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O U 21 "O2'" # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8JAY _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8JAY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8JAY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8JAY _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 33108 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.634 ? 45425 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.365 ? 5657 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 4909 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5180 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8JAY _struct.title 'CrtSPARTA Octamer bound with guide-target' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8JAY _struct_keywords.text 'SPARTA, Ago, Tir, DNA BINDING PROTEIN/DNA/RNA, DNA BINDING PROTEIN-DNA-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 5 ? R N N 5 ? S N N 5 ? T N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A1I7NFD7_9BACT A0A1I7NFD7 ? 1 ;MKELIYIEEPSILFAHGQKCTDPRDGLALFGPLNQIYGIKSGVVGTQKGLQIFKSYLDKIQKPIYNHNNITRPMFPGFEA VFGCKWESQNIVFKEITDEEIRRYLFNASTHKRTYDLVTLFNDKIITANKNDEERVDVWFVIVPEEIYKYCRPNSVLPNE LVQTKSLISKSKAKSFRYTPTLFEEFNKKLKEVEKEAKTYNYDAQFHDQLKARLLEHTIPTQILRESTLAWRDFKNTFGA PIRDFSKIEGHLAWTISTAAYYKAGGKPWKLGDIRPGVCYLGLVYKKIEKSKNPQNACCAAQMFLDNGDGTVFKGEVGPW YNPEKGEYHLKPKEAKALLTQALESYKEQNKSYPKEVFIHARTRFNDEEWNAFNEVTPKNTNLVGVTITKSKPLKLYKTE GAFPIMRGNAYIVDEKKAFLWTLGFVPKLQSTLSMEVPNPIFIEINKGEAEIQQVLKDILALTKLNYNACIYADGEPVTL RFANKIGEILTASTEIKTPPLAFKYYI ; 1 2 UNP A0A1I7NFG5_9BACT A0A1I7NFG5 ? 2 ;MRNKIFISHATPEDDDFTRWLSLKLIGLGYEVWCDILFLDKGVDFWSTIEKEIRENTCKFLIVSSTAGNKREGVLKELAV ATKVKKHLQDDMFIIPLAIDENLSYDDINIEIVRLNAIDFKKSWAKGLQDLLDAFEKQNVPKKPPDHSKSNLLYQQIFLH DKQAIEKEETYDSNWFPIISFPNELRFHRYDWRLPKQFDVRTLAFPAIRYKEYLCTFAWEYDFIHQLPKTETYNGQESIR ISTSDILSGRYDTDFIRNYECQRLIVQLINKAFELRMKDKNVREYQMSKTFAYWIEKGKLEKDKFEKIKLVGKQKNKYWH FGISAAGKLYPSPVLMVSSHIIFTMDGINLIKSKSIQHSSRRKQGKNWWNDKWREKLLAFIRFLSDDQNAIYLNVGSEEK ILISNKPLKFFGKMSYVTPSEVTLEEESVLADINNFEEDTEDLDELEDIE ; 1 3 PDB 8JAY 8JAY ? 3 ? 1 4 PDB 8JAY 8JAY ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8JAY C 1 ? 507 ? 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A0A1I7NFG5 1 ? 450 ? 1 450 9 3 8JAY E 1 ? 21 ? 8JAY 1 ? 21 ? 1 21 10 4 8JAY F 1 ? 25 ? 8JAY 1 ? 25 ? 1 25 11 3 8JAY G 1 ? 21 ? 8JAY 1 ? 21 ? 1 21 12 4 8JAY H 1 ? 25 ? 8JAY 1 ? 25 ? 1 25 13 3 8JAY K 1 ? 21 ? 8JAY 1 ? 21 ? 1 21 14 4 8JAY L 1 ? 25 ? 8JAY 1 ? 25 ? 1 25 15 3 8JAY O 1 ? 21 ? 8JAY 1 ? 21 ? 1 21 16 4 8JAY P 1 ? 25 ? 8JAY 1 ? 25 ? 1 25 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 15 ? GLY A 17 ? ALA C 15 GLY C 17 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 22 ? PHE A 30 ? ASP C 22 PHE C 30 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 46 ? ILE A 60 ? THR C 46 ILE C 60 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 77 ? PHE A 82 ? GLY C 77 PHE C 82 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 109 ? ASP A 132 ? SER C 109 ASP C 132 1 ? 24 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN A 205 ? LEU A 215 ? GLN C 205 LEU C 215 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 216 ? THR A 218 ? GLU C 216 THR C 218 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 226 ? ALA A 230 ? GLU C 226 ALA C 230 1 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 ILE A 248 ? GLY A 265 ? ILE C 248 GLY C 265 1 ? 18 HELX_P HELX_P10 AB1 LYS A 331 ? LYS A 351 ? LYS C 331 LYS C 351 1 ? 21 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN A 366 ? VAL A 376 ? ASN C 366 VAL C 376 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU A 451 ? LEU A 462 ? GLU C 451 LEU C 462 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO A 477 ? THR A 491 ? PRO C 477 THR C 491 1 ? 15 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA A 502 ? ILE A 507 ? ALA C 502 ILE C 507 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA B 15 ? GLY B 17 ? ALA A 15 GLY A 17 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP B 22 ? PHE B 30 ? ASP A 22 PHE A 30 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 46 ? ILE B 60 ? THR A 46 ILE A 60 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 AB9 SER B 109 ? ASP B 132 ? SER A 109 ASP A 132 1 ? 24 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN B 205 ? LEU B 215 ? GLN A 205 LEU A 215 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 GLU B 216 ? THR B 218 ? GLU A 216 THR A 218 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 ARG B 225 ? ALA B 230 ? ARG A 225 ALA A 230 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 ILE B 248 ? GLY B 265 ? ILE A 248 GLY A 265 1 ? 18 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS B 331 ? LYS B 351 ? LYS A 331 LYS A 351 1 ? 21 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP B 367 ? THR B 377 ? ASP A 367 THR A 377 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU B 451 ? LEU B 462 ? GLU A 451 LEU A 462 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO B 477 ? THR B 491 ? PRO A 477 THR A 491 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP C 15 ? LEU C 28 ? ASP D 15 LEU D 28 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 AD1 TRP C 46 ? ASN C 56 ? TRP D 46 ASN D 56 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 AD2 ARG C 71 ? GLN C 89 ? 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