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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.506 ? 29133 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.406 ? 7529 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 3543 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 3542 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8K1S _struct.title 'Potassium transporter KtrAB from Bacillus subtilis in ADP-bound state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8K1S _struct_keywords.text 'KtrAB, RCK, potassium, transporter, TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? 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ILE A 54 ? HIS A 51 ILE A 54 AA1 2 GLU A 31 ? ASP A 36 ? GLU A 31 ASP A 36 AA1 3 GLN A 8 ? ILE A 12 ? GLN A 8 ILE A 12 AA1 4 TYR A 73 ? VAL A 76 ? TYR A 73 VAL A 76 AA1 5 ASN A 99 ? LYS A 103 ? ASN A 99 LYS A 103 AA1 6 ARG A 120 ? ILE A 122 ? ARG A 120 ILE A 122 AA2 1 HIS B 51 ? ILE B 54 ? HIS B 51 ILE B 54 AA2 2 GLU B 31 ? ASP B 36 ? GLU B 31 ASP B 36 AA2 3 GLN B 8 ? ILE B 12 ? GLN B 8 ILE B 12 AA2 4 TYR B 73 ? VAL B 76 ? TYR B 73 VAL B 76 AA2 5 ASN B 99 ? LYS B 103 ? ASN B 99 LYS B 103 AA2 6 ARG B 120 ? ILE B 122 ? ARG B 120 ILE B 122 AA3 1 HIS C 51 ? ILE C 54 ? HIS C 51 ILE C 54 AA3 2 GLU C 31 ? ASP C 36 ? GLU C 31 ASP C 36 AA3 3 GLN C 8 ? ILE C 12 ? GLN C 8 ILE C 12 AA3 4 TYR C 73 ? VAL C 76 ? TYR C 73 VAL C 76 AA3 5 ASN C 99 ? LYS C 103 ? ASN C 99 LYS C 103 AA3 6 ARG C 120 ? ILE C 122 ? ARG C 120 ILE C 122 AA4 1 HIS D 51 ? ILE D 54 ? HIS D 51 ILE D 54 AA4 2 GLU D 31 ? ASP D 36 ? GLU D 31 ASP D 36 AA4 3 GLN D 8 ? ILE D 12 ? GLN D 8 ILE D 12 AA4 4 TYR D 73 ? VAL D 76 ? TYR D 73 VAL D 76 AA4 5 ASN D 99 ? LYS D 103 ? ASN D 99 LYS D 103 AA4 6 ARG D 120 ? ILE D 122 ? ARG D 120 ILE D 122 AA5 1 HIS E 51 ? ILE E 54 ? HIS E 51 ILE E 54 AA5 2 GLU E 31 ? ASP E 36 ? GLU E 31 ASP E 36 AA5 3 GLN E 8 ? ILE E 12 ? GLN E 8 ILE E 12 AA5 4 TYR E 73 ? VAL E 76 ? TYR E 73 VAL E 76 AA5 5 ASN E 99 ? LYS E 103 ? ASN E 99 LYS E 103 AA5 6 ARG E 120 ? ILE E 122 ? ARG E 120 ILE E 122 AA6 1 HIS F 51 ? ILE F 54 ? HIS F 51 ILE F 54 AA6 2 GLU F 31 ? ASP F 36 ? GLU F 31 ASP F 36 AA6 3 GLN F 8 ? ILE F 12 ? GLN F 8 ILE F 12 AA6 4 TYR F 73 ? VAL F 76 ? TYR F 73 VAL F 76 AA6 5 ASN F 99 ? LYS F 103 ? ASN F 99 LYS F 103 AA6 6 ARG F 120 ? ILE F 122 ? ARG F 120 ILE F 122 AA7 1 HIS G 51 ? ILE G 54 ? HIS G 51 ILE G 54 AA7 2 GLU G 31 ? ASP G 36 ? GLU G 31 ASP G 36 AA7 3 GLN G 8 ? ILE G 12 ? GLN G 8 ILE G 12 AA7 4 TYR G 73 ? VAL G 76 ? TYR G 73 VAL G 76 AA7 5 ASN G 99 ? LYS G 103 ? ASN G 99 LYS G 103 AA7 6 ARG G 120 ? ILE G 122 ? ARG G 120 ILE G 122 AA8 1 HIS H 51 ? ILE H 54 ? HIS H 51 ILE H 54 AA8 2 GLU H 31 ? ASP H 36 ? GLU H 31 ASP H 36 AA8 3 GLN H 8 ? ILE H 12 ? GLN H 8 ILE H 12 AA8 4 TYR H 73 ? VAL H 76 ? TYR H 73 VAL H 76 AA8 5 ASN H 99 ? LYS H 103 ? ASN H 99 LYS H 103 AA8 6 ARG H 120 ? ILE H 122 ? ARG H 120 ILE H 122 AA9 1 THR I 336 ? ILE I 338 ? THR I 336 ILE I 338 AA9 2 ARG I 341 ? ILE I 343 ? ARG I 341 ILE I 343 AB1 1 THR J 336 ? ILE J 338 ? THR J 336 ILE J 338 AB1 2 ARG J 341 ? ILE J 343 ? ARG J 341 ILE J 343 AB2 1 THR K 336 ? ILE K 338 ? THR K 336 ILE K 338 AB2 2 ARG K 341 ? ILE K 343 ? ARG K 341 ILE K 343 AB3 1 THR L 336 ? ILE L 338 ? THR L 336 ILE L 338 AB3 2 ARG L 341 ? ILE L 343 ? ARG L 341 ILE L 343 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O VAL A 53 ? O VAL A 53 N ALA A 34 ? N ALA A 34 AA1 2 3 O LEU A 33 ? O LEU A 33 N VAL A 11 ? N VAL A 11 AA1 3 4 N ILE A 12 ? N ILE A 12 O ILE A 75 ? O ILE A 75 AA1 4 5 N VAL A 76 ? N VAL A 76 O TRP A 101 ? O TRP A 101 AA1 5 6 N VAL A 102 ? N VAL A 102 O ILE A 122 ? O ILE A 122 AA2 1 2 O VAL B 53 ? O VAL B 53 N ALA B 34 ? N ALA B 34 AA2 2 3 O LEU B 33 ? O LEU B 33 N VAL B 11 ? N VAL B 11 AA2 3 4 N ILE B 12 ? N ILE B 12 O ILE B 75 ? O ILE B 75 AA2 4 5 N VAL B 76 ? N VAL B 76 O TRP B 101 ? O TRP B 101 AA2 5 6 N VAL B 102 ? N VAL B 102 O ILE B 122 ? O ILE B 122 AA3 1 2 O VAL C 53 ? O VAL C 53 N ALA C 34 ? N ALA C 34 AA3 2 3 O LEU C 33 ? O LEU C 33 N VAL C 11 ? N VAL C 11 AA3 3 4 N ILE C 12 ? N ILE C 12 O ILE C 75 ? O ILE C 75 AA3 4 5 N VAL C 76 ? N VAL C 76 O TRP C 101 ? O TRP C 101 AA3 5 6 N VAL C 102 ? N VAL C 102 O ILE C 122 ? O ILE C 122 AA4 1 2 O VAL D 53 ? O VAL D 53 N ALA D 34 ? N ALA D 34 AA4 2 3 O LEU D 33 ? O LEU D 33 N VAL D 11 ? N VAL D 11 AA4 3 4 N ILE D 12 ? N ILE D 12 O ILE D 75 ? O ILE D 75 AA4 4 5 N VAL D 76 ? N VAL D 76 O TRP D 101 ? O TRP D 101 AA4 5 6 N VAL D 102 ? N VAL D 102 O ILE D 122 ? O ILE D 122 AA5 1 2 O VAL E 53 ? O VAL E 53 N ALA E 34 ? N ALA E 34 AA5 2 3 O LEU E 33 ? O LEU E 33 N VAL E 11 ? N VAL E 11 AA5 3 4 N ILE E 12 ? N ILE E 12 O ILE E 75 ? O ILE E 75 AA5 4 5 N VAL E 76 ? N VAL E 76 O TRP E 101 ? O TRP E 101 AA5 5 6 N VAL E 102 ? N VAL E 102 O ILE E 122 ? O ILE E 122 AA6 1 2 O VAL F 53 ? O VAL F 53 N ALA F 34 ? N ALA F 34 AA6 2 3 O LEU F 33 ? O LEU F 33 N VAL F 11 ? N VAL F 11 AA6 3 4 N ILE F 12 ? N ILE F 12 O ILE F 75 ? O ILE F 75 AA6 4 5 N VAL F 76 ? N VAL F 76 O TRP F 101 ? O TRP F 101 AA6 5 6 N VAL F 102 ? N VAL F 102 O ILE F 122 ? O ILE F 122 AA7 1 2 O VAL G 53 ? O VAL G 53 N ALA G 34 ? N ALA G 34 AA7 2 3 O LEU G 33 ? O LEU G 33 N VAL G 11 ? N VAL G 11 AA7 3 4 N ILE G 12 ? N ILE G 12 O ILE G 75 ? O ILE G 75 AA7 4 5 N VAL G 76 ? N VAL G 76 O TRP G 101 ? O TRP G 101 AA7 5 6 N VAL G 102 ? N VAL G 102 O ILE G 122 ? O ILE G 122 AA8 1 2 O VAL H 53 ? O VAL H 53 N ALA H 34 ? N ALA H 34 AA8 2 3 O LEU H 33 ? O LEU H 33 N VAL H 11 ? N VAL H 11 AA8 3 4 N ILE H 12 ? N ILE H 12 O ILE H 75 ? O ILE H 75 AA8 4 5 N VAL H 76 ? N VAL H 76 O TRP H 101 ? O TRP H 101 AA8 5 6 N VAL H 102 ? N VAL H 102 O ILE H 122 ? O ILE H 122 AA9 1 2 N THR I 336 ? N THR I 336 O ILE I 343 ? O ILE I 343 AB1 1 2 N THR J 336 ? N THR J 336 O ILE J 343 ? O ILE J 343 AB2 1 2 N THR K 336 ? N THR K 336 O ILE K 343 ? O ILE K 343 AB3 1 2 N THR L 336 ? N THR L 336 O ILE L 343 ? O ILE L 343 # _pdbx_validate_rmsd_angle.id 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 N _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 J _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 ILE _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 314 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 CA _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 J _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 ILE _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 314 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 C _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 J _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 ILE _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 314 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value 94.17 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value 111.00 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation -16.83 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation 2.70 _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ALA A 80 ? ? 65.15 -1.28 2 1 ALA B 80 ? ? 65.09 -1.22 3 1 ALA C 80 ? ? 65.08 -1.22 4 1 ALA D 80 ? ? 65.11 -1.26 5 1 ALA E 80 ? ? 65.15 -1.35 6 1 ALA F 80 ? ? 65.20 -1.36 7 1 ALA G 80 ? ? 65.17 -1.26 8 1 ALA H 80 ? ? 65.14 -1.28 9 1 PRO I 38 ? ? -78.15 43.75 10 1 LEU I 185 ? ? 56.28 18.45 11 1 HIS I 259 ? ? -90.75 52.44 12 1 ALA I 305 ? ? -127.99 -133.98 13 1 PRO J 38 ? ? -78.23 43.76 14 1 LEU J 185 ? ? 56.27 18.51 15 1 HIS J 259 ? ? -90.74 52.40 16 1 ALA J 305 ? ? -130.76 -141.07 17 1 SER J 307 ? ? -76.75 -77.11 18 1 PRO K 38 ? ? -78.15 43.71 19 1 LEU K 185 ? ? 56.31 18.52 20 1 HIS K 259 ? ? -90.77 52.45 21 1 ALA K 305 ? ? -127.63 -136.87 22 1 SER K 307 ? ? -78.63 -72.30 23 1 PRO L 38 ? ? -78.17 43.76 24 1 LEU L 185 ? ? 56.33 18.40 25 1 HIS L 259 ? ? -90.74 52.33 26 1 ALA L 305 ? ? -120.45 -137.80 # _pdbx_entry_details.entry_id 8K1S _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8K1S _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 4J7C ? ? 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KtrAB complex in solution was composed of one KtrA octamer (chain A-H) and two KtrB dimer (chain I-J and chain K-L). The molecule weight of KtrAB complex (chain A-L) is 0.393 MDa ; ? ? '1, 2' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'KtrA octamer' ;KtrA ocatmer (chain A-H) The molecule weight of KtrA octamer (chain A-H) is 0.199 MDa. ; ? ? 1 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'KtrB dimer' ;Two KtrB dimers (chain I-J and chain K-L) The molecule weight of each KtrB dimer is 0.097 MDa ; ? ? 2 # _em_imaging.entry_id 8K1S _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2200 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/1' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8K1S _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8K1S _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8K1S _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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B ALA 174 131 1 Y 1 B LYS 175 ? B LYS 175 132 1 Y 1 B TYR 176 ? B TYR 176 133 1 Y 1 B GLY 177 ? B GLY 177 134 1 Y 1 B CYS 178 ? B CYS 178 135 1 Y 1 B THR 179 ? B THR 179 136 1 Y 1 B ILE 180 ? B ILE 180 137 1 Y 1 B LEU 181 ? B LEU 181 138 1 Y 1 B ALA 182 ? B ALA 182 139 1 Y 1 B ILE 183 ? B ILE 183 140 1 Y 1 B LYS 184 ? B LYS 184 141 1 Y 1 B HIS 185 ? B HIS 185 142 1 Y 1 B HIS 186 ? B HIS 186 143 1 Y 1 B GLY 187 ? B GLY 187 144 1 Y 1 B ASP 188 ? B ASP 188 145 1 Y 1 B ILE 189 ? B ILE 189 146 1 Y 1 B CYS 190 ? B CYS 190 147 1 Y 1 B LEU 191 ? B LEU 191 148 1 Y 1 B SER 192 ? B SER 192 149 1 Y 1 B PRO 193 ? B PRO 193 150 1 Y 1 B ALA 194 ? B ALA 194 151 1 Y 1 B PRO 195 ? B PRO 195 152 1 Y 1 B GLU 196 ? B GLU 196 153 1 Y 1 B ASP 197 ? B ASP 197 154 1 Y 1 B ILE 198 ? B ILE 198 155 1 Y 1 B ILE 199 ? B ILE 199 156 1 Y 1 B ARG 200 ? B ARG 200 157 1 Y 1 B GLU 201 ? B GLU 201 158 1 Y 1 B GLN 202 ? B GLN 202 159 1 Y 1 B ASP 203 ? B ASP 203 160 1 Y 1 B CYS 204 ? B CYS 204 161 1 Y 1 B LEU 205 ? 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