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C N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SPIKE_SARS P59594 ? 1 ;MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPV IPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCT FEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSP AQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNIT NLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPG QTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLND YGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTD SVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAE HVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDC NMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFI EDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPF AMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLN DILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPH GVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVY DPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQ ; 1 2 PDB 8KDT 8KDT ? 2 ? 1 3 PDB 8KDT 8KDT ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8KDT A 1 ? 1190 ? P59594 1 ? 1190 ? 1 1190 2 2 8KDT H 1 ? 450 ? 8KDT 1 ? 450 ? 1 450 3 3 8KDT L 1 ? 216 ? 8KDT 1 ? 216 ? 1 216 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8KDT ALA A 577 ? UNP P59594 SER 577 'engineered mutation' 577 1 1 8KDT PRO A 968 ? UNP P59594 LYS 968 'engineered mutation' 968 2 1 8KDT PRO A 969 ? UNP P59594 VAL 969 'engineered mutation' 969 3 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PHE A 325 ? ASN A 330 ? PHE A 325 ASN A 330 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 372 ? ASP A 376 ? THR A 372 ASP A 376 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 SER B 134 ? THR B 138 ? SER H 134 THR H 138 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO B 192 ? LEU B 196 ? PRO H 192 LEU H 196 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 SER C 123 ? LYS C 128 ? SER L 123 LYS L 128 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 184 ? GLU C 189 ? SER L 184 GLU L 189 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 323 SG ? ? ? 1_555 A CYS 348 SG ? ? A CYS 323 A CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 366 SG ? ? ? 1_555 A CYS 419 SG ? ? A CYS 366 A CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 378 SG ? ? ? 1_555 A CYS 511 SG ? ? A CYS 378 A CYS 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 467 SG ? ? ? 1_555 A CYS 474 SG ? ? A CYS 467 A CYS 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 147 SG ? ? ? 1_555 B CYS 203 SG ? ? H CYS 147 H CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf8 disulf ? ? C CYS 136 SG ? ? ? 1_555 C CYS 196 SG ? ? L CYS 136 L CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 341 ? ARG A 342 ? GLU A 341 ARG A 342 AA1 2 ASP A 385 ? VAL A 389 ? ASP A 385 VAL A 389 AA1 3 TYR A 494 ? SER A 500 ? TYR A 494 SER A 500 AA1 4 GLY A 418 ? ASN A 424 ? GLY A 418 ASN A 424 AA1 5 THR A 363 ? TYR A 367 ? THR A 363 TYR A 367 AA2 1 LYS A 439 ? ARG A 441 ? LYS A 439 ARG A 441 AA2 2 LEU A 478 ? ASP A 480 ? LEU A 478 ASP A 480 AA3 1 GLN B 3 ? GLN B 6 ? GLN H 3 GLN H 6 AA3 2 VAL B 18 ? SER B 25 ? VAL H 18 SER H 25 AA3 3 THR B 78 ? LEU B 83 ? THR H 78 LEU H 83 AA3 4 VAL B 68 ? THR B 71 ? VAL H 68 THR H 71 AA4 1 GLU B 10 ? LYS B 12 ? GLU H 10 LYS H 12 AA4 2 LEU B 117 ? VAL B 120 ? LEU H 117 VAL H 120 AA4 3 ALA B 92 ? ALA B 97 ? ALA H 92 ALA H 97 AA4 4 TYR B 35 ? GLN B 39 ? TYR H 35 GLN H 39 AA5 1 VAL B 50 ? ILE B 51 ? VAL H 50 ILE H 51 AA5 2 VAL B 58 ? THR B 59 ? VAL H 58 THR H 59 AA6 1 THR B 172 ? LEU B 177 ? THR H 172 LEU H 177 AA6 2 TYR B 183 ? SER B 187 ? TYR H 183 SER H 187 AA7 1 THR C 10 ? LEU C 13 ? THR L 10 LEU L 13 AA7 2 THR C 104 ? ILE C 108 ? THR L 104 ILE L 108 AA7 3 VAL C 85 ? TYR C 86 ? VAL L 85 TYR L 86 AA8 1 LEU C 21 ? CYS C 23 ? LEU L 21 CYS L 23 AA8 2 ASP C 70 ? ILE C 75 ? ASP L 70 ILE L 75 AA8 3 PHE C 62 ? SER C 67 ? PHE L 62 SER L 67 AA9 1 ASN C 53 ? ARG C 54 ? ASN L 53 ARG L 54 AA9 2 PRO C 44 ? TYR C 49 ? PRO L 44 TYR L 49 AA9 3 LEU C 33 ? GLN C 38 ? LEU L 33 GLN L 38 AA9 4 CYS C 88 ? ARG C 91 ? CYS L 88 ARG L 91 AA9 5 PHE C 98 ? PHE C 100 ? PHE L 98 PHE L 100 AB1 1 SER C 116 ? PHE C 120 ? SER L 116 PHE L 120 AB1 2 SER C 133 ? PHE C 141 ? SER L 133 PHE L 141 AB1 3 TYR C 175 ? THR C 182 ? TYR L 175 THR L 182 AB1 4 SER C 161 ? VAL C 165 ? SER L 161 VAL L 165 AB2 1 ALA C 146 ? VAL C 152 ? ALA L 146 VAL L 152 AB2 2 VAL C 193 ? HIS C 200 ? VAL L 193 HIS L 200 AB2 3 VAL C 207 ? ASN C 212 ? VAL L 207 ASN L 212 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N GLU A 341 ? N GLU A 341 O SER A 386 ? O SER A 386 AA1 2 3 N PHE A 387 ? N PHE A 387 O VAL A 496 ? O VAL A 496 AA1 3 4 O VAL A 497 ? O VAL A 497 N LEU A 421 ? N LEU A 421 AA1 4 5 O GLY A 418 ? O GLY A 418 N TYR A 367 ? N TYR A 367 AA2 1 2 N TYR A 440 ? N TYR A 440 O ASN A 479 ? O ASN A 479 AA3 1 2 N VAL B 5 ? N VAL H 5 O LYS B 23 ? O LYS H 23 AA3 2 3 N VAL B 18 ? N VAL H 18 O LEU B 83 ? O LEU H 83 AA3 3 4 O TYR B 80 ? O TYR H 80 N THR B 71 ? N THR H 71 AA4 1 2 N LYS B 12 ? N LYS H 12 O THR B 119 ? O THR H 119 AA4 2 3 O VAL B 118 ? O VAL H 118 N ALA B 92 ? N ALA H 92 AA4 3 4 O TYR B 95 ? O TYR H 95 N VAL B 37 ? N VAL H 37 AA5 1 2 N VAL B 50 ? N VAL H 50 O THR B 59 ? O THR H 59 AA6 1 2 N VAL B 176 ? N VAL H 176 O SER B 184 ? O SER H 184 AA7 1 2 N LEU C 11 ? N LEU L 11 O LYS C 105 ? O LYS L 105 AA7 2 3 O THR C 104 ? O THR L 104 N TYR C 86 ? N TYR L 86 AA8 1 2 N LEU C 21 ? N LEU L 21 O LEU C 73 ? O LEU L 73 AA8 2 3 O THR C 72 ? O THR L 72 N SER C 65 ? N SER L 65 AA9 1 2 O ASN C 53 ? 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