data_8KCC # _entry.id 8KCC # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.395 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8KCC pdb_00008kcc 10.2210/pdb8kcc/pdb WWPDB D_1300039495 ? ? EMDB EMD-37099 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-06-26 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8KCC _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-08-07 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBC _pdbx_database_status.status_code_cs ? 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_citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Structure _citation.journal_id_ASTM STRUE6 _citation.journal_id_CSD 2005 _citation.journal_id_ISSN 0969-2126 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Mechanism of heterochromatin remodeling revealed by the DDM1 bound nucleosome structures.' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.str.2024.05.013 _citation.pdbx_database_id_PubMed 38870940 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhang, H.' 1 ? primary 'Gu, Z.' 2 ? primary 'Zeng, Y.' 3 ? primary 'Zhang, Y.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Probable histone H2A.7' 15997.942 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H2B.10' 15767.544 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H3.1' 15300.968 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H4' 11436.467 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'DNA (170-MER)' 52199.215 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'DNA (170-MER)' 52764.609 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'ATP-dependent DNA helicase DDM1' 86757.758 1 3.6.4.12 ? ? ? 8 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 1 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION' 66.007 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 HTA6 2 HTB2 7 ;Protein CHROMATIN REMODELING 1,AtCHR1,CHR01,Protein DECREASED DNA METHYLATION 1,AtDDM1,Protein SOMNIFEROUS 1,SWI/SNF2-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin DDM1 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MESTGKVKKAFGGRKPPGAPKTKSVSKSMKAGLQFPVGRITRFLKKGRYAQRLGGGAPVYMAAVLEYLAAEVLELAGNAA RDNKKSRIIPRHLLLAIRNDEELGKLLSGVTIAHGGVLPNINSVLLPKKSATKPAEEKATKSPVKSPKKA ; ;MESTGKVKKAFGGRKPPGAPKTKSVSKSMKAGLQFPVGRITRFLKKGRYAQRLGGGAPVYMAAVLEYLAAEVLELAGNAA RDNKKSRIIPRHLLLAIRNDEELGKLLSGVTIAHGGVLPNINSVLLPKKSATKPAEEKATKSPVKSPKKA ; A,B ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MAKADKKPAEKKPAEKTPAAEPAAAAEKKPKAGKKLPKEPAGAGDKKKKRSKKNVETYKIYIFKVLKQVHPDIGISSKAM GIMNSFINDIFEKLAGESSKLARYNKKPTITSREIQTAVRLVLPGELAKHAVSEGTKAVTKFTSS ; ;MAKADKKPAEKKPAEKTPAAEPAAAAEKKPKAGKKLPKEPAGAGDKKKKRSKKNVETYKIYIFKVLKQVHPDIGISSKAM GIMNSFINDIFEKLAGESSKLARYNKKPTITSREIQTAVRLVLPGELAKHAVSEGTKAVTKFTSS ; C,D ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRFRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVAALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRFRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVAALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; E,F ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKIFLENVIRDAVTYTEHARRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKIFLENVIRDAVTYTEHARRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; G,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC) (DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG) (DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT) (DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA) (DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT) (DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG) (DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGT CCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCG GTGTCGCGAT ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA) (DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DC) (DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA) (DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCGCGACACCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAA AACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGAT TCTCCAGGAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MVSLRSRKVIPASEMVSDGKTEKDASGDSPTSVLNEEENCEEKSVTVVEEEILLAKNGDSSLISEAMAQEEEQLLKLRED EEKANNAGSAVAPNLNETQFTKLDELLTQTQLYSEFLLEKMEDITINGIESESQKAEPEKTGRGRKRKAASQYNNTKAKR AVAAMISRSKEDGETINSDLTEEETVIKLQNELCPLLTGGQLKSYQLKGVKWLISLWQNGLNGILADQMGLGKTIQTIGF LSHLKGNGLDGPYLVIAPLSTLSNWFNEIARFTPSINAIIYHGDKNQRDELRRKHMPKTVGPKFPIVITSYEVAMNDAKR ILRHYPWKYVVIDEGHRLKNHKCKLLRELKHLKMDNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNFILPDIFTSHDEFESWFDFSEKN KNEATKEEEEKRRAQVVSKLHGILRPFILRRMKCDVELSLPRKKEIIMYATMTDHQKKFQEHLVNNTLEAHLGENAIRGQ GWKGKLNNLVIQLRKNCNHPDLLQGQIDGSYLYPPVEEIVGQCGKFRLLERLLVRLFANNHKVLIFSQWTKLLDIMDYYF SEKGFEVCRIDGSVKLDERRRQIKDFSDEKSSCSIFLLSTRAGGLGINLTAADTCILYDSDWNPQMDLQAMDRCHRIGQT 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_pdbx_entity_nonpoly.comp_id 8 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 9 'BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION' BEF # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLU n 1 3 SER n 1 4 THR n 1 5 GLY n 1 6 LYS n 1 7 VAL n 1 8 LYS n 1 9 LYS n 1 10 ALA n 1 11 PHE n 1 12 GLY n 1 13 GLY n 1 14 ARG n 1 15 LYS n 1 16 PRO n 1 17 PRO n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 PRO n 1 21 LYS n 1 22 THR n 1 23 LYS n 1 24 SER n 1 25 VAL n 1 26 SER n 1 27 LYS n 1 28 SER n 1 29 MET n 1 30 LYS n 1 31 ALA n 1 32 GLY n 1 33 LEU n 1 34 GLN n 1 35 PHE n 1 36 PRO n 1 37 VAL n 1 38 GLY n 1 39 ARG n 1 40 ILE n 1 41 THR n 1 42 ARG n 1 43 PHE n 1 44 LEU n 1 45 LYS n 1 46 LYS n 1 47 GLY n 1 48 ARG n 1 49 TYR n 1 50 ALA n 1 51 GLN n 1 52 ARG n 1 53 LEU n 1 54 GLY n 1 55 GLY n 1 56 GLY n 1 57 ALA n 1 58 PRO n 1 59 VAL n 1 60 TYR n 1 61 MET n 1 62 ALA n 1 63 ALA n 1 64 VAL n 1 65 LEU n 1 66 GLU n 1 67 TYR n 1 68 LEU n 1 69 ALA n 1 70 ALA n 1 71 GLU n 1 72 VAL n 1 73 LEU n 1 74 GLU n 1 75 LEU n 1 76 ALA n 1 77 GLY n 1 78 ASN n 1 79 ALA n 1 80 ALA n 1 81 ARG n 1 82 ASP n 1 83 ASN n 1 84 LYS n 1 85 LYS n 1 86 SER n 1 87 ARG n 1 88 ILE n 1 89 ILE n 1 90 PRO n 1 91 ARG n 1 92 HIS n 1 93 LEU n 1 94 LEU n 1 95 LEU n 1 96 ALA n 1 97 ILE n 1 98 ARG n 1 99 ASN n 1 100 ASP n 1 101 GLU n 1 102 GLU n 1 103 LEU n 1 104 GLY n 1 105 LYS n 1 106 LEU n 1 107 LEU n 1 108 SER n 1 109 GLY n 1 110 VAL n 1 111 THR n 1 112 ILE n 1 113 ALA n 1 114 HIS n 1 115 GLY n 1 116 GLY n 1 117 VAL n 1 118 LEU n 1 119 PRO n 1 120 ASN n 1 121 ILE n 1 122 ASN n 1 123 SER n 1 124 VAL n 1 125 LEU n 1 126 LEU n 1 127 PRO n 1 128 LYS n 1 129 LYS n 1 130 SER n 1 131 ALA n 1 132 THR n 1 133 LYS n 1 134 PRO n 1 135 ALA n 1 136 GLU n 1 137 GLU n 1 138 LYS n 1 139 ALA n 1 140 THR n 1 141 LYS n 1 142 SER n 1 143 PRO n 1 144 VAL n 1 145 LYS n 1 146 SER n 1 147 PRO n 1 148 LYS n 1 149 LYS n 1 150 ALA n 2 1 MET n 2 2 ALA n 2 3 LYS n 2 4 ALA n 2 5 ASP n 2 6 LYS n 2 7 LYS n 2 8 PRO n 2 9 ALA n 2 10 GLU n 2 11 LYS n 2 12 LYS n 2 13 PRO n 2 14 ALA n 2 15 GLU n 2 16 LYS n 2 17 THR n 2 18 PRO n 2 19 ALA n 2 20 ALA n 2 21 GLU n 2 22 PRO n 2 23 ALA n 2 24 ALA n 2 25 ALA n 2 26 ALA n 2 27 GLU n 2 28 LYS n 2 29 LYS n 2 30 PRO n 2 31 LYS n 2 32 ALA n 2 33 GLY n 2 34 LYS n 2 35 LYS n 2 36 LEU n 2 37 PRO n 2 38 LYS n 2 39 GLU n 2 40 PRO n 2 41 ALA n 2 42 GLY n 2 43 ALA n 2 44 GLY n 2 45 ASP n 2 46 LYS n 2 47 LYS n 2 48 LYS n 2 49 LYS n 2 50 ARG n 2 51 SER n 2 52 LYS n 2 53 LYS n 2 54 ASN n 2 55 VAL n 2 56 GLU n 2 57 THR n 2 58 TYR n 2 59 LYS n 2 60 ILE n 2 61 TYR n 2 62 ILE n 2 63 PHE n 2 64 LYS n 2 65 VAL n 2 66 LEU n 2 67 LYS n 2 68 GLN n 2 69 VAL n 2 70 HIS n 2 71 PRO n 2 72 ASP n 2 73 ILE n 2 74 GLY n 2 75 ILE n 2 76 SER n 2 77 SER n 2 78 LYS n 2 79 ALA n 2 80 MET n 2 81 GLY n 2 82 ILE n 2 83 MET n 2 84 ASN n 2 85 SER n 2 86 PHE n 2 87 ILE n 2 88 ASN n 2 89 ASP n 2 90 ILE n 2 91 PHE n 2 92 GLU n 2 93 LYS n 2 94 LEU n 2 95 ALA n 2 96 GLY n 2 97 GLU n 2 98 SER n 2 99 SER n 2 100 LYS n 2 101 LEU n 2 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I DG 149 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog271 hydrog ? ? I DG 149 O6 ? ? ? 1_555 J DC 22 N4 ? ? I DG 149 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog272 hydrog ? ? I DT 150 N3 ? ? ? 1_555 J DA 21 N1 ? ? I DT 150 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog273 hydrog ? ? I DT 150 O4 ? ? ? 1_555 J DA 21 N6 ? ? I DT 150 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? 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LYS K 744 GLY K 745 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ARG A 52 ? N ARG A 51 O ILE D 110 ? O ILE D 109 AA2 1 2 N ILE A 88 ? N ILE A 87 O GLY D 74 ? O GLY D 73 AA3 1 2 N THR A 111 ? N THR A 110 O THR H 97 ? O THR H 96 AA4 1 2 N ARG B 52 ? N ARG B 51 O ILE C 110 ? O ILE C 109 AA5 1 2 N ILE B 88 ? N ILE B 87 O GLY C 74 ? O GLY C 73 AA6 1 2 N THR B 111 ? N THR B 110 O TYR G 99 ? O TYR G 98 AA7 1 2 N ARG E 84 ? N ARG E 83 O VAL G 82 ? O VAL G 81 AA8 1 2 N ILE E 120 ? N ILE E 119 O ARG G 46 ? O ARG G 45 AA9 1 2 N ARG F 84 ? N ARG F 83 O VAL H 82 ? O VAL H 81 AB1 1 2 N ILE F 120 ? N ILE F 119 O ARG H 46 ? O ARG H 45 AB2 1 2 N ILE K 224 ? N ILE K 224 O LEU K 429 ? O LEU K 429 AB3 1 2 N ILE K 279 ? N ILE K 279 O ILE K 308 ? O ILE K 308 AB3 2 3 O THR K 309 ? O THR K 309 N VAL K 255 ? N VAL K 255 AB3 3 4 N ILE K 256 ? N ILE K 256 O VAL K 331 ? O VAL K 331 AB3 4 5 N TRP K 327 ? N TRP K 327 O ASP K 355 ? O ASP K 355 AB4 1 2 N ILE K 279 ? N ILE K 279 O ILE K 308 ? O ILE K 308 AB4 2 3 O THR K 309 ? O THR K 309 N VAL K 255 ? N VAL K 255 AB4 3 4 N ILE K 256 ? N ILE K 256 O VAL K 331 ? O VAL K 331 AB4 4 5 N ILE K 332 ? N ILE K 332 O LEU K 360 ? O LEU K 360 AB5 1 2 N CYS K 568 ? N CYS K 568 O LEU K 597 ? O LEU K 597 AB5 2 3 O LEU K 598 ? O LEU K 598 N ILE K 545 ? N ILE K 545 AB5 3 4 N LEU K 544 ? N LEU K 544 O ILE K 616 ? O ILE K 616 AB5 4 5 N CYS K 615 ? N CYS K 615 O HIS K 644 ? O HIS K 644 AB5 5 6 O VAL K 645 ? O VAL K 645 N ILE K 446 ? N ILE K 446 AB5 6 7 N ILE K 447 ? N ILE K 447 O GLU K 749 ? O GLU K 749 AB5 7 8 O TRP K 748 ? O TRP K 748 N GLY K 745 ? N GLY K 745 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ILE K 321 ? ? -124.45 -51.08 2 1 ASN K 368 ? ? -96.39 -68.55 3 1 LEU K 369 ? ? 177.58 160.43 4 1 SER K 370 ? ? 61.82 -0.51 5 1 SER K 754 ? ? -71.60 -72.00 # _pdbx_entry_details.entry_id 8KCC _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.has_protein_modification ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8KCC _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8KCC _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 651090 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Complex of DDM1-nucleosome(H2A.W) complex with DDM1 bound to SHL2' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2,3,4,7,5,6 # _em_imaging.entry_id 8KCC _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 3500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_vitrification.entry_id 8KCC _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8KCC _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 0 ? 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