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'Drosophila melanogaster' 7227 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A1ZAW0_DROME A1ZAW0 ? 1 ;MEDVEIKPRGYQLRLVDHLTKSNGIVYLPTGSGKTFVAILVLKRFSQDFDKPIESGGKRALFMCNTVELARQQAMAVRRC TNFKVGFYVGEQGVDDWTRGMWSDEIKKNQVLVGTAQVFLDMVTQTYVALSSLSVVIIDECHHGTGHHPFREFMRLFTIA NQTKLPRVVGLTGVLIKGNEITNVATKLKELEITYRGNIITVSDTKEMENVMLYATKPTEVMVSFPHQEQVLTVTRLISA EIEKFYVSLDLMNIGVQPIRRSKSLQCLRDPSKKSFVKQLFNDFLYQMKEYGIYAASIAIISLIVEFDIKRRQAETLSVK LMHRTALTLCEKIRHLLVQKLQDMTYDDDDDNVNTEEVIMNFSTPKVQRFLMSLKVSFADKDPKDICCLVFVERRYTCKC IYGLLLNYIQSTPELRNVLTPQFMVGRNNISPDFESVLERKWQKSAIQQFRDGNANLMICSSVLEEGIDVQACNHVFILD PVKTFNMYVQSKGRARTTEAKFVLFTADKEREKTIQQIYQYRKAHNDIAEYLKDRVLEKTEPELYEIKGHFQDDIDPFTN ENGAVLLPNNALAILHRYCQTIPTDAFGFVIPWFHVLQEDERDRIFGVSAKGKHVISINMPVNCMLRDTIYSDPMDNVKT AKISAAFKACKVLYSLGELNERFVPKTLKERVASIADVHFEHWNKYGDSVTATVNKADKSKDRTYKTECPLEFYDALPRV GEICYAYEIFLEPQFESCEYTEHMYLNLQTPRNYAILLRNKLPRLAEMPLFSNQGKLHVRVANAPLEVIIQNSEQLELLH QFHGMVFRDILKIWHPFFVLDRRSKENSYLVVPLILGAGEQKCFDWELMTNFRRLPQSHGSNVQQREQQPAPRPEDFEGK IVTQWYANYDKPMLVTKVHRELTPLSYMEKNQQDKTYYEFTMSKYGNRIGDVVHKDKFMIEVRDLTEQLTFYVHNRGKFN AKSKAKMKVILIPELCFNFNFPGDLWLKLIFLPSILNRMYFLLHAEALRKRFNTYLNLHLLPFNGTDYMPRPLEIDYSLK RNVDPLGNVIPTEDIEEPKSLLEPMPTKSIEASVANLEITEFENPWQKYMEPVDLSRNLLSTYPVELDYYYHFSVGNVCE MNEMDFEDKEYWAKNQFHMPTGNIYGNRTPAKTNANVPALMPSKPTVRGKVKPLLILQKTVSKEHITPAEQGEFLAAITA SSAADVFDMERLEILGDSFLKLSATLYLASKYSDWNEGTLTEVKSKLVSNRNLLFCLIDADIPKTLNTIQFTPRYTWLPP GISLPHNVLALWRENPEFAKIIGPHNLRDLALGDEESLVKGNCSDINYNRFVEGCRANGQSFYAGADFSSEVNFCVGLVT IPNKVIADTLEALLGVIVKNYGLQHAFKMLEYFKICRADIDKPLTQLLNLELGGKKMRANVNTTEIDGFLINHYYLEKNL GYTFKDRRYLLQALTHPSYPTNRITGSYQELEFIGDAILDFLISAYIFENNTKMNPGALTDLRSALVNNTTLACICVRHR LHFFILAENAKLSEIISKFVNFQESQGHRVTNYVRILLEEADVQPTPLDLDDELDMTELPHANKCISQEAEKGVPPKGEF NMSTNVDVPKALGDVLEALIAAVYLDCRDLQRTWEVIFNLFEPELQEFTRKVPINHIRQLVEHKHAKPVFSSPIVEGETV MVSCQFTCMEKTIKVYGFGSNKDQAKLSAAKHALQQLSKCDA ; 1 2 UNP M9MRT5_DROME M9MRT5 ? 2 ;MDQENFHGSSLPQQLQNLHIQPQQASPNPVQTGFAPRRHYNNLVGLGNGNAVSGSPVKGAPLGQRHVKLKKEKISAQVAQ LSQPGQLQLSDVGDPALAGGSGLQGGVGLMGVILPSDEALKFVSETDANGLAMKTPVSILQELLSRRGITPGYELVQIEG AIHEPTFRFRVSFKDKDTPFTAMGAGRSKKEAKHAAARALIDKLIGAQLPESPSSSAGPSVTGLTVAGSGGDGNANATGG GDASDKTVGNPIGWLQEMCMQRRWPPPSYETETEVGLPHERLFTIACSILNYREMGKGKSKKIAKRLAAHRMWMRLQETP IDSGKISDSICGELEGEVSIIQDIDRYEQVSKDFEFIKI ; 1 3 UNP Q9VLW8_DROME Q9VLW8 ? 3 ;MDNKSAVSALQEFCARTQINLPTYSFIPGEDGGYVCKVELLEIEALGNGRSKRDAKHLAASNILRKIQLLPGIHGLMKDS TVGDLDEELTNLNRDMVKELRDYCVRREMPLPCIEVVQQSGTPSAPEFVACCSVASIVRYGKSDKKKDARQRAAIEMLAL ISSNSDNLRPDQMQVASTSKLKVVDMEESMEELEALRRKKFTTYWELKEAGSVDHTGMRLCDRHNYFKNFYPTLKKEAIE AINSDEYESSKDKAMDVMSSLKITPKISEVESSSLVPLLSVELNCAFDVVLMAKETDIYDHIIDYFRTMLI ; 1 4 PDB 8HF0 8HF0 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8HF0 A 1 ? 1722 ? A1ZAW0 1 ? 1722 ? 1 1722 2 2 8HF0 B 1 ? 359 ? M9MRT5 1 ? 359 ? 1 359 3 3 8HF0 C 1 ? 311 ? Q9VLW8 1 ? 311 ? 1 311 4 1 8HF0 D 1 ? 1722 ? A1ZAW0 1 ? 1722 ? 1 1722 5 3 8HF0 E 1 ? 311 ? Q9VLW8 1 ? 311 ? 1 311 6 4 8HF0 P 1 ? 52 ? 8HF0 1 ? 52 ? 1 52 7 4 8HF0 N 1 ? 52 ? 8HF0 1 ? 52 ? 1 52 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8HF0 ASN A 1217 ? UNP A1ZAW0 ASP 1217 conflict 1217 1 1 8HF0 ASN A 1476 ? UNP A1ZAW0 ASP 1476 conflict 1476 2 4 8HF0 ASN D 1217 ? UNP A1ZAW0 ASP 1217 conflict 1217 3 4 8HF0 ASN D 1476 ? UNP A1ZAW0 ASP 1476 conflict 1476 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8HF0 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8HF0 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 30334 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.562 ? 41488 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.823 ? 4846 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 4733 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4953 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8HF0 _struct.title 'DmDcr-2/R2D2/LoqsPD with 50bp-dsRNA in Dimer state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8HF0 _struct_keywords.text 'Ribonuclease, DOUBLE STRANDED RNA, RNA BINDING PROTEIN-RNA COMPLEX' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 3 ? F N N 4 ? 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