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J 5 MG 1 501 3 MG MG F . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8K87 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8K87 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8K87 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8K87 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 13868 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.725 ? 19188 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.786 ? 2534 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 2148 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 2152 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8K87 _struct.title 'Dimer structure of procaryotic Ago' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8K87 _struct_keywords.text 'Ago, DNA/RNA, DNA BINDING PROTEIN, CELL INVASION, DNA-RNA-CELL INVASION complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA/RNA/CELL INVASION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8K87 8K87 ? 1 ? 1 2 PDB 8K87 8K87 ? 2 ? 1 3 UNP Q74DF5_GEOSL Q74DF5 ? 3 ;MADNLSQLAAHSTIPEPLLLFKDNRTDTHPLRGLSQYGPYSACFNLPGQVRLAYLAPTEHMRKLDAIVRELQNPATPKEA TNYYVEYGGFEKVFKVPLVMPQEHLRCLALDECHGVAANGNGLALADKIVQSMSGLFRQKHAFDVLLVYLPASWKKCFEY DGFDLHDRIKAKVAPLNLPIQIINDTALTRQCRANVMWGVSVALYAKAGGIPWKLADWDKDEAYIGLSYAIKKNAEGQEY TTCCSQVFDPDGTGFEFVAYDTREFITDRKGNPYLSYQEMQSVLSKSLHLYQSSHNGRMPRKIFIHKTTHFTEDEIQGAF DSFSSSTEIELVQIIQSTNWYGLKVDGKKGDKPVAPASYPVDRGLYQPLTESECLLWTQGSVMGVNQQNPGQPVFKEAAL TPLPNPIMLRRFSGNGGWHATCSSILALTKVDWNNNTLYKKLPVTLVYSQVFADVVKQTPEIVNEIYDYRFFM ; 1 4 UNP Q74DF6_GEOSL Q74DF6 ? 4 ;MDVLTDNEFYQHYLQNSQHMMWFLGAGTSRSAGLPTASDIIWDLKHRYYCLHENQDYQKHDINNHAIKSKIQSYMDSKGF PLQWSPEEYSFYFELVFRDDYEAQRKYLLEALASRKVSLNIGHRVLAALLEMNQTKVVFTTNFDDVIETAFSDISGKHLS VYHLEGSYAALSALNTEAFPIYAKIHGDFRYQKIKNLTPDLQTNDREIHKCFLAAAIRFGLVVSGYSGRDENVMTMLRAA IDQNNAFPHGLYWTVPSISKSEPAVQDLITYAQGKGVRAYLVETGTFDEMLSKIWRQVKDKPAAIDAKVRTARVCPVSIP LPGPGKSFPALRTNALPVVTQSIRCGVVTLASPITFSELKERISQKSPKALLTYTEKVLFLGGEPEIRKIFSNDEINSIG QYYIDEIAQSVAASTFLKSFVEEAILTALLREKPILHRVRHRTHYAVIPNASAKDDRFLDLRKAVGFKGDLGYITGNVTN AKELSWAEAVSIRLEERGGKLWIMLKPEIWIKPLDRREEATDFIRSRRRYRFNQCSYQILDAWIKILFGSIGGGGTVNIS CFPDAEFKAEFEIGTRTAFSLGVGYGR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8K87 C 1 ? 41 ? 8K87 -14 ? 26 ? -14 26 2 2 8K87 D 1 ? 21 ? 8K87 1 ? 21 ? 1 21 3 3 8K87 A 1 ? 473 ? Q74DF5 1 ? 473 ? 1 473 4 4 8K87 B 1 ? 587 ? Q74DF6 1 ? 587 ? 1 587 5 1 8K87 H 1 ? 41 ? 8K87 -14 ? 26 ? -14 26 6 2 8K87 I 1 ? 21 ? 8K87 1 ? 21 ? 1 21 7 3 8K87 F 1 ? 473 ? Q74DF5 1 ? 473 ? 1 473 8 4 8K87 G 1 ? 587 ? Q74DF6 1 ? 587 ? 1 587 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 HIS C 29 ? TYR C 37 ? HIS A 29 TYR A 37 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO C 39 ? ASN C 45 ? PRO A 39 ASN A 45 5 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO C 57 ? GLU C 59 ? PRO A 57 GLU A 59 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 HIS C 60 ? ASN C 73 ? HIS A 60 ASN A 73 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY C 89 ? LYS C 95 ? GLY A 89 LYS A 95 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP C 111 ? GLY C 120 ? ASP A 111 GLY A 120 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN C 121 ? MET C 133 ? ASN A 121 MET A 133 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 SER C 134 ? PHE C 137 ? SER A 134 PHE A 137 5 ? 4 HELX_P HELX_P9 AA9 GLN C 139 ? PHE C 143 ? GLN A 139 PHE A 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 151 ? PHE C 158 ? PRO A 151 PHE A 158 5 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP C 164 ? ALA C 174 ? ASP A 164 ALA A 174 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN C 184 ? THR C 189 ? ASN A 184 THR A 189 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 CYS C 192 ? ALA C 208 ? CYS A 192 ALA A 208 1 ? 17 HELX_P HELX_P14 AB5 SER C 276 ? HIS C 295 ? SER A 276 HIS A 295 1 ? 20 HELX_P HELX_P15 AB6 THR C 312 ? PHE C 323 ? THR A 312 PHE A 323 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY C 417 ? LEU C 428 ? GLY A 417 LEU A 428 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO C 443 ? THR C 459 ? PRO A 443 THR A 459 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO C 460 ? VAL C 463 ? PRO A 460 VAL A 463 5 ? 4 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG C 470 ? PHE C 472 ? ARG A 470 PHE A 472 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 THR D 355 ? SER D 367 ? THR B 355 SER B 367 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY D 383 ? PHE D 391 ? GLY B 383 PHE B 391 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU D 406 ? SER D 414 ? GLU B 406 SER B 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 AC5 SER D 414 ? LEU D 430 ? SER B 414 LEU B 430 1 ? 17 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP D 455 ? ARG D 457 ? ASP B 455 ARG B 457 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 AC7 PHE D 458 ? VAL D 465 ? PHE B 458 VAL B 465 1 ? 8 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO D 513 ? GLU D 519 ? PRO B 513 GLU B 519 5 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA D 520 ? ARG D 528 ? ALA B 520 ARG B 528 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 PHE D 532 ? GLY D 549 ? PHE B 532 GLY B 549 1 ? 18 HELX_P HELX_P29 AD2 HIS G 29 ? TYR G 37 ? HIS F 29 TYR F 37 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 PRO G 39 ? CYS G 43 ? PRO F 39 CYS F 43 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 HIS G 60 ? ASN G 73 ? HIS F 60 ASN F 73 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY G 89 ? LYS G 95 ? GLY F 89 LYS F 95 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 GLN G 102 ? HIS G 104 ? GLN F 102 HIS F 104 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP G 111 ? GLY G 120 ? ASP F 111 GLY F 120 1 ? 10 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN G 121 ? MET G 133 ? ASN F 121 MET F 133 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 MET G 133 ? LYS G 140 ? MET F 133 LYS F 140 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 HIS G 141 ? PHE G 143 ? HIS F 141 PHE F 143 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO G 151 ? PHE G 158 ? PRO F 151 PHE F 158 5 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP G 164 ? ALA G 174 ? ASP F 164 ALA F 174 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN G 184 ? THR G 189 ? ASN F 184 THR F 189 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 CYS G 192 ? ALA G 208 ? CYS F 192 ALA F 208 1 ? 17 HELX_P HELX_P42 AE6 SER G 276 ? SER G 294 ? SER F 276 SER F 294 1 ? 19 HELX_P HELX_P43 AE7 THR G 312 ? PHE G 323 ? THR F 312 PHE F 323 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 AE8 GLU G 397 ? ALA G 399 ? GLU F 397 ALA F 399 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY G 417 ? LEU G 428 ? GLY F 417 LEU F 428 1 ? 12 HELX_P HELX_P46 AF1 PRO G 443 ? THR G 459 ? PRO F 443 THR F 459 1 ? 17 HELX_P HELX_P47 AF2 PRO G 460 ? VAL G 463 ? PRO F 460 VAL F 463 5 ? 4 HELX_P HELX_P48 AF3 ARG G 470 ? PHE G 472 ? ARG F 470 PHE F 472 5 ? 3 HELX_P HELX_P49 AF4 THR H 355 ? SER H 367 ? THR G 355 SER G 367 1 ? 13 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY H 383 ? PHE H 391 ? GLY G 383 PHE G 391 1 ? 9 HELX_P HELX_P51 AF6 GLU H 406 ? SER H 414 ? GLU G 406 SER G 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 AF7 SER H 414 ? LEU H 430 ? SER G 414 LEU G 430 1 ? 17 HELX_P HELX_P53 AF8 ASP H 455 ? ARG H 457 ? ASP G 455 ARG G 457 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 AF9 PHE H 458 ? GLY H 466 ? PHE G 458 GLY G 466 1 ? 9 HELX_P HELX_P55 AG1 PRO H 513 ? GLU H 519 ? PRO G 513 GLU G 519 5 ? 7 HELX_P HELX_P56 AG2 ALA H 520 ? ARG H 529 ? ALA G 520 ARG G 529 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 AG3 PHE H 532 ? GLY H 549 ? PHE G 532 GLY G 549 1 ? 18 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DT 39 N3 ? ? ? 1_555 B A 3 N1 ? ? C DT 24 D A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DT 39 O4 ? ? ? 1_555 B A 3 N6 ? ? C DT 24 D A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? E DC 21 N3 ? ? ? 1_555 F DG 21 N1 ? ? H DC 6 I DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? E DC 21 N4 ? ? ? 1_555 F DG 21 O6 ? ? H DC 6 I DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? E DC 21 O2 ? ? ? 1_555 F DG 21 N2 ? ? H DC 6 I DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? E DG 22 N1 ? ? ? 1_555 F C 20 N3 ? ? H DG 7 I C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? E DG 22 N2 ? ? ? 1_555 F C 20 O2 ? ? H DG 7 I C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? E DG 22 O6 ? ? ? 1_555 F C 20 N4 ? ? H DG 7 I C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? E DA 23 N1 ? ? ? 1_555 F U 19 N3 ? ? H DA 8 I U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? E DA 23 N6 ? ? ? 1_555 F U 19 O4 ? ? H DA 8 I U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? E DC 24 N3 ? ? ? 1_555 F G 18 N1 ? ? H DC 9 I G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? E DC 24 N4 ? ? ? 1_555 F G 18 O6 ? ? H DC 9 I G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? E DC 24 O2 ? ? ? 1_555 F G 18 N2 ? ? H DC 9 I G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? E DG 25 N1 ? ? ? 1_555 F C 17 N3 ? ? H DG 10 I C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? E DG 25 N2 ? ? ? 1_555 F C 17 O2 ? ? H DG 10 I C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? E DG 25 O6 ? ? ? 1_555 F C 17 N4 ? ? H DG 10 I C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? E DT 26 N3 ? ? ? 1_555 F A 16 N1 ? ? H DT 11 I A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? E DT 26 O4 ? ? ? 1_555 F A 16 N6 ? ? H DT 11 I A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog69 hydrog ? ? E DG 31 N1 ? ? ? 1_555 F C 11 N3 ? ? H DG 16 I C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog70 hydrog ? ? E DG 31 N2 ? ? ? 1_555 F C 11 O2 ? ? H DG 16 I C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog71 hydrog ? ? E DG 31 O6 ? ? ? 1_555 F C 11 N4 ? ? H DG 16 I C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog72 hydrog ? ? E DA 32 N6 ? ? ? 1_555 F U 10 O4 ? ? H DA 17 I U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-U PAIR' ? ? ? hydrog73 hydrog ? ? E DC 35 N3 ? ? ? 1_555 F G 7 N1 ? ? H DC 20 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog74 hydrog ? ? E DC 35 N4 ? ? ? 1_555 F G 7 O6 ? ? H DC 20 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog75 hydrog ? ? E DC 35 O2 ? ? ? 1_555 F G 7 N2 ? ? H DC 20 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog76 hydrog ? ? E DC 36 N3 ? ? ? 1_555 F G 6 N1 ? ? H DC 21 I G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog77 hydrog ? ? E DC 36 N4 ? ? ? 1_555 F G 6 O6 ? ? H DC 21 I G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OP2 ? B A 1 ? D A 1 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OP1 ? B A 3 ? D A 3 ? 1_555 80.7 ? 2 OP2 ? B A 1 ? D A 1 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OD1 ? C ASN 434 ? A ASN 434 ? 1_555 145.6 ? 3 OP1 ? B A 3 ? D A 3 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OD1 ? C ASN 434 ? A ASN 434 ? 1_555 70.9 ? 4 OP2 ? B A 1 ? D A 1 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OXT ? C MET 473 ? A MET 473 ? 1_555 90.2 ? 5 OP1 ? B A 3 ? D A 3 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OXT ? C MET 473 ? A MET 473 ? 1_555 105.6 ? 6 OD1 ? C ASN 434 ? A ASN 434 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 501 ? 1_555 OXT ? C MET 473 ? A MET 473 ? 1_555 115.5 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 46 C . ? LEU 46 A PRO 47 C ? PRO 47 A 1 -2.83 2 PHE 328 D . ? PHE 328 B PRO 329 D ? PRO 329 B 1 4.09 3 LYS 512 D . ? LYS 512 B PRO 513 D ? PRO 513 B 1 2.20 4 LEU 46 G . ? LEU 46 F PRO 47 G ? PRO 47 F 1 -2.85 5 PHE 328 H . ? PHE 328 G PRO 329 H ? PRO 329 G 1 3.98 6 LYS 512 H . ? LYS 512 G PRO 513 H ? PRO 513 G 1 0.39 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 10 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 10 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? parallel AA1 6 7 ? parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? parallel AB2 6 7 ? parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB2 8 9 ? anti-parallel AB2 9 10 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER C 12 ? 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ALA A 355 PRO A 356 AA5 2 LEU C 343 ? ASP C 346 ? LEU A 343 ASP A 346 AA5 3 ALA D 330 ? ARG D 332 ? ALA B 330 ARG B 332 AA5 4 PHE D 579 ? SER D 580 ? PHE B 579 SER B 580 AA6 1 SER C 381 ? VAL C 382 ? SER A 381 VAL A 382 AA6 2 VAL C 394 ? PHE C 395 ? VAL A 394 PHE A 395 AA7 1 ALA D 335 ? VAL D 338 ? ALA B 335 VAL B 338 AA7 2 LYS D 500 ? LYS D 512 ? LYS B 500 LYS B 512 AA7 3 SER D 485 ? ARG D 497 ? SER B 485 ARG B 497 AA7 4 THR D 443 ? VAL D 447 ? THR B 443 VAL B 447 AA7 5 LEU D 436 ? ARG D 440 ? LEU B 436 ARG B 440 AA8 1 ALA D 335 ? VAL D 338 ? ALA B 335 VAL B 338 AA8 2 LYS D 500 ? LYS D 512 ? LYS B 500 LYS B 512 AA8 3 SER D 485 ? ARG D 497 ? SER B 485 ARG B 497 AA8 4 THR D 475 ? ASN D 477 ? THR B 475 ASN B 477 AA9 1 LEU D 371 ? TYR D 374 ? LEU B 371 TYR B 374 AA9 2 VAL D 378 ? LEU D 381 ? VAL B 378 LEU B 381 AA9 3 SER D 342 ? LEU D 350 ? SER B 342 LEU B 350 AA9 4 ILE D 396 ? ASP D 405 ? ILE B 396 ASP B 405 AB1 1 THR D 556 ? CYS D 561 ? THR B 556 CYS B 561 AB1 2 ALA D 569 ? GLY D 574 ? ALA B 569 GLY B 574 AB2 1 SER G 12 ? THR G 13 ? SER F 12 THR F 13 AB2 2 LEU G 365 ? PRO G 368 ? LEU F 365 PRO F 368 AB2 3 GLU G 373 ? LEU G 376 ? GLU F 373 LEU F 376 AB2 4 ILE G 407 ? SER G 413 ? ILE F 407 SER F 413 AB2 5 GLU G 328 ? ILE G 335 ? GLU F 328 ILE F 335 AB2 6 LYS G 302 ? LYS G 307 ? LYS F 302 LYS F 307 AB2 7 GLU G 222 ? LYS G 233 ? GLU F 222 LYS F 233 AB2 8 GLN G 238 ? PHE G 248 ? GLN F 238 PHE F 248 AB2 9 GLU G 256 ? ASP G 261 ? GLU F 256 ASP F 261 AB2 10 TYR G 467 ? ASP G 468 ? TYR F 467 ASP F 468 AB3 1 ARG G 25 ? ASP G 27 ? ARG F 25 ASP F 27 AB3 2 LEU G 19 ? PHE G 21 ? LEU F 19 PHE F 21 AB3 3 LYS G 214 ? LEU G 215 ? LYS F 214 LEU F 215 AB4 1 LEU G 98 ? VAL G 99 ? LEU F 98 VAL F 99 AB4 2 VAL G 50 ? ALA G 56 ? VAL F 50 ALA F 56 AB4 3 ARG G 106 ? LEU G 108 ? ARG F 106 LEU F 108 AB5 1 LEU G 98 ? VAL G 99 ? LEU F 98 VAL F 99 AB5 2 VAL G 50 ? ALA G 56 ? VAL F 50 ALA F 56 AB5 3 VAL G 145 ? TYR G 149 ? VAL F 145 TYR F 149 AB5 4 ILE G 180 ? ILE G 183 ? ILE F 180 ILE F 183 AB6 1 ALA G 355 ? PRO G 356 ? ALA F 355 PRO F 356 AB6 2 LEU G 343 ? ASP G 346 ? LEU F 343 ASP F 346 AB6 3 ALA H 330 ? ARG H 332 ? ALA G 330 ARG G 332 AB6 4 PHE H 579 ? SER H 580 ? PHE G 579 SER G 580 AB7 1 SER G 381 ? VAL G 382 ? SER F 381 VAL F 382 AB7 2 VAL G 394 ? PHE G 395 ? VAL F 394 PHE F 395 AB8 1 ALA H 335 ? PRO H 337 ? ALA G 335 PRO G 337 AB8 2 LYS H 500 ? LYS H 512 ? LYS G 500 LYS G 512 AB8 3 SER H 485 ? ARG H 497 ? SER G 485 ARG G 497 AB8 4 THR H 443 ? VAL H 447 ? THR G 443 VAL G 447 AB8 5 LEU H 436 ? ARG H 440 ? LEU G 436 ARG G 440 AB9 1 ALA H 335 ? PRO H 337 ? ALA G 335 PRO G 337 AB9 2 LYS H 500 ? LYS H 512 ? LYS G 500 LYS G 512 AB9 3 SER H 485 ? ARG H 497 ? SER G 485 ARG G 497 AB9 4 THR H 475 ? ASN H 477 ? THR G 475 ASN G 477 AC1 1 LEU H 371 ? TYR H 374 ? LEU G 371 TYR G 374 AC1 2 VAL H 378 ? LEU H 381 ? VAL G 378 LEU G 381 AC1 3 SER H 342 ? LEU H 350 ? SER G 342 LEU G 350 AC1 4 ILE H 396 ? ASP H 405 ? ILE G 396 ASP G 405 AC2 1 THR H 556 ? CYS H 561 ? THR G 556 CYS G 561 AC2 2 ALA H 569 ? GLY H 574 ? ALA G 569 GLY G 574 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N SER C 12 ? N SER A 12 O TYR C 366 ? O TYR A 366 AA1 2 3 N GLN C 367 ? N GLN A 367 O LEU C 375 ? O LEU A 375 AA1 3 4 N CYS C 374 ? N CYS A 374 O LEU C 409 ? O LEU A 409 AA1 4 5 O MET C 408 ? O MET A 408 N ILE C 335 ? N ILE A 335 AA1 5 6 O VAL C 332 ? O VAL A 332 N ILE C 305 ? N ILE A 305 AA1 6 7 O HIS C 306 ? O HIS A 306 N ILE C 225 ? N ILE A 225 AA1 7 8 N ALA C 230 ? N ALA A 230 O THR C 241 ? O THR A 241 AA1 8 9 N GLN C 246 ? N GLN A 246 O VAL C 258 ? O VAL A 258 AA1 9 10 N ALA C 259 ? N ALA A 259 O TYR C 467 ? O TYR A 467 AA2 1 2 O ASP C 27 ? O ASP A 27 N LEU C 19 ? N LEU A 19 AA2 2 3 N LEU C 20 ? N LEU A 20 O LYS C 214 ? O LYS A 214 AA3 1 2 O VAL C 99 ? O VAL A 99 N VAL C 50 ? N VAL A 50 AA3 2 3 N TYR C 54 ? N TYR A 54 O CYS C 107 ? O CYS A 107 AA4 1 2 O VAL C 99 ? O VAL A 99 N VAL C 50 ? N VAL A 50 AA4 2 3 N ALA C 53 ? N ALA A 53 O LEU C 147 ? O LEU A 147 AA4 3 4 N VAL C 148 ? N VAL A 148 O ILE C 183 ? O ILE A 183 AA5 1 2 O ALA C 355 ? O ALA A 355 N ASP C 346 ? N ASP A 346 AA5 2 3 N LEU C 343 ? N LEU A 343 O ARG D 332 ? O ARG B 332 AA5 3 4 N LEU D 331 ? N LEU B 331 O SER D 580 ? O SER B 580 AA6 1 2 N VAL C 382 ? N VAL A 382 O VAL C 394 ? O VAL A 394 AA7 1 2 N LEU D 336 ? N LEU B 336 O ILE D 503 ? O ILE B 503 AA7 2 3 O GLU D 508 ? O GLU B 508 N ALA D 489 ? N ALA B 489 AA7 3 4 O VAL D 490 ? O VAL B 490 N ALA D 446 ? N ALA B 446 AA7 4 5 O TYR D 445 ? O TYR B 445 N ARG D 438 ? N ARG B 438 AA8 1 2 N LEU D 336 ? N LEU B 336 O ILE D 503 ? O ILE B 503 AA8 2 3 O GLU D 508 ? O GLU B 508 N ALA D 489 ? N ALA B 489 AA8 3 4 O TRP D 486 ? O TRP B 486 N GLY D 476 ? N GLY B 476 AA9 1 2 N THR D 373 ? N THR B 373 O LEU D 379 ? O LEU B 379 AA9 2 3 O VAL D 378 ? O VAL B 378 N VAL D 348 ? N VAL B 348 AA9 3 4 N CYS D 345 ? N CYS B 345 O TYR D 402 ? O TYR B 402 AB1 1 2 N ILE D 559 ? N ILE B 559 O PHE D 571 ? O PHE B 571 AB2 1 2 N SER G 12 ? N SER F 12 O TYR G 366 ? O TYR F 366 AB2 2 3 N GLN G 367 ? N GLN F 367 O LEU G 375 ? O LEU F 375 AB2 3 4 N CYS G 374 ? 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N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" sing N N 24 A N9 C8 sing Y N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 ALA N CA sing N N 40 ALA N H sing N N 41 ALA N H2 sing N N 42 ALA CA C sing N N 43 ALA CA CB sing N N 44 ALA CA HA sing N N 45 ALA C O doub N N 46 ALA C OXT sing N N 47 ALA CB HB1 sing N N 48 ALA CB HB2 sing N N 49 ALA CB HB3 sing N N 50 ALA OXT HXT sing N N 51 ARG N CA sing N N 52 ARG N H sing N N 53 ARG N H2 sing N N 54 ARG CA C sing N N 55 ARG CA CB sing N N 56 ARG CA HA sing N N 57 ARG C O doub N N 58 ARG C OXT sing N N 59 ARG CB CG sing N N 60 ARG CB HB2 sing N N 61 ARG CB HB3 sing N N 62 ARG CG CD sing N N 63 ARG CG HG2 sing N N 64 ARG CG HG3 sing N N 65 ARG CD NE sing N N 66 ARG CD HD2 sing N N 67 ARG CD HD3 sing N N 68 ARG NE CZ sing N N 69 ARG NE HE sing N N 70 ARG CZ NH1 sing N N 71 ARG CZ NH2 doub N N 72 ARG NH1 HH11 sing N N 73 ARG NH1 HH12 sing N N 74 ARG NH2 HH21 sing N N 75 ARG NH2 HH22 sing N N 76 ARG OXT HXT sing N N 77 ASN N CA sing N N 78 ASN N H sing N N 79 ASN N H2 sing N N 80 ASN CA C sing N N 81 ASN CA CB sing N N 82 ASN CA HA sing N N 83 ASN C O doub N N 84 ASN C OXT sing N N 85 ASN CB CG sing N N 86 ASN CB HB2 sing N N 87 ASN CB HB3 sing N N 88 ASN CG OD1 doub N N 89 ASN CG ND2 sing N N 90 ASN ND2 HD21 sing N N 91 ASN ND2 HD22 sing N N 92 ASN OXT HXT sing N N 93 ASP N CA sing N N 94 ASP N H sing N N 95 ASP N H2 sing N N 96 ASP CA C sing N N 97 ASP CA CB sing N N 98 ASP CA HA sing N N 99 ASP C O doub N N 100 ASP C OXT sing N N 101 ASP CB CG sing N N 102 ASP CB HB2 sing N N 103 ASP CB HB3 sing N N 104 ASP CG OD1 doub N N 105 ASP CG OD2 sing N N 106 ASP OD2 HD2 sing N N 107 ASP OXT HXT sing N N 108 C OP3 P sing N N 109 C OP3 HOP3 sing N N 110 C P OP1 doub N N 111 C P OP2 sing N N 112 C P "O5'" sing N N 113 C OP2 HOP2 sing N N 114 C "O5'" "C5'" sing N N 115 C "C5'" "C4'" sing N N 116 C "C5'" "H5'" sing N N 117 C "C5'" "H5''" sing N N 118 C "C4'" "O4'" sing N N 119 C "C4'" "C3'" sing N N 120 C "C4'" "H4'" sing N N 121 C "O4'" "C1'" sing N N 122 C "C3'" "O3'" sing N N 123 C "C3'" "C2'" sing N N 124 C "C3'" "H3'" sing N N 125 C "O3'" "HO3'" sing N N 126 C "C2'" "O2'" sing N N 127 C "C2'" "C1'" sing N N 128 C "C2'" "H2'" sing N N 129 C "O2'" "HO2'" sing N N 130 C "C1'" N1 sing N N 131 C "C1'" "H1'" sing N N 132 C N1 C2 sing N N 133 C N1 C6 sing N N 134 C C2 O2 doub N N 135 C C2 N3 sing N N 136 C N3 C4 doub N N 137 C C4 N4 sing N N 138 C C4 C5 sing N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 CYS N CA sing N N 145 CYS N H sing N N 146 CYS N H2 sing N N 147 CYS CA C sing N N 148 CYS CA CB sing N N 149 CYS CA HA sing N N 150 CYS C O doub N N 151 CYS C OXT sing N N 152 CYS CB SG sing N N 153 CYS CB HB2 sing N N 154 CYS CB HB3 sing N N 155 CYS SG HG sing N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 DA OP3 P sing N N 158 DA OP3 HOP3 sing N N 159 DA P OP1 doub N N 160 DA P OP2 sing N N 161 DA P "O5'" sing N N 162 DA OP2 HOP2 sing N N 163 DA "O5'" "C5'" sing N N 164 DA "C5'" "C4'" sing N N 165 DA "C5'" "H5'" sing N N 166 DA "C5'" "H5''" sing N N 167 DA "C4'" "O4'" sing N N 168 DA "C4'" "C3'" sing N N 169 DA "C4'" "H4'" sing N N 170 DA "O4'" "C1'" sing N N 171 DA "C3'" "O3'" sing N N 172 DA "C3'" "C2'" sing N N 173 DA "C3'" "H3'" sing N N 174 DA "O3'" "HO3'" sing N N 175 DA "C2'" "C1'" sing N N 176 DA "C2'" "H2'" sing N N 177 DA "C2'" "H2''" sing N N 178 DA "C1'" N9 sing N N 179 DA "C1'" "H1'" sing N N 180 DA N9 C8 sing Y N 181 DA N9 C4 sing Y N 182 DA C8 N7 doub Y N 183 DA C8 H8 sing N N 184 DA N7 C5 sing Y N 185 DA C5 C6 sing Y N 186 DA C5 C4 doub Y N 187 DA C6 N6 sing N N 188 DA C6 N1 doub Y N 189 DA N6 H61 sing N N 190 DA N6 H62 sing N N 191 DA N1 C2 sing Y N 192 DA C2 N3 doub Y N 193 DA C2 H2 sing N N 194 DA N3 C4 sing Y N 195 DC OP3 P sing N N 196 DC OP3 HOP3 sing N N 197 DC P OP1 doub N N 198 DC P OP2 sing N N 199 DC P "O5'" sing N N 200 DC OP2 HOP2 sing N N 201 DC "O5'" "C5'" sing N N 202 DC "C5'" "C4'" sing N N 203 DC "C5'" "H5'" sing N N 204 DC "C5'" "H5''" sing N N 205 DC "C4'" "O4'" sing N N 206 DC "C4'" "C3'" sing N N 207 DC "C4'" "H4'" sing N N 208 DC "O4'" "C1'" sing N N 209 DC "C3'" "O3'" sing N N 210 DC "C3'" "C2'" sing N N 211 DC "C3'" "H3'" sing N N 212 DC "O3'" "HO3'" sing N N 213 DC "C2'" "C1'" sing N N 214 DC "C2'" "H2'" sing N N 215 DC "C2'" "H2''" sing N N 216 DC "C1'" N1 sing N N 217 DC "C1'" "H1'" sing N N 218 DC N1 C2 sing N N 219 DC N1 C6 sing N N 220 DC C2 O2 doub N N 221 DC C2 N3 sing N N 222 DC N3 C4 doub N N 223 DC C4 N4 sing N N 224 DC C4 C5 sing N N 225 DC N4 H41 sing N N 226 DC N4 H42 sing N N 227 DC C5 C6 doub N N 228 DC C5 H5 sing N N 229 DC C6 H6 sing N N 230 DG OP3 P sing N N 231 DG OP3 HOP3 sing N N 232 DG P OP1 doub N N 233 DG P OP2 sing N N 234 DG P "O5'" sing N N 235 DG OP2 HOP2 sing N N 236 DG "O5'" "C5'" sing N N 237 DG "C5'" "C4'" sing N N 238 DG "C5'" "H5'" sing N N 239 DG "C5'" "H5''" sing N N 240 DG "C4'" "O4'" sing N N 241 DG "C4'" "C3'" sing N N 242 DG "C4'" "H4'" sing N N 243 DG "O4'" "C1'" sing N N 244 DG "C3'" "O3'" sing N N 245 DG "C3'" "C2'" sing N N 246 DG "C3'" "H3'" sing N N 247 DG "O3'" "HO3'" sing N N 248 DG "C2'" "C1'" sing N N 249 DG "C2'" "H2'" sing N N 250 DG "C2'" "H2''" sing N N 251 DG "C1'" N9 sing N N 252 DG "C1'" "H1'" sing N N 253 DG N9 C8 sing Y N 254 DG N9 C4 sing Y N 255 DG C8 N7 doub Y N 256 DG C8 H8 sing N N 257 DG N7 C5 sing Y N 258 DG C5 C6 sing N N 259 DG C5 C4 doub Y N 260 DG C6 O6 doub N N 261 DG C6 N1 sing N N 262 DG N1 C2 sing N N 263 DG N1 H1 sing N N 264 DG C2 N2 sing N N 265 DG C2 N3 doub N N 266 DG N2 H21 sing N N 267 DG N2 H22 sing N N 268 DG N3 C4 sing N N 269 DT OP3 P sing N N 270 DT OP3 HOP3 sing N N 271 DT P OP1 doub N N 272 DT P OP2 sing N N 273 DT P "O5'" sing N N 274 DT OP2 HOP2 sing N N 275 DT "O5'" "C5'" sing N N 276 DT "C5'" "C4'" sing N N 277 DT "C5'" "H5'" sing N N 278 DT "C5'" "H5''" sing N N 279 DT "C4'" "O4'" sing N N 280 DT "C4'" "C3'" sing N N 281 DT "C4'" "H4'" sing N N 282 DT "O4'" "C1'" sing N N 283 DT "C3'" "O3'" sing N N 284 DT "C3'" "C2'" sing N N 285 DT "C3'" "H3'" sing N N 286 DT "O3'" "HO3'" sing N N 287 DT "C2'" "C1'" sing N N 288 DT "C2'" "H2'" sing N N 289 DT "C2'" "H2''" sing N N 290 DT "C1'" N1 sing N N 291 DT "C1'" "H1'" sing N N 292 DT N1 C2 sing N N 293 DT N1 C6 sing N N 294 DT C2 O2 doub N N 295 DT C2 N3 sing N N 296 DT N3 C4 sing N N 297 DT N3 H3 sing N N 298 DT C4 O4 doub N N 299 DT C4 C5 sing N N 300 DT C5 C7 sing N N 301 DT C5 C6 doub N N 302 DT C7 H71 sing N N 303 DT C7 H72 sing N N 304 DT C7 H73 sing N N 305 DT C6 H6 sing N N 306 G OP3 P sing N N 307 G OP3 HOP3 sing N N 308 G P OP1 doub N N 309 G P OP2 sing N N 310 G P "O5'" sing N N 311 G OP2 HOP2 sing N N 312 G "O5'" "C5'" sing N N 313 G "C5'" "C4'" sing N N 314 G "C5'" "H5'" sing N N 315 G "C5'" "H5''" sing N N 316 G "C4'" "O4'" sing N N 317 G "C4'" "C3'" sing N N 318 G "C4'" "H4'" sing N N 319 G "O4'" "C1'" sing N N 320 G "C3'" "O3'" sing N N 321 G "C3'" "C2'" sing N N 322 G "C3'" "H3'" sing N N 323 G "O3'" "HO3'" sing N N 324 G "C2'" "O2'" sing N N 325 G "C2'" "C1'" sing N N 326 G "C2'" "H2'" sing N N 327 G "O2'" "HO2'" sing N N 328 G "C1'" N9 sing N N 329 G "C1'" "H1'" sing N N 330 G N9 C8 sing Y N 331 G N9 C4 sing Y N 332 G C8 N7 doub Y N 333 G C8 H8 sing N N 334 G N7 C5 sing Y N 335 G C5 C6 sing N N 336 G C5 C4 doub Y N 337 G C6 O6 doub N N 338 G C6 N1 sing N N 339 G N1 C2 sing N N 340 G N1 H1 sing N N 341 G C2 N2 sing N N 342 G C2 N3 doub N N 343 G N2 H21 sing N N 344 G N2 H22 sing N N 345 G N3 C4 sing N N 346 GLN N CA sing N N 347 GLN N H sing N N 348 GLN N H2 sing N N 349 GLN CA C sing N N 350 GLN CA CB sing N N 351 GLN CA HA sing N N 352 GLN C O doub N N 353 GLN C OXT sing N N 354 GLN CB CG sing N N 355 GLN CB HB2 sing N N 356 GLN CB HB3 sing N N 357 GLN CG CD sing N N 358 GLN CG HG2 sing N N 359 GLN CG HG3 sing N N 360 GLN CD OE1 doub N N 361 GLN CD NE2 sing N N 362 GLN NE2 HE21 sing N N 363 GLN NE2 HE22 sing N N 364 GLN OXT HXT sing N N 365 GLU N CA sing N N 366 GLU N H sing N N 367 GLU N H2 sing N N 368 GLU CA C sing N N 369 GLU CA CB sing N N 370 GLU CA HA sing N N 371 GLU C O doub N N 372 GLU C OXT sing N N 373 GLU CB CG sing N N 374 GLU CB HB2 sing N N 375 GLU CB HB3 sing N N 376 GLU CG CD sing N N 377 GLU CG HG2 sing N N 378 GLU CG HG3 sing N N 379 GLU CD OE1 doub N N 380 GLU CD OE2 sing N N 381 GLU OE2 HE2 sing N N 382 GLU OXT HXT sing N N 383 GLY N CA sing N N 384 GLY N H sing N N 385 GLY N H2 sing N N 386 GLY CA C sing N N 387 GLY CA HA2 sing N N 388 GLY CA HA3 sing N N 389 GLY C O doub N N 390 GLY C OXT sing N N 391 GLY OXT HXT sing N N 392 HIS N CA sing N N 393 HIS N H sing N N 394 HIS N H2 sing N N 395 HIS CA C sing N N 396 HIS CA CB sing N N 397 HIS CA HA sing N N 398 HIS C O doub N N 399 HIS C OXT sing N N 400 HIS CB CG sing N N 401 HIS CB HB2 sing N N 402 HIS CB HB3 sing N N 403 HIS CG ND1 sing Y N 404 HIS CG CD2 doub Y N 405 HIS ND1 CE1 doub Y N 406 HIS ND1 HD1 sing N N 407 HIS CD2 NE2 sing Y N 408 HIS CD2 HD2 sing N N 409 HIS CE1 NE2 sing Y N 410 HIS CE1 HE1 sing N N 411 HIS NE2 HE2 sing N N 412 HIS OXT HXT sing N N 413 ILE N CA sing N N 414 ILE N H sing N N 415 ILE N H2 sing N N 416 ILE CA C sing N N 417 ILE CA CB sing N N 418 ILE CA HA sing N N 419 ILE C O doub N N 420 ILE C OXT sing N N 421 ILE CB CG1 sing N N 422 ILE CB CG2 sing N N 423 ILE CB HB sing N N 424 ILE CG1 CD1 sing N N 425 ILE CG1 HG12 sing N N 426 ILE CG1 HG13 sing N N 427 ILE CG2 HG21 sing N N 428 ILE CG2 HG22 sing N N 429 ILE CG2 HG23 sing N N 430 ILE CD1 HD11 sing N N 431 ILE CD1 HD12 sing N N 432 ILE CD1 HD13 sing N N 433 ILE OXT HXT sing N N 434 LEU N CA sing N N 435 LEU N H sing N N 436 LEU N H2 sing N N 437 LEU CA C sing N N 438 LEU CA CB sing N N 439 LEU CA HA sing N N 440 LEU C O doub N N 441 LEU C OXT sing N N 442 LEU CB CG sing N N 443 LEU CB HB2 sing N N 444 LEU CB HB3 sing N N 445 LEU CG CD1 sing N N 446 LEU CG CD2 sing N N 447 LEU CG HG sing N N 448 LEU CD1 HD11 sing N N 449 LEU CD1 HD12 sing N N 450 LEU CD1 HD13 sing N N 451 LEU CD2 HD21 sing N N 452 LEU CD2 HD22 sing N N 453 LEU CD2 HD23 sing N N 454 LEU OXT HXT sing N N 455 LYS N CA sing N N 456 LYS N H sing N N 457 LYS N H2 sing N N 458 LYS CA C sing N N 459 LYS CA CB sing N N 460 LYS CA HA sing N N 461 LYS C O doub N N 462 LYS C OXT sing N N 463 LYS CB CG sing N N 464 LYS CB HB2 sing N N 465 LYS CB HB3 sing N N 466 LYS CG CD sing N N 467 LYS CG HG2 sing N N 468 LYS CG HG3 sing N N 469 LYS CD CE sing N N 470 LYS CD HD2 sing N N 471 LYS CD HD3 sing N N 472 LYS CE NZ sing N N 473 LYS CE HE2 sing N N 474 LYS CE HE3 sing N N 475 LYS NZ HZ1 sing N N 476 LYS NZ HZ2 sing N N 477 LYS NZ HZ3 sing N N 478 LYS OXT HXT sing N N 479 MET N CA sing N N 480 MET N H sing N N 481 MET N H2 sing N N 482 MET CA C sing N N 483 MET CA CB sing N N 484 MET CA HA sing N N 485 MET C O doub N N 486 MET C OXT sing N N 487 MET CB CG sing N N 488 MET CB HB2 sing N N 489 MET CB HB3 sing N N 490 MET CG SD sing N N 491 MET CG HG2 sing N N 492 MET CG HG3 sing N N 493 MET SD CE sing N N 494 MET CE HE1 sing N N 495 MET CE HE2 sing N N 496 MET CE HE3 sing N N 497 MET OXT HXT sing N N 498 PHE N CA sing N N 499 PHE N H sing N N 500 PHE N H2 sing N N 501 PHE CA C sing N N 502 PHE CA CB sing N N 503 PHE CA HA sing N N 504 PHE C O doub N N 505 PHE C OXT sing N N 506 PHE CB CG sing N N 507 PHE CB HB2 sing N N 508 PHE CB HB3 sing N N 509 PHE CG CD1 doub Y N 510 PHE CG CD2 sing Y N 511 PHE CD1 CE1 sing Y N 512 PHE CD1 HD1 sing N N 513 PHE CD2 CE2 doub Y N 514 PHE CD2 HD2 sing N N 515 PHE CE1 CZ doub Y N 516 PHE CE1 HE1 sing N N 517 PHE CE2 CZ sing Y N 518 PHE CE2 HE2 sing N N 519 PHE CZ HZ sing N N 520 PHE OXT HXT sing N N 521 PRO N CA sing N N 522 PRO N CD sing N N 523 PRO N H sing N N 524 PRO CA C sing N N 525 PRO CA CB sing N N 526 PRO CA HA sing N N 527 PRO C O doub N N 528 PRO C OXT sing N N 529 PRO CB CG sing N N 530 PRO CB HB2 sing N N 531 PRO CB HB3 sing N N 532 PRO CG CD sing N N 533 PRO CG HG2 sing N N 534 PRO CG HG3 sing N N 535 PRO CD HD2 sing N N 536 PRO CD HD3 sing N N 537 PRO OXT HXT sing N N 538 SER N CA sing N N 539 SER N H sing N N 540 SER N H2 sing N N 541 SER CA C sing N N 542 SER CA CB sing N N 543 SER CA HA sing N N 544 SER C O doub N N 545 SER C OXT sing N N 546 SER CB OG sing N N 547 SER CB HB2 sing N N 548 SER CB HB3 sing N N 549 SER OG HG sing N N 550 SER OXT HXT sing N N 551 THR N CA sing N N 552 THR N H sing N N 553 THR N H2 sing N N 554 THR CA C sing N N 555 THR CA CB sing N N 556 THR CA HA sing N N 557 THR C O doub N N 558 THR C OXT sing N N 559 THR CB OG1 sing N N 560 THR CB CG2 sing N N 561 THR CB HB sing N N 562 THR OG1 HG1 sing N N 563 THR CG2 HG21 sing N N 564 THR CG2 HG22 sing N N 565 THR CG2 HG23 sing N N 566 THR OXT HXT sing N N 567 TRP N CA sing N N 568 TRP N H sing N N 569 TRP N H2 sing N N 570 TRP CA C sing N N 571 TRP CA CB sing N N 572 TRP CA HA sing N N 573 TRP C O doub N N 574 TRP C OXT sing N N 575 TRP CB CG sing N N 576 TRP CB HB2 sing N N 577 TRP CB HB3 sing N N 578 TRP CG CD1 doub Y N 579 TRP CG CD2 sing Y N 580 TRP CD1 NE1 sing Y N 581 TRP CD1 HD1 sing N N 582 TRP CD2 CE2 doub Y N 583 TRP CD2 CE3 sing Y N 584 TRP NE1 CE2 sing Y N 585 TRP NE1 HE1 sing N N 586 TRP CE2 CZ2 sing Y N 587 TRP CE3 CZ3 doub Y N 588 TRP CE3 HE3 sing N N 589 TRP CZ2 CH2 doub Y N 590 TRP CZ2 HZ2 sing N N 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"C1'" sing N N 633 U "C3'" "O3'" sing N N 634 U "C3'" "C2'" sing N N 635 U "C3'" "H3'" sing N N 636 U "O3'" "HO3'" sing N N 637 U "C2'" "O2'" sing N N 638 U "C2'" "C1'" sing N N 639 U "C2'" "H2'" sing N N 640 U "O2'" "HO2'" sing N N 641 U "C1'" N1 sing N N 642 U "C1'" "H1'" sing N N 643 U N1 C2 sing N N 644 U N1 C6 sing N N 645 U C2 O2 doub N N 646 U C2 N3 sing N N 647 U N3 C4 sing N N 648 U N3 H3 sing N N 649 U C4 O4 doub N N 650 U C4 C5 sing N N 651 U C5 C6 doub N N 652 U C5 H5 sing N N 653 U C6 H6 sing N N 654 VAL N CA sing N N 655 VAL N H sing N N 656 VAL N H2 sing N N 657 VAL CA C sing N N 658 VAL CA CB sing N N 659 VAL CA HA sing N N 660 VAL C O doub N N 661 VAL C OXT sing N N 662 VAL CB CG1 sing N N 663 VAL CB CG2 sing N N 664 VAL CB HB sing N N 665 VAL CG1 HG11 sing N N 666 VAL CG1 HG12 sing N N 667 VAL CG1 HG13 sing N N 668 VAL CG2 HG21 sing N N 669 VAL CG2 HG22 sing N N 670 VAL CG2 HG23 sing N N 671 VAL OXT HXT sing N N 672 # _em_admin.current_status REL 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_em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 561 _em_entity_assembly_recombinant.organism Escherichia _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 60 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.category _em_software.details _em_software.id _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 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