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N . n # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 N LYS 30 ? CG ? N LYS 31 CG 2 1 Y 1 N LYS 30 ? CD ? N LYS 31 CD 3 1 Y 1 N LYS 30 ? CE ? N LYS 31 CE 4 1 Y 1 N LYS 30 ? NZ ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.595 ? 45440 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.636 ? 4438 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.049 ? 4872 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 5866 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8JX3 _struct.title 'alpha-Hemolysin(G122S/K147R/K237C)-SpyTag/SpyCatcher head to head 14-mer' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8JX3 _struct_keywords.text 'pore, chimera protein, spy-catcher, spy-tag, dimer, TOXIN' _struct_keywords.pdbx_keywords TOXIN # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? 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'expression tag' 323 1155 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 3 ? 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ASP D 212 ALA D 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 SER D 218 ? SER D 223 ? SER D 217 SER D 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP E 3 ? ASN E 7 ? ASP E 2 ASN E 6 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS E 206 ? ASN E 210 ? LYS E 205 ASN E 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP E 213 ? ALA E 217 ? ASP E 212 ALA E 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 SER E 218 ? SER E 223 ? SER E 217 SER E 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP F 3 ? ASN F 7 ? ASP F 2 ASN F 6 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS F 206 ? ASN F 210 ? LYS F 205 ASN F 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP F 213 ? ALA F 217 ? ASP F 212 ALA F 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 SER F 218 ? SER F 223 ? SER F 217 SER F 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA G 2 ? ASN G 7 ? ALA G 1 ASN G 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 LYS G 206 ? ASN G 210 ? LYS G 205 ASN G 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP G 213 ? ALA G 217 ? ASP G 212 ALA G 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 SER G 218 ? SER G 223 ? SER G 217 SER G 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA H 2 ? ASN H 7 ? ALA H 1 ASN H 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 LYS H 206 ? ASN H 210 ? LYS H 205 ASN H 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP H 213 ? ALA H 217 ? ASP H 212 ALA H 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 SER H 218 ? SER H 223 ? SER H 217 SER H 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA I 2 ? ASN I 7 ? ALA I 1 ASN I 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS I 206 ? ASN I 210 ? LYS I 205 ASN I 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP I 213 ? ALA I 217 ? ASP I 212 ALA I 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 SER I 218 ? SER I 223 ? SER I 217 SER I 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 ALA J 2 ? ASN J 7 ? ALA J 1 ASN J 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P38 AE2 LYS J 206 ? ASN J 210 ? LYS J 205 ASN J 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP J 213 ? ALA J 217 ? ASP J 212 ALA J 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 SER J 218 ? SER J 223 ? SER J 217 SER J 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 ALA K 2 ? ASN K 7 ? ALA K 1 ASN K 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 LYS K 206 ? ASN K 210 ? LYS K 205 ASN K 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP K 213 ? ALA K 217 ? ASP K 212 ALA K 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 AE8 SER K 218 ? SER K 223 ? SER K 217 SER K 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 ALA L 2 ? ASN L 7 ? ALA L 1 ASN L 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 LYS L 206 ? ASN L 210 ? LYS L 205 ASN L 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP L 213 ? ALA L 217 ? ASP L 212 ALA L 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 SER L 218 ? SER L 223 ? SER L 217 SER L 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P49 AF4 ALA M 2 ? ASN M 7 ? ALA M 1 ASN M 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS M 206 ? ASN M 210 ? LYS M 205 ASN M 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP M 213 ? ALA M 217 ? ASP M 212 ALA M 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 SER M 218 ? SER M 223 ? SER M 217 SER M 222 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 ALA N 2 ? ASN N 7 ? ALA N 1 ASN N 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 LYS N 206 ? ASN N 210 ? LYS N 205 ASN N 209 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP N 213 ? ALA N 217 ? ASP N 212 ALA N 216 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 AG2 SER N 218 ? SER N 223 ? SER N 217 SER N 222 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 238 SG ? ? ? 1_555 L CYS 238 SG ? ? A CYS 237 L CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 238 SG ? ? ? 1_555 K CYS 238 SG ? ? B CYS 237 K CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 238 SG ? ? ? 1_555 J CYS 238 SG ? ? C CYS 237 J CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 238 SG ? ? ? 1_555 I CYS 238 SG ? ? D CYS 237 I CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 238 SG ? ? ? 1_555 H CYS 238 SG ? ? E CYS 237 H CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 238 SG ? ? ? 1_555 N CYS 238 SG ? ? F CYS 237 N CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf7 disulf ? ? G CYS 238 SG ? ? ? 1_555 M CYS 238 SG ? ? G CYS 237 M CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 103 A . ? TYR 102 A PRO 104 A ? PRO 103 A 1 0.82 2 GLY 181 A . ? GLY 180 A PRO 182 A ? PRO 181 A 1 2.47 3 TYR 103 B . ? TYR 102 B PRO 104 B ? 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