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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.765 ? 23890 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.971 ? 3012 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.067 ? 3070 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 2860 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8JTM _struct.title 'CNE55.664 trimer in complex with broadly neutralizing HIV antibody PGT145' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8JTM _struct_keywords.text 'HIV, Envelope trimer, broadly neutralizing antibody, PGT145, Cryo-EM, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 6 ? N N N 7 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 6 ? 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THR E 627 SER E 636 1 ? 10 HELX_P HELX_P44 AE8 TYR E 127 ? GLN E 139 ? TYR E 638 GLN E 650 1 ? 13 HELX_P HELX_P45 AE9 GLN E 139 ? ASP E 153 ? GLN E 650 ASP E 664 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 AF1 LEU F 12 ? SER F 17 ? LEU F 523 SER F 528 5 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY F 20 ? MET F 24 ? GLY F 531 MET F 535 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 THR F 25 ? ARG F 31 ? THR F 536 ARG F 542 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 AF4 ASN F 32 ? LEU F 34 ? ASN F 543 LEU F 545 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 THR F 58 ? TRP F 85 ? THR F 569 TRP F 596 1 ? 28 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN F 100 ? SER F 104 ? ASN F 611 SER F 615 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN F 107 ? MET F 115 ? ASN F 618 MET F 626 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 AF8 THR F 116 ? ILE F 124 ? THR F 627 ILE F 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P54 AF9 TYR F 127 ? SER F 138 ? TYR F 638 SER F 649 1 ? 12 HELX_P HELX_P55 AG1 GLN F 139 ? ASP F 153 ? GLN F 650 ASP F 664 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 AG2 GLY G 49 ? ASN G 54 ? GLY J 26 ASN J 31 5 ? 6 HELX_P HELX_P57 AG3 GLN G 85 ? GLN G 88 ? 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A CYS 469 SG ? ? ? 1_555 B CYS 94 SG ? ? A CYS 501 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 87 SG ? ? ? 1_555 B CYS 93 SG ? ? B CYS 598 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 24 SG ? ? ? 1_555 C CYS 44 SG ? ? C CYS 54 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 89 SG ? ? ? 1_555 C CYS 175 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 96 SG ? ? ? 1_555 C CYS 166 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? C CYS 101 SG ? ? ? 1_555 C CYS 119 SG ? ? C CYS 131 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf16 disulf ? ? C CYS 188 SG ? ? ? 1_555 C CYS 217 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf17 disulf ? ? C CYS 198 SG ? ? ? 1_555 C CYS 209 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? C CYS 266 SG ? ? ? 1_555 C CYS 300 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf19 disulf ? ? C CYS 347 SG ? ? ? 1_555 C CYS 413 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf20 disulf ? ? C CYS 354 SG ? ? ? 1_555 C CYS 386 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf21 disulf ? ? C CYS 469 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? C CYS 501 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf22 disulf ? ? D CYS 24 SG ? ? ? 1_555 D CYS 44 SG ? ? D CYS 54 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf23 disulf ? ? D CYS 89 SG ? ? ? 1_555 D CYS 175 SG ? ? D CYS 119 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf24 disulf ? ? D CYS 96 SG ? ? ? 1_555 D CYS 166 SG ? ? D CYS 126 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf25 disulf ? ? D CYS 101 SG ? ? ? 1_555 D CYS 119 SG ? ? D CYS 131 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf26 disulf ? ? D CYS 188 SG ? ? ? 1_555 D CYS 217 SG ? ? D CYS 218 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf27 disulf ? ? D CYS 198 SG ? ? ? 1_555 D CYS 209 SG ? ? D CYS 228 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf28 disulf ? ? D CYS 266 SG ? ? ? 1_555 D CYS 300 SG ? ? D CYS 296 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf29 disulf ? ? D CYS 347 SG ? ? ? 1_555 D CYS 413 SG ? ? D CYS 378 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf30 disulf ? ? D CYS 354 SG ? ? ? 1_555 D CYS 386 SG ? ? D CYS 385 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf31 disulf ? ? D CYS 469 SG ? ? ? 1_555 E CYS 94 SG ? ? D CYS 501 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf32 disulf ? ? E CYS 87 SG ? ? ? 1_555 E CYS 93 SG ? ? E CYS 598 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf33 disulf ? ? F CYS 87 SG ? ? ? 1_555 F CYS 93 SG ? ? F CYS 598 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf34 disulf ? ? G CYS 45 SG ? ? ? 1_555 G CYS 119 SG ? ? J CYS 22 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf35 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 93 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? covale1 covale one ? A ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 88 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 133 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 156 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 160 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 197 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 262 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 295 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 301 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 332 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 363 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 386 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? A ASN 392 A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 448 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? B ASN 611 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? B ASN 618 B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? B ASN 637 B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? C ASN 88 C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? C ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 133 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 156 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? C ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 160 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? C ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 197 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? C ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? C ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 262 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? C ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? C ASN 295 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? C ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 301 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? C ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 332 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? C ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? C ASN 339 C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? C ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? C ASN 355 C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? C ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 363 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 386 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 392 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 448 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? D ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? D ASN 88 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? D ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? D ASN 133 D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? D ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? D ASN 156 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? D ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? D ASN 160 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? D ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? D ASN 197 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? D ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? D ASN 234 D NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? D ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? D ASN 262 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? D ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? D ASN 295 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? D ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? D ASN 301 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? D ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? D ASN 332 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? D ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? D ASN 339 D NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? D ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? D ASN 355 D NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? D ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? D ASN 363 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? D ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? D ASN 386 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? D ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? D ASN 392 D NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? D ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? D ASN 448 z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? E ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? E ASN 611 E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? E ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? E ASN 618 E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? E ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? E ASN 637 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? F ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? F ASN 611 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? F ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? F ASN 618 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? F ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? F ASN 637 F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale58 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale59 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale60 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale61 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale62 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale63 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale64 covale both ? N NAG . 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C1 ? ? q MAN 6 q MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale110 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale111 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale112 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA BMA . C1 ? ? s NAG 2 s BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale113 covale both ? KA BMA . O3 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale114 covale both ? KA BMA . O6 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale115 covale both ? KA MAN . O2 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? s MAN 4 s MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale116 covale both ? KA MAN . O3 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? s MAN 6 s MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale117 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? u NAG 1 u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale118 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . 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