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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.561 ? 18586 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 31.764 ? 3807 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.035 ? 2121 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1312 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8J92 _struct.title 'Cryo-EM structure of nucleosome containing Arabidopsis thaliana H2A.W' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8J92 _struct_keywords.text 'Chromatin, Epigenetics, Histon variant, chromatin remodeler, NUCLEAR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? 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J 60 ? 1 I DG 36 1_555 J DC 134 1_555 I DG 38 1_555 J DC 132 1_555 0.794 -0.223 6.338 5.017 10.164 66.851 -0.957 -0.339 6.291 9.158 -4.520 67.695 17 II_DG-60DG-58:DC58DC60_JJ I -60 ? J 60 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DG 38 1_555 J DC 132 1_555 I DC 39 1_555 J DG 131 1_555 -0.406 0.257 3.332 1.384 1.751 37.031 0.166 0.827 3.324 2.754 -2.176 37.095 18 II_DG-58DC-57:DG57DC58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DC 39 1_555 J DG 131 1_555 I DC 40 1_555 J DG 130 1_555 0.521 2.029 3.757 3.733 -3.907 40.827 3.362 -0.286 3.588 -5.571 -5.323 41.168 19 II_DC-57DC-56:DG56DG57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DC 40 1_555 J DG 130 1_555 I DG 41 1_555 J DC 129 1_555 -0.181 2.181 3.714 -0.817 -5.998 39.937 3.895 0.162 3.368 -8.721 1.189 40.375 20 II_DC-56DG-55:DC55DG56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DG 43 1_555 J DC 127 1_555 I DG 44 1_555 J DC 126 1_555 -0.697 0.345 3.118 -2.340 4.917 30.724 -0.266 0.864 3.177 9.190 4.374 31.191 21 II_DG-53DG-52:DC52DC53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DG 44 1_555 J DC 126 1_555 I DC 45 1_555 J DG 125 1_555 0.018 -0.182 3.129 -2.071 4.333 35.621 -0.885 -0.312 3.080 7.043 3.367 35.933 22 II_DG-52DC-51:DG51DC52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DC 45 1_555 J DG 125 1_555 I DC 46 1_555 J DG 124 1_555 -0.184 -0.432 3.255 -0.957 9.164 34.132 -2.040 0.164 3.045 15.270 1.594 35.318 23 II_DC-51DC-50:DG50DG51_JJ I -51 ? J 51 ? I -50 ? J 50 ? 1 I DC 46 1_555 J DG 124 1_555 I DG 47 1_555 J DC 123 1_555 0.276 0.168 3.227 0.392 3.620 35.120 -0.254 -0.398 3.230 5.979 -0.648 35.302 24 II_DC-50DG-49:DC49DG50_JJ I -50 ? J 50 ? I -49 ? J 49 ? 1 I DG 47 1_555 J DC 123 1_555 I DC 48 1_555 J DG 122 1_555 0.701 0.114 3.335 4.702 0.865 37.358 0.060 -0.456 3.397 1.344 -7.303 37.652 25 II_DG-49DC-48:DG48DC49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 48 1_555 J DG 122 1_555 I DT 49 1_555 J DA 121 1_555 -0.138 0.633 3.621 1.695 -0.065 34.360 1.082 0.526 3.609 -0.110 -2.867 34.400 26 II_DC-48DT-47:DA47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DT 49 1_555 J DA 121 1_555 I DC 50 1_555 J DG 120 1_555 0.251 1.372 3.694 0.213 -3.547 42.528 2.282 -0.321 3.575 -4.880 -0.293 42.669 27 II_DT-47DC-46:DG46DA47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DC 50 1_555 J DG 120 1_555 I DA 51 1_555 J DT 119 1_555 -0.180 1.983 3.627 0.769 -6.107 41.587 3.441 0.336 3.313 -8.545 -1.076 42.020 28 II_DC-46DA-45:DT45DG46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 51 1_555 J DT 119 1_555 I DA 52 1_555 J DT 118 1_555 -1.080 1.062 3.469 -3.369 1.026 37.127 1.515 1.209 3.577 1.607 5.277 37.288 29 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 52 1_555 J DT 118 1_555 I DT 53 1_555 J DA 117 1_555 -0.325 -0.181 3.308 -6.194 2.486 33.118 -0.721 -0.462 3.291 4.307 10.731 33.766 30 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DT 53 1_555 J DA 117 1_555 I DT 54 1_555 J DA 116 1_555 0.343 0.118 3.419 -4.361 5.380 33.570 -0.682 -1.297 3.328 9.194 7.452 34.257 31 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DT 54 1_555 J DA 116 1_555 I DG 55 1_555 J DC 115 1_555 0.400 0.514 3.206 -2.340 8.410 35.849 -0.321 -0.947 3.209 13.419 3.733 36.862 32 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DG 55 1_555 J DC 115 1_555 I DG 56 1_555 J DC 114 1_555 0.503 -0.526 3.293 -0.130 5.420 28.245 -2.265 -1.041 3.137 10.980 0.264 28.750 33 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 I DG 56 1_555 J DC 114 1_555 I DT 57 1_555 J DA 113 1_555 -0.006 -0.853 3.409 3.059 4.275 32.119 -2.288 0.558 3.257 7.662 -5.482 32.535 34 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 I DT 57 1_555 J DA 113 1_555 I DC 58 1_555 J DG 112 1_555 0.603 -0.149 3.413 6.587 1.889 40.007 -0.438 -0.093 3.455 2.737 -9.543 40.566 35 II_DT-39DC-38:DG38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 I DC 58 1_555 J DG 112 1_555 I DG 59 1_555 J DC 111 1_555 -0.108 0.039 3.341 1.050 0.377 32.661 0.003 0.378 3.336 0.670 -1.866 32.680 36 II_DC-38DG-37:DC37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DG 59 1_555 J DC 111 1_555 I DT 60 1_555 J DA 110 1_555 0.072 0.092 3.620 2.101 -0.512 36.393 0.226 0.208 3.617 -0.819 -3.361 36.455 37 II_DG-37DT-36:DA36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DT 60 1_555 J DA 110 1_555 I DA 61 1_555 J DT 109 1_555 -0.993 1.938 3.531 0.115 -5.344 47.245 2.856 1.242 3.303 -6.643 -0.143 47.529 38 II_DT-36DA-35:DT35DA36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DA 61 1_555 J DT 109 1_555 I DG 62 1_555 J DC 108 1_555 -0.164 0.996 3.610 -3.371 -0.547 31.601 1.930 -0.383 3.591 -1.000 6.167 31.780 39 II_DA-35DG-34:DC34DT35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DG 62 1_555 J DC 108 1_555 I DA 63 1_555 J DT 107 1_555 -1.190 1.485 3.325 -5.617 3.213 39.490 1.781 1.058 3.560 4.716 8.245 39.996 40 II_DG-34DA-33:DT33DC34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? J 33 ? 1 I DA 63 1_555 J DT 107 1_555 I DC 64 1_555 J DG 106 1_555 0.374 -0.078 3.050 -7.932 6.858 29.226 -1.356 -2.101 2.768 13.072 15.120 31.012 41 II_DA-33DC-32:DG32DT33_JJ I -33 ? J 33 ? I -32 ? J 32 ? 1 I DC 64 1_555 J DG 106 1_555 I DA 65 1_555 J DT 105 1_555 0.063 0.045 3.262 -0.676 16.373 33.587 -2.114 -0.189 2.968 26.467 1.094 37.268 42 II_DC-32DA-31:DT31DG32_JJ I -32 ? J 32 ? I -31 ? J 31 ? 1 I DA 65 1_555 J DT 105 1_555 I DG 66 1_555 J DC 104 1_555 -0.161 -0.579 3.401 -1.217 3.348 32.800 -1.606 0.070 3.331 5.907 2.147 32.987 43 II_DA-31DG-30:DC30DT31_JJ I -31 ? J 31 ? I -30 ? J 30 ? 1 I DG 66 1_555 J DC 104 1_555 I DC 67 1_555 J DG 103 1_555 -0.193 -0.336 3.264 -3.624 2.855 32.398 -1.087 -0.282 3.226 5.084 6.455 32.717 44 II_DG-30DC-29:DG29DC30_JJ I -30 ? J 30 ? I -29 ? J 29 ? 1 I DC 67 1_555 J DG 103 1_555 I DT 68 1_555 J DA 102 1_555 0.391 -0.089 3.353 -0.417 3.667 36.117 -0.668 -0.687 3.324 5.895 0.670 36.299 45 II_DC-29DT-28:DA28DG29_JJ I -29 ? J 29 ? I -28 ? J 28 ? 1 I DT 68 1_555 J DA 102 1_555 I DC 69 1_555 J DG 101 1_555 0.387 0.643 3.384 2.276 2.621 34.751 0.657 -0.285 3.440 4.375 -3.799 34.918 46 II_DT-28DC-27:DG27DA28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? 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J 22 ? 1 I DA 74 1_555 J DT 96 1_555 I DC 75 1_555 J DG 95 1_555 0.209 -1.239 3.295 -0.913 3.105 27.998 -3.260 -0.639 3.134 6.390 1.879 28.181 52 II_DA-22DC-21:DG21DT22_JJ I -22 ? J 22 ? I -21 ? J 21 ? 1 I DC 75 1_555 J DG 95 1_555 I DC 76 1_555 J DG 94 1_555 0.664 -0.144 3.441 2.895 0.334 35.096 -0.291 -0.642 3.482 0.552 -4.791 35.213 53 II_DC-21DC-20:DG20DG21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 76 1_555 J DG 94 1_555 I DG 77 1_555 J DC 93 1_555 0.047 -0.472 3.004 -0.598 14.255 26.344 -3.534 -0.200 2.432 28.752 1.207 29.899 54 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 77 1_555 J DC 93 1_555 I DC 78 1_555 J DG 92 1_555 -0.248 -0.461 3.234 3.584 4.580 36.539 -1.330 0.862 3.118 7.249 -5.672 36.984 55 II_DG-19DC-18:DG18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DC 78 1_555 J DG 92 1_555 I DT 79 1_555 J DA 91 1_555 -0.131 -0.521 3.277 5.085 3.022 32.826 -1.407 1.067 3.162 5.294 -8.908 33.340 56 II_DC-18DT-17:DA17DG18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 79 1_555 J DA 91 1_555 I DT 80 1_555 J DA 90 1_555 1.508 0.869 3.640 9.252 -6.115 37.406 2.154 -0.974 3.714 -9.287 -14.052 38.959 57 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? J 16 ? 1 I DT 80 1_555 J DA 90 1_555 I DA 81 1_555 J DT 89 1_555 -1.045 1.022 3.528 -1.970 -3.261 36.638 2.092 1.366 3.477 -5.170 3.124 36.829 58 II_DT-16DA-15:DT15DA16_JJ I -16 ? J 16 ? I -15 ? J 15 ? 1 I DA 81 1_555 J DT 89 1_555 I DA 82 1_555 J DT 88 1_555 0.422 0.504 3.553 -1.258 -2.577 34.397 1.280 -0.922 3.490 -4.349 2.122 34.513 59 II_DA-15DA-14:DT14DT15_JJ I -15 ? J 15 ? I -14 ? J 14 ? 1 I DA 82 1_555 J DT 88 1_555 I DA 83 1_555 J DT 87 1_555 -0.572 0.256 3.384 -3.058 2.001 41.310 0.139 0.469 3.424 2.829 4.324 41.464 60 II_DA-14DA-13:DT13DT14_JJ I -14 ? J 14 ? I -13 ? J 13 ? 1 I DA 83 1_555 J DT 87 1_555 I DC 84 1_555 J DG 86 1_555 -0.695 -0.152 3.267 -7.559 0.402 37.848 -0.281 0.099 3.338 0.612 11.513 38.571 61 II_DA-13DC-12:DG12DT13_JJ I -13 ? J 13 ? I -12 ? J 12 ? 1 I DC 84 1_555 J DG 86 1_555 I DG 85 1_555 J DC 85 1_555 0.160 0.193 3.165 -3.444 4.335 32.617 -0.370 -0.845 3.132 7.649 6.078 33.071 62 II_DC-12DG-11:DC11DG12_JJ I -12 ? J 12 ? I -11 ? J 11 ? 1 I DG 85 1_555 J DC 85 1_555 I DC 86 1_555 J DG 84 1_555 0.239 -0.150 3.275 -2.770 4.322 33.483 -0.950 -0.854 3.202 7.447 4.773 33.863 63 II_DG-11DC-10:DG10DC11_JJ I -11 ? J 11 ? I -10 ? J 10 ? 1 I DC 86 1_555 J DG 84 1_555 I DA 87 1_555 J DT 83 1_555 -0.272 -0.136 3.175 -2.665 9.156 34.685 -1.489 0.072 3.054 15.010 4.369 35.933 64 II_DC-10DA-9:DT9DG10_JJ I -10 ? J 10 ? I -9 ? J 9 ? 1 I DA 87 1_555 J DT 83 1_555 I DC 88 1_555 J DG 82 1_555 0.022 -0.470 3.435 0.972 3.152 31.480 -1.469 0.146 3.372 5.789 -1.785 31.647 65 II_DA-9DC-8:DG8DT9_JJ I -9 ? J 9 ? I -8 ? J 8 ? 1 I DC 88 1_555 J DG 82 1_555 I DG 89 1_555 J DC 81 1_555 0.522 0.233 3.338 1.643 0.857 34.158 0.257 -0.622 3.363 1.457 -2.795 34.207 66 II_DC-8DG-7:DC7DG8_JJ I -8 ? J 8 ? I -7 ? J 7 ? 1 I DG 89 1_555 J DC 81 1_555 I DT 90 1_555 J DA 80 1_555 -0.173 0.697 3.735 1.522 -0.321 36.323 1.168 0.520 3.719 -0.515 -2.440 36.355 67 II_DG-7DT-6:DA6DC7_JJ I -7 ? J 7 ? I -6 ? J 6 ? 1 I DT 90 1_555 J DA 80 1_555 I DA 91 1_555 J DT 79 1_555 -0.422 1.997 3.586 2.255 -6.822 46.104 3.123 0.731 3.253 -8.649 -2.859 46.630 68 II_DT-6DA-5:DT5DA6_JJ I -6 ? J 6 ? I -5 ? J 5 ? 1 I DA 91 1_555 J DT 79 1_555 I DC 92 1_555 J DG 78 1_555 -0.169 0.735 3.206 -5.031 -2.048 34.436 1.531 -0.466 3.151 -3.433 8.432 34.849 69 II_DA-5DC-4:DG4DT5_JJ I -5 ? J 5 ? I -4 ? J 4 ? 1 I DC 92 1_555 J DG 78 1_555 I DG 93 1_555 J DC 77 1_555 -0.849 1.251 3.603 -5.242 1.336 36.297 1.782 0.541 3.728 2.131 8.357 36.684 70 II_DC-4DG-3:DC3DG4_JJ I -4 ? J 4 ? I -3 ? J 3 ? 1 I DG 93 1_555 J DC 77 1_555 I DC 94 1_555 J DG 76 1_555 0.569 0.096 3.353 -4.174 2.209 34.926 -0.174 -1.570 3.265 3.659 6.914 35.234 71 II_DG-3DC-2:DG2DC3_JJ I -3 ? J 3 ? I -2 ? J 2 ? 1 I DC 94 1_555 J DG 76 1_555 I DG 95 1_555 J DC 75 1_555 -0.208 0.414 3.341 -2.547 2.472 34.118 0.303 -0.057 3.369 4.199 4.326 34.297 72 II_DC-2DG-1:DC1DG2_JJ I -2 ? J 2 ? I -1 ? J 1 ? 1 I DG 95 1_555 J DC 75 1_555 I DC 96 1_555 J DG 74 1_555 0.149 -0.672 3.374 -2.410 3.846 32.457 -1.866 -0.687 3.255 6.838 4.286 32.764 73 II_DG-1DC0:DG0DC1_JJ I -1 ? J 1 ? I 0 ? J 0 ? 1 I DC 96 1_555 J DG 74 1_555 I DT 97 1_555 J DA 73 1_555 0.163 -0.712 3.217 1.615 3.601 31.906 -1.913 -0.013 3.124 6.519 -2.924 32.143 74 II_DC0DT1:DA-1DG0_JJ I 0 ? J 0 ? I 1 ? J -1 ? 1 I DT 97 1_555 J DA 73 1_555 I DG 98 1_555 J DC 72 1_555 0.067 0.108 3.264 4.879 9.880 35.977 -1.129 0.536 3.166 15.552 -7.680 37.573 75 II_DT1DG2:DC-2DA-1_JJ I 1 ? J -1 ? I 2 ? J -2 ? 1 I DG 98 1_555 J DC 72 1_555 I DT 99 1_555 J DA 71 1_555 -0.310 -0.253 3.365 -0.451 2.555 31.992 -0.928 0.477 3.339 4.625 0.816 32.095 76 II_DG2DT3:DA-3DC-2_JJ I 2 ? J -2 ? I 3 ? 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