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'expression tag' 345 24 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 300-meric 300 2 'icosahedral asymmetric unit' ? pentameric 5 3 'icosahedral pentamer' ? 25-meric 25 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 30-meric 30 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? pentameric 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E 2 1 A,B,C,D,E 3 '(1-5)' A,B,C,D,E 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E 5 P A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 -0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 -0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 21 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 22 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 23 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 24 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 25 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 26 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 27 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 -0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 28 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 29 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 30 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 31 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 32 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 33 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 34 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.80901699 -0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 -0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 35 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.30901699 -0.80901699 0.00000 -0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 36 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 37 'point symmetry operation' ? 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? -0.50000000 -0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 -0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 45 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.50000000 0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 46 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 47 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 -0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 -0.50000000 0.00000 48 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 -0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 0.50000000 -0.30901699 0.00000 49 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.30901699 -0.80901699 0.00000 0.30901699 0.80901699 0.50000000 0.00000 0.80901699 -0.50000000 0.30901699 0.00000 50 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.50000000 -0.30901699 0.00000 0.50000000 0.30901699 0.80901699 0.00000 -0.30901699 -0.80901699 0.50000000 0.00000 51 'point symmetry operation' ? 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ASN B 158 TRP B 163 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN B 179 ? GLY B 196 ? ASN B 179 GLY B 196 1 ? 18 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 210 ? ASP B 218 ? THR B 210 ASP B 218 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 HIS B 219 ? GLU B 227 ? HIS B 219 GLU B 227 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 TYR B 235 ? ASP B 242 ? TYR B 235 ASP B 242 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 AC2 THR C 13 ? ALA C 19 ? THR C 13 ALA C 19 5 ? 7 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN C 24 ? GLY C 30 ? ASN C 24 GLY C 30 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 SER C 93 ? PHE C 98 ? SER C 93 PHE C 98 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 THR C 107 ? ASP C 140 ? THR C 107 ASP C 140 1 ? 34 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN C 158 ? TRP C 163 ? ASN C 158 TRP C 163 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN C 179 ? ASP C 193 ? ASN C 179 ASP C 193 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 THR C 209 ? ASP C 218 ? THR C 209 ASP C 218 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 AC9 HIS C 219 ? ARG C 229 ? HIS C 219 ARG C 229 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 TYR C 235 ? GLY C 241 ? TYR C 235 GLY C 241 1 ? 7 HELX_P HELX_P29 AD2 ARG C 327 ? LEU C 330 ? ARG C 327 LEU C 330 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 AD3 THR D 13 ? ALA D 19 ? THR D 13 ALA D 19 5 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN D 24 ? GLY D 30 ? ASN D 24 GLY D 30 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 AD5 ALA D 108 ? LYS D 139 ? ALA D 108 LYS D 139 1 ? 32 HELX_P HELX_P33 AD6 PHE D 159 ? GLY D 164 ? PHE D 159 GLY D 164 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO D 180 ? GLY D 196 ? PRO D 180 GLY D 196 1 ? 17 HELX_P HELX_P35 AD8 THR D 209 ? ASP D 218 ? THR D 209 ASP D 218 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 VAL D 222 ? GLY D 228 ? VAL D 222 GLY D 228 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 TYR D 235 ? GLY D 241 ? TYR D 235 GLY D 241 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 ARG D 327 ? LEU D 330 ? ARG D 327 LEU D 330 5 ? 4 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG E 41 ? SER E 49 ? ARG E 41 SER E 49 1 ? 9 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY E 64 ? GLU E 69 ? GLY E 64 GLU E 69 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 THR E 72 ? LYS E 81 ? THR E 72 LYS E 81 1 ? 10 HELX_P HELX_P42 AE6 THR E 110 ? LEU E 124 ? THR E 110 LEU E 124 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP E 131 ? HIS E 135 ? ASP E 131 HIS E 135 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 AE8 GLN E 150 ? LYS E 171 ? GLN E 150 LYS E 171 1 ? 22 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 9 ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _em_virus_natural_host.entity_assembly_id 1 _em_virus_natural_host.id 1 _em_virus_natural_host.ncbi_tax_id ? _em_virus_natural_host.organism 'Shigella flexneri Y' _em_virus_natural_host.strain ? # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM110185 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM116789 2 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM140803 3 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' 1750125 4 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI127652 5 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI127652 6 # _atom_sites.entry_id 8G1R _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_