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KA 12 UTI 1 600 600 UTI UTI 9 . # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 B LYS 418 ? CG ? B LYS 418 CG 2 1 Y 1 B LYS 418 ? CD ? B LYS 418 CD 3 1 Y 1 B LYS 418 ? CE ? B LYS 418 CE 4 1 Y 1 B LYS 418 ? NZ ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.583 ? 51821 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.227 ? 22703 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 5994 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 6733 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8JR0 _struct.title 'Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis ATP synthase in complex with TBAJ-587' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8JR0 _struct_keywords.text 'ATP synthase, Mycobacterium tuberculosis, cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 5 ? 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THR d 432 ARG d 443 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A THR 179 OG1 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? A THR 179 A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? metalc2 metalc ? ? U ATP . O1G ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? A ATP 600 A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? ? metalc3 metalc ? ? U ATP . O1B ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? A ATP 600 A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? ? metalc4 metalc ? ? B THR 179 OG1 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? B THR 179 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? metalc5 metalc ? ? W ATP . O1G ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? B ATP 600 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? ? metalc6 metalc ? ? W ATP . O1B ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? B ATP 600 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? metalc7 metalc ? ? C THR 179 OG1 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? C THR 179 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? metalc8 metalc ? ? Y ATP . O1G ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? ? metalc9 metalc ? ? Y ATP . O1B ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? ? metalc10 metalc ? ? D THR 178 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? D THR 178 D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.815 ? ? metalc11 metalc ? ? AA ADP . O3B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? D ADP 600 D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.747 ? ? metalc12 metalc ? ? F THR 178 OG1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F THR 178 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? metalc13 metalc ? ? CA ADP . O3B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F ADP 600 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG1 ? A THR 179 ? A THR 179 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 601 ? 1_555 O1G ? U ATP . ? A ATP 600 ? 1_555 150.8 ? 2 OG1 ? A THR 179 ? A THR 179 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 601 ? 1_555 O1B ? U ATP . ? A ATP 600 ? 1_555 75.0 ? 3 O1G ? U ATP . ? A ATP 600 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 601 ? 1_555 O1B ? U ATP . ? A ATP 600 ? 1_555 80.0 ? 4 OG1 ? B THR 179 ? B THR 179 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 601 ? 1_555 O1G ? W ATP . ? B ATP 600 ? 1_555 130.4 ? 5 OG1 ? B THR 179 ? B THR 179 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 601 ? 1_555 O1B ? W ATP . ? B ATP 600 ? 1_555 68.5 ? 6 O1G ? W ATP . ? B ATP 600 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 601 ? 1_555 O1B ? W ATP . ? B ATP 600 ? 1_555 75.7 ? 7 OG1 ? C THR 179 ? C THR 179 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 601 ? 1_555 O1G ? Y ATP . ? C ATP 600 ? 1_555 144.1 ? 8 OG1 ? C THR 179 ? C THR 179 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 601 ? 1_555 O1B ? Y ATP . ? C ATP 600 ? 1_555 92.5 ? 9 O1G ? Y ATP . ? C ATP 600 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 601 ? 1_555 O1B ? Y ATP . ? C ATP 600 ? 1_555 75.4 ? 10 OG1 ? D THR 178 ? D THR 178 ? 1_555 MG ? BA MG . ? D MG 601 ? 1_555 O3B ? AA ADP . ? D ADP 600 ? 1_555 91.2 ? 11 OG1 ? F THR 178 ? F THR 178 ? 1_555 MG ? DA MG . ? F MG 601 ? 1_555 O3B ? CA ADP . ? F ADP 600 ? 1_555 74.5 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 365 A . ? ARG 365 A PRO 366 A ? PRO 366 A 1 0.90 2 ARG 365 B . ? ARG 365 B PRO 366 B ? PRO 366 B 1 3.51 3 ARG 365 C . ? ARG 365 C PRO 366 C ? PRO 366 C 1 2.58 4 PHE 354 D . ? PHE 354 D PRO 355 D ? PRO 355 D 1 -1.00 5 PHE 354 E . ? PHE 354 E PRO 355 E ? PRO 355 E 1 0.51 6 PHE 354 F . ? PHE 354 F PRO 355 F ? PRO 355 F 1 -2.51 7 ALA 203 G . ? ALA 203 G PRO 204 G ? PRO 204 G 1 0.22 8 GLU 223 G . ? GLU 223 G PRO 224 G ? PRO 224 G 1 1.93 9 ALA 158 T . ? ALA 158 d PRO 159 T ? PRO 159 d 1 -7.43 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 11 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 8 ? AA4 ? 14 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 8 ? AA7 ? 14 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 8 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 8 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 8 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 8 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? anti-parallel AA1 10 11 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA4 8 9 ? anti-parallel AA4 9 10 ? anti-parallel AA4 10 11 ? anti-parallel AA4 11 12 ? anti-parallel AA4 12 13 ? anti-parallel AA4 13 14 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? parallel AA6 6 7 ? parallel AA6 7 8 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA7 8 9 ? anti-parallel AA7 9 10 ? anti-parallel AA7 10 11 ? anti-parallel AA7 11 12 ? anti-parallel AA7 12 13 ? anti-parallel AA7 13 14 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB3 6 7 ? parallel AB3 7 8 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB5 6 7 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? parallel AB7 7 8 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC1 6 7 ? parallel AC1 7 8 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL T 406 ? 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