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C ASN 368 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 368 C NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 471 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 471 C NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? D ASN 337 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? D ASN 337 D NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.558 ? N-Glycosylation covale17 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale18 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale19 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale20 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? N NAG 2 N MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale21 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale22 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? R NAG 2 R MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale23 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale24 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale25 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale26 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? c NAG 2 c MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale27 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 8 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 5 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AA9 6 7 ? anti-parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 63 ? 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TYR B 352 LEU B 353 AB3 1 ARG B 389 ? TYR B 390 ? ARG B 389 TYR B 390 AB3 2 PRO B 396 ? VAL B 397 ? PRO B 396 VAL B 397 AB4 1 ASP B 474 ? LEU B 477 ? ASP B 474 LEU B 477 AB4 2 THR B 404 ? THR B 407 ? THR B 404 THR B 407 AB4 3 MET B 505 ? ALA B 506 ? MET B 505 ALA B 506 AB4 4 PHE B 754 ? MET B 763 ? PHE B 754 MET B 763 AB4 5 ASP B 521 ? SER B 536 ? ASP B 521 SER B 536 AB4 6 ALA B 725 ? ASP B 729 ? ALA B 725 ASP B 729 AB4 7 PHE B 680 ? GLY B 681 ? PHE B 680 GLY B 681 AB5 1 ASP B 474 ? LEU B 477 ? ASP B 474 LEU B 477 AB5 2 THR B 404 ? THR B 407 ? THR B 404 THR B 407 AB5 3 MET B 505 ? ALA B 506 ? MET B 505 ALA B 506 AB5 4 PHE B 754 ? MET B 763 ? PHE B 754 MET B 763 AB5 5 ASP B 521 ? SER B 536 ? ASP B 521 SER B 536 AB5 6 LYS B 744 ? VAL B 746 ? LYS B 744 VAL B 746 AB6 1 ILE B 415 ? GLU B 417 ? ILE B 415 GLU B 417 AB6 2 LEU B 452 ? LYS B 455 ? LEU B 452 LYS B 455 AB6 3 VAL B 431 ? CYS B 433 ? VAL B 431 CYS B 433 AB7 1 GLN C 59 ? VAL C 65 ? GLN C 59 VAL C 65 AB7 2 ILE C 26 ? VAL C 32 ? ILE C 26 VAL C 32 AB7 3 VAL C 87 ? VAL C 92 ? VAL C 87 VAL C 92 AB7 4 VAL C 118 ? GLY C 120 ? VAL C 118 GLY C 120 AB7 5 PHE C 137 ? ARG C 139 ? PHE C 137 ARG C 139 AB8 1 LYS C 193 ? PHE C 197 ? LYS C 193 PHE C 197 AB8 2 ILE C 163 ? SER C 168 ? ILE C 163 SER C 168 AB8 3 VAL C 218 ? SER C 222 ? VAL C 218 SER C 222 AB9 1 ILE C 266 ? LEU C 271 ? ILE C 266 LEU C 271 AB9 2 TYR C 351 ? GLN C 357 ? TYR C 351 GLN C 357 AB9 3 LYS C 360 ? ASN C 368 ? LYS C 360 ASN C 368 AB9 4 HIS C 371 ? ILE C 373 ? HIS C 371 ILE C 373 AC1 1 LYS C 329 ? TYR C 330 ? LYS C 329 TYR C 330 AC1 2 VAL C 338 ? GLU C 339 ? VAL C 338 GLU C 339 AC2 1 TYR C 474 ? LEU C 478 ? TYR C 474 LEU C 478 AC2 2 LEU C 398 ? THR C 402 ? LEU C 398 THR C 402 AC2 3 MET C 512 ? ILE C 513 ? MET C 512 ILE C 513 AC2 4 GLY C 761 ? MET C 762 ? GLY C 761 MET C 762 AC2 5 GLU C 528 ? PHE C 529 ? GLU C 528 PHE C 529 AC3 1 TYR C 410 ? LYS C 412 ? TYR C 410 LYS C 412 AC3 2 VAL C 451 ? TYR C 456 ? VAL C 451 TYR C 456 AC3 3 VAL C 434 ? GLY C 438 ? 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THR D 339 TRP D 340 AD1 2 ARG D 343 ? ASP D 344 ? ARG D 343 ASP D 344 AD2 1 HIS D 402 ? THR D 407 ? HIS D 402 THR D 407 AD2 2 SER D 472 ? LEU D 477 ? SER D 472 LEU D 477 AD3 1 ILE D 415 ? GLU D 417 ? ILE D 415 GLU D 417 AD3 2 LEU D 452 ? LYS D 455 ? LEU D 452 LYS D 455 AD3 3 VAL D 431 ? CYS D 433 ? VAL D 431 CYS D 433 AD4 1 MET D 505 ? ALA D 506 ? MET D 505 ALA D 506 AD4 2 PHE D 754 ? MET D 763 ? PHE D 754 MET D 763 AD4 3 ASP D 521 ? VAL D 535 ? ASP D 521 VAL D 535 AD4 4 ALA D 725 ? ASP D 729 ? ALA D 725 ASP D 729 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O VAL A 65 ? 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RELION 3.1 'IMAGE ACQUISITION' ? 21 ? ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied NO # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Chinese Academy of Sciences' _pdbx_audit_support.country China _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero E 3 NAG 1 E NAG 1 A NAG 901 n E 3 NAG 2 E NAG 2 A NAG 902 n F 3 NAG 1 G NAG 1 A NAG 905 n F 3 NAG 2 G NAG 2 A NAG 906 n G 4 NAG 1 N NAG 1 A NAG 921 n G 4 NAG 2 N NAG 2 A NAG 922 n G 4 MAN 3 N MAN 3 A MAN 923 n H 4 NAG 1 R NAG 1 B NAG 902 n H 4 NAG 2 R NAG 2 B NAG 903 n H 4 MAN 3 R MAN 3 B MAN 904 n I 3 NAG 1 V NAG 1 C NAG 905 n I 3 NAG 2 V NAG 2 C NAG 906 n J 3 NAG 1 X NAG 1 C NAG 913 n J 3 NAG 2 X NAG 2 C NAG 914 n K 4 NAG 1 c NAG 1 C NAG 921 n K 4 NAG 2 c NAG 2 C NAG 922 n K 4 MAN 3 c MAN 3 C MAN 923 n L 3 NAG 1 g NAG 1 D NAG 902 n L 3 NAG 2 g NAG 2 D NAG 903 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 3 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 3 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 3 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 4 DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 4 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 4 3 MAN C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 MAN 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #