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UAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUA a5,b5 ? 12 polyribonucleotide no no UAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUA UAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUA a6,b6 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLU n 1 2 GLU n 1 3 LEU n 1 4 PHE n 1 5 ASN n 1 6 ALA n 1 7 LEU n 1 8 PRO n 1 9 GLN n 1 10 PRO n 1 11 LEU n 1 12 GLN n 1 13 GLN n 1 14 LEU n 1 15 SER n 1 16 LEU n 1 17 ALA n 1 18 LEU n 1 19 ALA n 1 20 GLY n 1 21 GLU n 1 22 ILE n 1 23 PRO n 1 24 LEU n 1 25 THR n 1 26 ASP n 1 27 HIS n 1 28 ILE n 1 29 PHE n 1 30 GLU n 1 31 GLN n 1 32 ALA n 1 33 ALA n 1 34 SER n 1 35 THR n 1 36 TRP n 1 37 HIS n 1 38 VAL n 1 39 GLN n 1 40 PRO n 1 41 ARG n 1 42 SER n 1 43 LEU n 1 44 THR n 1 45 TYR n 1 46 LYS n 1 47 LEU n 1 48 LEU n 1 49 ASP n 1 50 HIS n 1 51 ILE n 1 52 PRO n 1 53 PHE n 1 54 SER n 1 55 THR n 1 56 PRO n 1 57 VAL n 1 58 VAL n 1 59 VAL n 1 60 PRO n 1 61 PRO n 1 62 SER n 1 63 ILE n 1 64 TYR n 1 65 HIS n 1 66 SER n 1 67 LEU n 1 68 ASP n 1 69 TRP n 1 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4 ;TASPADTNVVPAKDAPTTNSPPSTTSPNQAAADANQQQAGIVSSQSGPNAVGDSAPSTSVNNDGDIITRPTSDSIAAVAN ATKPAAVVSDPQSM ; 13 5 UNP VP6_AQRVC Q8JU54 ? 5 ;AQRQFFGLTYNFYGQPAPLFDLNDLQELAGCYARPWTSRFSHLAISTGSLPVWSARYPSVASRNIIVNTLLGAHLNPFAG GQVTSHQGITWRDPVLSSLAPVPAIQPPPVWAVAENVPLDSNNYPTYVLNLSSMWPINQDVHIMTMWALSDQGPIYHLEV PVDPMPAATTAALMAYIGVPIAHLAQTAYRFAGQLPQSPDSTMVSTIRWLSAIWFGSLTGRLNRSRTCNGFYFEFAKPAL NPDQAVLKWNDGARAAPPAAAQSSYMRCISPHWQHQIVEVAGALMSQSVTAVTGLPALIDEATLPAWSQGVANLTGNGQG VVPCLDYNPVPMAAARHLQWRQDGLITAAQEAQLNNDYTAYALTIERHLTAMLVANPIAAGRMPIQPFNAADFGQAGQTA AAVALAQAMFV ; 2 6 UNP VP1_AQRVC Q8JU62 ? 6 ;AAVFGIQLVPKLNTSTTRRTFLPLRFDLLLDRLQSTNLHGVLYRALDFNPVDRSATVIQTYPPLNAWSPHPAFIENPLDY RDWTEFIHDRALAFVGVLTQRYPLTQNAQRYTNPLVLGAAFGDFLNARSIDIFLDRLFYGPTQESPITSITKFPYQWTID FNVTADSVRTPAGCKYITLYGYDPSRPSTPATYGKHRPTYATVFYYSTLPARSRLLANLAAGPTVLEHFDSPTYGPHLLL PQTGDVLGYSSSLISQAALLMVESVMDALRDNANASASTAVTRLDQSYHPVTSFDPSTFNTLLQRATNLALLAVQGVQSE SAIPAIPTMSDVRSFVARLMAEGDPQQWFPYRVDQILYWPESPFVPPIGPFYAPFRPVNFPFTTGSYTVVPDASRPLRLL PQYRNATITVQQADDAYEDTALSPLITTHGFCVTGGVSTSIYDISGDPTAYPPAQLVDTPNDYFDRERMARRDLFRRLRA PADRSAIKDRAVFDFLASLVNPTTANPVLDTSFSMAYLGASSAHANADEPVILADIRSGSIPGLPIPRRIVQFGYDVVHG SLLDLSRAVPTGTFGLVYADLDQVEDAGTDMPAANRAAIAMLGTALQMTTAGGVSVLKVNFPTRAFWTQVFNLYATHATT LHLVKPTIVNSSEVFLVFGGRQSNGALRSTTALQRALLSLYARNAAIDRAVTHIPFFGVPDDGTSDLGIDAVRLFDPMFS DAVANLPSNALASLVSRVVPSSIMFTRVPSNGPVSTTIYGKRTFLSNRRRARLRDVPMLITTTLVHQRRFTTPPTFTLFS SEAVPVTTLVAAGYNSFISEQTRNPNLAHLLDLGTGPECRILSLIPPTLQVTMSDARPCAELMASFDPALTAYVQGDYST AAFWNGIRCDSATAIFTLGAAAAAAGTDLIAFVQQLIPRIVAAGGTRMWLQLNTPLYEVSSLPDLIDIDLRDRVYRFNGG ERVEPYADPVPLQQAIAALLPAAALSWHTLSPTCDWLPYIIGVGSPLNLSDINTAISYSRLTPILHIDTTTPPLRVNPVP TPLNQQCAIRITSLDPAAVLSVQHNGVEVIGGTPGNVISVAGAAALQYILANQEFLLQFTPTLPGIFDVFLTTLGQPPVP RGSFTITPPPTTVVLNMPPPGQLDFTDVGNDARITCDPYYQLAVCIFKDGQYVRVNPEKASVVTNAPNRDLHFVLDLADN HVLLYLCDVTPSGLGDRIAFPIVDIYRIAFPRNTPVRASLPYTGGGAHLTSGGNPFMSLTTPPAVLPAGVALAALSTSVA TQYPTYTLPAGVYEYVI ; 2 7 PDB 8FJK 8FJK ? 7 ? 1 8 PDB 8FJK 8FJK ? 8 ? 1 9 PDB 8FJK 8FJK ? 9 ? 1 10 PDB 8FJK 8FJK ? 10 ? 1 11 PDB 8FJK 8FJK ? 11 ? 1 12 PDB 8FJK 8FJK ? 12 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8FJK A 1 ? 1273 ? 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Q8JU60 13 ? 106 ? 13 106 43 4 8FJK m 1 ? 94 ? Q8JU60 13 ? 106 ? 13 106 44 5 8FJK n 1 ? 411 ? Q8JU54 2 ? 412 ? 2 412 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8FJK _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8FJK _struct.title 'Golden Shiner Reovirus Core Polar Vertex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8FJK _struct_keywords.text 'dsRNA, virus, RNA-dependent, RNA-polymerase' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 5 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 5 ? U N N 7 ? V N N 8 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 11 ? Z N N 12 ? AA N N 5 ? BA N N 7 ? CA N N 8 ? DA N N 9 ? EA N N 10 ? FA N N 11 ? GA N N 12 ? HA N N 6 ? IA N N 5 ? JA N N 5 ? KA N N 6 ? LA N N 5 ? MA N N 5 ? NA N N 6 ? OA N N 4 ? PA N N 4 ? QA N N 4 ? RA N N 5 ? SA N N 13 ? TA N N 13 ? UA N N 13 ? VA N N 13 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 1 ? LEU A 7 ? 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