data_8HMZ # _entry.id 8HMZ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.368 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8HMZ pdb_00008hmz 10.2210/pdb8hmz/pdb WWPDB D_1300033960 ? ? EMDB EMD-34905 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of the human post-catalytic TSEN/pre-tRNA complex' _pdbx_database_related.db_id EMD-34905 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8HMZ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-12-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBC _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhang, X.' 1 ? 'Yang, F.' 2 ? 'Zhan, X.' 3 ? 'Shi, Y.' 4 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 83 _citation.language ? _citation.page_first 1328 _citation.page_last 1339.e4 _citation.title 'Structural basis of pre-tRNA intron removal by human tRNA splicing endonuclease.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2023.03.015 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37028420 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhang, X.' 1 ? primary 'Yang, F.' 2 ? primary 'Zhan, X.' 3 ? primary 'Bian, T.' 4 ? primary 'Xing, Z.' 5 ? primary 'Lu, Y.' 6 ? primary 'Shi, Y.' 7 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8HMZ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8HMZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2' 55459.012 1 4.6.1.16 ? ? ? 2 polymer man 'tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34' 35827.004 1 4.6.1.16 ? ? ? 3 polymer man 'tRNA-splicing endonuclease subunit Sen54' 61032.340 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Chromosome 1 open reading frame 19, isoform CRA_a' 22796.555 1 ? ? ? ? 5 polymer syn ;Pre-tRNA 5' END ; 23327.805 1 ? ? ? ? 6 polymer syn ;Pre-tRNA 3' END ; 13488.029 1 ? ? ? ? 7 polymer man ;Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1 ; 49837.504 1 2.7.1.78 ? ? ;Author stated that for the low map coverage of chain E, this is caused mainly by the weakness of EM density map of chain E. The chain E could be modelled in the low-pass filtered EM map. ; 8 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 6 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'tRNA-intron endonuclease Sen2,HsSen2' 2 'Leukocyte receptor cluster member 5,tRNA-intron endonuclease Sen34,HsSen34' 3 'SEN54 homolog,HsSEN54,tRNA-intron endonuclease Sen54' 4 'tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15' 7 'Polyadenylation factor Clp1,Polynucleotide kinase Clp1,Pre-mRNA cleavage complex II protein Clp1' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMAEAVFHAPKRKRRVYETYESPLPIPFGQDHGPLKEFKIFRAEMINNNVIVRNAEDIEQL YGKGYFGKGILSRSRPSFTISDPKLVAKWKDMKTNMPIITSKRYQHSVEWAAELMRRQGQDESTVRRILKDYTKPLEHPP VKRNEEAQVHDKLNSGMVSNMEGTAGGERPSVVNGDSGKSGGVGDPREPLGCLQEGSGCHPTTESFEKSVREDASPLPHV CCCKQDALILQRGLHHEDGSQHIGLLHPGDRGPDHEYVLVEEAECAMSEREAAPNEELVQRNRLICRRNPYRIFEYLQLS LEEAFFLVYALGCLSIYYEKEPLTIVKLWKAFTVVQPTFRTTYMAYHYFRSKGWVPKVGLKYGTDLLLYRKGPPFYHASY SVIIELVDDHFEGSLRRPLSWKSLAALSRVSVNVSKELMLCYLIKPSTMTDKEMESPECMKRIKVQEVILSRWVSSRERS DQDDL ; ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMAEAVFHAPKRKRRVYETYESPLPIPFGQDHGPLKEFKIFRAEMINNNVIVRNAEDIEQL YGKGYFGKGILSRSRPSFTISDPKLVAKWKDMKTNMPIITSKRYQHSVEWAAELMRRQGQDESTVRRILKDYTKPLEHPP VKRNEEAQVHDKLNSGMVSNMEGTAGGERPSVVNGDSGKSGGVGDPREPLGCLQEGSGCHPTTESFEKSVREDASPLPHV CCCKQDALILQRGLHHEDGSQHIGLLHPGDRGPDHEYVLVEEAECAMSEREAAPNEELVQRNRLICRRNPYRIFEYLQLS LEEAFFLVYALGCLSIYYEKEPLTIVKLWKAFTVVQPTFRTTYMAYHYFRSKGWVPKVGLKYGTDLLLYRKGPPFYHASY SVIIELVDDHFEGSLRRPLSWKSLAALSRVSVNVSKELMLCYLIKPSTMTDKEMESPECMKRIKVQEVILSRWVSSRERS DQDDL ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMLVVEVANGRSLVWGAEAVQALRERLGVGGRTVGALPRGPRQNSRLGLPLLLMPEEARLL AEIGAVTLVSAPRPDSRHHSLALTSFKRQQEESFQEQSALAAEARETRRQELLEKITEGQAAKKQKLEQASGASSSQEAG SSQAAKEDETSDGQASGEQEEAGPSSSQAGPSNGVAPLPRSALLVQLATARPRPVKARPLDWRVQSKDWPHAGRPAHELR YSIYRDLWERGFFLSAAGKFGGDFLVYPGDPLRFHAHYIAQCWAPEDTIPLQDLVAAGRLGTSVRKTLLLCSPQPDGKVV YTSLQWASLQ ; ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMLVVEVANGRSLVWGAEAVQALRERLGVGGRTVGALPRGPRQNSRLGLPLLLMPEEARLL AEIGAVTLVSAPRPDSRHHSLALTSFKRQQEESFQEQSALAAEARETRRQELLEKITEGQAAKKQKLEQASGASSSQEAG SSQAAKEDETSDGQASGEQEEAGPSSSQAGPSNGVAPLPRSALLVQLATARPRPVKARPLDWRVQSKDWPHAGRPAHELR YSIYRDLWERGFFLSAAGKFGGDFLVYPGDPLRFHAHYIAQCWAPEDTIPLQDLVAAGRLGTSVRKTLLLCSPQPDGKVV YTSLQWASLQ ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMEPEPEPAAVEVPAGRVLSARELFAARSRSQKLPQRSHGPKDFLPDGSAAQAERLRRCRE ELWQLLAEQRVERLGSLVAAEWRPEEGFVELKSPAGKFWQTMGFSEQGRQRLHPEEALYLLECGSIHLFHQDLPLSIQEA YQLLLTDHTVTFLQYQVFSHLKRLGYVVRRFQPSSVLSPYERQLNLDASVQHLEDGDGKRKRSSSSPRSINKKAKALDNS LQPKSLAASSPPPCSQPSQCPEEKPQESSPMKGPGGPFQLLGSLGPSPGPAREGVGCSWESGRAENGVTGAGKRRWNFEQ 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LKASRKLQGDPDLPMSFTLAIVESDSTIVYYKLTDGFMLPDPQVSFENISLRR ; ;MASSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEKGSAAAMEERGDSEPTPGCSGLGPGGVRGFGDGGGAPSWAPEDAWMGT HPKYLEMMELDIGDATQVYVAFLVYLDLMESKSWHEVNCVGLPELQLICLVGTEIEGEGLQTVVPTPITASLSHNRIREI LKASRKLQGDPDLPMSFTLAIVESDSTIVYYKLTDGFMLPDPQVSFENISLRR ; D ? 5 polyribonucleotide no yes 'UAAUACGACUCACUAUAGGGGGCUCUGUGGCGCAAUGGAUAGCGCAUUGGACUUCUAGUGACGAAUAGAGC(A23)' UAAUACGACUCACUAUAGGGGGCUCUGUGGCGCAAUGGAUAGCGCAUUGGACUUCUAGUGACGAAUAGAGCA 5 ? 6 polyribonucleotide no no AUUCAAAGGUUGUGGGUUCGAAUCCCACCAGAGUCGGAUAUC AUUCAAAGGUUGUGGGUUCGAAUCCCACCAGAGUCGGAUAUC 3 ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMGEEANDDKKPTTKFELERETELRFEVEASQSVQLELLTGMAEIFGTELTRNKKFTFDAG AKVAVFTWHGCSVQLSGRTEVAYVSKDTPMLLYLNTHTALEQMRRQAEKEEERGPRVMVVGPTDVGKSTVCRLLLNYAVR LGRRPTYVELDVGQGSVSIPGTMGALYIERPADVEEGFSIQAPLVYHFGSTTPGTNIKLYNKITSRLADVFNQRCEVNRR ASVSGCVINTCGWVKGSGYQALVHAASAFEVDVVVVLDQERLYNELKRDLPHFVRTVLLPKSGGVVERSKDFRRECRDER IREYFYGFRGCFYPHAFNVKFSDVKIYKVGAPTIPDSCLPLGMSQEDNQLKLVPVTPGRDMVHHLLSVSTAEGTEENLSE TSVAGFIVVTSVDLEHQVFTVLSPAPRPLPKNFLLIMDIRFMDLK ; ;MASDYKDDDDKASDEVDAGTMGEEANDDKKPTTKFELERETELRFEVEASQSVQLELLTGMAEIFGTELTRNKKFTFDAG AKVAVFTWHGCSVQLSGRTEVAYVSKDTPMLLYLNTHTALEQMRRQAEKEEERGPRVMVVGPTDVGKSTVCRLLLNYAVR LGRRPTYVELDVGQGSVSIPGTMGALYIERPADVEEGFSIQAPLVYHFGSTTPGTNIKLYNKITSRLADVFNQRCEVNRR ASVSGCVINTCGWVKGSGYQALVHAASAFEVDVVVVLDQERLYNELKRDLPHFVRTVLLPKSGGVVERSKDFRRECRDER IREYFYGFRGCFYPHAFNVKFSDVKIYKVGAPTIPDSCLPLGMSQEDNQLKLVPVTPGRDMVHHLLSVSTAEGTEENLSE TSVAGFIVVTSVDLEHQVFTVLSPAPRPLPKNFLLIMDIRFMDLK ; E ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 SER n 1 4 ASP n 1 5 TYR n 1 6 LYS n 1 7 ASP n 1 8 ASP n 1 9 ASP n 1 10 ASP n 1 11 LYS n 1 12 ALA n 1 13 SER n 1 14 ASP n 1 15 GLU n 1 16 VAL n 1 17 ASP n 1 18 ALA n 1 19 GLY n 1 20 THR n 1 21 MET n 1 22 ALA n 1 23 GLU n 1 24 ALA n 1 25 VAL n 1 26 PHE n 1 27 HIS n 1 28 ALA n 1 29 PRO n 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GLY E 358 VAL E 362 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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F U 13 O4 ? ? ? 1_555 F A 27 N6 ? ? 3 U 65 3 A 79 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? F G 14 N1 ? ? ? 1_555 F C 26 N3 ? ? 3 G 66 3 C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? F G 14 N2 ? ? ? 1_555 F C 26 O2 ? ? 3 G 66 3 C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? F G 14 O6 ? ? ? 1_555 F C 26 N4 ? ? 3 G 66 3 C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? F G 15 N1 ? ? ? 1_555 F C 25 N3 ? ? 3 G 67 3 C 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? F G 15 N2 ? ? ? 1_555 F C 25 O2 ? ? 3 G 67 3 C 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? F G 15 O6 ? ? ? 1_555 F C 25 N4 ? ? 3 G 67 3 C 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? F G 16 N1 ? ? ? 1_555 F C 24 N3 ? ? 3 G 68 3 C 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? F G 16 N2 ? ? ? 1_555 F C 24 O2 ? ? 3 G 68 3 C 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? 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E C 23 O2 ? ? ? 1_555 F G 33 N2 ? ? 5 C 3 3 G 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? E U 24 N3 ? ? ? 1_555 F A 32 N1 ? ? 5 U 4 3 A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? E U 24 O4 ? ? ? 1_555 F A 32 N6 ? ? 5 U 4 3 A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? E C 25 N3 ? ? ? 1_555 F G 31 N1 ? ? 5 C 5 3 G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? E C 25 N4 ? ? ? 1_555 F G 31 O6 ? ? 5 C 5 3 G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? E C 25 O2 ? ? ? 1_555 F G 31 N2 ? ? 5 C 5 3 G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? E U 26 N3 ? ? ? 1_555 F A 30 N1 ? ? 5 U 6 3 A 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? E U 26 O4 ? ? ? 1_555 F A 30 N6 ? ? 5 U 6 3 A 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? E G 27 N1 ? ? ? 1_555 F C 29 N3 ? ? 5 G 7 3 C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? E G 27 N2 ? ? ? 1_555 F C 29 O2 ? ? 5 G 7 3 C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? E G 27 O6 ? ? ? 1_555 F C 29 N4 ? ? 5 G 7 3 C 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? E U 28 N3 ? ? ? 1_555 E A 34 N7 ? ? 5 U 8 5 A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? E U 28 O2 ? ? ? 1_555 E A 34 N6 ? ? 5 U 8 5 A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? E G 29 N7 ? ? ? 1_555 E C 43 N4 ? ? 5 G 9 5 C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? E G 30 O6 ? ? ? 1_555 F G 8 N2 ? ? 5 G 10 3 G 60 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? E G 30 N1 ? ? ? 1_555 E C 45 N3 ? ? 5 G 10 5 C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? E G 30 N2 ? ? ? 1_555 E C 45 O2 ? ? 5 G 10 5 C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? E G 30 O6 ? ? ? 1_555 E C 45 N4 ? ? 5 G 10 5 C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? E C 31 N3 ? ? ? 1_555 E G 44 N1 ? ? 5 C 11 5 G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? E C 31 N4 ? ? ? 1_555 E G 44 O6 ? ? 5 C 11 5 G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? E C 31 O2 ? ? ? 1_555 E G 44 N2 ? ? 5 C 11 5 G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? E G 32 N1 ? ? ? 1_555 E C 43 N3 ? ? 5 G 12 5 C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? E G 32 N2 ? ? ? 1_555 E C 43 O2 ? ? 5 G 12 5 C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? E G 32 O6 ? ? ? 1_555 E C 43 N4 ? ? 5 G 12 5 C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? E C 33 N3 ? ? ? 1_555 E G 42 N1 ? ? 5 C 13 5 G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? E C 33 N4 ? ? ? 1_555 E G 42 O6 ? ? 5 C 13 5 G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? E C 33 O2 ? ? ? 1_555 E G 42 N2 ? ? 5 C 13 5 G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? E A 34 N6 ? ? ? 1_555 E A 41 N3 ? ? 5 A 14 5 A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? E A 35 N1 ? ? ? 1_555 F U 11 N3 ? ? 5 A 15 3 U 63 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? E A 35 N6 ? ? ? 1_555 F U 11 O2 ? ? 5 A 15 3 U 63 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? E U 36 O2 ? ? ? 1_555 F A 22 N6 ? ? 5 U 16 3 A 74 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? E G 37 O6 ? ? ? 1_555 E A 39 N6 ? ? 5 G 17 5 A 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? E G 38 N2 ? ? ? 1_555 F U 18 O2 ? ? 5 G 18 3 U 70 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? E G 42 N7 ? ? ? 1_555 F G 9 N1 ? ? 5 G 22 3 G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_7_PAIR ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? E G 42 O6 ? ? ? 1_555 F G 9 N2 ? ? 5 G 22 3 G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_7_PAIR ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? E G 44 O6 ? ? ? 1_555 F G 8 N2 ? ? 5 G 24 3 G 60 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? E A 46 N6 ? ? ? 1_555 F A 7 N1 ? ? 5 A 26 3 A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? E U 47 N3 ? ? ? 1_555 F A 6 N1 ? ? 5 U 27 3 A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? E U 47 O4 ? ? ? 1_555 F A 6 N6 ? ? 5 U 27 3 A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? E U 48 N3 ? ? ? 1_555 F A 5 N1 ? ? 5 U 28 3 A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? E U 48 O4 ? ? ? 1_555 F A 5 N6 ? ? 5 U 28 3 A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? E G 49 N1 ? ? ? 1_555 F C 4 N3 ? ? 5 G 29 3 C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? E G 49 N2 ? ? ? 1_555 F C 4 O2 ? ? 5 G 29 3 C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? E G 49 O6 ? ? ? 1_555 F C 4 N4 ? ? 5 G 29 3 C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? E G 50 N1 ? ? ? 1_555 F U 3 O2 ? ? 5 G 30 3 U 55 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog68 hydrog ? ? 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'A-A MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 68 B . ? LEU 48 B PRO 69 B ? PRO 49 B 1 4.18 2 ARG 427 G . ? ARG 407 E PRO 428 G ? PRO 408 E 1 -7.26 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 10 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 10 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? parallel AA3 8 9 ? anti-parallel AA3 9 10 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA8 7 8 ? parallel AA8 8 9 ? anti-parallel AA8 9 10 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB5 6 7 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 88 ? 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ASP A 408 ? ALA A 378 ASP A 388 AA4 4 GLU A 437 ? LYS A 445 ? GLU A 417 LYS A 425 AA4 5 LYS A 464 ? ARG A 472 ? LYS A 444 ARG A 452 AA4 6 GLN C 448 ? THR C 449 ? GLN C 428 THR C 429 AA5 1 LEU B 70 ? LEU B 72 ? LEU B 50 LEU B 52 AA5 2 ARG B 30 ? VAL B 33 ? ARG B 10 VAL B 13 AA5 3 VAL B 24 ? ALA B 27 ? VAL B 4 ALA B 7 AA5 4 LEU B 88 ? SER B 90 ? LEU B 68 SER B 70 AA6 1 LEU B 204 ? LEU B 207 ? LEU B 184 LEU B 187 AA6 2 ARG C 90 ? ARG C 93 ? ARG C 70 ARG C 73 AA7 1 VAL B 215 ? ALA B 217 ? VAL B 195 ALA B 197 AA7 2 VAL C 30 ? VAL C 32 ? VAL C 10 VAL C 12 AA8 1 PHE B 253 ? ALA B 256 ? PHE B 233 ALA B 236 AA8 2 PHE B 264 ? TYR B 267 ? PHE B 244 TYR B 247 AA8 3 TYR B 278 ? CYS B 282 ? TYR B 258 CYS B 262 AA8 4 THR B 307 ? PRO B 313 ? THR B 287 PRO B 293 AA8 5 VAL B 319 ? TRP B 326 ? VAL B 299 TRP B 306 AA8 6 ILE D 188 ? THR D 194 ? ILE D 150 THR D 156 AA8 7 SER D 176 ? VAL D 182 ? SER D 138 VAL D 144 AA8 8 GLN D 141 ? PRO D 147 ? GLN D 103 PRO D 109 AA8 9 LEU D 127 ? THR D 133 ? 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