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'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 319 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 144 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 69 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 116 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 51 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 1 146 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 114 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 230 'wild cabbage' 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 1169 ? 'Brassica oleracea' 3712 ? ? ? inflorescence ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 1 1 sample 1 34 'Brassica oleracea' ? 3712 ? 2 1 sample 1 34 'Brassica oleracea' ? 3712 ? 3 1 sample 1 20 'Brassica oleracea' ? 3712 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8HIM 8HIM ? 1 ? 1 2 PDB 8HIM 8HIM ? 2 ? 1 3 PDB 8HIM 8HIM ? 3 ? 1 4 PDB 8HIM 8HIM ? 4 ? 1 5 UNP A0A0D3D418_BRAOL A0A0D3D418 ? 5 ;MDSGATYQRFPKVKIRELKDDYAKFELRDTDVSMANALRRVMISEVPTVAIDLVEIEVNSSVLNDEFIAHRLGLIPLTSE RAMSMRFSRDCDACDGDGQCEFCSVEFRLSAKCVTDQTLDVTSKDLYSADPTVTPVDFGDSSGADSSEQRGIIIVKLRRG QELKLRAIARKGIGKDHAKWSPAATVTFMYEPDIIINEDMMDTLTDDEKIDLIESSPTKVFDFDAVTRQVVVVDPEAYTY DEEVIKKAEAMGKQGLIEIRPKDDSFIFTVESTGAVKASQLVLNAIDLLKQKLDAVRLSDDTVEADDQFGELGAHMRGG ; 1 6 UNP A0A0D3BZZ8_BRAOL A0A0D3BZZ8 ? 6 ;MAEDDYNEVDDLGYEDEPAEPEIEEGIEEDADMKDNDDINGEPLETEDKVDTEPVQRPRKTSKFMTKYERARILGTRALQ ISMNAPVMVELEGETDPLEIAMKELRQRKIPFTIRRYLPDGSFEEWGVDELIVEDSWKRQVGGD ; 1 7 UNP A0A0D3AAT3_BRAOL A0A0D3AAT3 ? 7 MIIPVRCFTCGKVIGNKWDTYLDLLQADYTEGDALDAIGLVRYCCRRMLMTHVDLIEKLLNYNTLEKSD 1 8 UNP A0A0D3DS91_BRAOL A0A0D3DS91 ? 8 ;MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREDHTIGNIVRMQLHRDENVLFAGYQLPHPLKYKIIVRIHTTSQ SSPMQAYNQAINDLDKELDFLKSQFEAEVAKFSNPY ; 1 9 UNP A0A0D2ZPP3_BRAOL A0A0D2ZPP3 ? 9 MDQQSEPVTYVCGDCGQKNTLKSGDVIQCRERGYRILYKKRTRRVVQYEAR 1 10 UNP A0A0D3DUD8_BRAOL A0A0D3DUD8 ? 10 ;MASSIIMFEDIFVVDKLDPDGKKFDKVTRIEATSHNLDMFMHLDVNTEVYPMAVGDKFTLAMAPTLNLDGTPDTGYFTPG AKKTLADKYEYVMHGKLYKITERDGQTPKAEMYVSFGGLLMLLRGDPAHISHFELDQRLFLLMRKL ; 1 11 UNP A0A3P6GD79_BRAOL A0A3P6GD79 ? 11 ;MSTMKFCRECNNILYPKEDREQSILLYACRNCDHQEAADDNCVYRNEVHHSVSEQTQILSDVASDPTLPRTKAVRCAKCQ HGEAVFFQATARGEEGMTLFFVCCNPNCGHRWRE ; 1 12 PDB 8HIM 8HIM ? 12 ? 1 13 PDB 8HIM 8HIM ? 13 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8HIM T 1 ? 34 ? 8HIM 1 ? 34 ? 1 34 2 2 8HIM N 1 ? 34 ? 8HIM 1 ? 34 ? 1 34 3 3 8HIM P 1 ? 20 ? 8HIM 1 ? 20 ? 1 20 4 4 8HIM A 1 ? 2032 ? 8HIM 1 ? 2032 ? 1 2032 5 5 8HIM C 1 ? 319 ? 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UNP A0A0D2ZPP3 LYS 18 variant 18 3 9 8HIM CYS L 32 ? UNP A0A0D2ZPP3 ARG 32 variant 32 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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ALA A 773 ARG A 787 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO D 827 ? SER D 847 ? PRO A 827 SER A 847 1 ? 21 HELX_P HELX_P21 AC3 SER D 848 ? LEU D 863 ? SER A 848 LEU A 863 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 AC4 THR D 872 ? ASP D 874 ? THR A 872 ASP A 874 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 CYS D 884 ? LYS D 888 ? CYS A 884 LYS A 888 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 CYS D 891 ? LYS D 904 ? CYS A 891 LYS A 904 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS D 909 ? THR D 911 ? LYS A 909 THR A 911 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN D 942 ? TRP D 949 ? ASN A 942 TRP A 949 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 SER D 952 ? LYS D 970 ? SER A 952 LYS A 970 1 ? 19 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA D 975 ? LYS D 979 ? ALA A 975 LYS A 979 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU D 1017 ? THR D 1027 ? LEU A 1017 THR A 1027 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 THR D 1027 ? GLU D 1034 ? THR A 1027 GLU A 1034 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY D 1085 ? CYS D 1095 ? GLY A 1085 CYS A 1095 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 SER D 1111 ? GLY D 1120 ? SER A 1111 GLY A 1120 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY D 1120 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DT 20 O4 ? ? ? 1_555 C A 17 N6 ? ? T DT 20 P A 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DG 21 N1 ? ? ? 1_555 C C 16 N3 ? ? T DG 21 P C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A DG 21 N2 ? ? ? 1_555 C C 16 O2 ? ? T DG 21 P C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A DG 21 O6 ? ? ? 1_555 C C 16 N4 ? ? T DG 21 P C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A DG 22 N1 ? ? ? 1_555 C C 15 N3 ? ? T DG 22 P C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A DG 22 N2 ? ? ? 1_555 C C 15 O2 ? ? T DG 22 P C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A DG 22 O6 ? ? ? 1_555 C C 15 N4 ? ? T DG 22 P C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A DT 23 N3 ? ? ? 1_555 C A 14 N1 ? ? T DT 23 P A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A DT 23 O4 ? ? ? 1_555 C A 14 N6 ? ? T DT 23 P A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A DC 24 N3 ? ? ? 1_555 C G 13 N1 ? ? T DC 24 P G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A DC 24 N4 ? ? ? 1_555 C G 13 O6 ? ? T DC 24 P G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A DC 24 O2 ? ? ? 1_555 C G 13 N2 ? ? T DC 24 P G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? A DA 25 N1 ? ? ? 1_555 C A 12 N6 ? ? T DA 25 P A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-A MISPAIR' ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? A DT 26 N3 ? ? ? 1_555 C A 11 N1 ? ? T DT 26 P A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? A DT 26 O4 ? ? ? 1_555 C A 11 N6 ? ? T DT 26 P A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? A DA 28 N1 ? ? ? 1_555 B DT 7 N3 ? ? T DA 28 N DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? A DA 28 N6 ? ? ? 1_555 B DT 7 O4 ? ? T DA 28 N DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? A DC 29 N3 ? ? ? 1_555 B DG 6 N2 ? ? T DC 29 N DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? A DC 29 O2 ? ? ? 1_555 B DT 7 N3 ? ? T DC 29 N DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DT MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 8 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 9 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 7 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 8 ? 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