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ESFESYSSASESPLKPKYRLTKHTQPCTSVCWNFLSKGTLVSGSQDATLSCWDLNAYNESDSASVLKVHISSHEKQVSDV RFHYKHQDLLASVSYDQYLHVHDIRRPDASTKPARSVHAHSGPIHSVAFNPHNDFILATCSTDKTIALWDLRNLNQRLHT LEGHEDIVTKISFSPHEEPILASTSADRRTLVWDLSRIGEDQPAEEAQDGPPELLFMHGGHTSCTIDMDWCPNYNWTMAT AAEDNILQIWTPSRSIWGNEQLEEDATAYLS ; 1 5 UNP EAF3_SCHPO O13953 ? 5 ;MAVSYKVNERVLCFHGPLLYEAKIVDTEMKGDVTTYLIHYKGWKNSWDEWVEQDRILQWTEENLKTQKELKNAAISTRQK PTSKKSASSTSKHDSTGVKTSGKRSRESSTVTVDGDSHELPSRIKTQKSESPIPQQVKRDGTTDAKNEETTKPENNEKDD FEEEPPLPKHKISVPDVLKLWLVDDWENITKNQQLIAIPRNPTVRAAIAAFRESKISHLNNEIDVDVFEQAMAGLVIYFN KCLGNMLLYRFERQQYLEIRQQYPDTEMCDLYGVEHLIRLFVSLPELIDRTNMDSQSIECLLNYIEEFLKYLVLHKDEYF IKEYQNAPPNYRSLVGV ; 1 6 UNP YA27_SCHPO Q09698 ? 6 ;MDAKPWNHTSEAFQASILEDLKIIQKAGAERNAKSSHGSINSRSASPNKATSRRNRAQNGNSNGRASVDNSDDGSKDDLD YSPSVKRKHVNGEGAEKGDHDTSNNGPSITKLRRKVRRTYDTKDGFVAWNTLDDDFRPIVPDQERSRKINPQKGNNNNLL KENKSLKTTAKDLSDISSSSMKKANNSSKPLFSGKLTFKANIPVPTSEVVTENNVTRNVTVYSNQKHLGNESENFNDMEG RAEDISSNELLPTPEEYPYRYNNDYCSACHGPGNFLCCETCPNSFHFTCIDPPIEEKNLPDDAWYCNECKHHSLYNELDE QEELESNVKEEGTMVDVWMQLCTYIDSHNPIQFHLPHSISSFFRGVGSGVMGEYIETDVLKHLKSSRRSNGEERDPLLLK SKSGTPILCFRCHKSALVSQSILACDYCNSYWHPDCLNPPLATLPSNLRKWKCPNHSDHVTPRYRLPEKAKVIRVGLPRG FKNKGNIVIDENEDEPSVQTIQLQGKIRVVPSKPFKLNFLEQIRDNVINLRKMVEQDEQLCIETFSKFDFYATRDCELPL RILCDVANDNLENDDYVLALRDLLRISKWDPNQPVPAPFDLANLLSY ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8I02 F 1 ? 404 ? Q09819 1 ? 404 ? 1 404 2 2 8I02 A 1 ? 1075 ? O13919 1 ? 1075 ? 1 1075 3 3 8I02 B 1 ? 405 ? O59702 1 ? 405 ? 1 405 4 4 8I02 C 1 ? 431 ? O14021 1 ? 431 ? 1 431 5 5 8I02 D 1 ? 337 ? O13953 1 ? 337 ? 1 337 6 5 8I02 E 1 ? 337 ? O13953 1 ? 337 ? 1 337 7 6 8I02 G 1 ? 607 ? Q09698 1 ? 607 ? 1 607 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 K non-polymer . 'POTASSIUM ION' ? 'K 1' 39.098 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.857 ? 27611 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.626 ? 2679 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.053 ? 2988 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 3562 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8I02 _struct.title 'Cryo-EM structure of the SIN3S complex from S. pombe' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8I02 _struct_keywords.text 'SIN3, SIN3S, Pst2, Clr6, deacetylase, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 7 ? J N N 7 ? K N N 8 ? L N N 8 ? M N N 7 ? N N N 7 ? O N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 149 ? ILE A 153 ? THR F 149 ILE F 153 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 CYS A 160 ? ILE A 165 ? CYS F 160 ILE F 165 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 TRP A 178 ? GLN A 188 ? TRP F 178 GLN F 188 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 196 ? HIS A 201 ? PRO F 196 HIS F 201 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 CYS A 268 ? ALA A 272 ? CYS F 268 ALA F 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 343 ? 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GLY A 307 THR A 316 1 ? 10 HELX_P HELX_P21 AC3 SER B 319 ? ASN B 328 ? SER A 319 ASN A 328 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU B 347 ? ILE B 351 ? GLU A 347 ILE A 351 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA B 392 ? ASN B 425 ? ALA A 392 ASN A 425 1 ? 34 HELX_P HELX_P24 AC6 GLU B 431 ? TYR B 435 ? GLU A 431 TYR A 435 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 445 ? TYR B 457 ? SER A 445 TYR A 457 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 THR B 458 ? GLU B 460 ? THR A 458 GLU A 460 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 HIS B 461 ? MET B 472 ? HIS A 461 MET A 472 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU B 475 ? SER B 497 ? LEU A 475 SER A 497 1 ? 23 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU B 498 ? TYR B 510 ? LEU A 498 TYR A 510 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP B 511 ? LEU B 514 ? ASP A 511 LEU A 514 5 ? 4 HELX_P HELX_P31 AD4 SER B 516 ? VAL B 529 ? SER A 516 VAL A 529 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 530 ? PHE B 549 ? SER A 530 PHE A 549 1 ? 20 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN B 565 ? SER B 584 ? ASN A 565 SER A 584 1 ? 20 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS B 590 ? GLY B 604 ? 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LEU C 355 ILE C 358 5 ? 4 HELX_P HELX_P63 AG9 SER D 413 ? GLY D 418 ? SER C 413 GLY C 418 1 ? 6 HELX_P HELX_P64 AH1 PRO E 175 ? LYS E 191 ? PRO D 175 LYS D 191 1 ? 17 HELX_P HELX_P65 AH2 ARG E 205 ? ILE E 216 ? ARG D 205 ILE D 216 1 ? 12 HELX_P HELX_P66 AH3 SER E 217 ? LEU E 219 ? SER D 217 LEU D 219 5 ? 3 HELX_P HELX_P67 AH4 ASN E 221 ? ASN E 240 ? ASN D 221 ASN D 240 1 ? 20 HELX_P HELX_P68 AH5 TYR E 249 ? PHE E 251 ? TYR D 249 PHE D 251 5 ? 3 HELX_P HELX_P69 AH6 GLU E 252 ? TYR E 263 ? GLU D 252 TYR D 263 1 ? 12 HELX_P HELX_P70 AH7 GLU E 267 ? LEU E 271 ? GLU D 267 LEU D 271 5 ? 5 HELX_P HELX_P71 AH8 LEU E 277 ? SER E 283 ? LEU D 277 SER D 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P72 AH9 GLN E 296 ? LEU E 314 ? GLN D 296 LEU D 314 1 ? 19 HELX_P HELX_P73 AI1 PRO E 328 ? VAL E 335 ? PRO D 328 VAL D 335 1 ? 8 HELX_P HELX_P74 AI2 VAL F 177 ? LEU F 178 ? VAL E 177 LEU E 178 5 ? 2 HELX_P HELX_P75 AI3 LEU F 180 ? LEU F 180 ? LEU E 180 LEU E 180 5 ? 1 HELX_P HELX_P76 AI4 TRP F 181 ? LYS F 191 ? TRP E 181 LYS E 191 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 AI5 VAL F 204 ? ILE F 216 ? VAL E 204 ILE E 216 1 ? 13 HELX_P HELX_P78 AI6 ASN F 221 ? GLY F 244 ? ASN E 221 GLY E 244 1 ? 24 HELX_P HELX_P79 AI7 ARG F 253 ? TYR F 263 ? ARG E 253 TYR E 263 1 ? 11 HELX_P HELX_P80 AI8 GLU F 267 ? LEU F 271 ? GLU E 267 LEU E 271 5 ? 5 HELX_P HELX_P81 AI9 HIS F 276 ? LEU F 284 ? HIS E 276 LEU E 284 1 ? 9 HELX_P HELX_P82 AJ1 LEU F 284 ? ASP F 289 ? LEU E 284 ASP E 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P83 AJ2 ASP F 294 ? HIS F 315 ? ASP E 294 HIS E 315 1 ? 22 HELX_P HELX_P84 AJ3 MET G 334 ? ILE G 345 ? MET G 334 ILE G 345 1 ? 12 HELX_P HELX_P85 AJ4 PRO G 356 ? SER G 361 ? PRO G 356 SER G 361 1 ? 6 HELX_P HELX_P86 AJ5 ASN G 518 ? PHE G 545 ? ASN G 518 PHE G 545 1 ? 28 HELX_P HELX_P87 AJ6 LYS G 547 ? ASN G 568 ? LYS G 547 ASN G 568 1 ? 22 HELX_P HELX_P88 AJ7 ASP G 575 ? SER G 587 ? ASP G 575 SER G 587 1 ? 13 HELX_P HELX_P89 AJ8 ASP G 600 ? LEU G 605 ? ASP G 600 LEU G 605 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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B HIS 175 B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? metalc11 metalc ? ? C HIS 175 O ? ? ? 1_555 K K . K ? ? B HIS 175 B K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? ? metalc12 metalc ? ? C PHE 184 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? B PHE 184 B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? ? metalc13 metalc ? ? C THR 187 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? B THR 187 B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? ? metalc14 metalc ? ? C VAL 190 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? B VAL 190 B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? ? metalc15 metalc ? ? C PHE 195 O ? ? ? 1_555 K K . K ? ? B PHE 195 B K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.034 ? ? metalc16 metalc ? ? G CYS 266 SG ? ? ? 1_555 M ZN . ZN ? ? G CYS 266 G ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.220 ? ? metalc17 metalc ? ? G CYS 269 SG ? ? ? 1_555 M ZN . ZN ? ? G CYS 269 G ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? ? metalc18 metalc ? ? G HIS 286 ND1 ? ? ? 1_555 M ZN . ZN ? ? G HIS 286 G ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? ? metalc19 metalc ? ? G CYS 289 SG ? ? ? 1_555 M ZN . ZN ? ? G CYS 289 G ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? ? metalc20 metalc ? ? G CYS 409 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? G CYS 409 G ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.500 ? ? metalc21 metalc ? ? G CYS 412 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? G CYS 412 G ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? ? metalc22 metalc ? ? G CYS 425 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? G CYS 425 G ZN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.360 ? ? metalc23 metalc ? ? G CYS 436 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? G CYS 436 G ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc24 metalc ? ? G CYS 453 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? G CYS 453 G ZN 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id ASN _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 201 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id F _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id ASN _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 201 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id E _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 202 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 F _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 202 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 E _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -0.61 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 8 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? 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