data_8HPQ # _entry.id 8HPQ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.383 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8HPQ pdb_00008hpq 10.2210/pdb8hpq/pdb WWPDB D_1300034099 ? ? EMDB EMD-34940 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-01-31 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _database_PDB_caveat.id 1 _database_PDB_caveat.text 'There are polymer geometry and linkage errors' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8HPQ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-12-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBC _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 S-trimer in complex with fab L4.65 and L5.34' _pdbx_database_related.db_id EMD-34940 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email ls199236@sina.com _pdbx_contact_author.name_first Sheng _pdbx_contact_author.name_last Liu _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-8109-9772 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Gao, G.F.' 1 ? 'Liu, S.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Cell Discov' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2056-5968 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 9 _citation.language ? _citation.page_first 79 _citation.page_last 79 _citation.title ;Dosing interval regimen shapes potency and breadth of antibody repertoire after vaccination of SARS-CoV-2 RBD protein subunit vaccine. ; _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41421-023-00585-5 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37507370 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Guo, S.' 1 ? primary 'Zheng, Y.' 2 ? primary 'Gao, Z.' 3 ? primary 'Duan, M.' 4 ? primary 'Liu, S.' 5 ? primary 'Du, P.' 6 ? primary 'Xu, X.' 7 ? primary 'Xu, K.' 8 ? primary 'Zhao, X.' 9 0000-0002-2001-1343 primary 'Chai, Y.' 10 ? primary 'Wang, P.' 11 0000-0001-7737-181X primary 'Zhao, Q.' 12 ? primary 'Gao, G.F.' 13 0000-0002-3869-615X primary 'Dai, L.' 14 0000-0001-8352-1327 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man ;Spike protein S2' ; 125336.180 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'fab L4.65' 24953.938 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'fab L4.65' 23556.061 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'fab L5.34' 23592.424 3 ? ? ? ? 5 polymer man 'fab L5.34' 23379.928 3 ? ? ? ? 6 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 3 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QCVNLITRTQSYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAISGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKS NIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMD LEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGW TAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPF DEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNFAPFFAFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGNEVSQIAPGQTGNI ADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNKLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGNKPCNGVAGVNCYFPLQSYGFR PTYGVGHQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRD PQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEYVNN SYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDC 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MNSLRAEDTAVYYCARESGGFPLAEGAFDIWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; M,E,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVSITCRASQSISTHLHWYQQKPGKAPKLLISAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTITSLQP EDFATYYCQQSYSTPRGLSFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVSITCRASQSISTHLHWYQQKPGKAPKLLISAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTITSLQP EDFATYYCQQSYSTPRGLSFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; N,F,S ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 6 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 CYS n 1 3 VAL n 1 4 ASN n 1 5 LEU n 1 6 ILE n 1 7 THR n 1 8 ARG n 1 9 THR n 1 10 GLN n 1 11 SER n 1 12 TYR n 1 13 THR n 1 14 ASN n 1 15 SER n 1 16 PHE n 1 17 THR n 1 18 ARG n 1 19 GLY n 1 20 VAL n 1 21 TYR n 1 22 TYR n 1 23 PRO n 1 24 ASP n 1 25 LYS n 1 26 VAL n 1 27 PHE n 1 28 ARG n 1 29 SER n 1 30 SER n 1 31 VAL n 1 32 LEU n 1 33 HIS n 1 34 SER n 1 35 THR n 1 36 GLN n 1 37 ASP n 1 38 LEU n 1 39 PHE n 1 40 LEU n 1 41 PRO n 1 42 PHE n 1 43 PHE n 1 44 SER n 1 45 ASN n 1 46 VAL n 1 47 THR n 1 48 TRP n 1 49 PHE n 1 50 HIS n 1 51 ALA n 1 52 ILE n 1 53 SER n 1 54 GLY n 1 55 THR n 1 56 ASN n 1 57 GLY n 1 58 THR n 1 59 LYS n 1 60 ARG n 1 61 PHE n 1 62 ASP n 1 63 ASN n 1 64 PRO n 1 65 VAL n 1 66 LEU n 1 67 PRO n 1 68 PHE n 1 69 ASN n 1 70 ASP n 1 71 GLY n 1 72 VAL n 1 73 TYR n 1 74 PHE n 1 75 ALA n 1 76 SER n 1 77 THR n 1 78 GLU n 1 79 LYS n 1 80 SER n 1 81 ASN n 1 82 ILE n 1 83 ILE n 1 84 ARG n 1 85 GLY n 1 86 TRP n 1 87 ILE n 1 88 PHE n 1 89 GLY n 1 90 THR n 1 91 THR n 1 92 LEU n 1 93 ASP n 1 94 SER n 1 95 LYS n 1 96 THR n 1 97 GLN n 1 98 SER n 1 99 LEU n 1 100 LEU n 1 101 ILE n 1 102 VAL n 1 103 ASN n 1 104 ASN n 1 105 ALA n 1 106 THR n 1 107 ASN n 1 108 VAL n 1 109 VAL n 1 110 ILE n 1 111 LYS n 1 112 VAL n 1 113 CYS n 1 114 GLU n 1 115 PHE n 1 116 GLN n 1 117 PHE n 1 118 CYS n 1 119 ASN n 1 120 ASP n 1 121 PRO n 1 122 PHE n 1 123 LEU n 1 124 ASP n 1 125 VAL n 1 126 TYR n 1 127 TYR n 1 128 HIS n 1 129 LYS n 1 130 ASN n 1 131 ASN n 1 132 LYS n 1 133 SER n 1 134 TRP n 1 135 MET n 1 136 GLU n 1 137 SER n 1 138 GLU n 1 139 PHE n 1 140 ARG n 1 141 VAL n 1 142 TYR n 1 143 SER n 1 144 SER n 1 145 ALA n 1 146 ASN n 1 147 ASN n 1 148 CYS n 1 149 THR n 1 150 PHE n 1 151 GLU n 1 152 TYR n 1 153 VAL n 1 154 SER n 1 155 GLN n 1 156 PRO n 1 157 PHE n 1 158 LEU n 1 159 MET n 1 160 ASP n 1 161 LEU n 1 162 GLU n 1 163 GLY n 1 164 LYS n 1 165 GLN n 1 166 GLY n 1 167 ASN n 1 168 PHE n 1 169 LYS n 1 170 ASN n 1 171 LEU n 1 172 ARG n 1 173 GLU n 1 174 PHE n 1 175 VAL n 1 176 PHE n 1 177 LYS n 1 178 ASN n 1 179 ILE n 1 180 ASP n 1 181 GLY n 1 182 TYR n 1 183 PHE n 1 184 LYS n 1 185 ILE n 1 186 TYR n 1 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LYS S 185 LYS S 190 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 644 SG ? ? ? 1_555 A CYS 653 SG ? ? A CYS 676 A CYS 685 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 720 SG ? ? ? 1_555 A CYS 742 SG ? ? A CYS 752 A CYS 774 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 725 SG ? ? ? 1_555 A CYS 731 SG ? ? A CYS 757 A CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? A CYS 1014 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1025 SG ? ? A CYS 1046 A CYS 1057 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf14 disulf ? ? A CYS 1064 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1108 SG ? ? A CYS 1096 A CYS 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 97 SG ? ? H CYS 22 H CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 155 SG ? ? ? 1_555 B CYS 211 SG ? ? H CYS 155 H CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 231 SG ? ? ? 1_555 C CYS 215 SG ? ? H CYS 231 L CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf18 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 89 SG ? ? L CYS 23 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf19 disulf ? ? C CYS 135 SG ? ? ? 1_555 C CYS 195 SG ? ? L CYS 135 L CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf20 disulf ? ? D CYS 21 SG ? ? ? 1_555 D CYS 94 SG ? ? M CYS 22 M CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf21 disulf ? ? D CYS 148 SG ? ? ? 1_555 D CYS 204 SG ? ? M CYS 149 M CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf22 disulf ? ? D CYS 224 SG ? ? ? 1_555 E CYS 216 SG ? ? M CYS 225 N CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf23 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf24 disulf ? ? E CYS 136 SG ? ? ? 1_555 E CYS 196 SG ? ? N CYS 136 N CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf25 disulf ? ? F CYS 2 SG ? ? ? 1_555 F CYS 118 SG ? ? B CYS 34 B CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf26 disulf ? ? F CYS 113 SG ? ? ? 1_555 F CYS 148 SG ? ? B CYS 145 B CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf27 disulf ? ? F CYS 273 SG ? ? ? 1_555 F CYS 283 SG ? ? B CYS 305 B CYS 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf28 disulf ? ? F CYS 318 SG ? ? ? 1_555 F CYS 343 SG ? ? B CYS 350 B CYS 375 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf29 disulf ? ? F CYS 361 SG ? ? ? 1_555 F CYS 414 SG ? ? B CYS 393 B CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf30 disulf ? ? F CYS 373 SG ? ? ? 1_555 F CYS 507 SG ? ? B CYS 405 B CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf31 disulf ? ? F CYS 462 SG ? ? ? 1_555 F CYS 470 SG ? ? B CYS 494 B CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf32 disulf ? ? F CYS 520 SG ? ? ? 1_555 F CYS 572 SG ? ? B CYS 552 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf33 disulf ? ? F CYS 599 SG ? ? ? 1_555 F CYS 631 SG ? ? B CYS 631 B CYS 663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf34 disulf ? ? F CYS 644 SG ? ? ? 1_555 F CYS 653 SG ? ? B CYS 676 B CYS 685 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf35 disulf ? ? F CYS 720 SG ? ? ? 1_555 F CYS 742 SG ? ? B CYS 752 B CYS 774 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf36 disulf ? ? F CYS 725 SG ? ? ? 1_555 F CYS 731 SG ? ? B CYS 757 B CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf37 disulf ? ? F CYS 1014 SG ? ? ? 1_555 F CYS 1025 SG ? ? B CYS 1046 B CYS 1057 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf38 disulf ? ? F CYS 1064 SG ? ? ? 1_555 F CYS 1108 SG ? ? B CYS 1096 B CYS 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf39 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 97 SG ? ? P CYS 22 P CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf40 disulf ? ? G CYS 155 SG ? ? ? 1_555 G CYS 211 SG ? ? P CYS 155 P CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf41 disulf ? ? G CYS 231 SG ? ? ? 1_555 H CYS 215 SG ? ? P CYS 231 Q CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf42 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 89 SG ? ? Q CYS 23 Q CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf43 disulf ? ? H CYS 135 SG ? ? ? 1_555 H CYS 195 SG ? ? Q CYS 135 Q CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf44 disulf ? ? I CYS 21 SG ? ? ? 1_555 I CYS 94 SG ? ? E CYS 22 E CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf45 disulf ? ? I CYS 148 SG ? ? ? 1_555 I CYS 204 SG ? ? E CYS 149 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf46 disulf ? ? I CYS 224 SG ? ? ? 1_555 J CYS 216 SG ? ? E CYS 225 F CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf47 disulf ? ? J CYS 23 SG ? ? ? 1_555 J CYS 88 SG ? ? F CYS 23 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf48 disulf ? ? J CYS 136 SG ? ? ? 1_555 J CYS 196 SG ? ? F CYS 136 F CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf49 disulf ? ? K CYS 2 SG ? ? ? 1_555 K CYS 118 SG ? ? C CYS 34 C CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf50 disulf ? ? K CYS 113 SG ? ? ? 1_555 K CYS 148 SG ? ? C CYS 145 C CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf51 disulf ? ? K CYS 273 SG ? ? ? 1_555 K CYS 283 SG ? ? C CYS 305 C CYS 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf52 disulf ? ? K CYS 318 SG ? ? ? 1_555 K CYS 343 SG ? ? C CYS 350 C CYS 375 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf53 disulf ? ? K CYS 361 SG ? ? ? 1_555 K CYS 414 SG ? ? C CYS 393 C CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf54 disulf ? ? K CYS 373 SG ? ? ? 1_555 K CYS 507 SG ? ? C CYS 405 C CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf55 disulf ? ? K CYS 462 SG ? ? ? 1_555 K CYS 470 SG ? ? C CYS 494 C CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf56 disulf ? ? K CYS 520 SG ? ? ? 1_555 K CYS 572 SG ? ? C CYS 552 C CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf57 disulf ? ? K CYS 599 SG ? ? ? 1_555 K CYS 631 SG ? ? C CYS 631 C CYS 663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf58 disulf ? ? K CYS 644 SG ? ? ? 1_555 K CYS 653 SG ? ? C CYS 676 C CYS 685 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf59 disulf ? ? K CYS 720 SG ? ? ? 1_555 K CYS 742 SG ? ? C CYS 752 C CYS 774 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf60 disulf ? ? K CYS 725 SG ? ? ? 1_555 K CYS 731 SG ? ? C CYS 757 C CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf61 disulf ? ? K CYS 1014 SG ? ? ? 1_555 K CYS 1025 SG ? ? C CYS 1046 C CYS 1057 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf62 disulf ? ? K CYS 1064 SG ? ? ? 1_555 K CYS 1108 SG ? ? C CYS 1096 C CYS 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf63 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 97 SG ? ? I CYS 22 I CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf64 disulf ? ? L CYS 155 SG ? ? ? 1_555 L CYS 211 SG ? ? I CYS 155 I CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf65 disulf ? ? L CYS 231 SG ? ? ? 1_555 M CYS 215 SG ? ? I CYS 231 J CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf66 disulf ? ? M CYS 23 SG ? ? ? 1_555 M CYS 89 SG ? ? J CYS 23 J CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf67 disulf ? ? M CYS 135 SG ? ? ? 1_555 M CYS 195 SG ? ? J CYS 135 J CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf68 disulf ? ? N CYS 21 SG ? ? ? 1_555 N CYS 94 SG ? ? R CYS 22 R CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf69 disulf ? ? N CYS 148 SG ? ? ? 1_555 N CYS 204 SG ? ? R CYS 149 R CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf70 disulf ? ? N CYS 224 SG ? ? ? 1_555 O CYS 216 SG ? ? R CYS 225 S CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf71 disulf ? ? O CYS 23 SG ? ? ? 1_555 O CYS 88 SG ? ? S CYS 23 S CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf72 disulf ? ? O CYS 136 SG ? ? ? 1_555 O CYS 196 SG ? ? S CYS 136 S CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? covale1 covale one ? A ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 357 A NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? F ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 357 B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? K ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? C ASN 357 C NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 161 B . ? PHE 161 H PRO 162 B ? PRO 162 H 1 -7.56 2 GLU 163 B . ? GLU 163 H PRO 164 B ? PRO 164 H 1 -11.33 3 SER 7 C . ? SER 7 L PRO 8 C ? PRO 8 L 1 -3.41 4 SER 95 C . ? SER 95 L PRO 96 C ? PRO 96 L 1 -2.63 5 TYR 141 C . ? TYR 141 L PRO 142 C ? PRO 142 L 1 1.85 6 PHE 154 D . ? PHE 155 M PRO 155 D ? PRO 156 M 1 -4.48 7 GLU 156 D . ? GLU 157 M PRO 157 D ? PRO 158 M 1 -3.29 8 SER 7 E . ? SER 7 N PRO 8 E ? PRO 8 N 1 -4.73 9 TYR 142 E . ? TYR 142 N PRO 143 E ? PRO 143 N 1 -1.81 10 PHE 161 G . ? PHE 161 P PRO 162 G ? PRO 162 P 1 -7.52 11 GLU 163 G . ? GLU 163 P PRO 164 G ? PRO 164 P 1 -11.43 12 SER 7 H . ? SER 7 Q PRO 8 H ? PRO 8 Q 1 -3.37 13 SER 95 H . ? SER 95 Q PRO 96 H ? PRO 96 Q 1 -2.62 14 TYR 141 H . ? TYR 141 Q PRO 142 H ? PRO 142 Q 1 1.76 15 PHE 154 I . ? PHE 155 E PRO 155 I ? PRO 156 E 1 -4.50 16 GLU 156 I . ? GLU 157 E PRO 157 I ? PRO 158 E 1 -3.36 17 SER 7 J . ? SER 7 F PRO 8 J ? PRO 8 F 1 -4.83 18 TYR 142 J . ? TYR 142 F PRO 143 J ? PRO 143 F 1 -1.72 19 PHE 161 L . ? PHE 161 I PRO 162 L ? PRO 162 I 1 -7.62 20 GLU 163 L . ? GLU 163 I PRO 164 L ? PRO 164 I 1 -11.43 21 SER 7 M . ? SER 7 J PRO 8 M ? PRO 8 J 1 -3.52 22 SER 95 M . ? SER 95 J PRO 96 M ? PRO 96 J 1 -2.63 23 TYR 141 M . ? TYR 141 J PRO 142 M ? PRO 142 J 1 1.81 24 PHE 154 N . ? PHE 155 R PRO 155 N ? PRO 156 R 1 -4.46 25 GLU 156 N . ? GLU 157 R PRO 157 N ? PRO 158 R 1 -3.31 26 SER 7 O . ? SER 7 S PRO 8 O ? PRO 8 S 1 -4.70 27 TYR 142 O . ? TYR 142 S PRO 143 O ? PRO 143 S 1 -1.79 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 7 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 6 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 7 ? AE2 ? 7 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 6 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 3 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 4 ? AF8 ? 6 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 3 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 6 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 3 ? 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AL5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? 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