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EMD-29655 'other EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8G0C _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-01-31 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Courbon, G.M.' 1 0000-0001-6628-9087 'Rubinstein, J.L.' 2 0000-0003-0566-2209 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.journal_id_ISSN 1460-2075 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 42 _citation.language ? _citation.page_first e113687 _citation.page_last e113687 _citation.title 'Mechanism of mycobacterial ATP synthase inhibition by squaramides and second generation diarylquinolines.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.15252/embj.2023113687 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37377118 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Courbon, G.M.' 1 ? primary 'Palme, P.R.' 2 ? primary 'Mann, L.' 3 ? primary 'Richter, A.' 4 ? primary 'Imming, P.' 5 0000-0003-2178-3887 primary 'Rubinstein, J.L.' 6 0000-0003-0566-2209 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha' 58951.461 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase subunit beta' 51670.453 3 7.1.2.2 ? ? ? 3 polymer nat 'ATP synthase gamma chain' 33439.836 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase epsilon chain' 13277.741 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase subunit b' 17636.701 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'ATP synthase subunit b-delta' 47504.723 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'ATP synthase subunit c' 8597.982 9 ? ? ? ? 8 polymer nat 'ATP synthase subunit a' 27568.482 1 ? ? ? ? 9 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 4 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 4 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 'PHOSPHATE ION' 94.971 1 ? ? ? ? 12 non-polymer syn ;(1R,2S)-1-(6-bromo-2-methoxyquinolin-3-yl)-2-(2,6-dimethoxypyridin-4-yl)-4-(dimethylamino)-1-(2,3,6-trimethoxypyridin-4-yl)butan-2-ol ; 657.552 7 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 sector subunit alpha,F-ATPase subunit alpha' 2 'ATP synthase F1 sector subunit beta,F-ATPase subunit beta' 3 'ATP synthase F1 sector gamma subunit,F-ATPase gamma subunit' 4 'ATP synthase F1 sector epsilon subunit,F-ATPase epsilon subunit' 5 'ATP synthase F(0) sector subunit b,ATPase subunit I,F-type ATPase subunit b,F-ATPase subunit b' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS 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AQADYEKEMAEARAQASALRDEARAAGRSVVDEKRAQASGEVAQTLTQADQQLSAQGDQVRSGLESSVDGLSAKLASRIL GVDVNSGGTQ ; ;MGEFSATILAASQAAEEGGGGSNFLIPNGTFFAVLIIFLIVLGVISKWVVPPISKVLAEREAMLAKTAADNRKSAEQVAA AQADYEKEMAEARAQASALRDEARAAGRSVVDEKRAQASGEVAQTLTQADQQLSAQGDQVRSGLESSVDGLSAKLASRIL GVDVNSGGTQ ; b ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; ;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; d ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; 6,7,8,9,1,2,3,4,5 ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; a ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 GLU n 1 4 LEU n 1 5 THR n 1 6 ILE n 1 7 SER n 1 8 ALA n 1 9 ALA n 1 10 ASP n 1 11 ILE n 1 12 GLU n 1 13 GLY n 1 14 ALA n 1 15 ILE n 1 16 GLU n 1 17 ASP n 1 18 TYR n 1 19 VAL n 1 20 SER n 1 21 SER n 1 22 PHE n 1 23 SER n 1 24 ALA n 1 25 ASP n 1 26 THR n 1 27 GLU n 1 28 ARG n 1 29 GLU n 1 30 GLU n 1 31 ILE n 1 32 GLY n 1 33 THR n 1 34 VAL n 1 35 ILE n 1 36 ASP n 1 37 ALA n 1 38 GLY n 1 39 ASP n 1 40 GLY n 1 41 ILE n 1 42 ALA n 1 43 HIS n 1 44 VAL n 1 45 GLU n 1 46 GLY n 1 47 LEU n 1 48 PRO n 1 49 SER n 1 50 VAL n 1 51 MET n 1 52 THR n 1 53 GLN n 1 54 GLU n 1 55 LEU n 1 56 LEU n 1 57 GLU n 1 58 PHE n 1 59 PRO n 1 60 GLY n 1 61 GLY n 1 62 VAL n 1 63 LEU n 1 64 GLY n 1 65 VAL n 1 66 ALA n 1 67 LEU n 1 68 ASN n 1 69 LEU n 1 70 ASP n 1 71 GLU n 1 72 HIS n 1 73 SER n 1 74 VAL n 1 75 GLY n 1 76 ALA n 1 77 VAL n 1 78 ILE n 1 79 LEU n 1 80 GLY n 1 81 GLU n 1 82 PHE n 1 83 GLU n 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GLN n 1 169 LEU n 1 170 ILE n 1 171 ILE n 1 172 GLY n 1 173 ASP n 1 174 ARG n 1 175 LYS n 1 176 THR n 1 177 GLY n 1 178 LYS n 1 179 THR n 1 180 ALA n 1 181 VAL n 1 182 CYS n 1 183 VAL n 1 184 ASP n 1 185 THR n 1 186 ILE n 1 187 LEU n 1 188 ASN n 1 189 GLN n 1 190 ARG n 1 191 GLU n 1 192 ALA n 1 193 TRP n 1 194 LEU n 1 195 THR n 1 196 GLY n 1 197 ASP n 1 198 PRO n 1 199 LYS n 1 200 GLN n 1 201 GLN n 1 202 VAL n 1 203 ARG n 1 204 CYS n 1 205 VAL n 1 206 TYR n 1 207 VAL n 1 208 ALA n 1 209 ILE n 1 210 GLY n 1 211 GLN n 1 212 LYS n 1 213 GLY n 1 214 THR n 1 215 THR n 1 216 ILE n 1 217 ALA n 1 218 SER n 1 219 VAL n 1 220 LYS n 1 221 ARG n 1 222 ALA n 1 223 LEU n 1 224 GLU n 1 225 GLU n 1 226 GLY n 1 227 GLY n 1 228 ALA n 1 229 MET n 1 230 GLU n 1 231 TYR n 1 232 THR n 1 233 THR n 1 234 ILE n 1 235 VAL n 1 236 ALA n 1 237 ALA n 1 238 PRO n 1 239 ALA n 1 240 SER n 1 241 ASP n 1 242 ALA n 1 243 ALA n 1 244 GLY n 1 245 PHE n 1 246 LYS n 1 247 TRP n 1 248 LEU n 1 249 ALA n 1 250 PRO n 1 251 TYR 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n 8 245 MET n 8 246 GLU n 8 247 LEU n 8 248 ASP n 8 249 HIS n 8 250 GLU n 8 251 ASP n 8 252 HIS n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 548 ? 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'Mycolicibacterium smegmatis MC2 155' 246196 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATPA_MYCS2 A0R202 ? 1 ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; 1 2 UNP ATPB_MYCS2 A0R200 ? 2 ;MTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLVRGVEVT DTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGGKIALFG GAGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSALTMAEF FRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADDYTDPAP ATTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDELSEEDKQ LVNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAKL ; 1 3 UNP ATPG_MYCS2 A0R201 ? 3 ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI ATRVYAALLEAAASESASRRRAMKSATDNADDLIKALTLAANRERQAQITQEISEIVGGANALAGSK ; 1 4 UNP ATPE_MYCS2 A0R1Z9 ? 4 ;MADLNVEIVAVERELWSGPATFVFTRTTAGEIGILPRHIPLVAQLVDDAMVRVEREGEDDLRIAVDGGFLSVTEETVRIL VENAQFESEIDADAAKEDAASDDERTAAWGRARLRALGQID ; 1 5 UNP ATPF_MYCS2 A0R204 ? 5 ;MGEFSATILAASQAAEEGGGGSNFLIPNGTFFAVLIIFLIVLGVISKWVVPPISKVLAEREAMLAKTAADNRKSAEQVAA AQADYEKEMAEARAQASALRDEARAAGRSVVDEKRAQASGEVAQTLTQADQQLSAQGDQVRSGLESSVDGLSAKLASRIL GVDVNSGGTQ ; 1 6 UNP ATPFD_MYCS2 A0R203 ? 6 ;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; 1 7 UNP A0R205_MYCS2 A0R205 ? 7 ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; 1 8 UNP A0R206_MYCS2 A0R206 ? 8 ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8G0C B 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 2 1 8G0C C 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 3 1 8G0C A 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 4 2 8G0C E 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 5 2 8G0C F 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 6 2 8G0C D 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 7 3 8G0C G 1 ? 307 ? A0R201 1 ? 307 ? 1 307 8 4 8G0C H 1 ? 121 ? A0R1Z9 1 ? 121 ? 1 121 9 5 8G0C b 1 ? 170 ? A0R204 1 ? 170 ? 1 170 10 6 8G0C d 1 ? 445 ? A0R203 1 ? 445 ? 1 445 11 7 8G0C 6 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 12 7 8G0C 7 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 13 7 8G0C 8 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 14 7 8G0C 9 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 15 7 8G0C 1 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 16 7 8G0C 2 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 17 7 8G0C 3 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 18 7 8G0C 4 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 19 7 8G0C 5 1 ? 86 ? A0R205 1 ? 86 ? 1 86 20 8 8G0C a 1 ? 252 ? A0R206 1 ? 252 ? 1 252 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PO4 non-polymer . 'PHOSPHATE ION' ? 'O4 P -3' 94.971 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 YGR non-polymer . ;(1R,2S)-1-(6-bromo-2-methoxyquinolin-3-yl)-2-(2,6-dimethoxypyridin-4-yl)-4-(dimethylamino)-1-(2,3,6-trimethoxypyridin-4-yl)butan-2-ol ; ? 'C31 H37 Br N4 O7' 657.552 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8G0C _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8G0C _struct.title 'Cryo-EM structure of TBAJ-876-bound Mycobacterium smegmatis ATP synthase rotational state 1 (backbone model)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8G0C _struct_keywords.text 'ATP synthase, mycobacterial, inhibitor, tuberculosis, antibiotic, HYDROLASE, TRANSLOCASE-INHIBITOR complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLOCASE/INHIBITOR # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 7 ? M N N 7 ? N N N 7 ? O N N 7 ? P N N 7 ? Q N N 7 ? R N N 7 ? S N N 7 ? T N N 8 ? U N N 9 ? V N N 10 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 9 ? Z N N 10 ? AA N N 9 ? BA N N 10 ? CA N N 11 ? DA N N 12 ? EA N N 12 ? FA N N 12 ? GA N N 12 ? HA N N 12 ? IA N N 12 ? JA N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 9 ? 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GLU B 356 GLY B 363 1 ? 8 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL A 377 ? GLN A 382 ? VAL B 377 GLN B 382 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 ILE A 383 ? ALA A 390 ? ILE B 383 ALA B 390 1 ? 8 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA A 390 ? GLU A 404 ? ALA B 390 GLU B 404 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA A 405 ? LEU A 413 ? ALA B 405 LEU B 413 5 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 414 ? LYS A 432 ? ASP B 414 LYS B 432 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA A 440 ? GLN A 453 ? ALA B 440 GLN B 453 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO A 460 ? GLU A 462 ? PRO B 460 GLU B 462 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP A 463 ? HIS A 479 ? ASP B 463 HIS B 479 1 ? 17 HELX_P HELX_P24 AC6 HIS A 479 ? LYS A 490 ? HIS B 479 LYS B 490 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 SER A 493 ? PHE A 511 ? SER B 493 PHE B 511 1 ? 19 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP B 10 ? PHE B 22 ? ASP C 10 PHE C 22 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 AC9 GLU B 81 ? ILE B 85 ? GLU C 81 ILE C 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 GLY B 103 ? LEU B 107 ? GLY C 103 LEU C 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 ILE B 153 ? THR B 160 ? ILE C 153 THR C 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY B 177 ? ASN B 188 ? GLY C 177 ASN C 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 GLN B 189 ? GLY B 196 ? GLN C 189 GLY C 196 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 LYS B 212 ? GLY B 226 ? LYS C 212 GLY C 226 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA B 228 ? GLU B 230 ? ALA C 228 GLU C 230 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA B 242 ? TYR B 262 ? ALA C 242 TYR C 262 1 ? 21 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU B 274 ? LEU B 288 ? LEU C 274 LEU C 288 1 ? 15 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY B 293 ? PHE B 297 ? GLY C 293 PHE C 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY B 299 ? GLU B 310 ? GLY C 299 GLU C 310 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 AE2 SER B 316 ? GLY B 320 ? SER C 316 GLY C 320 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 ALA B 339 ? THR B 349 ? ALA C 339 THR C 349 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 GLU B 356 ? GLN B 362 ? GLU C 356 GLN C 362 1 ? 7 HELX_P HELX_P41 AE5 ILE B 383 ? ALA B 390 ? ILE C 383 ALA C 390 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 AE6 SER B 392 ? ALA B 408 ? SER C 392 ALA C 408 1 ? 17 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP B 414 ? LYS B 432 ? ASP C 414 LYS C 432 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA B 440 ? GLN B 453 ? ALA C 440 GLN C 453 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 AE9 PRO B 460 ? GLU B 462 ? PRO C 460 GLU C 462 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP B 463 ? HIS B 479 ? ASP C 463 HIS C 479 1 ? 17 HELX_P HELX_P47 AF2 HIS B 479 ? LYS B 490 ? HIS C 479 LYS C 490 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 SER B 493 ? PHE B 511 ? SER C 493 PHE C 511 1 ? 19 HELX_P HELX_P49 AF4 ALA C 9 ? PHE C 22 ? ALA A 9 PHE A 22 1 ? 14 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY C 103 ? LEU C 107 ? GLY A 103 LEU A 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 SER C 138 ? ARG C 142 ? SER A 138 ARG A 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 ILE C 153 ? THR C 160 ? ILE A 153 THR A 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 GLY C 177 ? ASN C 188 ? GLY A 177 ASN A 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 AF9 GLN C 189 ? LEU C 194 ? GLN A 189 LEU A 194 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 AG1 LYS C 212 ? GLY C 226 ? LYS A 212 GLY A 226 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 AG2 GLY C 227 ? GLU C 230 ? GLY A 227 GLU A 230 5 ? 4 HELX_P HELX_P57 AG3 ALA C 242 ? TYR C 262 ? 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