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EMDB EMD-29677 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of the methylosome-Lsm10/11 complex' _pdbx_database_related.db_id EMD-29677 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8G1U _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-02-03 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Lin, M.' 1 0000-0002-8639-0542 'Paige, A.' 2 ? 'Tong, L.' 3 0000-0002-0563-6468 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Rna _citation.journal_id_ASTM RNARFU _citation.journal_id_CSD 2122 _citation.journal_id_ISSN 1469-9001 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 29 _citation.language ? _citation.page_first 1673 _citation.page_last 1690 _citation.title 'In vitro methylation of the U7 snRNP subunits Lsm11 and SmE by the PRMT5/MEP50/pICln methylosome.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1261/rna.079709.123 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37562960 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, X.C.' 1 ? primary 'Desotell, A.' 2 ? primary 'Lin, M.H.' 3 ? primary 'Paige, A.S.' 4 ? primary 'Malinowska, A.' 5 ? primary 'Sun, Y.' 6 ? primary 'Aik, W.S.' 7 ? primary 'Dadlez, M.' 8 ? primary 'Tong, L.' 9 ? primary 'Dominski, Z.' 10 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8G1U _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? 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;MRKETPPPLVPPAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCAAPNEGFCSAGVQTE AGVADLTWVGERGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDICIKVWDLAQQVVL SSYRAHAAQVTCVAASPHKDSVFLSCSEDNRILLWDTRCPKPASQIGCSAPGYLPTSLAWHPQQSEVFVFGDENGTVSLV DTKSTSCVLSSAVHSQCVTGLVFSPHSVPFLASLSEDCSLAVLDSSLSELFRSQAHRDFVRDATWSPLNHSLLTTVGWDH QVVHHVVPTEPLPAPGPASVTE ; ;MRKETPPPLVPPAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCAAPNEGFCSAGVQTE AGVADLTWVGERGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDICIKVWDLAQQVVL SSYRAHAAQVTCVAASPHKDSVFLSCSEDNRILLWDTRCPKPASQIGCSAPGYLPTSLAWHPQQSEVFVFGDENGTVSLV DTKSTSCVLSSAVHSQCVTGLVFSPHSVPFLASLSEDCSLAVLDSSLSELFRSQAHRDFVRDATWSPLNHSLLTTVGWDH QVVHHVVPTEPLPAPGPASVTE ; B,F,J,N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSFLKSFPPPGSADGLRLQQPDTEAVLNGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPTISLHAVSRDPNAYPQEHLYV MVNAKLGEESKEPPSDEDEEDNDDIEPISEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQ GDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSVRNYEDGMEVETTPTVAGQFEDADVDH ; ;MSFLKSFPPPGSADGLRLQQPDTEAVLNGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPTISLHAVSRDPNAYPQEHLYV MVNAKLGEESKEPPSDEDEEDNDDIEPISEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQ GDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSVRNYEDGMEVETTPTVAGQFEDADVDH ; C,G,K,O ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MEERERGARSAGAGSPARPPSPRLDVSSDSFDPLLALYAPRLPPIPYPNAPCFNNVAEYESFLRTGVRGGGRGRGRARGA AAGSGVPAAPGPSGRTRRRPDAPAPDPERIQRLRRLMVAKEEGDGAAGAGRRGPGRSRKAPRNVLTRMPLHEGSPLGELH RCIREGVKVNVHIRTFKGLRGVCTGFLVAFDKFWNMALTDVDETYRKPVLGKAYERDSSLTLTRLFDRLKLQDSSKKEAD SKSAVEDSTLSRYSQTSTWKLASVWGRADTGRGSHKRSRSVPSSLQASAREESRSELSGRTTRTDGSSVGGTFSRATTLS RGQSRKKKRKPKVDYQQVFTRHINQIFIRGENVLLVHLAQ ; ;MEERERGARSAGAGSPARPPSPRLDVSSDSFDPLLALYAPRLPPIPYPNAPCFNNVAEYESFLRTGVRGGGRGRGRARGA AAGSGVPAAPGPSGRTRRRPDAPAPDPERIQRLRRLMVAKEEGDGAAGAGRRGPGRSRKAPRNVLTRMPLHEGSPLGELH RCIREGVKVNVHIRTFKGLRGVCTGFLVAFDKFWNMALTDVDETYRKPVLGKAYERDSSLTLTRLFDRLKLQDSSKKEAD SKSAVEDSTLSRYSQTSTWKLASVWGRADTGRGSHKRSRSVPSSLQASAREESRSELSGRTTRTDGSSVGGTFSRATTLS 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_entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 637 human ? 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'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? baculovirus ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ANM5_HUMAN O14744 ? 1 ;MAAMAVGGAGGSRVSSGRDLNCVPEIADTLGAVAKQGFDFLCMPVFHPRFKREFIQEPAKNRPGPQTRSDLLLSGRDWNT LIVGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIHTGHHSSMFWMRVPLVAP EDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNK KGFPVLSKMHQRLIFRLLKLEVQFIITGTNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLE SQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVT LENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKDDGVSIPGEYTSFLAPISSSKL YNEVRACREKDRDPEAQFEMPYVVRLHNFHQLSAPQPCFTFSHPNRDPMIDNNRYCTLEFPVEVNTVLHGFAGYFETVLY QDITLSIRPETHSPGMFSWFPILFPIKQPITVREGQTICVRFWRCSNSKKVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGRSYTIGL ; 1 2 UNP MEP50_HUMAN Q9BQA1 ? 2 ;MRKETPPPLVPPAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCAAPNEGFCSAGVQTE AGVADLTWVGERGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDICIKVWDLAQQVVL SSYRAHAAQVTCVAASPHKDSVFLSCSEDNRILLWDTRCPKPASQIGCSAPGYLPTSLAWHPQQSEVFVFGDENGTVSLV DTKSTSCVLSSAVHSQCVTGLVFSPHSVPFLASLSEDCSLAVLDSSLSELFRSQAHRDFVRDATWSPLNHSLLTTVGWDH QVVHHVVPTEPLPAPGPASVTE ; 1 3 UNP ICLN_MOUSE Q61189 ? 3 ;MSFLKSFPPPGSADGLRLQQPDTEAVLNGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPTISLHAVSRDPNAYPQEHLYV MVNAKLGEESKEPPSDEDEEDNDDIEPISEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQ GDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSVRNYEDGMEVETTPTVAGQFEDADVDH ; 1 4 UNP LSM11_HUMAN P83369 ? 4 ;MEERERGARSAGAGSPARPPSPRLDVSSDSFDPLLALYAPRLPPIPYPNAPCFNNVAEYESFLRTGVRGGGRGRGRARGA AAGSGVPAAPGPSGRTRRRPDAPAPDPERIQRLRRLMVAKEEGDGAAGAGRRGPGRSRKAPRNVLTRMPLHEGSPLGELH RCIREGVKVNVHIRTFKGLRGVCTGFLVAFDKFWNMALTDVDETYRKPVLGKAYERDSSLTLTRLFDRLKLQDSSKKEAD SKSAVEDSTLSRYSQTSTWKLASVWGRADTGRGSHKRSRSVPSSLQASAREESRSELSGRTTRTDGSSVGGTFSRATTLS RGQSRKKKRKPKVDYQQVFTRHINQIFIRGENVLLVHLAQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8G1U A 1 ? 637 ? O14744 1 ? 637 ? 1 637 2 2 8G1U B 1 ? 342 ? Q9BQA1 1 ? 342 ? 1 342 3 3 8G1U C 1 ? 236 ? Q61189 1 ? 236 ? -222 13 4 1 8G1U E 1 ? 637 ? O14744 1 ? 637 ? 1 637 5 2 8G1U F 1 ? 342 ? Q9BQA1 1 ? 342 ? 1 342 6 3 8G1U G 1 ? 236 ? Q61189 1 ? 236 ? -222 13 7 1 8G1U I 1 ? 637 ? O14744 1 ? 637 ? 1 637 8 2 8G1U J 1 ? 342 ? Q9BQA1 1 ? 342 ? 1 342 9 3 8G1U K 1 ? 236 ? Q61189 1 ? 236 ? -222 13 10 1 8G1U M 1 ? 637 ? O14744 1 ? 637 ? 1 637 11 2 8G1U N 1 ? 342 ? Q9BQA1 1 ? 342 ? 1 342 12 3 8G1U O 1 ? 236 ? Q61189 1 ? 236 ? -222 13 13 4 8G1U D 1 ? 360 ? P83369 1 ? 360 ? 1 360 14 4 8G1U H 1 ? 360 ? P83369 1 ? 360 ? 1 360 15 4 8G1U L 1 ? 360 ? P83369 1 ? 360 ? 1 360 16 4 8G1U P 1 ? 360 ? P83369 1 ? 360 ? 1 360 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADN non-polymer . ADENOSINE ? 'C10 H13 N5 O4' 267.241 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 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