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K . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code L 12 AGS 1 601 663 AGS AGS A . M 13 MG 1 602 668 MG MG A . N 12 AGS 1 401 500 AGS AGS B . O 13 MG 1 402 505 MG MG B . P 12 AGS 1 401 500 AGS AGS C . Q 13 MG 1 402 505 MG MG C . R 12 AGS 1 401 500 AGS AGS D . S 13 MG 1 402 505 MG MG D . T 14 ADP 1 500 500 ADP ADP E . # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 J DA 21 ? "C5'" ? J DA 21 "C5'" 2 1 Y 1 J DA 21 ? "C4'" ? J DA 21 "C4'" 3 1 Y 1 J DA 21 ? "O4'" ? J DA 21 "O4'" 4 1 Y 1 J DA 21 ? "C3'" ? J DA 21 "C3'" 5 1 Y 1 J DA 21 ? "O3'" ? J DA 21 "O3'" 6 1 Y 1 J DA 21 ? "C2'" ? J DA 21 "C2'" 7 1 Y 1 J DA 21 ? "C1'" ? J DA 21 "C1'" 8 1 Y 1 J DA 21 ? N9 ? J DA 21 N9 9 1 Y 1 J DA 21 ? C8 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.911 ? 29793 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.426 ? 3234 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 3451 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3565 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8FS4 _struct.title ;Structure of S. cerevisiae Rad24-RFC loading the 9-1-1 clamp onto a 10-nt gapped DNA in step 2 (open 9-1-1 ring and flexibly bound chamber DNA) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8FS4 _struct_keywords.text ;DNA damage repair, Rad24-RFC, 9-1-1 clamp, DNA clamp, alternative clamp loader, DNA damage signaling, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex, CELL CYCLE-DNA complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? 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A0A8H4BUG7 1 ? 612 ? 1 612 9 9 8FS4 I 1 ? 50 ? 8FS4 1 ? 50 ? 1 50 10 10 8FS4 J 1 ? 21 ? 8FS4 1 ? 21 ? 1 21 11 11 8FS4 K 1 ? 20 ? 8FS4 1 ? 20 ? 1 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details '2D averages showed the protein-DNA complex formed successfully' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 65 ? 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SER E 12 LEU E 16 5 ? 5 HELX_P HELX_P86 AJ5 ASN E 19 ? GLN E 32 ? ASN E 19 GLN E 32 1 ? 14 HELX_P HELX_P87 AJ6 PRO E 33 ? LEU E 36 ? PRO E 33 LEU E 36 5 ? 4 HELX_P HELX_P88 AJ7 GLY E 48 ? GLY E 62 ? GLY E 48 GLY E 62 1 ? 15 HELX_P HELX_P89 AJ8 PRO E 98 ? ASN E 103 ? PRO E 98 ASN E 103 5 ? 6 HELX_P HELX_P90 AJ9 ASN E 104 ? MET E 119 ? ASN E 104 MET E 119 1 ? 16 HELX_P HELX_P91 AK1 ALA E 143 ? LEU E 146 ? ALA E 143 LEU E 146 5 ? 4 HELX_P HELX_P92 AK2 ALA E 153 ? TYR E 161 ? ALA E 153 TYR E 161 1 ? 9 HELX_P HELX_P93 AK3 ILE E 178 ? ARG E 184 ? ILE E 178 ARG E 184 1 ? 7 HELX_P HELX_P94 AK4 SER E 194 ? GLU E 209 ? SER E 194 GLU E 209 1 ? 16 HELX_P HELX_P95 AK5 ASP E 217 ? ASN E 227 ? ASP E 217 ASN E 227 1 ? 11 HELX_P HELX_P96 AK6 ASN E 229 ? ASN E 244 ? ASN E 229 ASN E 244 1 ? 16 HELX_P HELX_P97 AK7 PRO E 257 ? GLU E 273 ? PRO E 257 GLU E 273 1 ? 17 HELX_P HELX_P98 AK8 SER E 275 ? ALA E 291 ? SER E 275 ALA E 291 1 ? 17 HELX_P HELX_P99 AK9 PRO E 295 ? LEU E 308 ? 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ASP H 328 GLY H 336 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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I DA 14 K DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? I DA 14 N6 ? ? ? 1_555 K DT 7 O4 ? ? I DA 14 K DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? I DC 15 N3 ? ? ? 1_555 K DG 6 N1 ? ? I DC 15 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? I DC 15 N4 ? ? ? 1_555 K DG 6 O6 ? ? I DC 15 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? I DC 15 O2 ? ? ? 1_555 K DG 6 N2 ? ? I DC 15 K DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? I DG 16 N1 ? ? ? 1_555 K DC 5 N3 ? ? I DG 16 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? I DG 16 N2 ? ? ? 1_555 K DC 5 O2 ? ? I DG 16 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? I DG 16 O6 ? ? ? 1_555 K DC 5 N4 ? ? I DG 16 K DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? I DA 17 N1 ? ? ? 1_555 K DT 4 N3 ? ? I DA 17 K DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? I DA 17 N6 ? ? ? 1_555 K DT 4 O4 ? ? I DA 17 K DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? I DA 18 N1 ? ? ? 1_555 K DT 3 N3 ? ? I DA 18 K DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? I DA 18 N6 ? ? ? 1_555 K DT 3 O4 ? ? I DA 18 K DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? I DT 19 N3 ? ? ? 1_555 K DA 2 N1 ? ? I DT 19 K DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? I DT 19 O4 ? ? ? 1_555 K DA 2 N6 ? ? I DT 19 K DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? I DC 20 N3 ? ? ? 1_555 K DG 1 N1 ? ? I DC 20 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? I DC 20 N4 ? ? ? 1_555 K DG 1 O6 ? ? I DC 20 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? I DC 20 O2 ? ? ? 1_555 K DG 1 N2 ? ? I DC 20 K DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? I DC 32 O2 ? ? ? 1_555 J DG 19 N1 ? ? I DC 32 J DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? I DG 38 N1 ? ? ? 1_555 J DC 13 N3 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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