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PA 4 NAG 1 1306 46 NAG NAG D . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8G75 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8G75 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8G75 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8G75 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 29374 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.669 ? 39976 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.355 ? 10547 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.049 ? 4619 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 5133 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8G75 _struct.title 'SARS-CoV-2 spike/Nb4 complex with 2 RBDs up and 3 Nb4 bound' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8G75 _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex, Nanobody' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 4 ? 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NAG M 1 ? 1_555 ASN B 1134 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 20 NAG MA . ? ASN C 603 ? NAG D 1303 ? 1_555 ASN D 616 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 21 NAG N . ? ASN C 704 ? NAG N 1 ? 1_555 ASN D 717 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 22 NAG NA . ? ASN C 644 ? NAG D 1304 ? 1_555 ASN D 657 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 23 NAG O . ? ASN C 788 ? NAG O 1 ? 1_555 ASN D 801 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 24 NAG OA . ? ASN C 696 ? NAG D 1305 ? 1_555 ASN D 709 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 25 NAG P . ? ASN C 1085 ? NAG P 1 ? 1_555 ASN D 1098 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 26 NAG PA . ? ASN C 1061 ? NAG D 1306 ? 1_555 ASN D 1074 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 27 NAG Q . ? ASN C 1121 ? NAG Q 1 ? 1_555 ASN D 1134 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 28 NAG R . ? ASN A 269 ? 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