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'Gria1, Glur1' ? ? ? ? ? ? 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 314 'Norway rat' ? Cacng3 ? ? ? ? ? ? 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GRIA1_RAT P19490 P19490-2 1 ;MPYIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSK GVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQEALISIIDHYKWQTFVYIYDADRGLSVLQR VLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIVKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPARIMQQWRTSDSRDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNA GDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGD NSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRF SPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTV ERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSA LSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASGGGGSGENGRVV SQDFPKSMQSIPCMSHSSGMPLGATGL ; 1 2 UNP CCG3_RAT Q8VHX0 ? 2 ;RMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTHSGLWRTCCLEGAFRGVCKKID HFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGLCVAASEFHRSRHSVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANA GDPGQRDSKKSYSYGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRARSHSELLKKSTFARLPPYRYRFRRRSSSRSTE PRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKLTMGTLLNSDRDHAFLQFHNSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV ; 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8P3U A 1 ? 915 ? P19490 1 ? 907 ? -25 889 2 1 8P3U B 1 ? 915 ? P19490 1 ? 907 ? -25 889 3 1 8P3U C 1 ? 915 ? P19490 1 ? 907 ? -25 889 4 1 8P3U D 1 ? 915 ? P19490 1 ? 907 ? -25 889 5 2 8P3U E 1 ? 314 ? Q8VHX0 2 ? 315 ? 2 315 6 2 8P3U F 1 ? 314 ? Q8VHX0 2 ? 315 ? 2 315 7 2 8P3U G 1 ? 314 ? Q8VHX0 2 ? 315 ? 2 315 8 2 8P3U H 1 ? 314 ? Q8VHX0 2 ? 315 ? 2 315 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8P3U ASP A 20 ? UNP P19490 ? ? insertion -6 1 1 8P3U TYR A 21 ? UNP P19490 ? ? insertion -5 2 1 8P3U LYS A 22 ? UNP P19490 ? ? insertion -4 3 1 8P3U ASP A 23 ? UNP P19490 ? ? insertion -3 4 1 8P3U ASP A 24 ? UNP P19490 ? ? insertion -2 5 1 8P3U ASP A 25 ? UNP P19490 ? ? insertion -1 6 1 8P3U ASP A 26 ? UNP P19490 ? ? insertion 0 7 1 8P3U LYS A 27 ? UNP P19490 ? ? insertion 1 8 2 8P3U ASP B 20 ? UNP P19490 ? ? insertion -6 9 2 8P3U TYR B 21 ? UNP P19490 ? ? insertion -5 10 2 8P3U LYS B 22 ? UNP P19490 ? ? insertion -4 11 2 8P3U ASP B 23 ? UNP P19490 ? ? insertion -3 12 2 8P3U ASP B 24 ? UNP P19490 ? ? insertion -2 13 2 8P3U ASP B 25 ? UNP P19490 ? ? insertion -1 14 2 8P3U ASP B 26 ? UNP P19490 ? ? insertion 0 15 2 8P3U LYS B 27 ? UNP P19490 ? ? insertion 1 16 3 8P3U ASP C 20 ? UNP P19490 ? ? insertion -6 17 3 8P3U TYR C 21 ? UNP P19490 ? ? insertion -5 18 3 8P3U LYS C 22 ? UNP P19490 ? ? insertion -4 19 3 8P3U ASP C 23 ? UNP P19490 ? ? insertion -3 20 3 8P3U ASP C 24 ? UNP P19490 ? ? insertion -2 21 3 8P3U ASP C 25 ? UNP P19490 ? ? insertion -1 22 3 8P3U ASP C 26 ? UNP P19490 ? ? insertion 0 23 3 8P3U LYS C 27 ? UNP P19490 ? ? insertion 1 24 4 8P3U ASP D 20 ? UNP P19490 ? ? insertion -6 25 4 8P3U TYR D 21 ? UNP P19490 ? ? insertion -5 26 4 8P3U LYS D 22 ? UNP P19490 ? ? insertion -4 27 4 8P3U ASP D 23 ? UNP P19490 ? ? insertion -3 28 4 8P3U ASP D 24 ? UNP P19490 ? ? insertion -2 29 4 8P3U ASP D 25 ? UNP P19490 ? ? insertion -1 30 4 8P3U ASP D 26 ? UNP P19490 ? ? insertion 0 31 4 8P3U LYS D 27 ? UNP P19490 ? ? insertion 1 32 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8P3U _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8P3U _struct.title 'Homomeric GluA1 in tandem with TARP gamma-3, desensitized conformation 2' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8P3U _struct_keywords.text 'AMPAR, ion channels, neurotransmission, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 433 ? PHE A 437 ? ASN A 407 PHE A 411 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 438 ? ASP A 441 ? GLU A 412 ASP A 415 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 445 ? GLY A 459 ? GLY A 419 GLY A 433 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 484 ? TYR A 491 ? GLY A 458 TYR A 465 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 504 ? GLU A 509 ? THR A 478 GLU A 483 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 PHE A 537 ? 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ASN B 457 TYR B 465 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 THR B 504 ? GLU B 509 ? THR B 478 GLU B 483 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 ALA B 544 ? PHE B 568 ? ALA B 518 PHE B 542 1 ? 25 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY B 594 ? MET B 607 ? GLY B 568 MET B 581 1 ? 14 HELX_P HELX_P24 AC6 SER B 617 ? GLU B 649 ? SER B 591 GLU B 623 1 ? 33 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 657 ? GLN B 664 ? SER B 631 GLN B 638 1 ? 8 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY B 675 ? ARG B 683 ? GLY B 649 ARG B 657 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 ILE B 686 ? ALA B 699 ? ILE B 660 ALA B 673 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 707 ? SER B 718 ? THR B 681 SER B 692 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 SER B 728 ? ARG B 737 ? SER B 702 ARG B 711 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU B 764 ? GLN B 778 ? LEU B 738 GLN B 752 1 ? 15 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY B 779 ? TRP B 789 ? GLY B 753 TRP B 763 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 810 ? ASN B 813 ? SER B 784 ASN B 787 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 VAL B 814 ? ARG B 841 ? VAL B 788 ARG B 815 1 ? 28 HELX_P HELX_P34 AD7 ASN C 433 ? PHE C 437 ? ASN C 407 PHE C 411 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU C 438 ? ASP C 441 ? GLU C 412 ASP C 415 5 ? 4 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY C 445 ? GLY C 459 ? GLY C 419 GLY C 433 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY C 484 ? TYR C 491 ? GLY C 458 TYR C 465 1 ? 8 HELX_P HELX_P38 AE2 THR C 504 ? GLU C 509 ? THR C 478 GLU C 483 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 PHE C 537 ? ASP C 541 ? PHE C 511 ASP C 515 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 ALA C 544 ? SER C 566 ? ALA C 518 SER C 540 1 ? 23 HELX_P HELX_P41 AE5 GLY C 594 ? MET C 607 ? GLY C 568 MET C 581 1 ? 14 HELX_P HELX_P42 AE6 SER C 617 ? VAL C 648 ? SER C 591 VAL C 622 1 ? 32 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA C 658 ? GLN C 664 ? ALA C 632 GLN C 638 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 GLY C 675 ? ARG C 683 ? GLY C 649 ARG C 657 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 AE9 ILE C 686 ? SER C 698 ? ILE C 660 SER C 672 1 ? 13 HELX_P HELX_P46 AF1 THR C 707 ? SER C 718 ? THR C 681 SER C 692 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 AF2 SER C 728 ? ARG C 737 ? SER C 702 ARG C 711 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU C 764 ? GLN C 778 ? 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GLY H 176 ALA H 209 1 ? 34 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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H CYS 67 H CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 425 A . ? ASP 399 A PRO 426 A ? PRO 400 A 1 -8.16 2 GLU 700 A . ? GLU 674 A PRO 701 A ? PRO 675 A 1 3.75 3 LYS 738 A . ? LYS 712 A PRO 739 A ? PRO 713 A 1 1.45 4 ASP 425 B . ? 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