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B . n I 7 2 DG 2 38 ? ? ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.450 ? 42966 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.546 ? 12205 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 4926 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5288 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8F1K _struct.title 'SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to full duplex DNA fragment dhsU36 (-12T)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8F1K _struct_keywords.text 'promoter-bound, initiation, DNA melting, transcription bubble nucleation, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 7 ? K N N 8 ? L N N 9 ? 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'expression tag' 1408 1 6 8F1K GLU J 1409 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1409 2 6 8F1K LEU J 1410 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1410 3 6 8F1K GLU J 1411 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1411 4 6 8F1K VAL J 1412 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1412 5 6 8F1K LEU J 1413 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1413 6 6 8F1K PHE J 1414 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1414 7 6 8F1K GLN J 1415 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1415 8 6 8F1K GLY J 1416 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1416 9 6 8F1K PRO J 1417 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1417 10 6 8F1K SER J 1418 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1418 11 6 8F1K SER J 1419 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1419 12 6 8F1K GLY J 1420 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1420 13 6 8F1K HIS J 1421 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1421 14 6 8F1K HIS J 1422 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1422 15 6 8F1K HIS J 1423 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1423 16 6 8F1K HIS J 1424 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1424 17 6 8F1K HIS J 1425 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1425 18 6 8F1K HIS J 1426 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1426 19 6 8F1K HIS J 1427 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1427 20 6 8F1K HIS J 1428 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1428 21 6 8F1K HIS J 1429 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1429 22 6 8F1K HIS J 1430 ? UNP P0A8T7 ? ? 'expression tag' 1430 23 8 8F1K SER M 1 ? UNP P24255 ? ? 'expression tag' -2 24 8 8F1K GLU M 2 ? UNP P24255 ? ? 'expression tag' -1 25 8 8F1K PHE M 3 ? UNP P24255 ? ? 'expression tag' 0 26 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'electron microscopy' ? 2 1 'native gel electrophoresis' ? 3 1 'gel filtration' ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY C 34 ? SER C 50 ? GLY G 34 SER G 50 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP C 77 ? GLY C 87 ? ASP G 77 GLY G 87 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA C 113 ? ILE C 115 ? ALA G 113 ILE G 115 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP C 212 ? LEU C 234 ? ASP G 212 LEU G 234 1 ? 23 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY D 34 ? SER D 50 ? GLY H 34 SER H 50 1 ? 17 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP D 77 ? GLY D 87 ? ASP H 77 GLY H 87 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA D 113 ? ILE D 115 ? ALA H 113 ILE H 115 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO D 154 ? ILE D 159 ? PRO H 154 ILE H 159 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP D 212 ? LEU D 228 ? ASP H 212 LEU H 228 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP D 250 ? ARG D 255 ? ASP H 250 ARG H 255 5 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO D 256 ? LEU D 260 ? PRO H 256 LEU H 260 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 THR D 263 ? GLU D 273 ? THR H 263 GLU H 273 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 TYR D 277 ? GLN D 283 ? TYR H 277 GLN H 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 THR D 285 ? LYS D 291 ? THR H 285 LYS H 291 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY D 296 ? SER D 309 ? GLY H 296 SER H 309 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 SER E 4 ? LYS E 9 ? SER I 4 LYS I 9 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 LEU E 28 ? GLU E 40 ? LEU I 28 GLU I 40 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 48 ? SER E 55 ? GLY I 48 SER I 55 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP E 81 ? GLY E 89 ? ASP I 81 GLY I 89 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 ALA E 206 ? LEU E 213 ? ALA I 206 LEU I 213 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 THR E 216 ? PHE E 225 ? THR I 216 PHE I 225 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL E 242 ? ARG E 247 ? VAL I 242 ARG I 247 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 THR E 270 ? ASP E 281 ? THR I 270 ASP I 281 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO E 288 ? ALA E 293 ? PRO I 288 ALA I 293 5 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 SER E 318 ? SER E 328 ? SER I 318 SER I 328 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 TYR E 346 ? ASP E 354 ? TYR I 346 ASP I 354 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG E 359 ? ARG E 371 ? ARG I 359 ARG I 371 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 AD1 THR E 377 ? PHE E 390 ? THR I 377 PHE I 390 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 SER E 398 ? LEU E 409 ? SER I 398 LEU I 409 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 SER E 421 ? GLY E 438 ? SER I 421 GLY I 438 1 ? 18 HELX_P HELX_P31 AD4 SER E 455 ? LEU E 479 ? SER I 455 LEU I 479 1 ? 25 HELX_P HELX_P32 AD5 MET E 488 ? ILE E 493 ? MET I 488 ILE I 493 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA E 495 ? SER E 509 ? ALA I 495 SER I 509 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 ASN E 519 ? ARG E 528 ? ASN I 519 ARG I 528 1 ? 10 HELX_P HELX_P35 AD8 PHE E 545 ? ASP E 549 ? PHE I 545 ASP I 549 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 HIS E 551 ? TYR E 555 ? HIS I 551 TYR I 555 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 ALA E 608 ? GLY E 612 ? ALA I 608 GLY I 612 1 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 SER E 646 ? VAL E 650 ? SER I 646 VAL I 650 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY E 664 ? ILE E 668 ? GLY I 664 ILE I 668 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 PHE E 670 ? ASP E 674 ? PHE I 670 ASP I 674 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP E 675 ? ARG E 687 ? ASP I 675 ARG I 687 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 AE6 MET E 704 ? SER E 712 ? MET I 704 SER I 712 1 ? 9 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU E 738 ? MET E 741 ? 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AF5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? parallel AC8 5 6 ? anti-parallel AC8 6 7 ? parallel AC8 7 8 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD3 5 6 ? parallel AD3 6 7 ? anti-parallel AD3 7 8 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG C 12 ? GLN C 18 ? ARG G 12 GLN G 18 AA1 2 HIS C 23 ? LEU C 31 ? HIS G 23 LEU G 31 AA1 3 ASP C 199 ? THR C 207 ? ASP G 199 THR G 207 AA1 4 VAL C 180 ? ALA C 189 ? VAL G 180 ALA G 189 AA2 1 GLU C 97 ? SER C 105 ? GLU G 97 SER G 105 AA2 2 SER C 139 ? ARG C 150 ? SER G 139 ARG G 150 AA2 3 PRO C 52 ? ILE C 61 ? PRO G 52 ILE G 61 AA2 4 ARG C 170 ? LEU C 172 ? ARG G 170 LEU G 172 AA3 1 VAL C 90 ? VAL C 92 ? VAL G 90 VAL G 92 AA3 2 VAL C 121 ? ILE C 123 ? VAL G 121 ILE G 123 AA4 1 GLY C 108 ? THR C 111 ? GLY G 108 THR G 111 AA4 2 VAL C 129 ? LEU C 133 ? VAL G 129 LEU G 133 AA5 1 TYR C 152 ? VAL C 153 ? TYR G 152 VAL G 153 AA5 2 ALA C 175 ? CYS C 176 ? ALA G 175 CYS G 176 AA6 1 ASP D 15 ? GLN D 18 ? ASP H 15 GLN H 18 AA6 2 HIS D 23 ? LEU D 31 ? HIS H 23 LEU H 31 AA6 3 LEU D 198 ? THR D 207 ? LEU H 198 THR H 207 AA6 4 VAL D 180 ? ALA D 190 ? VAL H 180 ALA H 190 AA7 1 GLU D 97 ? SER D 105 ? GLU H 97 SER H 105 AA7 2 SER D 139 ? ARG D 150 ? SER H 139 ARG H 150 AA7 3 PRO D 52 ? ILE D 61 ? PRO H 52 ILE H 61 AA7 4 ARG D 170 ? LEU D 172 ? ARG H 170 LEU H 172 AA8 1 VAL D 90 ? ARG D 91 ? VAL H 90 ARG H 91 AA8 2 GLU D 122 ? ILE D 123 ? GLU H 122 ILE H 123 AA9 1 GLY D 108 ? THR D 111 ? GLY H 108 THR H 111 AA9 2 VAL D 129 ? LEU D 133 ? VAL H 129 LEU H 133 AB1 1 TYR D 152 ? VAL D 153 ? TYR H 152 VAL H 153 AB1 2 ALA D 175 ? CYS D 176 ? ALA H 175 CYS H 176 AB2 1 LYS E 13 ? ASP E 14 ? LYS I 13 ASP I 14 AB2 2 ILE E 1182 ? ALA E 1183 ? ILE I 1182 ALA I 1183 AB3 1 ILE E 59 ? GLN E 60 ? ILE I 59 GLN I 60 AB3 2 SER E 66 ? LEU E 75 ? SER I 66 LEU I 75 AB3 3 SER E 93 ? TYR E 105 ? SER I 93 TYR I 105 AB3 4 VAL E 114 ? PRO E 128 ? VAL I 114 PRO I 128 AB4 1 PHE E 136 ? VAL E 137 ? PHE I 136 VAL I 137 AB4 2 GLU E 142 ? ILE E 145 ? GLU I 142 ILE I 145 AB4 3 SER E 512 ? PHE E 514 ? SER I 512 PHE I 514 AB5 1 ARG E 451 ? ARG E 454 ? ARG I 451 ARG I 454 AB5 2 SER E 147 ? ARG E 151 ? SER I 147 ARG I 151 AB5 3 ARG E 529 ? SER E 531 ? ARG I 529 SER I 531 AB5 4 ILE E 572 ? SER E 574 ? ILE I 572 SER I 574 AB6 1 GLY E 154 ? ASP E 160 ? GLY I 154 ASP I 160 AB6 2 LEU E 171 ? ILE E 177 ? LEU I 171 ILE I 177 AB6 3 LEU E 184 ? GLU E 187 ? LEU I 184 GLU I 187 AB6 4 PHE E 195 ? ILE E 198 ? PHE I 195 ILE I 198 AB6 5 LEU E 204 ? PRO E 205 ? LEU I 204 PRO I 205 AB7 1 LYS E 227 ? GLU E 231 ? LYS I 227 GLU I 231 AB7 2 ARG E 332 ? LEU E 336 ? ARG I 332 LEU I 336 AB8 1 MET E 239 ? GLU E 240 ? MET I 239 GLU I 240 AB8 2 LEU E 284 ? ILE E 285 ? LEU I 284 ILE I 285 AB9 1 GLU E 249 ? THR E 250 ? GLU I 249 THR I 250 AB9 2 ARG E 268 ? ILE E 269 ? ARG I 268 ILE I 269 AC1 1 ILE E 255 ? ALA E 257 ? ILE I 255 ALA I 257 AC1 2 LYS E 260 ? VAL E 263 ? LYS I 260 VAL I 263 AC2 1 GLN E 580 ? THR E 581 ? GLN I 580 THR I 581 AC2 2 LEU E 587 ? THR E 595 ? LEU I 587 THR I 595 AC2 3 VAL E 598 ? SER E 607 ? VAL I 598 SER I 607 AC3 1 GLN E 580 ? THR E 581 ? GLN I 580 THR I 581 AC3 2 LEU E 587 ? THR E 595 ? LEU I 587 THR I 595 AC3 3 TYR E 652 ? ASP E 654 ? TYR I 652 ASP I 654 AC3 4 ILE E 616 ? ALA E 617 ? ILE I 616 ALA I 617 AC3 5 VAL E 634 ? ARG E 637 ? VAL I 634 ARG I 637 AC3 6 SER E 642 ? PHE E 645 ? SER I 642 PHE I 645 AC4 1 ALA E 716 ? VAL E 717 ? ALA I 716 VAL I 717 AC4 2 VAL E 782 ? ASP E 785 ? VAL I 782 ASP I 785 AC4 3 MET E 768 ? PRO E 769 ? MET I 768 PRO I 769 AC5 1 ILE E 748 ? ASN E 752 ? ILE I 748 ASN I 752 AC5 2 ARG E 731 ? VAL E 736 ? ARG I 731 VAL I 736 AC5 3 GLY E 722 ? VAL E 727 ? GLY I 722 VAL I 727 AC5 4 PRO E 776 ? VAL E 777 ? PRO I 776 VAL I 777 AC6 1 THR E 757 ? ARG E 758 ? THR I 757 ARG I 758 AC6 2 CYS E 764 ? ILE E 765 ? CYS I 764 ILE I 765 AC7 1 THR E 789 ? ASP E 790 ? THR I 789 ASP I 790 AC7 2 GLU E 793 ? LEU E 794 ? GLU I 793 LEU I 794 AC8 1 GLN E 1209 ? ILE E 1210 ? GLN I 1209 ILE I 1210 AC8 2 VAL E 1225 ? LYS E 1234 ? VAL I 1225 LYS I 1234 AC8 3 LYS E 1065 ? ALA E 1067 ? LYS I 1065 ALA I 1067 AC8 4 LYS E 1073 ? ASN E 1080 ? LYS I 1073 ASN I 1080 AC8 5 SER E 815 ? SER E 819 ? SER I 815 SER I 819 AC8 6 ILE E 1096 ? LEU E 1098 ? 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RECONSTRUCTION 'NU refinement with global CTF and per-particle defocus refinement enabled' 13 1 ? ? cryoSPARC v3.2.0 # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8F1K 'double helix' 8F1K 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 I DG 36 1_555 0.160 -0.169 0.568 -3.576 -4.282 -1.299 1 A_DC1:DG72_B A 1 ? 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