 55
ASN HD22 H N N 56
ASN HXT H N N 57
ASP N N N N 58
ASP CA C N S 59
ASP C C N N 60
ASP O O N N 61
ASP CB C N N 62
ASP CG C N N 63
ASP OD1 O N N 64
ASP OD2 O N N 65
ASP OXT O N N 66
ASP H H N N 67
ASP H2 H N N 68
ASP HA H N N 69
ASP HB2 H N N 70
ASP HB3 H N N 71
ASP HD2 H N N 72
ASP HXT H N N 73
CYS N N N N 74
CYS CA C N R 75
CYS C C N N 76
CYS O O N N 77
CYS CB C N N 78
CYS SG S N N 79
CYS OXT O N N 80
CYS H H N N 81
CYS H2 H N N 82
CYS HA H N N 83
CYS HB2 H N N 84
CYS HB3 H N N 85
CYS HG H N N 86
CYS HXT H N N 87
FUC C1 C N R 88
FUC C2 C N S 89
FUC C3 C N R 90
FUC C4 C N S 91
FUC C5 C N S 92
FUC C6 C N N 93
FUC O1 O N N 94
FUC O2 O N N 95
FUC O3 O N N 96
FUC O4 O N N 97
FUC O5 O N N 98
FUC H1 H N N 99
FUC H2 H N N 100
FUC H3 H N N 101
FUC H4 H N N 102
FUC H5 H N N 103
FUC H61 H N N 104
FUC H62 H N N 105
FUC H63 H N N 106
FUC HO1 H N N 107
FUC HO2 H N N 108
FUC HO3 H N N 109
FUC HO4 H N N 110
GLN N N N N 111
GLN CA C N S 112
GLN C C N N 113
GLN O O N N 114
GLN CB C N N 115
GLN CG C N N 116
GLN CD C N N 117
GLN OE1 O N N 118
GLN NE2 N N N 119
GLN OXT O N N 120
GLN H H N N 121
GLN H2 H N N 122
GLN HA H N N 123
GLN HB2 H N N 124
GLN HB3 H N N 125
GLN HG2 H N N 126
GLN HG3 H N N 127
GLN HE21 H N N 128
GLN HE22 H N N 129
GLN HXT H N N 130
GLU N N N N 131
GLU CA C N S 132
GLU C C N N 133
GLU O O N N 134
GLU CB C N N 135
GLU CG C N N 136
GLU CD C N N 137
GLU OE1 O N N 138
GLU OE2 O N N 139
GLU OXT O N N 140
GLU H H N N 141
GLU H2 H N N 142
GLU HA H N N 143
GLU HB2 H N N 144
GLU HB3 H N N 145
GLU HG2 H N N 146
GLU HG3 H N N 147
GLU HE2 H N N 148
GLU HXT H N N 149
GLY N N N N 150
GLY CA C N N 151
GLY C C N N 152
GLY O O N N 153
GLY OXT O N N 154
GLY H H N N 155
GLY H2 H N N 156
GLY HA2 H N N 157
GLY HA3 H N N 158
GLY HXT H N N 159
HIS N N N N 160
HIS CA C N S 161
HIS C C N N 162
HIS O O N N 163
HIS CB C N N 164
HIS CG C Y N 165
HIS ND1 N Y N 166
HIS CD2 C Y N 167
HIS CE1 C Y N 168
HIS NE2 N Y N 169
HIS OXT O N N 170
HIS H H N N 171
HIS H2 H N N 172
HIS HA H N N 173
HIS HB2 H N N 174
HIS HB3 H N N 175
HIS HD1 H N N 176
HIS HD2 H N N 177
HIS HE1 H N N 178
HIS HE2 H N N 179
HIS HXT H N N 180
ILE N N N N 181
ILE CA C N S 182
ILE C C N N 183
ILE O O N N 184
ILE CB C N S 185
ILE CG1 C N N 186
ILE CG2 C N N 187
ILE CD1 C N N 188
ILE OXT O N N 189
ILE H H N N 190
ILE H2 H N N 191
ILE HA H N N 192
ILE HB H N N 193
ILE HG12 H N N 194
ILE HG13 H N N 195
ILE HG21 H N N 196
ILE HG22 H N N 197
ILE HG23 H N N 198
ILE HD11 H N N 199
ILE HD12 H N N 200
ILE HD13 H N N 201
ILE HXT H N N 202
LEU N N N N 203
LEU CA C N S 204
LEU C C N N 205
LEU O O N N 206
LEU CB C N N 207
LEU CG C N N 208
LEU CD1 C N N 209
LEU CD2 C N N 210
LEU OXT O N N 211
LEU H H N N 212
LEU H2 H N N 213
LEU HA H N N 214
LEU HB2 H N N 215
LEU HB3 H N N 216
LEU HG H N N 217
LEU HD11 H N N 218
LEU HD12 H N N 219
LEU HD13 H N N 220
LEU HD21 H N N 221
LEU HD22 H N N 222
LEU HD23 H N N 223
LEU HXT H N N 224
LYS N N N N 225
LYS CA C N S 226
LYS C C N N 227
LYS O O N N 228
LYS CB C N N 229
LYS CG C N N 230
LYS CD C N N 231
LYS CE C N N 232
LYS NZ N N N 233
LYS OXT O N N 234
LYS H H N N 235
LYS H2 H N N 236
LYS HA H N N 237
LYS HB2 H N N 238
LYS HB3 H N N 239
LYS HG2 H N N 240
LYS HG3 H N N 241
LYS HD2 H N N 242
LYS HD3 H N N 243
LYS HE2 H N N 244
LYS HE3 H N N 245
LYS HZ1 H N N 246
LYS HZ2 H N N 247
LYS HZ3 H N N 248
LYS HXT H N N 249
MET N N N N 250
MET CA C N S 251
MET C C N N 252
MET O O N N 253
MET CB C N N 254
MET CG C N N 255
MET SD S N N 256
MET CE C N N 257
MET OXT O N N 258
MET H H N N 259
MET H2 H N N 260
MET HA H N N 261
MET HB2 H N N 262
MET HB3 H N N 263
MET HG2 H N N 264
MET HG3 H N N 265
MET HE1 H N N 266
MET HE2 H N N 267
MET HE3 H N N 268
MET HXT H N N 269
NAG C1 C N R 270
NAG C2 C N R 271
NAG C3 C N R 272
NAG C4 C N S 273
NAG C5 C N R 274
NAG C6 C N N 275
NAG C7 C N N 276
NAG C8 C N N 277
NAG N2 N N N 278
NAG O1 O N N 279
NAG O3 O N N 280
NAG O4 O N N 281
NAG O5 O N N 282
NAG O6 O N N 283
NAG O7 O N N 284
NAG H1 H N N 285
NAG H2 H N N 286
NAG H3 H N N 287
NAG H4 H N N 288
NAG H5 H N N 289
NAG H61 H N N 290
NAG H62 H N N 291
NAG H81 H N N 292
NAG H82 H N N 293
NAG H83 H N N 294
NAG HN2 H N N 295
NAG HO1 H N N 296
NAG HO3 H N N 297
NAG HO4 H N N 298
NAG HO6 H N N 299
PHE N N N N 300
PHE CA C N S 301
PHE C C N N 302
PHE O O N N 303
PHE CB C N N 304
PHE CG C Y N 305
PHE CD1 C Y N 306
PHE CD2 C Y N 307
PHE CE1 C Y N 308
PHE CE2 C Y N 309
PHE CZ C Y N 310
PHE OXT O N N 311
PHE H H N N 312
PHE H2 H N N 313
PHE HA H N N 314
PHE HB2 H N N 315
PHE HB3 H N N 316
PHE HD1 H N N 317
PHE HD2 H N N 318
PHE HE1 H N N 319
PHE HE2 H N N 320
PHE HZ H N N 321
PHE HXT H N N 322
PRO N N N N 323
PRO CA C N S 324
PRO C C N N 325
PRO O O N N 326
PRO CB C N N 327
PRO CG C N N 328
PRO CD C N N 329
PRO OXT O N N 330
PRO H H N N 331
PRO HA H N N 332
PRO HB2 H N N 333
PRO HB3 H N N 334
PRO HG2 H N N 335
PRO HG3 H N N 336
PRO HD2 H N N 337
PRO HD3 H N N 338
PRO HXT H N N 339
SER N N N N 340
SER CA C N S 341
SER C C N N 342
SER O O N N 343
SER CB C N N 344
SER OG O N N 345
SER OXT O N N 346
SER H H N N 347
SER H2 H N N 348
SER HA H N N 349
SER HB2 H N N 350
SER HB3 H N N 351
SER HG H N N 352
SER HXT H N N 353
THR N N N N 354
THR CA C N S 355
THR C C N N 356
THR O O N N 357
THR CB C N R 358
THR OG1 O N N 359
THR CG2 C N N 360
THR OXT O N N 361
THR H H N N 362
THR H2 H N N 363
THR HA H N N 364
THR HB H N N 365
THR HG1 H N N 366
THR HG21 H N N 367
THR HG22 H N N 368
THR HG23 H N N 369
THR HXT H N N 370
TRP N N N N 371
TRP CA C N S 372
TRP C C N N 373
TRP O O N N 374
TRP CB C N N 375
TRP CG C Y N 376
TRP CD1 C Y N 377
TRP CD2 C Y N 378
TRP NE1 N Y N 379
TRP CE2 C Y N 380
TRP CE3 C Y N 381
TRP CZ2 C Y N 382
TRP CZ3 C Y N 383
TRP CH2 C Y N 384
TRP OXT O N N 385
TRP H H N N 386
TRP H2 H N N 387
TRP HA H N N 388
TRP HB2 H N N 389
TRP HB3 H N N 390
TRP HD1 H N N 391
TRP HE1 H N N 392
TRP HE3 H N N 393
TRP HZ2 H N N 394
TRP HZ3 H N N 395
TRP HH2 H N N 396
TRP HXT H N N 397
TYR N N N N 398
TYR CA C N S 399
TYR C C N N 400
TYR O O N N 401
TYR CB C N N 402
TYR CG C Y N 403
TYR CD1 C Y N 404
TYR CD2 C Y N 405
TYR CE1 C Y N 406
TYR CE2 C Y N 407
TYR CZ C Y N 408
TYR OH O N N 409
TYR OXT O N N 410
TYR H H N N 411
TYR H2 H N N 412
TYR HA H N N 413
TYR HB2 H N N 414
TYR HB3 H N N 415
TYR HD1 H N N 416
TYR HD2 H N N 417
TYR HE1 H N N 418
TYR HE2 H N N 419
TYR HH H N N 420
TYR HXT H N N 421
VAL N N N N 422
VAL CA C N S 423
VAL C C N N 424
VAL O O N N 425
VAL CB C N N 426
VAL CG1 C N N 427
VAL CG2 C N N 428
VAL OXT O N N 429
VAL H H N N 430
VAL H2 H N N 431
VAL HA H N N 432
VAL HB H N N 433
VAL HG11 H N N 434
VAL HG12 H N N 435
VAL HG13 H N N 436
VAL HG21 H N N 437
VAL HG22 H N N 438
VAL HG23 H N N 439
VAL HXT H N N 440
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
ALA N CA sing N N 1
ALA N H sing N N 2
ALA N H2 sing N N 3
ALA CA C sing N N 4
ALA CA CB sing N N 5
ALA CA HA sing N N 6
ALA C O doub N N 7
ALA C OXT sing N N 8
ALA CB HB1 sing N N 9
ALA CB HB2 sing N N 10
ALA CB HB3 sing N N 11
ALA OXT HXT sing N N 12
ARG N CA sing N N 13
ARG N H sing N N 14
ARG N H2 sing N N 15
ARG CA C sing N N 16
ARG CA CB sing N N 17
ARG CA HA sing N N 18
ARG C O doub N N 19
ARG C OXT sing N N 20
ARG CB CG sing N N 21
ARG CB HB2 sing N N 22
ARG CB HB3 sing N N 23
ARG CG CD sing N N 24
ARG CG HG2 sing N N 25
ARG CG HG3 sing N N 26
ARG CD NE sing N N 27
ARG CD HD2 sing N N 28
ARG CD HD3 sing N N 29
ARG NE CZ sing N N 30
ARG NE HE sing N N 31
ARG CZ NH1 sing N N 32
ARG CZ NH2 doub N N 33
ARG NH1 HH11 sing N N 34
ARG NH1 HH12 sing N N 35
ARG NH2 HH21 sing N N 36
ARG NH2 HH22 sing N N 37
ARG OXT HXT sing N N 38
ASN N CA sing N N 39
ASN N H sing N N 40
ASN N H2 sing N N 41
ASN CA C sing N N 42
ASN CA CB sing N N 43
ASN CA HA sing N N 44
ASN C O doub N N 45
ASN C OXT sing N N 46
ASN CB CG sing N N 47
ASN CB HB2 sing N N 48
ASN CB HB3 sing N N 49
ASN CG OD1 doub N N 50
ASN CG ND2 sing N N 51
ASN ND2 HD21 sing N N 52
ASN ND2 HD22 sing N N 53
ASN OXT HXT sing N N 54
ASP N CA sing N N 55
ASP N H sing N N 56
ASP N H2 sing N N 57
ASP CA C sing N N 58
ASP CA CB sing N N 59
ASP CA HA sing N N 60
ASP C O doub N N 61
ASP C OXT sing N N 62
ASP CB CG sing N N 63
ASP CB HB2 sing N N 64
ASP CB HB3 sing N N 65
ASP CG OD1 doub N N 66
ASP CG OD2 sing N N 67
ASP OD2 HD2 sing N N 68
ASP OXT HXT sing N N 69
CYS N CA sing N N 70
CYS N H sing N N 71
CYS N H2 sing N N 72
CYS CA C sing N N 73
CYS CA CB sing N N 74
CYS CA HA sing N N 75
CYS C O doub N N 76
CYS C OXT sing N N 77
CYS CB SG sing N N 78
CYS CB HB2 sing N N 79
CYS CB HB3 sing N N 80
CYS SG HG sing N N 81
CYS OXT HXT sing N N 82
FUC C1 C2 sing N N 83
FUC C1 O1 sing N N 84
FUC C1 O5 sing N N 85
FUC C1 H1 sing N N 86
FUC C2 C3 sing N N 87
FUC C2 O2 sing N N 88
FUC C2 H2 sing N N 89
FUC C3 C4 sing N N 90
FUC C3 O3 sing N N 91
FUC C3 H3 sing N N 92
FUC C4 C5 sing N N 93
FUC C4 O4 sing N N 94
FUC C4 H4 sing N N 95
FUC C5 C6 sing N N 96
FUC C5 O5 sing N N 97
FUC C5 H5 sing N N 98
FUC C6 H61 sing N N 99
FUC C6 H62 sing N N 100
FUC C6 H63 sing N N 101
FUC O1 HO1 sing N N 102
FUC O2 HO2 sing N N 103
FUC O3 HO3 sing N N 104
FUC O4 HO4 sing N N 105
GLN N CA sing N N 106
GLN N H sing N N 107
GLN N H2 sing N N 108
GLN CA C sing N N 109
GLN CA CB sing N N 110
GLN CA HA sing N N 111
GLN C O doub N N 112
GLN C OXT sing N N 113
GLN CB CG sing N N 114
GLN CB HB2 sing N N 115
GLN CB HB3 sing N N 116
GLN CG CD sing N N 117
GLN CG HG2 sing N N 118
GLN CG HG3 sing N N 119
GLN CD OE1 doub N N 120
GLN CD NE2 sing N N 121
GLN NE2 HE21 sing N N 122
GLN NE2 HE22 sing N N 123
GLN OXT HXT sing N N 124
GLU N CA sing N N 125
GLU N H sing N N 126
GLU N H2 sing N N 127
GLU CA C sing N N 128
GLU CA CB sing N N 129
GLU CA HA sing N N 130
GLU C O doub N N 131
GLU C OXT sing N N 132
GLU CB CG sing N N 133
GLU CB HB2 sing N N 134
GLU CB HB3 sing N N 135
GLU CG CD sing N N 136
GLU CG HG2 sing N N 137
GLU CG HG3 sing N N 138
GLU CD OE1 doub N N 139
GLU CD OE2 sing N N 140
GLU OE2 HE2 sing N N 141
GLU OXT HXT sing N N 142
GLY N CA sing N N 143
GLY N H sing N N 144
GLY N H2 sing N N 145
GLY CA C sing N N 146
GLY CA HA2 sing N N 147
GLY CA HA3 sing N N 148
GLY C O doub N N 149
GLY C OXT sing N N 150
GLY OXT HXT sing N N 151
HIS N CA sing N N 152
HIS N H sing N N 153
HIS N H2 sing N N 154
HIS CA C sing N N 155
HIS CA CB sing N N 156
HIS CA HA sing N N 157
HIS C O doub N N 158
HIS C OXT sing N N 159
HIS CB CG sing N N 160
HIS CB HB2 sing N N 161
HIS CB HB3 sing N N 162
HIS CG ND1 sing Y N 163
HIS CG CD2 doub Y N 164
HIS ND1 CE1 doub Y N 165
HIS ND1 HD1 sing N N 166
HIS CD2 NE2 sing Y N 167
HIS CD2 HD2 sing N N 168
HIS CE1 NE2 sing Y N 169
HIS CE1 HE1 sing N N 170
HIS NE2 HE2 sing N N 171
HIS OXT HXT sing N N 172
ILE N CA sing N N 173
ILE N H sing N N 174
ILE N H2 sing N N 175
ILE CA C sing N N 176
ILE CA CB sing N N 177
ILE CA HA sing N N 178
ILE C O doub N N 179
ILE C OXT sing N N 180
ILE CB CG1 sing N N 181
ILE CB CG2 sing N N 182
ILE CB HB sing N N 183
ILE CG1 CD1 sing N N 184
ILE CG1 HG12 sing N N 185
ILE CG1 HG13 sing N N 186
ILE CG2 HG21 sing N N 187
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ILE CG2 HG23 sing N N 189
ILE CD1 HD11 sing N N 190
ILE CD1 HD12 sing N N 191
ILE CD1 HD13 sing N N 192
ILE OXT HXT sing N N 193
LEU N CA sing N N 194
LEU N H sing N N 195
LEU N H2 sing N N 196
LEU CA C sing N N 197
LEU CA CB sing N N 198
LEU CA HA sing N N 199
LEU C O doub N N 200
LEU C OXT sing N N 201
LEU CB CG sing N N 202
LEU CB HB2 sing N N 203
LEU CB HB3 sing N N 204
LEU CG CD1 sing N N 205
LEU CG CD2 sing N N 206
LEU CG HG sing N N 207
LEU CD1 HD11 sing N N 208
LEU CD1 HD12 sing N N 209
LEU CD1 HD13 sing N N 210
LEU CD2 HD21 sing N N 211
LEU CD2 HD22 sing N N 212
LEU CD2 HD23 sing N N 213
LEU OXT HXT sing N N 214
LYS N CA sing N N 215
LYS N H sing N N 216
LYS N H2 sing N N 217
LYS CA C sing N N 218
LYS CA CB sing N N 219
LYS CA HA sing N N 220
LYS C O doub N N 221
LYS C OXT sing N N 222
LYS CB CG sing N N 223
LYS CB HB2 sing N N 224
LYS CB HB3 sing N N 225
LYS CG CD sing N N 226
LYS CG HG2 sing N N 227
LYS CG HG3 sing N N 228
LYS CD CE sing N N 229
LYS CD HD2 sing N N 230
LYS CD HD3 sing N N 231
LYS CE NZ sing N N 232
LYS CE HE2 sing N N 233
LYS CE HE3 sing N N 234
LYS NZ HZ1 sing N N 235
LYS NZ HZ2 sing N N 236
LYS NZ HZ3 sing N N 237
LYS OXT HXT sing N N 238
MET N CA sing N N 239
MET N H sing N N 240
MET N H2 sing N N 241
MET CA C sing N N 242
MET CA CB sing N N 243
MET CA HA sing N N 244
MET C O doub N N 245
MET C OXT sing N N 246
MET CB CG sing N N 247
MET CB HB2 sing N N 248
MET CB HB3 sing N N 249
MET CG SD sing N N 250
MET CG HG2 sing N N 251
MET CG HG3 sing N N 252
MET SD CE sing N N 253
MET CE HE1 sing N N 254
MET CE HE2 sing N N 255
MET CE HE3 sing N N 256
MET OXT HXT sing N N 257
NAG C1 C2 sing N N 258
NAG C1 O1 sing N N 259
NAG C1 O5 sing N N 260
NAG C1 H1 sing N N 261
NAG C2 C3 sing N N 262
NAG C2 N2 sing N N 263
NAG C2 H2 sing N N 264
NAG C3 C4 sing N N 265
NAG C3 O3 sing N N 266
NAG C3 H3 sing N N 267
NAG C4 C5 sing N N 268
NAG C4 O4 sing N N 269
NAG C4 H4 sing N N 270
NAG C5 C6 sing N N 271
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NAG C6 O6 sing N N 274
NAG C6 H61 sing N N 275
NAG C6 H62 sing N N 276
NAG C7 C8 sing N N 277
NAG C7 N2 sing N N 278
NAG C7 O7 doub N N 279
NAG C8 H81 sing N N 280
NAG C8 H82 sing N N 281
NAG C8 H83 sing N N 282
NAG N2 HN2 sing N N 283
NAG O1 HO1 sing N N 284
NAG O3 HO3 sing N N 285
NAG O4 HO4 sing N N 286
NAG O6 HO6 sing N N 287
PHE N CA sing N N 288
PHE N H sing N N 289
PHE N H2 sing N N 290
PHE CA C sing N N 291
PHE CA CB sing N N 292
PHE CA HA sing N N 293
PHE C O doub N N 294
PHE C OXT sing N N 295
PHE CB CG sing N N 296
PHE CB HB2 sing N N 297
PHE CB HB3 sing N N 298
PHE CG CD1 doub Y N 299
PHE CG CD2 sing Y N 300
PHE CD1 CE1 sing Y N 301
PHE CD1 HD1 sing N N 302
PHE CD2 CE2 doub Y N 303
PHE CD2 HD2 sing N N 304
PHE CE1 CZ doub Y N 305
PHE CE1 HE1 sing N N 306
PHE CE2 CZ sing Y N 307
PHE CE2 HE2 sing N N 308
PHE CZ HZ sing N N 309
PHE OXT HXT sing N N 310
PRO N CA sing N N 311
PRO N CD sing N N 312
PRO N H sing N N 313
PRO CA C sing N N 314
PRO CA CB sing N N 315
PRO CA HA sing N N 316
PRO C O doub N N 317
PRO C OXT sing N N 318
PRO CB CG sing N N 319
PRO CB HB2 sing N N 320
PRO CB HB3 sing N N 321
PRO CG CD sing N N 322
PRO CG HG2 sing N N 323
PRO CG HG3 sing N N 324
PRO CD HD2 sing N N 325
PRO CD HD3 sing N N 326
PRO OXT HXT sing N N 327
SER N CA sing N N 328
SER N H sing N N 329
SER N H2 sing N N 330
SER CA C sing N N 331
SER CA CB sing N N 332
SER CA HA sing N N 333
SER C O doub N N 334
SER C OXT sing N N 335
SER CB OG sing N N 336
SER CB HB2 sing N N 337
SER CB HB3 sing N N 338
SER OG HG sing N N 339
SER OXT HXT sing N N 340
THR N CA sing N N 341
THR N H sing N N 342
THR N H2 sing N N 343
THR CA C sing N N 344
THR CA CB sing N N 345
THR CA HA sing N N 346
THR C O doub N N 347
THR C OXT sing N N 348
THR CB OG1 sing N N 349
THR CB CG2 sing N N 350
THR CB HB sing N N 351
THR OG1 HG1 sing N N 352
THR CG2 HG21 sing N N 353
THR CG2 HG22 sing N N 354
THR CG2 HG23 sing N N 355
THR OXT HXT sing N N 356
TRP N CA sing N N 357
TRP N H sing N N 358
TRP N H2 sing N N 359
TRP CA C sing N N 360
TRP CA CB sing N N 361
TRP CA HA sing N N 362
TRP C O doub N N 363
TRP C OXT sing N N 364
TRP CB CG sing N N 365
TRP CB HB2 sing N N 366
TRP CB HB3 sing N N 367
TRP CG CD1 doub Y N 368
TRP CG CD2 sing Y N 369
TRP CD1 NE1 sing Y N 370
TRP CD1 HD1 sing N N 371
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TRP NE1 HE1 sing N N 375
TRP CE2 CZ2 sing Y N 376
TRP CE3 CZ3 doub Y N 377
TRP CE3 HE3 sing N N 378
TRP CZ2 CH2 doub Y N 379
TRP CZ2 HZ2 sing N N 380
TRP CZ3 CH2 sing Y N 381
TRP CZ3 HZ3 sing N N 382
TRP CH2 HH2 sing N N 383
TRP OXT HXT sing N N 384
TYR N CA sing N N 385
TYR N H sing N N 386
TYR N H2 sing N N 387
TYR CA C sing N N 388
TYR CA CB sing N N 389
TYR CA HA sing N N 390
TYR C O doub N N 391
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TYR CB CG sing N N 393
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TYR CD2 HD2 sing N N 401
TYR CE1 CZ doub Y N 402
TYR CE1 HE1 sing N N 403
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TYR CZ OH sing N N 406
TYR OH HH sing N N 407
TYR OXT HXT sing N N 408
VAL N CA sing N N 409
VAL N H sing N N 410
VAL N H2 sing N N 411
VAL CA C sing N N 412
VAL CA CB sing N N 413
VAL CA HA sing N N 414
VAL C O doub N N 415
VAL C OXT sing N N 416
VAL CB CG1 sing N N 417
VAL CB CG2 sing N N 418
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VAL CG1 HG11 sing N N 420
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VAL OXT HXT sing N N 426
#
_em_admin.current_status REL
_em_admin.deposition_date 2022-11-02
_em_admin.deposition_site RCSB
_em_admin.entry_id 8F0H
_em_admin.last_update 2024-11-20
_em_admin.map_release_date 2023-05-03
_em_admin.title
'Structure of SARS-CoV-2 spike with antibody Fabs 2A10 and 1H2 (Local refinement of the RBD and Fabs 1H2 and 2A10)'
#
_em_ctf_correction.details ?
_em_ctf_correction.em_image_processing_id 1
_em_ctf_correction.id 1
_em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION'
#
loop_
_em_entity_assembly_naturalsource.cell
_em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location
_em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id
_em_entity_assembly_naturalsource.id
_em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id
_em_entity_assembly_naturalsource.organism
_em_entity_assembly_naturalsource.organelle
_em_entity_assembly_naturalsource.organ
_em_entity_assembly_naturalsource.strain
_em_entity_assembly_naturalsource.tissue
? ? 2 1 9606 'Homo sapiens' ? ? ? ?
? ? 3 2 2697049 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' ? ? ? ?
#
loop_
_em_entity_assembly_recombinant.cell
_em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id
_em_entity_assembly_recombinant.id
_em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id
_em_entity_assembly_recombinant.organism
_em_entity_assembly_recombinant.plasmid
_em_entity_assembly_recombinant.strain
? 2 1 10029 'Cricetulus griseus' ? ?
? 3 2 10029 'Cricetulus griseus' ? ?
#
_em_image_processing.details ?
_em_image_processing.id 1
_em_image_processing.image_recording_id 1
#
_em_image_recording.average_exposure_time ?
_em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ?
_em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50
_em_image_recording.details ?
_em_image_recording.detector_mode ?
_em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)'
_em_image_recording.id 1
_em_image_recording.imaging_id 1
_em_image_recording.num_diffraction_images ?
_em_image_recording.num_grids_imaged ?
_em_image_recording.num_real_images ?
#
loop_
_em_software.category
_em_software.details
_em_software.id
_em_software.image_processing_id
_em_software.fitting_id
_em_software.imaging_id
_em_software.name
_em_software.version
'PARTICLE SELECTION' ? 1 1 ? ? cryoSPARC ?
'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 EPU ?
MASKING ? 3 ? ? ? ? ?
'CTF CORRECTION' ? 4 1 ? ? cryoSPARC ?
'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ?
'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ?
'MODEL FITTING' ? 7 ? 1 ? ? ?
OTHER ? 8 ? ? ? ? ?
'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? 9 1 ? ? cryoSPARC ?
'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? 10 1 ? ? cryoSPARC ?
CLASSIFICATION ? 11 1 ? ? cryoSPARC ?
RECONSTRUCTION ? 12 1 ? ? cryoSPARC ?
'MODEL REFINEMENT' ? 13 ? 1 ? PHENIX ?
#
_em_specimen.concentration ?
_em_specimen.details ?
_em_specimen.embedding_applied NO
_em_specimen.experiment_id 1
_em_specimen.id 1
_em_specimen.shadowing_applied NO
_em_specimen.staining_applied NO
_em_specimen.vitrification_applied YES
#
loop_
_pdbx_audit_support.funding_organization
_pdbx_audit_support.country
_pdbx_audit_support.grant_number
_pdbx_audit_support.ordinal
'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'U19 AI142790' 1
'GHR Foundation' 'United States' ? 2
#
loop_
_pdbx_entity_branch_list.entity_id
_pdbx_entity_branch_list.comp_id
_pdbx_entity_branch_list.num
_pdbx_entity_branch_list.hetero
6 NAG 1 n
6 NAG 2 n
6 FUC 3 n
#
_atom_sites.entry_id 8F0H
_atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ?
_atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ?
_atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ?
_atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ?
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_atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ?
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_atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ?
_atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ?
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#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
loop_