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'Structure of beta-arrestin in complex with a phosphopeptide' 2023 ? https://doi.org/10.1016/j.molcel.2023.04.025 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Maharana, J.' 1 ? primary 'Sarma, P.' 2 ? primary 'Yadav, M.K.' 3 ? primary 'Saha, S.' 4 ? primary 'Singh, V.' 5 ? primary 'Saha, S.' 6 ? primary 'Chami, M.' 7 ? primary 'Banerjee, R.' 8 ? primary 'Shukla, A.K.' 9 ? 1 'Maharana, J.' 10 ? 1 'Sarma, P.' 11 ? 1 'Yadav, M.K.' 12 ? 1 'Banerjee, R.' 13 ? 1 'Shukla, A.K.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man Beta-arrestin-1 47088.508 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Fab30 Heavy Chain' 25512.354 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Fab30 Light Chain' 23435.064 2 ? ? ? ? 4 polymer syn 'C-X-C chemokine receptor type 4' 2380.530 2 ? ? ? 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C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ARRB1_RAT P29066 ? 1 ;MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLF VANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHK RNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYAD ICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVS YKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPESETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMK DDKDEEDDGTGSPHLNNR ; 1 2 PDB 8I0Q 8I0Q ? 2 ? 1 3 PDB 8I0Q 8I0Q ? 3 ? 1 4 UNP CXCR4_HUMAN P61073 ? 4 GHSSVSTESESSSFHSS 336 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8I0Q A 1 ? 418 ? P29066 1 ? 418 ? 1 418 2 1 8I0Q B 1 ? 418 ? P29066 1 ? 418 ? 1 418 3 2 8I0Q H 1 ? 237 ? 8I0Q 1 ? 237 ? 1 237 4 2 8I0Q I 1 ? 237 ? 8I0Q 1 ? 237 ? 1 237 5 3 8I0Q L 1 ? 215 ? 8I0Q 1 ? 215 ? 1 215 6 3 8I0Q M 1 ? 215 ? 8I0Q 1 ? 215 ? 1 215 7 4 8I0Q U 1 ? 17 ? P61073 336 ? 352 ? 336 352 8 4 8I0Q V 1 ? 17 ? P61073 336 ? 352 ? 336 352 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 90 ? LYS A 94 ? ALA A 90 LYS A 94 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 98 ? GLY A 109 ? THR A 98 GLY A 109 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 278 ? ARG A 282 ? LEU A 278 ARG A 282 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 307 ? ASN A 311 ? ARG A 307 ASN A 311 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 LEU A 335 ? ALA A 339 ? LEU A 335 ALA A 339 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA B 90 ? LYS B 94 ? ALA B 90 LYS B 94 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 98 ? GLY B 109 ? THR B 98 GLY B 109 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU B 278 ? ARG B 282 ? LEU B 278 ARG B 282 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 ARG B 307 ? ASN B 311 ? ARG B 307 ASN B 311 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU B 335 ? ALA B 339 ? LEU B 335 ALA B 339 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP C 65 ? LYS C 68 ? ASP H 65 LYS H 68 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 AB3 ARG C 90 ? THR C 94 ? ARG H 90 THR H 94 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP D 65 ? LYS D 68 ? ASP I 65 LYS I 68 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 AB5 ARG D 90 ? THR D 94 ? ARG I 90 THR I 94 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 GLN E 80 ? PHE E 84 ? GLN L 80 PHE L 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 GLN F 80 ? PHE F 84 ? 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C CYS 25 SG ? ? ? 1_555 C CYS 99 SG ? ? H CYS 25 H CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 25 SG ? ? ? 1_555 D CYS 99 SG ? ? I CYS 25 I CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? E CYS 24 SG ? ? ? 1_555 E CYS 89 SG ? ? L CYS 24 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? F CYS 24 SG ? ? ? 1_555 F CYS 89 SG ? ? M CYS 24 M CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale both ? G GLU 8 C ? ? ? 1_555 G SEP 9 N ? ? U GLU 343 U SEP 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale2 covale both ? G SEP 9 C ? ? ? 1_555 G GLU 10 N ? ? U SEP 344 U GLU 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale3 covale both ? G GLU 10 C ? ? ? 1_555 G SEP 11 N ? ? U GLU 345 U SEP 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale4 covale both ? G SEP 11 C ? ? ? 1_555 G SEP 12 N ? ? U SEP 346 U SEP 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale5 covale both ? G SEP 12 C ? ? ? 1_555 G SEP 13 N ? ? U SEP 347 U SEP 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale6 covale both ? G SEP 13 C ? ? ? 1_555 G PHE 14 N ? ? U SEP 348 U PHE 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale7 covale both ? G HIS 15 C ? ? ? 1_555 G SEP 16 N ? ? U HIS 350 U SEP 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale8 covale both ? H GLU 8 C ? ? ? 1_555 H SEP 9 N ? ? V GLU 343 V SEP 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale9 covale both ? H SEP 9 C ? ? ? 1_555 H GLU 10 N ? ? V SEP 344 V GLU 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale10 covale both ? H GLU 10 C ? ? ? 1_555 H SEP 11 N ? ? V GLU 345 V SEP 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale11 covale both ? H SEP 11 C ? ? ? 1_555 H SEP 12 N ? ? V SEP 346 V SEP 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale12 covale both ? H SEP 12 C ? ? ? 1_555 H SEP 13 N ? ? V SEP 347 V SEP 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale13 covale both ? H SEP 13 C ? ? ? 1_555 H PHE 14 N ? ? V SEP 348 V PHE 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale14 covale both ? H HIS 15 C ? ? ? 1_555 H SEP 16 N ? ? V HIS 350 V SEP 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 SEP G 9 ? . . . . SEP U 344 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 2 SEP G 11 ? . . . . SEP U 346 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 3 SEP G 12 ? . . . . SEP U 347 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 4 SEP G 13 ? . . . . SEP U 348 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 5 SEP G 16 ? . . . . SEP U 351 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 6 SEP H 9 ? . . . . SEP V 344 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 7 SEP H 11 ? . . . . SEP V 346 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 8 SEP H 12 ? . . . . SEP V 347 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 9 SEP H 13 ? . . . . SEP V 348 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 10 SEP H 16 ? . . . . SEP V 351 ? 1_555 . . . . . . . SER 1 SEP Phosphorylation 'Named protein modification' 11 CYS C 25 ? CYS C 99 ? CYS H 25 ? 1_555 CYS H 99 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS D 25 ? CYS D 99 ? CYS I 25 ? 1_555 CYS I 99 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS E 24 ? CYS E 89 ? CYS L 24 ? 1_555 CYS L 89 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS F 24 ? CYS F 89 ? CYS M 24 ? 1_555 CYS M 89 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 87 A . ? PHE 87 A PRO 88 A ? PRO 88 A 1 1.72 2 PHE 87 B . ? PHE 87 B PRO 88 B ? PRO 88 B 1 1.33 3 PHE 105 C . ? PHE 105 H TRP 106 C ? TRP 106 H 1 -1.84 4 PHE 105 D . ? PHE 105 I TRP 106 D ? TRP 106 I 1 -1.86 5 SER 8 E . ? SER 8 L PRO 9 E ? PRO 9 L 1 -1.38 6 VAL 95 E . ? VAL 95 L PRO 96 E ? PRO 96 L 1 0.41 7 SER 8 F . ? SER 8 M PRO 9 F ? PRO 9 M 1 -0.61 8 VAL 95 F . ? VAL 95 M PRO 96 F ? PRO 96 M 1 0.31 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 112 ? 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