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L LEU 119 CD2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8IHM _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8IHM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8IHM _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8IHM _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 14471 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.674 ? 20897 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 24.533 ? 7616 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 2363 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1542 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8IHM _struct.title 'Eaf3 CHD domain bound to the nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8IHM _struct_keywords.text 'HDAC, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 1 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 2 UNP A0A8J1LTD2_XENLA A0A8J1LTD2 ? 2 ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 15 3 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 4 UNP A0A8J0U496_XENLA A0A8J0U496 ? 4 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 5 PDB 8IHM 8IHM ? 5 ? 1 6 PDB 8IHM 8IHM ? 6 ? 1 7 PDB 8IHM 8IHM ? 7 ? 1 8 UNP A0A8H4F719_YEASX A0A8H4F719 ? 8 ;RCLAFHGPLMYEAKILKIWDPSSKMYTSIPNDKPGGSSQATKEIKPQKLGEDESIPEEIINGKCFFIHYQGWKSSWDEWV GYDRIRAYNEENIAMKKRLANEAKEAKKSLLEQQKKKKL ; 13 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8IHM A 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 2 2 8IHM B 1 ? 102 ? A0A8J1LTD2 15 ? 116 ? 1 102 3 3 8IHM C 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 4 4 8IHM D 1 ? 122 ? A0A8J0U496 5 ? 126 ? 1 122 5 1 8IHM E 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 6 2 8IHM F 1 ? 102 ? A0A8J1LTD2 15 ? 116 ? 1 102 7 3 8IHM G 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 8 4 8IHM H 1 ? 122 ? A0A8J0U496 5 ? 126 ? 1 122 9 5 8IHM I 1 ? 164 ? 8IHM -91 ? 72 ? -91 72 10 6 8IHM J 1 ? 165 ? 8IHM -72 ? 92 ? -72 92 11 7 8IHM M 1 ? 18 ? 8IHM 50 ? 67 ? 50 67 12 8 8IHM N 1 ? 119 ? A0A8H4F719 13 ? 131 ? 13 131 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8IHM ALA A 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 conflict 110 1 5 8IHM ALA E 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 conflict 110 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? ARG A 53 ? GLY A 44 ARG A 53 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 63 ? ASP A 77 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 85 ? LYS A 115 ? GLN A 85 LYS A 115 1 ? 31 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 120 ? ILE A 130 ? MET A 120 ILE A 130 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN B 25 ? ILE B 29 ? ASN B 25 ILE B 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 30 ? GLY B 42 ? THR B 30 GLY B 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 49 ? LYS B 77 ? LEU B 49 LYS B 77 1 ? 29 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 82 ? GLN B 93 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 16 ? ALA C 21 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 26 ? GLY C 37 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 45 ? ARG C 71 ? ALA C 45 ARG C 71 1 ? 27 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP C 72 ? LYS C 74 ? ASP C 72 LYS C 74 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 ILE C 79 ? ASP C 90 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP C 90 ? LEU C 97 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR D 34 ? HIS D 46 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER D 52 ? ALA D 74 ? SER D 52 ALA D 74 1 ? 23 HELX_P HELX_P17 AB8 SER D 75 ? ASN D 81 ? SER D 75 ASN D 81 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 SER D 88 ? LEU D 99 ? SER D 88 LEU D 99 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY D 101 ? LYS D 122 ? GLY D 101 LYS D 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL E 46 ? GLN E 55 ? VAL E 46 GLN E 55 1 ? 10 HELX_P HELX_P21 AC3 ARG E 63 ? LYS E 79 ? ARG E 63 LYS E 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P22 AC4 GLN E 85 ? ALA E 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P23 AC5 MET E 120 ? ARG E 131 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN F 25 ? ILE F 29 ? ASN F 25 ILE F 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 THR F 30 ? GLY F 42 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 LEU F 49 ? ALA F 76 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P27 AC9 THR F 82 ? GLY F 94 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 AD1 THR G 16 ? ALA G 21 ? THR G 16 ALA G 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 AD2 PRO G 26 ? GLY G 37 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA G 45 ? LYS G 74 ? ALA G 45 LYS G 74 1 ? 30 HELX_P HELX_P31 AD4 ILE G 79 ? ASP G 90 ? ILE G 79 ASP G 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP G 90 ? LYS G 95 ? ASP G 90 LYS G 95 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU G 96 ? GLY G 98 ? LEU G 96 GLY G 98 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 TYR H 34 ? HIS H 46 ? TYR H 34 HIS H 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 LYS H 54 ? ASN H 81 ? LYS H 54 ASN H 81 1 ? 28 HELX_P HELX_P36 AD9 THR H 87 ? LEU H 99 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY H 101 ? ALA H 121 ? GLY H 101 ALA H 121 1 ? 21 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO L 56 ? GLY L 62 ? PRO N 68 GLY N 74 1 ? 7 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN L 89 ? LEU L 119 ? ASN N 101 LEU N 131 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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O GLN N 59 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" I DG -53 ? ? "C1'" I DG -53 ? ? N9 I DG -53 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 2 1 "O4'" I DG -34 ? ? "C1'" I DG -34 ? ? N9 I DG -34 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 3 1 "O4'" I DC -20 ? ? "C1'" I DC -20 ? ? N1 I DC -20 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 4 1 "O4'" I DT 53 ? ? "C1'" I DT 53 ? ? N1 I DT 53 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 5 1 "O4'" I DT 62 ? ? "C1'" I DT 62 ? ? N1 I DT 62 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 6 1 "O4'" I DA 63 ? ? "C1'" I DA 63 ? ? N9 I DA 63 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 7 1 "O4'" J DA 16 ? ? "C1'" J DA 16 ? ? 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A ML3 36 37 1 Y 1 A LYS 37 ? A LYS 37 38 1 Y 1 A ALA 135 ? A ALA 135 39 1 Y 1 B SER 1 ? B SER 1 40 1 Y 1 B GLY 2 ? B GLY 2 41 1 Y 1 B ARG 3 ? B ARG 3 42 1 Y 1 B GLY 4 ? B GLY 4 43 1 Y 1 B LYS 5 ? B LYS 5 44 1 Y 1 B GLY 6 ? B GLY 6 45 1 Y 1 B GLY 7 ? B GLY 7 46 1 Y 1 B LYS 8 ? B LYS 8 47 1 Y 1 B GLY 9 ? B GLY 9 48 1 Y 1 B LEU 10 ? B LEU 10 49 1 Y 1 B GLY 11 ? B GLY 11 50 1 Y 1 B LYS 12 ? B LYS 12 51 1 Y 1 B GLY 13 ? B GLY 13 52 1 Y 1 B GLY 14 ? B GLY 14 53 1 Y 1 B ALA 15 ? B ALA 15 54 1 Y 1 B LYS 16 ? B LYS 16 55 1 Y 1 B ARG 17 ? B ARG 17 56 1 Y 1 B HIS 18 ? B HIS 18 57 1 Y 1 B ARG 19 ? B ARG 19 58 1 Y 1 B LYS 20 ? B LYS 20 59 1 Y 1 B VAL 21 ? B VAL 21 60 1 Y 1 B GLY 102 ? B GLY 102 61 1 Y 1 C SER 1 ? C SER 1 62 1 Y 1 C GLY 2 ? C GLY 2 63 1 Y 1 C ARG 3 ? C ARG 3 64 1 Y 1 C GLY 4 ? C GLY 4 65 1 Y 1 C LYS 5 ? C LYS 5 66 1 Y 1 C GLN 6 ? C GLN 6 67 1 Y 1 C GLY 7 ? C GLY 7 68 1 Y 1 C GLY 8 ? C GLY 8 69 1 Y 1 C LYS 9 ? C LYS 9 70 1 Y 1 C THR 10 ? C THR 10 71 1 Y 1 C ARG 11 ? 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J -72 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DT 8 1_555 J DA 157 1_555 I DC 10 1_555 J DG 155 1_555 2.842 -1.496 6.685 26.967 25.369 69.719 -2.754 -0.600 6.516 20.804 -22.115 77.827 1 II_DT-84DC-82:DG82DA84_JJ I -84 ? J 84 ? I -82 ? J 82 ? 1 I DC 10 1_555 J DG 155 1_555 I DT 11 1_555 J DA 154 1_555 -1.669 2.004 3.376 -5.257 -1.252 39.677 3.079 1.802 3.498 -1.834 7.702 40.029 2 II_DC-82DT-81:DA81DG82_JJ I -82 ? J 82 ? I -81 ? J 81 ? 1 I DT 11 1_555 J DA 154 1_555 I DG 12 1_555 J DC 153 1_555 0.356 0.694 3.348 -3.494 15.465 42.325 -0.568 -0.798 3.355 20.574 4.649 45.070 3 II_DT-81DG-80:DC80DA81_JJ I -81 ? J 81 ? I -80 ? J 80 ? 1 I DG 12 1_555 J DC 153 1_555 I DG 13 1_555 J DC 152 1_555 -0.212 1.181 2.611 -14.890 11.946 39.064 0.590 -0.971 2.748 16.707 20.826 43.315 4 II_DG-80DG-79:DC79DC80_JJ I -80 ? J 80 ? I -79 ? J 79 ? 1 I DG 13 1_555 J DC 152 1_555 I DC 14 1_555 J DG 151 1_555 -0.911 0.606 2.907 -0.500 -0.387 30.018 1.240 1.666 2.913 -0.747 0.965 30.024 5 II_DG-79DC-78:DG78DC79_JJ I -79 ? J 79 ? I -78 ? J 78 ? 1 I DC 14 1_555 J DG 151 1_555 I DC 15 1_555 J DG 150 1_555 0.093 0.343 2.930 -1.207 0.930 36.705 0.431 -0.296 2.933 1.476 1.916 36.736 6 II_DC-78DC-77:DG77DG78_JJ I -78 ? J 78 ? I -77 ? J 77 ? 1 I DC 19 1_555 J DG 146 1_555 I DT 20 1_555 J DA 145 1_555 0.278 -0.077 3.335 -2.921 3.345 28.923 -0.887 -1.193 3.262 6.648 5.804 29.255 7 II_DC-73DT-72:DA72DG73_JJ I -73 ? J 73 ? I -72 ? J 72 ? 1 I DT 20 1_555 J DA 145 1_555 I DG 21 1_555 J DC 144 1_555 1.013 1.437 3.034 -0.234 3.136 41.579 1.708 -1.447 3.124 4.410 0.329 41.693 8 II_DT-72DG-71:DC71DA72_JJ I -72 ? J 72 ? I -71 ? J 71 ? 1 I DG 21 1_555 J DC 144 1_555 I DG 22 1_555 J DC 143 1_555 -0.059 -0.084 3.093 0.661 2.732 28.982 -0.731 0.254 3.070 5.443 -1.317 29.115 9 II_DG-71DG-70:DC70DC71_JJ I -71 ? J 71 ? I -70 ? J 70 ? 1 I DG 22 1_555 J DC 143 1_555 I DA 23 1_555 J DT 142 1_555 0.044 0.113 3.330 -2.005 3.732 42.182 -0.232 -0.269 3.323 5.169 2.777 42.385 10 II_DG-70DA-69:DT69DC70_JJ I -70 ? J 70 ? I -69 ? J 69 ? 1 I DA 23 1_555 J DT 142 1_555 I DG 24 1_555 J DC 141 1_555 0.270 -0.627 3.097 -1.536 -1.001 26.590 -1.112 -0.967 3.098 -2.174 3.334 26.652 11 II_DA-69DG-68:DC68DT69_JJ I -69 ? J 69 ? I -68 ? 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J 63 ? 1 I DC 29 1_555 J DG 136 1_555 I DC 30 1_555 J DG 135 1_555 0.333 0.191 2.874 -1.363 -1.586 22.478 0.995 -1.287 2.829 -4.056 3.488 22.573 17 II_DC-63DC-62:DG62DG63_JJ I -63 ? J 63 ? I -62 ? J 62 ? 1 I DC 30 1_555 J DG 135 1_555 I DG 31 1_555 J DC 134 1_555 -0.575 -0.235 2.992 -1.523 11.525 38.722 -1.522 0.678 2.831 16.923 2.236 40.365 18 II_DC-62DG-61:DC61DG62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? J 61 ? 1 I DG 31 1_555 J DC 134 1_555 I DG 32 1_555 J DC 133 1_555 0.058 -0.577 3.463 0.445 1.230 29.060 -1.433 -0.012 3.436 2.451 -0.887 29.089 19 II_DG-61DG-60:DC60DC61_JJ I -61 ? J 61 ? I -60 ? J 60 ? 1 I DG 32 1_555 J DC 133 1_555 I DT 33 1_555 J DA 132 1_555 -0.424 -0.984 3.292 5.820 0.671 34.247 -1.750 1.595 3.160 1.130 -9.794 34.729 20 II_DG-60DT-59:DA59DC60_JJ I -60 ? J 60 ? I -59 ? J 59 ? 1 I DT 33 1_555 J DA 132 1_555 I DG 34 1_555 J DC 131 1_555 0.920 0.699 3.604 0.576 -0.065 37.135 1.107 -1.360 3.617 -0.102 -0.905 37.140 21 II_DT-59DG-58:DC58DA59_JJ I -59 ? J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DG 34 1_555 J DC 131 1_555 I DC 35 1_555 J DG 130 1_555 -0.758 -0.415 3.178 -0.092 0.242 35.128 -0.723 1.243 3.177 0.402 0.153 35.129 22 II_DG-58DC-57:DG57DC58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DC 35 1_555 J DG 130 1_555 I DC 36 1_555 J DG 129 1_555 0.712 1.365 3.714 0.739 0.100 39.824 1.991 -0.948 3.729 0.147 -1.084 39.831 23 II_DC-57DC-56:DG56DG57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DC 36 1_555 J DG 129 1_555 I DG 37 1_555 J DC 128 1_555 -0.206 2.142 3.601 2.241 -7.558 40.732 3.866 0.540 3.156 -10.738 -3.184 41.456 24 II_DC-56DG-55:DC55DG56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DG 37 1_555 J DC 128 1_555 I DA 38 1_555 J DT 127 1_555 -1.123 2.594 4.011 0.021 0.626 46.842 3.199 1.415 4.043 0.787 -0.026 46.846 25 II_DG-55DA-54:DT54DC55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DA 38 1_555 J DT 127 1_555 I DG 39 1_555 J DC 126 1_555 0.395 0.396 3.022 -4.601 5.644 24.329 -0.609 -2.130 2.915 13.024 10.617 25.380 26 II_DA-54DG-53:DC53DT54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DG 39 1_555 J DC 126 1_555 I DG 40 1_555 J DC 125 1_555 -0.471 0.303 3.075 -6.431 4.313 33.002 -0.146 -0.186 3.123 7.464 11.130 33.874 27 II_DG-53DG-52:DC52DC53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DG 40 1_555 J DC 125 1_555 I DC 41 1_555 J DG 124 1_555 0.424 -0.334 3.012 -1.837 5.562 36.401 -1.215 -0.897 2.907 8.833 2.918 36.853 28 II_DG-52DC-51:DG51DC52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DC 41 1_555 J DG 124 1_555 I DC 42 1_555 J DG 123 1_555 0.117 -0.477 3.192 2.282 2.907 32.220 -1.351 0.180 3.138 5.217 -4.095 32.426 29 II_DC-51DC-50:DG50DG51_JJ I -51 ? J 51 ? I -50 ? J 50 ? 1 I DC 42 1_555 J DG 123 1_555 I DG 43 1_555 J DC 122 1_555 -0.104 0.292 3.633 1.030 31.172 35.514 -2.650 0.230 2.968 42.440 -1.402 46.931 30 II_DC-50DG-49:DC49DG50_JJ I -50 ? J 50 ? I -49 ? J 49 ? 1 I DG 43 1_555 J DC 122 1_555 I DC 44 1_555 J DG 121 1_555 0.065 0.380 3.167 2.130 -2.561 36.550 0.941 0.178 3.133 -4.074 -3.387 36.697 31 II_DG-49DC-48:DG48DC49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 44 1_555 J DG 121 1_555 I DT 45 1_555 J DA 120 1_555 -0.703 1.693 3.486 -3.245 -0.707 34.591 2.950 0.647 3.502 -1.186 5.442 34.745 32 II_DC-48DT-47:DA47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DT 45 1_555 J DA 120 1_555 I DC 46 1_555 J DG 119 1_555 0.677 2.464 3.336 -7.119 -4.052 48.035 3.292 -1.353 3.008 -4.935 8.672 48.688 33 II_DT-47DC-46:DG46DA47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DC 46 1_555 J DG 119 1_555 I DA 47 1_555 J DT 118 1_555 -0.311 2.007 3.620 -0.361 -3.064 39.403 3.359 0.414 3.463 -4.536 0.535 39.519 34 II_DC-46DA-45:DT45DG46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 47 1_555 J DT 118 1_555 I DA 48 1_555 J DT 117 1_555 -1.013 0.916 3.544 -3.073 2.497 38.008 1.053 1.120 3.663 3.822 4.703 38.206 35 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 48 1_555 J DT 117 1_555 I DT 49 1_555 J DA 116 1_555 -0.118 -0.533 2.901 -3.402 1.042 32.341 -1.114 -0.316 2.880 1.863 6.085 32.531 36 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DT 49 1_555 J DA 116 1_555 I DT 50 1_555 J DA 115 1_555 0.078 0.177 3.375 -2.268 5.633 33.157 -0.644 -0.517 3.347 9.769 3.932 33.693 37 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DT 50 1_555 J DA 115 1_555 I DG 51 1_555 J DC 114 1_555 1.226 0.516 3.206 -3.394 9.434 36.311 -0.408 -2.336 3.116 14.794 5.322 37.625 38 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DG 51 1_555 J DC 114 1_555 I DG 52 1_555 J DC 113 1_555 0.299 -0.727 2.959 0.772 6.975 30.189 -2.548 -0.428 2.733 13.169 -1.457 30.975 39 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 I DG 52 1_555 J DC 113 1_555 I DT 53 1_555 J DA 112 1_555 -0.216 -1.107 3.368 5.181 2.241 31.061 -2.457 1.372 3.205 4.142 -9.575 31.557 40 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 I DT 53 1_555 J DA 112 1_555 I DC 54 1_555 J DG 111 1_555 0.860 -0.100 3.562 6.096 -0.656 40.322 -0.063 -0.489 3.650 -0.945 -8.782 40.766 41 II_DT-39DC-38:DG38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 I DC 54 1_555 J DG 111 1_555 I DG 55 1_555 J DC 110 1_555 0.335 0.242 3.380 0.558 -4.709 31.768 1.307 -0.503 3.316 -8.543 -1.013 32.111 42 II_DC-38DG-37:DC37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DG 55 1_555 J DC 110 1_555 I DT 56 1_555 J DA 109 1_555 0.245 -0.523 3.351 1.883 1.963 34.733 -1.179 -0.117 3.326 3.282 -3.149 34.836 43 II_DG-37DT-36:DA36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DT 56 1_555 J DA 109 1_555 I DA 57 1_555 J DT 108 1_555 -1.413 1.620 3.438 -1.370 -9.890 48.368 2.686 1.589 3.107 -11.923 1.651 49.327 44 II_DT-36DA-35:DT35DA36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DA 57 1_555 J DT 108 1_555 I DG 58 1_555 J DC 107 1_555 1.623 0.727 3.441 -2.800 -25.798 31.818 3.800 -2.625 2.148 -39.815 4.321 40.845 45 II_DA-35DG-34:DC34DT35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DG 58 1_555 J DC 107 1_555 I DA 59 1_555 J DT 106 1_555 -0.987 0.202 3.313 -4.393 3.823 39.104 -0.165 0.926 3.404 5.674 6.520 39.519 46 II_DG-34DA-33:DT33DC34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? 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J 28 ? 1 I DT 64 1_555 J DA 101 1_555 I DC 65 1_555 J DG 100 1_555 1.941 -0.227 3.738 0.227 -7.272 37.967 0.689 -2.902 3.728 -11.053 -0.344 38.632 52 II_DT-28DC-27:DG27DA28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 65 1_555 J DG 100 1_555 I DT 66 1_555 J DA 99 1_555 -2.449 -0.748 2.747 7.006 -15.097 34.947 0.399 4.416 2.348 -23.560 -10.934 38.596 53 II_DC-27DT-26:DA26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DT 66 1_555 J DA 99 1_555 I DA 67 1_555 J DT 98 1_555 2.011 0.757 3.013 0.169 -22.240 41.437 2.574 -2.520 2.347 -29.056 -0.221 46.796 54 II_DT-26DA-25:DT25DA26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DA 67 1_555 J DT 98 1_555 I DG 68 1_555 J DC 97 1_555 -0.047 -0.805 3.441 0.710 2.525 30.969 -2.006 0.230 3.364 4.719 -1.327 31.077 55 II_DA-25DG-24:DC24DT25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DG 68 1_555 J DC 97 1_555 I DC 69 1_555 J DG 96 1_555 -0.387 -0.659 3.310 4.600 -1.471 35.570 -0.857 1.293 3.260 -2.394 -7.487 35.886 56 II_DG-24DC-23:DG23DC24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? 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