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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP DYHC1_HUMAN Q14204 ? 1 ;ALEEFLKQIREVWNTYELDLVNYQNKCRLIRGWDDLFNKVKEHINSVSAMKLSPYYKVFEEDALSWEDKLNRIMALFDVW IDVQRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVSKSPLVMDVLNIQGVQRSLERLADLLGKIQKALGE YLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMFAGVSSIILNEDNSVVLGISSREGEEVMFKTPVSITEHPK INEWLTLVEKEMRVTLAKLLAESVTEVEIFGKATSIDPNTYITWIDKYQAQLVVLSAQIAWSENVETALSSMGGGGDAAP LHSVLSNVEVTLNVLADSVLMEQPPLRRRKLEHLITELVHQRDVTRSLIKSKIDNAKSFEWLSQMRFYFDPKQTDVLQQL SIQMANAKFNYGFEYLGVQDKLVQTPLTDRCYLTMTQALEARLGGSPFGPAGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFD FQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNPNYDKTSAPITCELLNKQVKVSPDMAIFIT MNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTKPDRQLIAQVMLYSQGFRTAEVLANKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVL VSAGNVKRERIQKIKREKEERGEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPGVQYHRGEMTA LREELKKVCQEMYLTYGDGEEVGGMWVEKVLQLYQITQINHGLMMVGPSGSGKSMAWRVLLKALERLEGVEGVAHIIDPK AISKDHLYGTLDPNTREWTDGLFTHVLRKIIDSVRGELQKRQWIVFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPP NVRIMFEVQDLKYATLATVSRCGMVWFSEDVLSTDMIFNNFLARLRSIPLDEGEDEAQRRRKGKEDEGEEAASPMLQIQR DAATIMQPYFTSNGLVTKALEHAFQLEHIMDLTRLRCLGSLFSMLHQACRNVAQYNANHPDFPMQIEQLERYIQRYLVYA ILWSLSGDSRLKMRAELGEYIRRITTVPLPTAPNIPIIDYEVSISGEWSPWQAKVPQIEVETHKVAAPDVVVPTLDTVRH EALLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDMEVVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRRTPNGVVLAPVQLGK WLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQMVEHGGFYRTSDQTWVKLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPVVYVD YPGPASLTQIYGTFNRAMLRLIPSLRTYAEPLTAAMVEFYTMSQERFTQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLP VEGLIRIWAHEALRLFQDRLVEDEERRWTDENIDTVALKHFPNIDREKAMSRPILYSNWLSKDYIPVDQEELRDYVKARL KVFYEEELDVPLVLFNEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSVYQIKVHRKYTGEDFDEDLR TVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYATLMTQCKEGAQKEGLMLDSHEELYKWFTSQ VIRNLHVVFTMNPSSEGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSTEALYQVGKEFTSKMDLEKPNYIVPDYMPVVYDKLPQPP SHREAIVNSCVFVHQTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFHEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEE LRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKDQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMS ; 1458 2 UNP SYS_THET8 Q5SJX7 ? 1 LLALDQEVQELKKRLQEVQTERNQVAKRVPKAPPEEKEALIARGRALGEEAKRLEEALREKEAQLEA 30 3 UNP DYHC1_HUMAN Q14204 ? 1 ;LRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEK TSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQANIQFRTDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADD LCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATEFIMNEYKDRKITRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDVESYDPVLNPVLNR EVRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDLCSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERPDVDEKRSDL LKLQGEFQLRLRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRKVEETDIVMQEVETVSQQYLPLSTACSSI YFTMESLKQIHFLYQYSLQFFLDIYHNVLYENPNLKGVTDHTQRLSIITKDLFQVAFNRVARGMLHQDHITFAMLLARIK LKGTVGEPTYDAEFQHFLRGNEIVLSAGSTPRIQGLTVEQAEAVVRLSCLPAFKDLIAKVQADEQFGIWLDSSSPEQTVP YLWSEETPATPIGQAIHRLLLIQAFRPDRLLAMAHMFVSTNLGESFMSIMEQPLDLTHIVGTEVKPNTPVLMCSVPGYDA SGHVEDLAAEQNTQITSIAIGSAEGFNQADKAINTAVKSGRWVMLKNVHLAPGWLMQLEKKLHSLQPHACFRLFLTMEIN PKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGVKANMLRTFSSIPVSRICKSPNERARLYFLLAWFHAIIQERLRYAPLGWSKKYEFGESD LRSACDTVDTWLDDTAKGRQNISPDKIPWSALKTLMAQSIYGGRVDNEFDQRLLNTFLERLFTTRSFDSEFKLACKVDGH KDIQMPDGIRREEFVQWVELLPDTQTPSWLGLPNNAERVLLTTQGVDMISKMLKMQMLEDEDDLAYAETEKKTRTDSTSD GRPAWMRTLHTTASNWLHLIPQTLSHLKRTVENIKDPLFRFFEREVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTL INELVKGILPRSWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERIKQLQNISLAAASGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQA NSWSLEELCLEVNVTTSQGATLDACSFGVTGLKLQGATCNNNKLSLSNAISTALPLTQLRWVKQTNTEKKASVVTLPVYL NFTRADLIFTVDFEIATKEDPRSFYERGVAVLCTE ; 3412 4 UNP LIS1_HUMAN P43034 ? 2 ;VLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDVNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMELESKLNEAKEEFTS GGPLGQKRDPKEWIPRPPEKYALSGHRSPVTRVIFHPVFSVMVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHS GKLLASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVR PNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSSISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIK MWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHEHFVTSLDFHKTAPYVVTGSVD QTVKVWECR ; 2 5 PDB 8FDU 8FDU ? 2 ? 412 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8FDU A 3 ? 1822 ? Q14204 1458 ? 3277 ? 3 1822 2 2 8FDU A 1823 ? 1889 ? Q5SJX7 30 ? 96 ? 1823 1889 3 3 8FDU A 1890 ? 3124 ? Q14204 3412 ? 4646 ? 1890 3124 4 4 8FDU B 3 ? 411 ? P43034 2 ? 410 ? 3 411 5 5 8FDU B 412 ? 598 ? 8FDU 412 ? 598 ? 412 598 6 4 8FDU C 3 ? 411 ? P43034 2 ? 410 ? 3 411 7 5 8FDU C 412 ? 598 ? 8FDU 412 ? 598 ? 412 598 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8FDU GLY A 1 ? UNP Q14204 ? ? 'expression tag' 1 1 1 8FDU SER A 2 ? UNP Q14204 ? ? 'expression tag' 2 2 3 8FDU GLU A 3125 ? UNP Q14204 ? ? 'expression tag' 3125 3 3 8FDU PHE A 3126 ? UNP Q14204 ? ? 'expression tag' 3126 4 4 8FDU GLY B 1 ? UNP P43034 ? ? 'expression tag' 1 5 4 8FDU SER B 2 ? UNP P43034 ? ? 'expression tag' 2 6 6 8FDU GLY C 1 ? UNP P43034 ? ? 'expression tag' 1 7 6 8FDU SER C 2 ? UNP P43034 ? ? 'expression tag' 2 8 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8FDU _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8FDU _struct.title ;Engineered human dynein motor domain in the microtubule-unbound state with LIS1 complex in the buffer containing ATP-Vi (local refined on AAA3-AAA5 and LIS1) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8FDU _struct_keywords.text 'Dynein, motor domain, microtubule-unbound, MOTOR PROTEIN, LIS1' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 1116 ? GLU A 1132 ? THR A 1116 GLU A 1132 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 1145 ? LEU A 1157 ? GLY A 1145 LEU A 1157 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 1172 ? CYS A 1184 ? THR A 1172 CYS A 1184 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN A 1222 ? HIS A 1234 ? GLN A 1222 HIS A 1234 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 1269 ? ARG A 1274 ? SER A 1269 ARG A 1274 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 1285 ? LEU A 1301 ? GLY A 1285 LEU A 1301 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 ARG A 1302 ? ILE A 1304 ? ARG A 1302 ILE A 1304 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 1307 ? THR A 1309 ? LEU A 1307 THR A 1309 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 TYR A 1310 ? PHE A 1329 ? TYR A 1310 PHE A 1329 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 AB1 SER A 1340 ? LEU A 1355 ? SER A 1340 LEU A 1355 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO A 1362 ? GLN A 1379 ? PRO A 1362 GLN A 1379 1 ? 18 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU A 1384 ? PHE A 1403 ? GLU A 1384 PHE A 1403 1 ? 20 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP A 1407 ? MET A 1412 ? ASP A 1407 MET A 1412 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 1430 ? GLU A 1449 ? ASP A 1430 GLU A 1449 1 ? 20 HELX_P HELX_P15 AB6 PHE A 1457 ? GLN A 1473 ? PHE A 1457 GLN A 1473 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY A 1487 ? ASN A 1499 ? GLY A 1487 ASN A 1499 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 1513 ? GLY A 1529 ? THR A 1513 GLY A 1529 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP A 1546 ? GLY A 1560 ? ASP A 1546 GLY A 1560 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY A 1568 ? GLY A 1586 ? GLY A 1568 GLY A 1586 1 ? 19 HELX_P HELX_P20 AC2 SER A 1591 ? ASN A 1606 ? SER A 1591 ASN A 1606 1 ? 16 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU A 1618 ? SER A 1627 ? GLU A 1618 SER A 1627 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO A 1628 ? ARG A 1633 ? PRO A 1628 ARG A 1633 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 1643 ? THR A 1655 ? SER A 1643 THR A 1655 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 1683 ? ARG A 1709 ? SER A 1683 ARG A 1709 1 ? 27 HELX_P HELX_P25 AC7 THR A 1717 ? ARG A 1765 ? THR A 1717 ARG A 1765 1 ? 49 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL A 1950 ? THR A 1980 ? VAL A 1950 THR A 1980 1 ? 31 HELX_P HELX_P27 AC9 THR A 1980 ? TYR A 1994 ? THR A 1980 TYR A 1994 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP A 1999 ? ALA A 2017 ? ASP A 1999 ALA A 2017 1 ? 19 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA A 2026 ? SER A 2032 ? ALA A 2026 SER A 2032 1 ? 7 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN A 2033 ? SER A 2043 ? ASN A 2033 SER A 2043 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP A 2048 ? ARG A 2060 ? ASP A 2048 ARG A 2060 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY A 2072 ? TYR A 2082 ? GLY A 2072 TYR A 2082 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 AD6 LYS A 2083 ? LYS A 2086 ? LYS A 2083 LYS A 2086 5 ? 4 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA A 2096 ? GLY A 2108 ? ALA A 2096 GLY A 2108 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP A 2115 ? TYR A 2119 ? ASP A 2115 TYR A 2119 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP A 2120 ? VAL A 2122 ? ASP A 2120 VAL A 2122 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU A 2123 ? ARG A 2129 ? LEU A 2123 ARG A 2129 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO A 2167 ? SER A 2172 ? PRO A 2167 SER A 2172 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 THR A 2182 ? ARG A 2199 ? THR A 2182 ARG A 2199 1 ? 18 HELX_P HELX_P40 AE4 ARG A 2199 ? VAL A 2234 ? ARG A 2199 VAL A 2234 1 ? 36 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP A 2240 ? VAL A 2268 ? ASP A 2240 VAL A 2268 1 ? 29 HELX_P HELX_P42 AE6 VAL A 2268 ? GLN A 2278 ? VAL A 2268 GLN A 2278 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 AE7 PRO B 287 ? GLY B 299 ? PRO B 287 GLY B 299 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 PRO C 287 ? SER C 289 ? PRO C 287 SER C 289 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 SER C 290 ? GLY C 299 ? SER C 290 GLY C 299 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? 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